Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7709 cluster # 7709       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7709#0 length = 680 sequences # 5  
consensusID : consensus_7709#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 680
fasta sequence 
                              [CAGTTAAGTCAACATTGGTGGGAAGGACAGTTAGCTTCAGATTTGAGTTGTAAACGTGGCCTAATACCACATTTATATGTTGTACCCAAAGCTGCTCTACTACACCTTGCAGCATGTGAAGATGATAATCACAGTAATGAAAACCAACTGTTAAATGAGATGACCATTGATCTTTCTAAAAAGAGTGGATGTACAGCAATTGATGGAAGTTTAACTAATTTAGATCATGTCGATGCCGATAATAATAATAATGATGATGATAATAAAAGTGTAACAGAAAATGGTAGTGTACTCAGTTGGAATTGTCCTTCTGAAAGTTCAAACGAAAATATTCTTTCCGATACTAATGATAATAAAGTACATCATTCATCACAATCTGAAACTCCGATTTCAATAACTGACAAATCAAATCAATTAGAAACTATAACTGTGTCTAAAACTATTCGCGACACTTCTATTCTCAAAGGGACTTCTTCAATGATTGAGATTTCTGATAAAGGTGTAAAACCGACTAGTTCTAAGGAAAGTTCAAATACTACTTCAGAATCTCCCGAATCTAAAGATAAGAAGTCTTTACAAGAATTTGGTTATTCAGATAAACTTGTGATGCACCGGTTTAATAATCGTTATACTATTAGTTATCCAGCCTTTGGACCTTTAGGTTCTGTTCCTGAAAATGA]

[+] EMBL CD117018             [CAGTTAAGTCAACATTGGTGGGAAGGACAGTTAGCTTCAGATTTGAGTTGTAAACGTGGCCTAATACCACATTTATATGTTGTACCCAAAGCTGCTCTACTACACCTTGCAGCATGTGAAGATGATAATCACAGTAATGAAAACCAACTGTTAAATGAGATGACCATTGATCTTTCTAAAAAGAGTGGATGTACAGCAATTGATGGAAGTTTAACTAATTTAGATCATGTCGATGCCGATAATAATAATAATGATGATGATAATAAAAGTGTAACAGAAAATGGTAGTGTACTCAGTTGGAATTGTCCTTCTGAAAGTTCAAACGAAAATATTCTTTCCGATACTAATGATAATAAAGTACATCATTCATCACAATCTGAAACTCCGATTTCAATAACTGACAAATCAAATCAATTAGAAACTATAACTGTGTCTAAAACTATTCGCGACACTTCTATTCACAAAGGGACTTCTTCAATGATTGAGATTTCTGATAAAGGTGTAAAACCGACTAGTTCTAAGGAAAGTTCAAATACTACTTCAGAATCTCCCGAATCTAAAGATAAGAAGTCTTTACAAGAATTTGGTTATTCAGATAAACTTGTGATGCACCGGTTTAATAATCGTTATACTAT                                             ]
[+] EMBL CD116670             [CAGTTAAGTCAACATTGGTGGGAAGGACAGTTAGCTTCAGATTTGAGTTGTAAACGTGGCCTAATACCACATTTATATGTTGTACCCAAAGCTGCTCTACTACACCTTGCAGCATGTGAAGATGATAATCACAGTAATGAAAACCAACTGTTAAATGAGATGACCATTGATCTTTCTAAAAAGAGTGGATGTACAGCAATTGATGGAAGTTTAACTAATTTAGATCATGTCGATGCCGATAATAATAATAATGATGATGATAATAAAAGTGTAACAGAAAATGGTAGTGTACTCAGTTGGAATTGTCCTTCTGAAAG TCANACGAna                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD116930             [                                                                                                                                                                                    AAGAGTGGATGTACAGCAATTGATGGAAGTTTATCTAATTTAGATCATGTCGATGCCGATAATAATAATAATGATGATGATAATAAAAGTGTAACAGAAAATGGTAGTGTACTCAGTTGGAATTGTCCTTGTGAAAGTTCAAACGAAAATATTCTTTCCGATACTAATGATAATAAAGTACATCATTCTTCCCAATCTGAAACTCCGATTTCAATAACTGACAAATCAAATCAATTAGAAACTATAACTGTGTCTAAAACTATTCGCGACACTTCTATTCTCAAAGGGACTTCTTCAATGATTGAGATTTCTGATAAAGGTGTAAAACCGACTAGTTCTAAGGAAAGTTCAAATACTACTTCAGAATCTCCCGAATCTAAAGATAAGAAGTCTTTACAAGAATTTGGTTATTCAGATAAACTTGTGATGCACCGGTTTAATAATCGTTATACTATTAGTTATCCAGCCTTTGGACCTTTAGGTTCTGTTCCTGAAAATGA]
