cluster # 7820

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Schistosoma mansoni
cluster # 7820 cluster # 7820 Sequences # 5 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7820#0 length = 445 sequences # 5

consensusID : consensus_7820#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 445
fasta sequence

                              [CGTTGATTAGTAGTCAATGTGACTAATGAAGATTGATTTTGATGGAAACCATTTCCAAGAGTATTATTCGTATTGTTAGAACATGGTAGGACAGAACGAAGAAGCATTCCTCCACTTGGAGTTGAGTTGGTGAAACTTCTTCCAAATGTATTCGACATTGACTGATGTTGTGGTGCAGCGATAATTTGCTGTCCAGTCGGTGATTGAAATATGATCTGTTGTGGATGTTGTTGTTGCGGTTGTGGTGTAAAACAACCATGGATTGTTTGATACTGTGGTGGAGTACCAACGCCGCCACCACCAACAGGAACAGCAGCAGCGGTAGCGGGTGAAAGTTGAAC-TTTCTG-TG-NTGNTGCTGCTNGTGCTGNTGATAGTGTGTAGGATGAGGCGTCAATGCAGCAGAGAATTGATGT-GGGTG-TGTACATAATG-CCGATTCAATTGGTTA]

[+] EMBL CD115837             [CGTTGATTAGTAGTCAATGTGACTAATGAAGATTGATTTTGATGGAAACCATTTCCAAGAGTATTATTCGTATTGTTAGAACATGGTAGGACAGAACGAAGAAGCATTCCTCCACTTGGAGTTGAGTTGGTGAAACTTCTTCCAAATGTATTCGACATTGACTGATGTTGTGGTGCAGCGATAATTTGCTGTCCAGTCGGTGATTGAAATATGATCTGTTGTGGATGTTGTTGTTGCGGTTGTGGTGTAAAACAACCATGGATTGTTTGATACTGTGGTGGAGTACCAACGCCGCCACCACCAACAGGAACAGCAGCAGCGGCAGCGGGTGAAAGTTGAAC TTTCTGTTG TTGTTGCTGCTGTTGCTGTTGATAGTGTGTAGGATGAGGCGTCAATGCAGCAGAGAATAGATGT GGTTGTTGTACATAATG CCGATTCAATTGGTTA]
[+] EMBL CD130377             [                 TGTGACTAATGAAGATTGATTTTGATGGAAACCATTTCCAAGAGTATTATTCGTATTGTTAGAACATGGTAGGACAGAACGAAGAAGCATTCCTCCACTTGGAGTTGAGTTGGTGAAACTTCTTCCAAATGTATTCGACATTGACTGATGTTGTGGTGCAGCGATAATTTGCTGTCCAGTCGGTGATTGAAATATGATCTGTTGTGGATGTTGTTGTTGCGGTTGTGGTGTAAAACAACCATGGATTGTTTGATACTGTGGT                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD130435             [                                   ATTTTGATGGAAACCATTTCCAAGAGTATTATTCGTATTGTTAGAACATGGTAGGACAGAACGAAGAAGCATTCTTCCACTTGGAGTTGAGTTGGTGAAACTTCTTCCAAATGTATTCGACATTGACTGATGTTGTGGTGCAGCGTTAATTTGCTGTCCAGTCGGTGATTGAAATATGATCTGTTGTGGATGTTGTTGTTGCGGTTGTGGTGTAAAACAACCATGGATTGTTTGATACTGTGGTGGAGTACCAACGCCGCCACCACCAACAGGAACAGCAGCAGCGGTAGCGGGTGAAAGTTGAACTTTTCTG TG NTGNTGCTGCTNGTGCTGNTGATAGTGTGTAGGATGAGGCGTNCATGCAGCAGAGAATTGATGTNGGGTG TGTACATAATGCCCGAT           ]
[+] EMBL CD130235             [                                   ATTTTGATGGAAACCATTTCCAAGAGTATTATTCGTATTGTTAGAACATGGTAGGACAGAACGAAGAAGCATTCCTCCACTTGGAGTTGAGTTGGTGAAACTTCTTCCAAATGTATTCGACATTGACTGATGTTGTGGTGCAGCGATAATTTGCTGTCCAGTCGGTGATTGAAATATGATCTGTTGTGGATGTTGTTGTTGCGGTTGTGGTGTAAAACAACCATGGATTGTTTGATACTGTGGTGGAGTACCAACGCCGCCACCACCAACAGGAACAGCAGCAGCGGTAGCGAGTGAAAGTTGAAC TTTCTGNTGNNTG TGCTGCTNGTGCTGNTGATAGTGTGTAGGATGAGGCGTCAATGCAGCAGAGAATTGATGN TGGTGNTGTACATAATG CCG             ]
[+] EMBL CD196030             [                                                                   TCGTATTGTTAGAACATGGTAGGACAGAACGAAGAAGCATTCCTCCACTTGGAGTTGAGTTGGAGAAACTTCTTCCAAATGTATTCGACATTGACTGATGTTGTGGTGCAGCGATAATTTGCTGTCCAGTCGGTGATTGAAATATGATCTGTTGTGGATGTTGTTGTTGCGGTTGTGGTGT AAACAACCATGGATTGTTTGATACTGTGGTGGAGTACC ACGCCGCCACCACC ACA GAACAGCAGCAGCGGTAGCG                                                                                                                            ]




>consensus_7820#0
CGTTGATTAGTAGTCAATGTGACTAATGAAGATTGATTTTGATGGAAACCATTTCCAAGA
GTATTATTCGTATTGTTAGAACATGGTAGGACAGAACGAAGAAGCATTCCTCCACTTGGA
GTTGAGTTGGTGAAACTTCTTCCAAATGTATTCGACATTGACTGATGTTGTGGTGCAGCG
ATAATTTGCTGTCCAGTCGGTGATTGAAATATGATCTGTTGTGGATGTTGTTGTTGCGGT
TGTGGTGTAAAACAACCATGGATTGTTTGATACTGTGGTGGAGTACCAACGCCGCCACCA
CCAACAGGAACAGCAGCAGCGGTAGCGGGTGAAAGTTGAACTTTCTGTGNTGNTGCTGCT
NGTGCTGNTGATAGTGTGTAGGATGAGGCGTCAATGCAGCAGAGAATTGATGTGGGTGTG
TACATAATGCCGATTCAATTGGTTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case