cluster # 7833

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Schistosoma mansoni
cluster # 7833 cluster # 7833 Sequences # 5 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7833#0 length = 401 sequences # 5

consensusID : consensus_7833#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 401
fasta sequence

                              [GTCTATGTGTGCTGCTTCGATGTCCGATGGGTCCAGTGGGACTGGTCTGTTCAAAAGTTCTTGATGATGCTCTATCCACCTATTCAGCTGTTCTTGAACCTCAGTGATTGGCTTGCCTTCTTTGTTATTGACTAGTCCCTCTGGTTTGTCGTATTTTTCTGTTGGTTTCTTTGTTATATCATATATCTGTCTCATATATTCTTCTCTTGCAGCCTTCGCTGTCATTGTTAGGTCTCCTACGTATTTCCGCTTATCGGCTTCAATGCTACTCTCCACCTTCTTGTTTGCTTCTGTTTAGTCGGCGTGTGCCTTAAATGTCTTTGCCCTAGTTCGACTGCTGTTGATTGCTGTCTTCTTGTTCTTCCTTTATTGAATCTTGGCCAGCTTATCGATGGTGGTTC]

[+] EMBL CD119037             [GTCTATGTGTGCTGCTTCGATGTCCGGTGGGTCCAGTGGGACTGGTCTGTTCAAAAGTTCTTGATGATGCTCTATCCACCTATTCAGCTGTTCTTGAACCTCAGTGATTGGCTTGCCTTCTTTGTTATTGACTAGTCCCTCTGGTTTGTCGTATTTTTCTGTTGGTTTCTTTGTTATATCATATATCTGTCTCATATATTCTTCTCTTGCAGCCTTCGCTGTCATTGTTAGGTCTCCTACGTATTTCCGCTTATCGGCTTCAATGCTACTCTCCACCTTCTTGTTTGCTTCTGTTTAGTCGGCGTGTGCCTTAAATGTCTTTGCCCTAGTTCGACTGCTGTTGATTGCTGTCTTCTTGTTCTTCCTTTATTGAATCTTGGCCAGCTTATCGATGGTGGTT ]
[+] EMBL CD119058             [GTCTATGTGTGCTGCTTCGATGTCCGATGGGTCCAGTGGGACTGGTCTGTTCAAAAGTTCTTGATGATGCTCTATCCACCTATTCAGCTGTTCTTGAACCTCAGTGATTGGCTTGCCTTCTTTGTTATTGACTAGTCCCTCTGGTTTGTCGTATTTTTCTGTTGGTTTCTTTGTTATATCATATATCTGTCTCATATATTCTTCTCTTGCAGCCTTCGCTGTCATTGTTAGGTCTCCTACGTATTTCCGCTTATCGGCTTCAATGCTACTCTCCACCTTCTTGTTTGCTTCTGTTTAGTCGGCGTGTGCCTTAATTGTCTTTGCCCTAGTTCGACTGCTGTTGATTGCTGTCTTCTTGTTCTTCCTTTATTGAATCTTGGCCAGCTTATCGATGGTGGTT ]
[-] EMBL CD090210             [ TCTATGTGTGCTGCTTCGATGTCCGATGGGTCCAGTGGGACTGGTCTGTTCAAAAGTTCTTGATGATGCTCTATCCACCTATTCAGCTGTTCTTGAACCTCAGTGATTGGCTTGCCTTCTTTGTTATTGACTAGTCCCTCTGGTTTGTCGTATTTTTCTGTTGGTTTCTTTGTTATATCATATATCTGTCTCATATATTCTTCTCTTGCAGCCTTCGCTGTCATTGTTAGGTCTTCTACGTATTTCCGCTTATCGGCTTCAATGCTACTCTCCACCTTCTTGTTTGCTTCTGTTTAGTCGGCGTGTGCCTTAAATGTCTTTGCCCTAGTTCGACTGCTGTTGATTGCTGTCTTCTTGTTCTTCCTTTATTGAATCTTGGCCAGCTTATCGATGGTGGTTC]
[-] EMBL CD192521             [ TCTATGTGTGCTGCTTCAATGTCCGATGGGTCCAGTGGGACTGGTCTGTTCAAAAGTTCTTGATGATGCTCTATCCACCTATTCAGCTGTTCTTGAACCTCAGTGATTGGCTTGCCTTCTTTGTTATTGACTAGTCCCTCTGGTTTGTCGTATTTTTCTGTTGGTTTCTTTGTTATATCATATATCTGTCTCATATATTCTTCTCTTGCAGCCTTCGCTGTCATTGTTAGGTCTTCTACGTATTTCCGCTTATCGGCTTCAATGCTACTCTCCACCTTCTTGTTTGCTTCTGTTTAGTCGGt                                                                                                  ]
[+] EMBL CD148184             [                                                                                                                                                                                                                                                             TCGGCTTCAATGCTACTCTCCACCTTCTTGTTTGCTTCTGTTTAGTCGGCGTGTGCCTTAAATGTCTTTGCCCTAGTTCGACTGCTGTTGATTGCTGTCTTCTTGTTCTTCCTTTATTGAATCTTGGCCAGCTTATCGATG       ]




>consensus_7833#0
GTCTATGTGTGCTGCTTCGATGTCCGATGGGTCCAGTGGGACTGGTCTGTTCAAAAGTTC
TTGATGATGCTCTATCCACCTATTCAGCTGTTCTTGAACCTCAGTGATTGGCTTGCCTTC
TTTGTTATTGACTAGTCCCTCTGGTTTGTCGTATTTTTCTGTTGGTTTCTTTGTTATATC
ATATATCTGTCTCATATATTCTTCTCTTGCAGCCTTCGCTGTCATTGTTAGGTCTCCTAC
GTATTTCCGCTTATCGGCTTCAATGCTACTCTCCACCTTCTTGTTTGCTTCTGTTTAGTC
GGCGTGTGCCTTAAATGTCTTTGCCCTAGTTCGACTGCTGTTGATTGCTGTCTTCTTGTT
CTTCCTTTATTGAATCTTGGCCAGCTTATCGATGGTGGTTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case