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Schistosoma mansoni
cluster # 7958 cluster # 7958       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7958#0 length = 920 sequences # 6  
consensusID : consensus_7958#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 920
fasta sequence 
                              [CGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAATCATCATCATGTATATTTTAATTTTAATCACACTAAAAATAGTCAACTTTATTCTTTTTTTACGATTTAAACTTGAGTTAATTTATTTTGTTTGTCTATTTTCTTATTCTCTGAAGGAGTGGCTTTCATTACAATCAGTTATTTAAGCAAAATCATGGAATTCATAAGATTGTTCATGACTTACTTGATCAGAAAATGAAAAGATATTAATAACAACAACAACAACAAAAATGAAATGATAATTGCAAAATAAGAATTATTTTGAAGGAACTACATAATAAGTGAAAGATAAATGTTACAAAAAATTGAAAGATATGATTAGTTTCTATTGTTTTATTGTTATTCTCCTTTAGTTTTGATAGTATTTTATTCCGCCGAAATACCCAAACTAATACGTACACTTCGAAGTGCTAGACTATTGAAACGTGCTTTATCTTCACGCCATGTTTTTGCTGCATCCACATTAGCTGCACTCTCATCATTCGGTTCTGCAAGCATACTAACAACAGATAATAAAATTTTTTCTACTGATTGAACTGGACTCCAACGTTCAACGGAACTTTCATAACCCATTGGATCATCACCAGGAGCATGAAGTATGGAAATGCATACGCGTCCATCTGGATAGATATTTGGATGGAACACTTCAGTTAGAAACTGCATTTTTGGTGGAGACAAAGGATAATCTGATGGGAAGTTTAAACGTACAGCGAAAACACCACCTTCAAATGGAGTACCCTCTGGTCCAGCAATTAATGCTTCCCACTCAAAAAAATTCCTTTCATCCACTGGTCCAGCAACAATACCCTCTGGTGGGTTGACTGTTAATTGTTTGTACTCTGCCATGAGTCTTTTCAAAGCATTGC]

[+] EMBL AI975872             [CGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAATCATCATCATGTATATTTTAATTTTAATCACACTAAAAATAGTCAACTTTATTCTTTTTTTACGATTTAAACTTGAGTTAATTTATTTTGTTTGTCTATTTTCTTATTCTCTGAAGGAGTGGCTTTCATTACAATCAGTTATTTAAGCAAAATCATGGAATTCATAAGATTGTTCATGACTTACTTGATCAGAAAATGAAAAGATATTAATAACAACAACAACAACAAAAATGAAATGATAATTGCAAAATAAGAATTATTTTGAAGGAACTACATAATAAGTGAAAGATAAATGTTACAAAAAATTGAAAGATATGATTAGTTTCTATTGTTTTATTGATATTCTCCTTTAGTTTTGATAGTATTTTATTCCGCCGAAATACCCAAACTAATACGTACACTTCGAAGTGCTAGACTATTGAAACGTGCTTTATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD077123             [                                                       CATCATCATGTATATTTTAATTTTAATCACACTAAAAATAGTCAACTTTATTCTTTTTTTACGATTTAAACTTGAGTTAATTTATTTTGTTTGCCTATTTTCTTATTCTCTGAAGGAGTGGCTTTCATTACAATCAGTTATTTAAGCAAAATCATGGAATTCATAAGATTGTTCATGACTTACTTGATCAGAAAATGAAAAGATATTAATAACAACAACAACAACAAAAATGAAATGATAATTGCAAAATAAGAATTATTTTGAAGGAACTACATAATAAGTGAAAGATAAATGTTACAAAAAATTGAAAGATATGATTAGTTTCTATTGTTTTATTGTTATTCTCCTTTAGTTTTGATAGTATTTTATTCCGCCGAAATACCCAAACTAATACGTACACTTCGAAGTGCTAGACTATTGAAACGTGCTTTATCTTCACGCCATGTTTTTGCTGCATCCACATTAGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD073266             [                                                                                                                            ACTTGAGTTAATTTATTTTGTTTGTCTATTTTCTTATTCTCTGAAGGAGTGGCTTTCATTACAATCAGTTATTTAAGCAAAATCATGGAATTCATAAGATTGTTCATGACTTACTTGATCAGAAAATGAAAAGATATTAATAACAACAACAACAACAAAAATGAAATGATAATTGCAAAATAAGAATTATTTTGAAGGAACTACATAATAAGTGAAAGATAAATGTTACAAAAAATTGAAAGATATGATTAGTTTCTATTGTTTTATTGTTATTCTCCTTTAGTTTTGATAGTATTTTATTCCGCCGAAATACCCAAACTAATACGTACACTTCGAAGTGCTAGACTATTGAAACGTGCTTTATCTTCACGCCATGTTTTTGCTGCATCCACATTAGCTGCACTCTCATCATTCGGTTCTGCAAGCATACTAACAACAGATAATAAAATTTTTTCTACTGATTGAACTGGACTCCAACGTTCAACGGAACTTTCATAACCCATTGGATCATCACCAGGAGCATGAAGTATGGAAATGCATACGCGTCCATCTGGATAGATATTTGGATGGAACACTTCAGTTAGAAACTGCATTTTTGGTGGAGAC