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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7761#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 618 fasta sequence
[TTGCAATTGTGTTGGATATAATTGACTGAATAGCAAATTAGCATTTGTCGACATACCCGTATAATTATAGGTGACAGGATTTGATTTCGTTGTACTTATTGTTGTCATTGAAGTAGGAATAGTGGCAGGAAGCAATGACAATGAACTTGGATTTAAAACATTTTGAAATGTTAAAGTATTTGTACCTTGTTGGTTTGACTGTATTTGTTGGGACTGTTGTTGTTGCTGTAATAATGGAAGTAATGCTAATATGGACGTATCAAACAATGGAATTTGATTAATCGAATTAGCTGCAGATGTTGTAGTCACAATTTTATCCAATGCTTTCGTCGTATTCATATTGGACTGTACAGGGCTAGATGATAACAAACTCAATGGTATACAACCTGTATTGATTGAGGATTTTGTTTCGCTAATTACACCGTCAATAATTCCTTGTGACTTATAATCTTGTTTTGTTGATTTTGTATTCAAAGAACCTGTATGATAGTCCATGGAATCAGATGTTTCATTATGTAAAGACAAGTCTAATGCATCAGCTTCATTTGAAGTACTTTGTTGTGTAGTCGAAGATTCCAGAGATATTGCACTCAATATAGGCTTTTTTTTCATTGAGCA]
[+] EMBL CD152993 [TTGCAATTGTGTTGGATATAATTGACTGAATAGCAAATTAGCATTTGTCGACATACCCGTATAATTATAGGTGACAGGATTTGATTTCGTTGTACTTATTGTTGTCATTGAAGTAGGAATAGTGGCAGGAAGCAATGACAATGAACTTGGATTTAAAACATTTTGAAATGTTAAAGTATTTGTACCTTGTTGGTTTGACTGTATTTGTTGGGACTGTTGTTGTTGCTGTAATAATGGAAGTAATGCTAATATGGACGTATCAAACAATGGAATTTGATTAATCGAATTAGCTGCAGATGTTGTAGTCACAATTTTATCCAATGCTTTCGTCGTATTCATATTGGACTGTACAGGGCTAGATGATAACAAACTCAATGGTATACAACCTGCATTGATTGAGGATTTTGTTTCGCTAATTACACCGTCAATAATTCCTTGTGACTTATAATCTTGTTTTGTTGATTNTGTATTCAAAGAACCTGTATGATAGTCCATGGAATCAGATGTTTCATTATGTAAAGACAAGTCTAATGCATCAGCTTCATTTGAAGTACTTTGTT ]
[-] EMBL CD166353 [ ATTTCGTTGTACTTATTGTTGTCATTGAAGTAGGAATAGTGGCAGGAAGCAATGACAATGAACTTGGATTTAAAACATTTTGAAATGTTAAAGTATTTGTACCTTGTTGGTTTGACTGTATTTGTTGGGACTGTTGTTGTTGCTGTAATAATGGAAGTAATGCTAATATGGACGTATCAAACAATGGAATTTGATTAATCGAATTAGCTGCAGATGTTGTAGTCACAATTTTATCCAATGCTTTCGTCGTATTCATATTGGACTGTACAGGGCTAGATGATAACAAACTCAATGGTATACAACCTGTATTGATTGAGGATTTTGTTTCGCTAATTACACCGTCAATAATTCCTTGTGACTTATAATCTTGTTTTGTTGATTTTGTATTCAAAGAACCTGTATGATAGTCCATGGAATCAGATGTTTCATTATGTAAAGACAAGTTTAATGCATCAGCTCCATTTGAAGTACTTTGTTGTGTAGTCGAAGATT ]
[+] EMBL CD146895 [ ACTTATTGTTGTCATTGAAGTAGGAATAGTGGCAGGAAGCAATGACAATGAACTTGGATTTAAAACATTTTGAAATGTTAAAGTATTTGTACCTTGTTGGTTTGACTGTATTTGTTGGGACTGTTGTTGGTGCTGTAATAATGGAAGTAATGCTAATATGGACGTATCAAACAATGGAATTTGATTAATCGAATTAGCTGCAGATGTTGTAGTCACAATTTTATCCAATGCTTTCGTCGTATTCATATTGGACTGTACAGGGCTAGATGATAACAAACTCAATGGTATACAACCTGTATTGATTGAGGATTTTGTTTCGCTAATTACACCGTCAATAATTCCTTGTGACTTATAATCTTGTTTTGTTGATTTTGTATTCAAAGAACCTGTATGATAGTCCATGGAATCAGATGTTTTATTATGTAAAGACAAGTCT ]
[+] EMBL CD187261 [ GGACTGTTGTTGTTGCTGTACTAATGGAAGTAATGCTAATATGGACGTATCAAACAATGGAATTTGATTAATCGAATTATCTGCAGATGTTGTACTCACAATTTTATCCCATGCTTTCGTCCTATACATATTGGACTGTACAGGGCTAGATTATAACAAACTCAATGGTATACAACCTGTATTGATCGAGGATTTTGTTTCGCTAATTACACCGTCAATAATTCCTTGTGACTTATAATCTTGTTTTGTCGATATTGTATTCAAAGAACCTGTATG ]
[-] EMBL BG931809 [ gattcGTTGCTGTAATAATGGAAGTAATGCTAATATGGACGTATCAAACAATGGAATTTGATTAATCGAAATAGCTGCAGATGTTGTAGTCACAATTTTATCCAATGCTTTCGTCGTATTCATATTGGACTGTACAGGGCTAGATGATAACAAACTCAATGGTATACAACCTGTATTGATTGAGGATTTTGTTTCGCTAATTACACCGTCAATAATTCCTTGTGACTTATAATCTTGTTTTGTTGATTTTGTATTCAAAGAACCTGTATGATAGTCCATGGAATCAGATGTTTCATTATGTAAAGACAAGTCTAATGCATCAGCTTCATTTGAAGTACTTTGTTGTGTAGTCGAAGATTCCAGAGATATTGCACTCAATATAGGCTTTTTTTTCATTGAGCA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||