cluster # 7702

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Schistosoma mansoni
cluster # 7702 cluster # 7702 Sequences # 5 consensus # 2

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consensus_7702#0 length = 947 sequences # 4

consensus_7702#1 length = 721 sequences # 1

consensusID : consensus_7702#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 947
fasta sequence

                              [TCCGAGCCAAGATTCGGCACGAGGGAAAAAAATAAATAAACAGAACATAATCTTTGATAATTAATTTTAATGAAGATTATAGTTAAATATACTTATTTATACCTGTGAGTAGTATGTATTTCATATAGCCAAAACAGACCGATGAACACATATTGAAAAAGGGAAAAAAAGACAGTAAATTCAATATAAATTTTTGTGGAAGAAAATGTGACACAATTTGTTTTTCTCTCTGTTCCCTTTTTGATCCCATTCTCTATCTTTCCTTTTTTTTAAATTCCAATATACAATAGTCAGATCGGTATACTAAATTCTAGTTATACTGTATGTGTTCCCTTCTTATTTTATTTATCCAGTACCAACATCTTGGTTGAATACACTTCTATATATTTACTGTACACATTGGGTAATTCTATGGGGGATTTTTTTGTTCTCGAAAAATTAATTTTTGTGTTTCACCTTGGATATTAATTATGGGTGTTATTATTATTACTATTATTATTATTATTATTATTGTCAATTTATGATCGTTCTTTATTCATATTCATTTGTGATTTGTTGGTTACAAGTAAGTAGTCGATATTATTTGACTTCTTATATTTACATTGCTATCTTACCTTTCTATTAGCGCTATCACAATCTGGACTATCTTTATAATTATAATTCAATGTTTGTTTTTCGTTAAATTGTCCGGTCTCTTTTTTCCCTCCCCTTCGTCTCCGTTCTCTTTTATCCTCAGGTATCAAATTGTAAACAAATTCACAGTTGTTTTTTTTCTTTTGTTTTCTATGCTTGTGTGTGTGTGCTTACGCACTCATTGTTCGATGCACAAAAAGGAAAAGAGAAGTATGAAGTGTAATTTACACTTGCTCACAATTGTAAATATATTGCAATAAATCAATCTATTTTACTAATCATGCTAAACGTTTTAAAAAAGAAATAAAGAAATT]