[-] EMBL CD117444             [                                                                                                                                                                                     AGAGTGGATGTACACCAATTGATGGAAGTTTAACTAATTTAGATCATGTCGATGCCGATAATAATAATAATGATGATGATAATAAAAGTGTAACAGAAAATGGTAGTGTACTCAGTTGGAATTGTCCTTCTGAAAGTTCAAACGAAAATATTCTTTCCGATACTAATGATAATAAAGTACATCATTCATCACAATCTGAAACTCCGATTTCAATAACTGACAAATCAAATCAATTAGAAACTATAACTGTGTCTAAAACTATTCGCGACACTTCTATTCTCAAAGGGACTTCTTCAATGATTGAGATTTCTGATAAAGGTGTAAAACCGACTAGTTCTAAGGAAAGTTCAAATACTACTTCAGAATCTCCCGAATCTAAAGATAAGAAGTCTTTACAAGAATTTGGTTATTCAGATAAACTTGTGATGCACCGGTTTAATAATCGTTATACTATTAGTTATCCAGCCTTTGGACCTTTAGGTTCTGTTCCTGAAAATGA]
[-] EMBL CD117226             [                                                                                                                                                                                                                       TAATTTAGATCATGTCGATGCCGATAATAATAATAATGATGATGATAATAAAAGTGTAACAGAAAATGGTAGTGTACTCAGTTGGAATTGTCCTTCTGAAAGTTCAAACGAAAATATTCTTTCCGATACTAATGATAATAAAGTACATCATTCATCACAATCTGAAACTCCGATTTCAATAACTGACAAATCAAATCAATTAGAAACTATAACTGTGTCTAAAACTATTCGCGACACTTCTATTCTCAAAGGGACTTCTTCAATGATTGAGATTTCTGATAAAGGTGTAAAACCGACTAGTTCTAAGGAAAGTTCAAATACTACTTCAGAATCTCCCGAATCTAAAGATAAGAAGTCTTTACAAGAATTTGGTTATTCAGATAAACTTGTGATGCACCGGTTTAATAATCGTTATACTATTAGTTATCCAGCCTTTGGACCTTTAGGTTCTGTTCCTGAAAATGA]




>consensus_7709#0
CAGTTAAGTCAACATTGGTGGGAAGGACAGTTAGCTTCAGATTTGAGTTGTAAACGTGGC
CTAATACCACATTTATATGTTGTACCCAAAGCTGCTCTACTACACCTTGCAGCATGTGAA
GATGATAATCACAGTAATGAAAACCAACTGTTAAATGAGATGACCATTGATCTTTCTAAA
AAGAGTGGATGTACAGCAATTGATGGAAGTTTAACTAATTTAGATCATGTCGATGCCGAT
AATAATAATAATGATGATGATAATAAAAGTGTAACAGAAAATGGTAGTGTACTCAGTTGG
AATTGTCCTTCTGAAAGTTCAAACGAAAATATTCTTTCCGATACTAATGATAATAAAGTA
CATCATTCATCACAATCTGAAACTCCGATTTCAATAACTGACAAATCAAATCAATTAGAA
ACTATAACTGTGTCTAAAACTATTCGCGACACTTCTATTCTCAAAGGGACTTCTTCAATG
ATTGAGATTTCTGATAAAGGTGTAAAACCGACTAGTTCTAAGGAAAGTTCAAATACTACT
TCAGAATCTCCCGAATCTAAAGATAAGAAGTCTTTACAAGAATTTGGTTATTCAGATAAA
CTTGTGATGCACCGGTTTAATAATCGTTATACTATTAGTTATCCAGCCTTTGGACCTTTA
GGTTCTGTTCCTGAAAATGA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)