cluster # 7809

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Schistosoma mansoni
cluster # 7809 cluster # 7809 Sequences # 5 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7809#0 length = 395 sequences # 5

consensusID : consensus_7809#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 395
fasta sequence

                              [AACTTTATATTCAATGAATTA-GTACAA-GTGTAATTAATATAGTTAGTAATAAACGAAATTTATCCTACCTAAAGTGGTTAAATATAGGAAAGATGTTTTGATGATATTATGTTCGTCAGGACTTAGCATCCTATGAAGAGGCCGAATCAAAGAACTGGCAATGTAGATGGTTTATAGCTGAGCTATTGGATGCATCGATTCCATGCAGTCGACACATAAACTAGCAATGACCACAGATAACTACAACCTTAATAATCCTCAGTAGCATGATCGTATTGAGGAATTAATGGTTTGGATAGGTTTCAGGATTATTTCACTGGTCCCACAGAGACCTCAGTGGAATCAGTTGCAGTTAGGTCCGATACCAATTCATAAGGGGAATGAACACTTCAGGT]

[+] EMBL CD134536             [AACTTTATATTCAATGAATTACGTACAACGTGTAATTAATATAGTTAGTAATAAACGAAATTTATCCTACCTAAAGTGGTTAAATATAGGAAAGATGTTTTGATGATATTATGTTCGTCAGGACTTAGCATCCTATGAAGAGGCCGAATCAAAGAACTGGCAATGTAGATGGTTTATAGCTGAGCTATTGGATGCATCGATTCCATGCAGTCGACACATAAACTAGCAATGACCACAGATAACTACAACCTTAATAATCCTCAGTAGCATGATCGTATTGAGGAATTAATGGTTTGGATAGGTTTCAGGATTATTTCACTGGTCCCACAGAGACCTCAGTGGAATCAGTTGCAGTTAGGTCCGATACCca                           ]
[+] EMBL CD134534             [AACTTTATATTCAATGAATTA GTACAA GTGTAATTAATATAGTTAGTAATAAACGAGATTTATCCTACCTAAAGTGGTTAAATATAGGAAAGATGTTTTGATGATATTATGTTCGTCAGGACTTAGCATCCTATGAAGAGGCCGAATCAAAGAACTGGCAATGTAGATGGTTTATAGCTGAGCTATTGGATGCATCGATTCCATGCAGTCGACACATAAACTAGCAATGACCACAGATAACTACAACCTTAATAATCCTCAGTAGCATGATCGTATTGAGGAATTAATGGTTTGGATAGGTTTCAGGATTATTTCACTGGTCCCACAGAGACCTCAGT                                                         ]
[+] EMBL CD134485             [ ACTTTATATTCAATGAATTA GTACAA GTGTAATTAATATAGTTAGTAATAAACGAAATTTATCCTACCTAAAGTGGTTAAATATAGGAAAGATGTTTTGATGATATTATGTTCGTCAGGACTTAGCATCCTATGAAGAGGCCGAATCAAAGAACTGGCAATGTAGATAGTTTATAGCTGAGCTATTGGATGCATCGATTCCATGCAGTCGACACATAAACTAGCAATGACCACAGATAACTACAACCTTAATAATCCTCAGTAGCATGATCGTATTGAGGAATTAATGGTTTGGATAGGTTTCAGGATTATTTCACTGGTCCCACAGAGACCTCAGTGGAATCAGTTGCAGTTAGGTCCGATACCAATTCATAAGGGGAATGAACACTTCAGGT]
[+] EMBL CD134538             [ ACTTTATATTCGATGAATTA GTACAA GTGTAATTAATATAGTTAGTAATAAACGAAATTTATCCTACCTAAAGTGGTTAAATATAGGAAAGATGTTTTGATGATATTATGTTCGTCAGGACTTAGCATCCTATGAAGAGGCCGAATCAAAGAACTGGCAATGTAGATGGTTTATAGCTGAGCTATTGGATGCATCGATTCCATGCAGTCGACACATAAACTAGCAATGACCACAGATAACTACAACCTTAATAATCCTCAGTAGCATGATCGTATTGAGGAATTAATGGTTTGGATAGGTTTCAGGATTATTTCACTGGTCCCACAGAGACCTCAGTGGAATCAGTTGCAGTTAGGTCCGATACCAATTCATAAGGGGA               ]
[+] EMBL CD134515             [ ACTTTATATTCAATGAATTA GTACAA GTGTAATTAATATAGTTAGTAATAAACGAAATTTATCCTACCTAAAGTGGTTAAATATAGGAAAGATGTTTTGATGATATTATGTTCGTCAGGACTTAGCATCCTATGAAGAGGCCGAATCAAAGAACTGGCAATGTAGATGGTTTATAGCTGAGCTATTGGATGCATCGATTCCATGCAGTCGACACATAAACTAACAATGACCACAGATAACTACAACCTTAATAATCCTCAGTAGCATGATCGTATTGAGGAATTAATGGTTTGGATAGGTTTCAGGATTATTTCACTGGTCCCACAGAGACCTCAGTGGAATCAGTTGCAGTTAG                                       ]




>consensus_7809#0
AACTTTATATTCAATGAATTAGTACAAGTGTAATTAATATAGTTAGTAATAAACGAAATT
TATCCTACCTAAAGTGGTTAAATATAGGAAAGATGTTTTGATGATATTATGTTCGTCAGG
ACTTAGCATCCTATGAAGAGGCCGAATCAAAGAACTGGCAATGTAGATGGTTTATAGCTG
AGCTATTGGATGCATCGATTCCATGCAGTCGACACATAAACTAGCAATGACCACAGATAA
CTACAACCTTAATAATCCTCAGTAGCATGATCGTATTGAGGAATTAATGGTTTGGATAGG
TTTCAGGATTATTTCACTGGTCCCACAGAGACCTCAGTGGAATCAGTTGCAGTTAGGTCC
GATACCAATTCATAAGGGGAATGAACACTTCAGGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case