[+] EMBL CD082706             [TCCGAGCCAAGATTCGGCACGAGGGAAAAAAATAAATAAACAGAACATAATCTTTGATAATTAATTTTAATGAAGATTATAGTTAAATATACTTATTTATACCTGTGAGTAGTATGTATTTCATATAGCCAAAACAGACCGATGAACACATATTGAAAAAGGGAAAAAAAGACAGTAAATTCAATATAAATTTTTGTGGAAGAAAATGTGACACAATTTGTTTTTCTCTCTGTTCCCTTTTTGATCCCATTCTCTATCTTTCCTTTTTTTTAAATTCCAATATACAATAGTCAGATCGGTATACTAAATTCTAGTTATACTGTATGTGTTCCCTTCTTATTTTATTTATCCAGTACCAACATCTTGGTTGAATACACTTCTATATATTTACTGTACACATTGGGTAATTCTATGGGGGATTTTTTTGTTCTCGAAAAATTAATTTTTGTGTTTCACCTTGGATATTAATTATGGGTGTTATTATTATTACTATTATTATTATTATTATTATTGTCAATTTATGATCGTTCTTTATTCATATTCATTTGTGATTTGTTGGTTACAAGTAAGTAGTCGATATTATTTGACTTCTTATATTTACATTGCTATCTTACCTTTCTATTAGCGCTATCACAATCTGGACTATCTNTATAATTATAATTC                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD196941             [                                                                                                                                                                   AAAAAAAGACAGTAAATTCAATAT AATTTTTGTGGAAGAAAATGTGACACAATTTGTTTTTCTCTCTGTTCCCTTTTTGATCCCATTCTCTATCTTTCCTTTTTTTTAAATTCCAATATACAATAGTCAGATCGGTATACTAAATTCTAGTTATACTGTATGTGTTCCCTTCTTATTTTATTTATCCAGTACCAACATCTTGGTTGAATACACTTCTATATATTTACTGTACACATTGGGTAATTCTATGGGGGATTTTTTTGTTCTCGAAAAATTAATTTTTGTGTTTCACCTTGGATATTAATTATGGGTGTTATTATTATTACTATTATTATTATTATTATTATTGTCAATTTATGATCGTTCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD075653             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTTCTTATTTTATTTATCCAGTACCAACATCTTGGTTGAATACACTTCTATATATTTACTGTACACATTGGGTAATTCTATGGGGGATTTTTTTGTTCTCGAAAAATTAATTTTTGTGTTTCACCTTGGATATTAATTATGGGTGTTATTATTATTACTATTATTATTATTATTATTATTGTCAATTTATGATCGTTCTTTATTCATATTCATTTGTGATTTGTTGGTTACAAGTAAGTAGTCGATATTATTTGACTTCTTATATTTACATTGCTATCTTACCTTTCTATTAGCGCTATCACAATCTGGACTATCTTTATAATTATAATTCAATGTTTGTTTTTCGTTAAATTGTCCGGTCTCTTTTTTCCCTCCCCTTCGTCTCCGTTCTCTTTTATCCTCAGGTATCAAATTGTAAACAAATTCACAGTTGTTTTTTTTCTTTTGTTTTCTATGCTTGTGTGTGTGTGCTTACGCACTCATTGTTCGATGCACAAAAAGGAAAAGAGAAGTATGAAGTGTAATTTACACTTGCTCACAATTGTAAATATATTGCAATAAATCAATCTATTTTACTAATCATGCTAAACGTTTTAAAAAAGAAATAAAGAAATT]
[-] EMBL CD076296             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CCAACATCTTGGTTGAATACACTTCTATATATTTACTGTACACATTGGGTAATTCTATGGGGGATTTTTTTGTTCTCGAAAAATTAATTTTTGTGTTTCACCTTGGATATTAATTATGGGTGTTATTATTATTACTATTATTATTATTATTATTATTGTCAATTTATGATCGTTCTTTATTCATATTCATTTGTGATTTGTTGGTTACAAGTAAGTAGTCGATATTATTTGACTTCTTATATTTACATTGCTATCTTACCTTTCTATTAGCGCTATCACAATCTGGACTATCTTTATAATTATAATTCAATGTTTGTTTTTCGTTAAATTGTCCGGTCTCTTTTTTCCCTCCCCTTCGTCTCCGTTCTCTTTTATCCTCAGGTATCAAATTGTAAACAAATTCACAGTTGTTTTTTTTCTTTTGTTTTCTATGCTTGTGTGTGTGTGCTTACGCACTCATTGTTCGATGCACAAAAAGGAAAAGAGAAGTATGAAGTGTAATTTACACTTGCTCACAATTGTAAATATATTGCAATAAATCAATCTATTTTACTAATCATGCTAAACGTTTTAAAAAAGAAATAAAGAAATT]