AAGGATAATCT                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD078806             [                                                                                                                                                                                                                                                                   ATTAATANCANCANCANCAACAANAATGAAATGATAATTGCAAAATAAGAATTATTNTGAAGGAACTACATAATAAGTGAAAGATAAATGTTACAAAAAATTGAAAGATATGATTAGTTTCTATTGTTTTATTGTTATTCTCCTTTAGTTTTGATAGTATTTTATTCCGCCGAAATACCCAAACTAATACGTACACTTCGAAGTGCTAGACTATTGAAACGTGCTTTATCTTCACGCCATGTTTTTGCTGCATCCACATTAGCTGCACTCTCATCATTCGGTTCTGCAAGCATACTAACAACAGATAATAAAATTTTTTCTACTGATTGAACTGGACTCCAACGTTCAACGGAACTTTCATAACCCATTGGATCATCACCAGGAGCATGAAGTATGGAAATGCATACGCGTCCATCTGGATAGATATTTGGATGGAACACTTCAGTTAGAAACTGCATTTTTGGTGGAGACAAAGGATAATCTGATGGGAAGTTTAAACGTACAGCGAAAACACCACCTTCAAATGGAGTACCCTCTGGTCCAGCAATTAATGCTTCCCACTCAAAAAAATTCCTTTCATCCACTGGTCCAGCAAC                                                                 ]
[+] EMBL CD167281             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTGGATCATCACCAGGAGCATGAAGTATGGAAATGTGTACGCGTCCATCTGGATAGATATTTGGATGGAACACTTCAGTTAGAAACTGCATTTTTGGTGGAGACAAAGGATAATCTGATGGGAAGTTTAAACGTACAGCGAAAACACCACCTTCAAATGGAGTACCCTCTGGTCCAGCAATTAATGCTTCCCACTCAAAAAAATTCCTTTCATCCACTGGTCCAGCAACAATACCCTCTGGTGGGTTGACTGTTAATTGTTTGTACTCTGCCATGAGTCTTTTCAAAGCATTGC]
[+] EMBL CD128434             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGGATCATCACCAGGAGCATGAAGTATGGAAATGCATACGCGTCCATCTGGATAGATATTTGGATGGAACACTTCAGTTAGAAACTGCATTTTTGGTGGAGACAAAGGATAATCTGATGGGAAGTTTAAACGTACAGCGAAAACACCACCTTCAAATGGAGTACCCTCTGGTCCAGCAATTAATGCTTCCCACTCAAAAAAATTCCTTTCATCCACTGGTCCAGCAACAATACCCTCTGGTGGGTTGACTGTTAATTGTTTGTACTCTGCCATGAGTCTTTTCAAAGCATTGC]




>consensus_7958#0
CGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAATCATCA
TCATGTATATTTTAATTTTAATCACACTAAAAATAGTCAACTTTATTCTTTTTTTACGAT
TTAAACTTGAGTTAATTTATTTTGTTTGTCTATTTTCTTATTCTCTGAAGGAGTGGCTTT
CATTACAATCAGTTATTTAAGCAAAATCATGGAATTCATAAGATTGTTCATGACTTACTT
GATCAGAAAATGAAAAGATATTAATAACAACAACAACAACAAAAATGAAATGATAATTGC
AAAATAAGAATTATTTTGAAGGAACTACATAATAAGTGAAAGATAAATGTTACAAAAAAT
TGAAAGATATGATTAGTTTCTATTGTTTTATTGTTATTCTCCTTTAGTTTTGATAGTATT
TTATTCCGCCGAAATACCCAAACTAATACGTACACTTCGAAGTGCTAGACTATTGAAACG
TGCTTTATCTTCACGCCATGTTTTTGCTGCATCCACATTAGCTGCACTCTCATCATTCGG
TTCTGCAAGCATACTAACAACAGATAATAAAATTTTTTCTACTGATTGAACTGGACTCCA
ACGTTCAACGGAACTTTCATAACCCATTGGATCATCACCAGGAGCATGAAGTATGGAAAT
GCATACGCGTCCATCTGGATAGATATTTGGATGGAACACTTCAGTTAGAAACTGCATTTT
TGGTGGAGACAAAGGATAATCTGATGGGAAGTTTAAACGTACAGCGAAAACACCACCTTC
AAATGGAGTACCCTCTGGTCCAGCAATTAATGCTTCCCACTCAAAAAAATTCCTTTCATC
CACTGGTCCAGCAACAATACCCTCTGGTGGGTTGACTGTTAATTGTTTGTACTCTGCCAT
GAGTCTTTTCAAAGCATTGC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)