Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7667 cluster # 7667       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7667#0 length = 620 sequences # 5  
consensusID : consensus_7667#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 620
fasta sequence 
                              [TGTAATGCATCGGAATAGTGGTCATGATTATGGAATAATGGTTCATCAAGGTGATGTAATTGGTTGTTTGTTAGATTTAGACAAAGGATCGATTTCTTGGTCGTGTAATGGAAAAATATTTCGTCGTGCATTCACTATACCTGACCAATTAAGAGGTGAAGCTTTCTTACCAGCGGCTAGTCTAAAAGATTCACGTATCCTATTTAATTTCGGTGAA-GAACAACCGTTAGAATTCCCACCAGATGGTCCTTTTATTCCTGTAGCTCAATCTGCTGATGATAGTCAAGTATCTAATCGAAATCCTGGTTGGCGCATGAATCAGTACGATGCAACGAATGCTTTAGATGTTGCACCCGACGGCAGTCAAGTTCAATCACATTTTAATCAAGGTTGGCAAGGTTGTCGATCGAATCATGGTATTCGTGGTCTTGGACGCTTCTACTTTGAAGTAACTCCTATTGAATCTACTGGATTATGGCGCGTCGGTTGGTCAACAGATGATGGGAATTTAATTGTTGGCACAGATCAATATGGTTTCGGTTATGGTGCAGATAATGAAGGTTTCGGTTTGAATGGACAACAAGGCAAACGTATACATTGTGATGAAATTGAAAATTATG]

[+] EMBL CD089652             [TGTAATGCATCGGAATAGTGGTCATGATTATGGAATAATGGTTCATCAAGGTGATGTAATTGGTTGTTTGTTAGATTTAGACAAAGGATCGATTTCTTGGTCGTGTAATGGAAAAATATTTCGTCGTGCATTCACTATACCTGACCAATTAAGAGGTGAAGCTTTCTTACCAGCGGCTAGTCTAAAAGATTCACGTATCCTATTTAATTTCGGTGAA GAACAACCGTTAGAATTCCCACCAGATGGTCCTTTTATTCCTGTAGCTCAATCTGCTGATGATAGTCAAGTATCTAATCGAAATCCTGGTTGGCGCATGAATCAGTACGATGCAACGAATGCTTTAGATGTTGCACCCGACGGCAGTCAAGTTCAATCACATTTTAATCAAGGTTGGCAAGGTTGTCGATCGAATCATGGTATTCGTGGTCTTGGACGCTTCTACT                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD063983             [                                                                                                                          ccggacgcTTCACTATACCTGACCAATTAAGAGGAGAAGC TTCTTACCAGCGGCTAGTCTAAAAGATTCACGTATCCTATTTAATTTCGGTGAA GAACGACCGTTAGAATTCCCACCAGATGGTCCATTTATTCCTGTAGCTCAATCTGCTGATGATAGTCAAGTATCTAATCGAAATCCTGGTTGGCGCATGAATCAGTACGATGCAACGAATGCTTTAGATGTTGCACCCGACGGTAGTCAAGTTCAATCACATCTTAATCAAGGTTGGCAAGGTTGTCGATCGAATCATGGTATTCGTGGTCTTGGACGCTTTTACTTTGAAGTAACTCCTATTGAATCTACTGGATTATGGCGCGTCGGTTGGTCAACAGATGATGGGAATTTAATTGTTGGCACAGATCAATATGGTTTCGGTTATGGTGCAGATAATGAAGGTTTCGGTTTGAATGGACAACAAGGCAAACGTATACATTGTGATGAAATTGAAAATTATG]
[+] EMBL CD167469             [                                                                                                                                            CTGACCAATTAAGAGGTGAAGCTTTCTTACCAGCGGCTAGTCTAAAAGATTCACGTATCCTATTTAATTTCGGTGAAGGAACAACCGTTAGAATTCCCACCAGATGGTCCTTTTATTCCTGTAGCTCAATCTGCTGATGATAGTCAAGTATCTAATCGAAATCCTGGTTGGCGCATGAATCAGTACGATGCAACGAATGCTTTAGATGTTGCACCCGACGGCAGTCAAGTTCAATCACATTTTAATCAAGGTTGGCAAGGTTGTCGATCGAATCATGGTATTCGTGGTCTTGGACGCTTCTACTTTGAAGTAACTCCTATTG                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD064322             [                                                                                                                                               ACCAATT AGAGGTGAAGCTTTCTTACCAGCGGCTAGTCTAAAAGATTCACGTATCCTATTTAATTTCGGTGAA GAACAACCGTTAGAATTCCCACCAGATGGTCCTTTTATTCCTGTAGCTCAATCTGCTGATGATAGTCAAGTATCTAATCGAAATCCTGGTTGGCGCATGAATCAGTACGATGCAACGAATGCTTTAGATGTTGCACCCGACGGCAGTCAAGTTCAATCACATTTTAATCAAGGTTGGCAAGGTTGTCGATCGAATCATGGTATTCGTGGTCTTGGACGCTTCTACTTTGAAG                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD146373             [                                                                                                                                                                                                                                                                                        TAGTCAAGTATCTAATCGAAATCCTGGTTGGCGCATGAATCAGTACGATGCAACGAATGCTTTAGATGTTGCACCCGACGGCAGTCAAGTTCAATCACATTTTAATCAAGGTTGGCAAGGTTGTCGATCGAATCATGGTATTCGTGGTCTTGGACGCTTTTACTTCGAA                                                                                                                                                                            ]




>consensus_7667#0
TGTAATGCATCGGAATAGTGGTCATGATTATGGAATAATGGTTCATCAAGGTGATGTAAT
TGGTTGTTTGTTAGATTTAGACAAAGGATCGATTTCTTGGTCGTGTAATGGAAAAATATT
TCGTCGTGCATTCACTATACCTGACCAATTAAGAGGTGAAGCTTTCTTACCAGCGGCTAG
TCTAAAAGATTCACGTATCCTATTTAATTTCGGTGAAGAACAACCGTTAGAATTCCCACC
AGATGGTCCTTTTATTCCTGTAGCTCAATCTGCTGATGATAGTCAAGTATCTAATCGAAA
TCCTGGTTGGCGCATGAATCAGTACGATGCAACGAATGCTTTAGATGTTGCACCCGACGG
CAGTCAAGTTCAATCACATTTTAATCAAGGTTGGCAAGGTTGTCGATCGAATCATGGTAT
TCGTGGTCTTGGACGCTTCTACTTTGAAGTAACTCCTATTGAATCTACTGGATTATGGCG
CGTCGGTTGGTCAACAGATGATGGGAATTTAATTGTTGGCACAGATCAATATGGTTTCGG
TTATGGTGCAGATAATGAAGGTTTCGGTTTGAATGGACAACAAGGCAAACGTATACATTG
TGATGAAATTGAAAATTATG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)