>consensus_7702#0
TCCGAGCCAAGATTCGGCACGAGGGAAAAAAATAAATAAACAGAACATAATCTTTGATAA
TTAATTTTAATGAAGATTATAGTTAAATATACTTATTTATACCTGTGAGTAGTATGTATT
TCATATAGCCAAAACAGACCGATGAACACATATTGAAAAAGGGAAAAAAAGACAGTAAAT
TCAATATAAATTTTTGTGGAAGAAAATGTGACACAATTTGTTTTTCTCTCTGTTCCCTTT
TTGATCCCATTCTCTATCTTTCCTTTTTTTTAAATTCCAATATACAATAGTCAGATCGGT
ATACTAAATTCTAGTTATACTGTATGTGTTCCCTTCTTATTTTATTTATCCAGTACCAAC
ATCTTGGTTGAATACACTTCTATATATTTACTGTACACATTGGGTAATTCTATGGGGGAT
TTTTTTGTTCTCGAAAAATTAATTTTTGTGTTTCACCTTGGATATTAATTATGGGTGTTA
TTATTATTACTATTATTATTATTATTATTATTGTCAATTTATGATCGTTCTTTATTCATA
TTCATTTGTGATTTGTTGGTTACAAGTAAGTAGTCGATATTATTTGACTTCTTATATTTA
CATTGCTATCTTACCTTTCTATTAGCGCTATCACAATCTGGACTATCTTTATAATTATAA
TTCAATGTTTGTTTTTCGTTAAATTGTCCGGTCTCTTTTTTCCCTCCCCTTCGTCTCCGT
TCTCTTTTATCCTCAGGTATCAAATTGTAAACAAATTCACAGTTGTTTTTTTTCTTTTGT
TTTCTATGCTTGTGTGTGTGTGCTTACGCACTCATTGTTCGATGCACAAAAAGGAAAAGA
GAAGTATGAAGTGTAATTTACACTTGCTCACAATTGTAAATATATTGCAATAAATCAATC
TATTTTACTAATCATGCTAAACGTTTTAAAAAAGAAATAAAGAAATT

consensusID : consensus_7702#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 721
fasta sequence

                              [CTCGAAGCCAAAAATTGGCACGAGGTGTGTTTTGGTTGTGGTGGTGGATGTGCTTCTAATTTCTCGTTTTATTCACCACCTCGCCCCCACAATACTCTTAAGATTCAATGTATCAATTATTATTTATGATAATAACAATAAATATTGTACACAATCAAATTACAAAACATTTAGTTGCATACATATGGTTCTCTAATGTTTATAATTCATTCTAAATAAGTTTGTTGTTTTTTGGTTTCCACATTCTTTTTGTTTTCGTCGGTGTTTCTTTTATCTAATTAAAGACCTTTTTGGGAGGGGGGAGTTTCTTTTAAATATTCATTTTGTATTTATTTATTGTTTGTTTTGTAATTGACTTCACTTCCCTTCCTCCCGCCCTCTTTCTTTCTACCTCTTTGTTGAGGAGTTTTAATTGATTTCAAAAGTTTAATCCAAAGAAAAACTTATTCATAGAGGGGATTCACAAAAAAAATAAATAAACAGAACATAATCTTTGATAATTAATTTTAATGAAGATTATAGTTAAATATACTTATTTATACCTGTGAGTAGTATGTATTTCATATAGCCAAAACAGACCGATGAACACATATTGAAAAAGGGAAAAAAAGACAGTAAATTCAATATAAATTTTTGTGGAAGAAAATGTGACACAATTTGTTTTTCTCTCTGTTCCCTTTTTGATCCCATTCTCTATCTTTCCTTTNTTTTAAATTCCATA]

[+] EMBL CD082038             [CTCGAAGCCAAAAATTGGCACGAGGTGTGTTTTGGTTGTGGTGGTGGATGTGCTTCTAATTTCTCGTTTTATTCACCACCTCGCCCCCACAATACTCTTAAGATTCAATGTATCAATTATTATTTATGATAATAACAATAAATATTGTACACAATCAAATTACAAAACATTTAGTTGCATACATATGGTTCTCTAATGTTTATAATTCATTCTAAATAAGTTTGTTGTTTTTTGGTTTCCACATTCTTTTTGTTTTCGTCGGTGTTTCTTTTATCTAATTAAAGACCTTTTTGGGAGGGGGGAGTTTCTTTTAAATATTCATTTTGTATTTATTTATTGTTTGTTTTGTAATTGACTTCACTTCCCTTCCTCCCGCCCTCTTTCTTTCTACCTCTTTGTTGAGGAGTTTTAATTGATTTCAAAAGTTTAATCCAAAGAAAAACTTATTCATAGAGGGGATTCACAAAAAAAATAAATAAACAGAACATAATCTTTGATAATTAATTTTAATGAAGATTATAGTTAAATATACTTATTTATACCTGTGAGTAGTATGTATTTCATATAGCCAAAACAGACCGATGAACACATATTGAAAAAGGGAAAAAAAGACAGTAAATTCAATATAAATTTTTGTGGAAGAAAATGTGACACAATTTGTTTTTCTCTCTGTTCCCTTTTTGATCCCATTCTCTATCTTTCCTTTNTTTTAAATTCCATA]




>consensus_7702#1
CTCGAAGCCAAAAATTGGCACGAGGTGTGTTTTGGTTGTGGTGGTGGATGTGCTTCTAAT
TTCTCGTTTTATTCACCACCTCGCCCCCACAATACTCTTAAGATTCAATGTATCAATTAT
TATTTATGATAATAACAATAAATATTGTACACAATCAAATTACAAAACATTTAGTTGCAT
ACATATGGTTCTCTAATGTTTATAATTCATTCTAAATAAGTTTGTTGTTTTTTGGTTTCC
ACATTCTTTTTGTTTTCGTCGGTGTTTCTTTTATCTAATTAAAGACCTTTTTGGGAGGGG
GGAGTTTCTTTTAAATATTCATTTTGTATTTATTTATTGTTTGTTTTGTAATTGACTTCA
CTTCCCTTCCTCCCGCCCTCTTTCTTTCTACCTCTTTGTTGAGGAGTTTTAATTGATTTC
AAAAGTTTAATCCAAAGAAAAACTTATTCATAGAGGGGATTCACAAAAAAAATAAATAAA
CAGAACATAATCTTTGATAATTAATTTTAATGAAGATTATAGTTAAATATACTTATTTAT
ACCTGTGAGTAGTATGTATTTCATATAGCCAAAACAGACCGATGAACACATATTGAAAAA
GGGAAAAAAAGACAGTAAATTCAATATAAATTTTTGTGGAAGAAAATGTGACACAATTTG
TTTTTCTCTCTGTTCCCTTTTTGATCCCATTCTCTATCTTTCCTTTNTTTTAAATTCCAT
A

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_7702#0      -TCCGAGCCAAGATTCGGCACGAGGGAAAAAAATAAATAAACAGAACATAATCTT-TGAT 58
consensus_7702#1      CTCGAAGCCAAAAATTGGCACGAGGTGTGTTTTGGTTGTGGTGGTGGATGTGCTTCTAAT 60
                       **  ****** * * *********                  *   **   *** * **

consensus_7702#0      AATTAATTTTAATGAAGATTATAGTTAAATATACTTATTTATACCTGTGAGTAGTATGTA 118
consensus_7702#1      TTCTCGTTTTATTCACCACCTCGCCCCCACA-ATACTCTTAAGATTCAATGTATCAATTA 119
                         *  ***** * *  *          * * *     ***    *    ***  *  **

consensus_7702#0      TTTCATATAGCCAAAACAGACCGATGAACACATATTGAAAAAGGGAAAAAAAGACAGTAA 178
consensus_7702#1      TTATTTATGATAATAACAA--TAAATATTGTACACAATCAAATTACAAAACATTTAGTTG 177
                      **   ***    * ****     *  *    * *     ***    **** *   ***  

consensus_7702#0      ATTCAATATAAATTTTTGTGGAAGAAAATGTGACACAATTTGTTTTTCTCTCTGTTCCCT 238
consensus_7702#1      CATACATATGGTTCTCTAATGTTTATAATTCATTCTAAATAAGTTTGTTGTTTTTTGGTT 237
                        *  ****   * * *   *   * ***       ** *   ***  * * * **   *

consensus_7702#0      TTTTGATCCCATTCTCTATCTTTCCTTTTTTTTAAATTCCAATATACAA-TAGTCAGATC 297
consensus_7702#1      TCCACATTCTTTTTGTTTTCGTCGGTGTTTCTTTTATCTAATTAAAGACCTTTTTGGGAG 297
                      *    ** *  **   * ** *   * *** **  **   * ** * *  *  *  *   

consensus_7702#0      GGTATACTAAATTCTAGTTATACTGTATGTGTTCCCTTCTTATTTTATTTATCCAGTACC 357
consensus_7702#1      GGGGGAGTTTCTTTTAAATATTCATTTTGTATTTATTTATTGTTTGTTTTGTA-ATTGAC 356
                      **   * *   ** **  *** *  * *** **   ** ** ***  *** *  * *  *

consensus_7702#0      AACATCTTGGTTGAATACACT-TCTATATATTTACTGTACACATTGGGTAATTCTATGGG 416
consensus_7702#1      TTCACTTCCCTTCCTCCCGCCCTCTTTCTTTCTACC-TCTTTGTTGAGGAGTTTTA-ATT 414
                        **  *   **     * *  *** * * * ***  *     *** * * ** **    

consensus_7702#0      GGATTTTTTTGTTC--TCGAAAAATTAATTTTTGTGTTTCACCTTGGATATTAATTATGG 474
consensus_7702#1      GATTTCAAAAGTTTAATCCAAAGAAAAACTT-----ATTCATAGAGGGGATTCACAAAAA 469
                      *  **     ***   ** *** *  ** **      ****    **  *** *  *   

consensus_7702#0      GTGTTATTATTATTACTATTATTATTATTATTATTATTGTCAATTTATGATCGTTCTTTA 534
consensus_7702#1      AAATAAATAAACAGAACATAATCTTTGATA--ATTAATTTTAATG-AAGATTATAGTTAA 526
                         * * **     *  ** **  **  **  **** * * ***  * ***  *  ** *

consensus_7702#0      TTCATATTCATTTGTGATTTGTTGGTTACAAGTAAGTAGTCGATATTATTTGACTTCTTA 594
consensus_7702#1      AT-ATACTTATTTAT-ACCTGTGAGT----AGTATGTATTTCATATAGCCAAAACAGACC 580
                       * *** * **** * *  ***  **    **** *** *  ****      *       

consensus_7702#0      TATTTACATTGCTATCTTACCTTTCTATTAGCGCTATCACAATCTGGACTATCTTTATAA 654
consensus_7702#1      GATGAACA-----------CATATTGAAAAAGGGAAAAAAAGACAGTAAATTCAATATAA 629
                       **  ***           * * *  *  *  *  *  * *  * * *   **  *****

consensus_7702#0      TTATAATTCAATGTTTGTTTTTCGTTAAATTGTCCGGTCTCTTTTTTCCCTCCCCTTCGT 714
consensus_7702#1      ATTTTTGTGGAAGAAAAT-----GTGACACAATTTGTTTTTCTCTCTGTTCCCTTTTTGA 684
                       * *   *  * *    *     ** * *   *  * * *  * * *    **  ** * 

consensus_7702#0      CTCCGTTCTCTTTTATCCTCAGGTATCAAATTGTAAACAAATTCACAGTTGTTTTTTTTC 774
consensus_7702#1      TCCCATTCTCTATCTTTCCTTTNTTTTAAATTCCATA----------------------- 721
                        ** ****** *  * *     * * *****  * *                       

consensus_7702#0      TTTTGTTTTCTATGCTTGTGTGTGTGTGCTTACGCACTCATTGTTCGATGCACAAAAAGG 834
consensus_7702#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7702#0      AAAAGAGAAGTATGAAGTGTAATTTACACTTGCTCACAATTGTAAATATATTGCAATAAA 894
consensus_7702#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7702#0      TCAATCTATTTTACTAATCATGCTAAACGTTTTAAAAAAGAAATAAAGAAATT 947
consensus_7702#1      -----------------------------------------------------