cluster # 8005

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Schistosoma mansoni
cluster # 8005 cluster # 8005 Sequences # 6 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_8005#0 length = 906 sequences # 6
consensusID : consensus_8005#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 906
fasta sequence
                              [ATATATGTATTTT--T-GTGGGACAATT--ATCGTCTC-GGTTTAAAGGGTT-AAGAACTGCAAAATAATTT-GGCGTAAAATTAAAACGAAAAATAAAGAAGTGAAAATCAGGATTTCAGGTTAAGCATAAGCGCAGATAAGAAAGGGATGATTATTCAAAAGCTTATTTATGTAATATGATTTATTAAATGAAACATTTACTTAAGAAGCATAAAATTATGTGTAACGAACTAAGTAGCAAGGGTAAAAACATGTGAACTTGACAATAATTAACAACTATACAGGTAAAACAAAATGACGCGGAAAGAAAACAATATTGAATAACGTAAGGCAACAGACATTGATGGCTAGTAGGAAGCATATAAGTCAATTTTTAGGAACATAAACAGTTGAGTCCCCAAATGTAAACACCGAAACACAAAAGCTACAAAAACATTTAAGATTTTCGTTTGATTCATATGAACTGAAAAAA-CAAGTAACTGTAATTACCGACTCACTAACAGATATATGTATATGAAAATATGAACGGAGTAGTACAGTGCAGGAATTAAGAAAATATGAGAAACAGGAAGTGTATGGTGACAACATTAAATATAATCAAAAATTAAGAGAATAATACTTTACATGTAATTTTAAAAATTATTTGAATTTTAGTAAGCAGGAAGTGGGAATAAATCAGAACAGCAGGAGGAAAGGGAAGTGATCTTCCAGTAATACATTACTTCCAAAATCAAATATCCTAAACAAAACATTGTGTAATTTTCTCAAGGGAAAGAGAAGCATATTAATTAGCTGAAAT-ATAATAGTATCAACGAACAAACAAATTCAGAAGATCCAATACAAAAGCATTGCTTTTCATCGTCTATTCTACTACCTTGNGAAACTTCCATGTGATGTAGGGAAGATGTGAAG]

[+] EMBL CD074195             [ATATATGTATTTT  T GTGGGACAATTTCATCGTCTCAGGTTTAAAGGGTTAAAGAACTGCAAAATAATTT GGCGTAAAATTAAAACGAAAAATAAAGAAGTGAAAATCAGGATTTCAGGTTAAGCATAAGCGCAGATAAGAAAGGGATGATTATTCAAAAGCTTATTTATGTAATATGATTTATTAAATGAAACATTTACTTAAGAAGCATAAAATTATGTGTAACGAACTAAGTAGCAAGGGTAAAAACATGTGAACTTGACAATAATTAACAACTATACAGGTAAAACAAAATGACGCGGAAAGAAAACAATATTGAATAACGTAAGGCAACAGACATTGATGGCTAGTAGGAAGCATATAAGTCAATTTTTAGGAACATAAACAGTTGAGTCCCCAAATGTAAACACCGAAACACAAAAGCTACAAAAACATTTAAGATTTTCGTTTGATTCATATGAACTGAAAAAA CAAGTAACTGTAATTACCGACTCACTAACAGATATATGTATATGAAAATATGAACGGAGTAGTACAGTGCAGGAATTAAGAAAATATGAGAAACAGGAAGTGTATGGTGACAACATTAAATATAATCAAAAATTAAGAGAAATATACTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD075024             [      taATTTTCCTAGTGGCAGAATT  ATGGNCTC GGTTTAAAGGGTT ATCAACTGCAAAATAATTTAGGCGTAAAATTAAAACGAAAAATAAAGAAGTGAAAATCAGGATTTCAGGTTAAGCATAAGCGCAGATTTGAACGGGATGATTATTCAAAAGCTTATTTATGTAATATGATTTATTAAATGAAACATTTACTTAAGAAGCATAAAATTATGTGTAACGAACTAAGTAGCAAGGGTAAAAACATGTGAACTTGACAATAATTAACAACTATACAGGTAAAACAAAATGACGCGGAAAGAAAACAATATTGAATAACGTAAGGCAACAGACATTGATGGCTAGTAGGAAGCATATAAGTCAATTTTTAGGAACATAAACAGTTGAGTCCCCAAATGTAAACACCGAAACACAAAAGCTACAAAAACATTTAAGATTTTCGTTTGATTCATATGAACTGAAAAAAGTAAGTAACTGTAATTACCGACTCACTAACAGATATATGTATATGAAAATATGAACGGAGTAGTACAGTGCAGGAATTAAGAAAATATGAGAAACAGGAAGTGTATGGTGACAACATTAAATATAATCAAAAATTAAGAGAATAATACTTTACATGTAATTTTAAAAATTATTTGAATTTTAGTAAGCAGGAAGTGGGAATAAATCAGAACAGCAGGAGGAAAGGGAAGTGATCTTCCAGTAATACATTACTTCCAAAATCAAATATCCTAAACAAAACATTGTGTAATTTTCTCAAGGGAAAGAGAAGCATATTAATTAGCTGAAAT ATAATAGTATCA                                                                                                     ]
[+] EMBL CD064659             [                                                                                                                                                                                                                                                                            TAATTAACAACTATACAGGTAAAACAAAATGACGCGGAAAGAAAACAATATTGAATAACGTAAGGCAACAGACATTGATGGCTAGTAGGAAGCATATAAGTCAATTTTTAGGAACATAAACAGTTGAGTCCCCAAATGTAAACACCGAAACACAAAAGCTACAAAAACATTTAAGATTTTCGTTTGATTCATATGAACTGAAAAAA CAAGTAACTGTAATTACCGACTCACTAACAGATATATGTATATGAAAATATGAACGGAGTAATACAGTGCAGGAATTAAGAAAATATGAGAAACAGGAAGTGTATGGTGACAACATTAAATATAATCAAAAATTAAGAGAATAATACTTTACATGTAATTTTAAAAATTATTTGAATTTTAGTAAGCAGGAAGTGGGAATAAATCAGAACAGCAGGAGGAAAGGGAAGTGATCTTCCAGTAATACATTACTTCCAAAATCAAATATCCTAAACAAAACATTGTGTAATTTTCTCAAGGGAAAGAGGAGCATATTAATTAGCTGAAATAATAATAGTATCGACGAACAAACAAATTCAGAAGATCCAATACAAAAGCATTGCTTTTCATCGTCTATTCTACTACCTTGNGAAACTTCCATGTGATGTAGGGAAGATGTGAAG]
[-] EMBL CD069167             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CAATATTGAATAACGTAAGGCAACAGACATTGATGGCTAGTAGGAAGCATATAAGTCAATTTTTAGGAACATAAACAGTTGAGTCCCCAAATGTAAACACCGAAACACAAAAGCTACAAAAACATTTAAGATTTTCGTTTGATTCATATGAACTGAAAAAA CAAGTAACTGTAATTACCGACTCACTAACAGATATATGTATATGAAAATATGAACGGAGTAGTACAGTGCAGGAATTAAGAAAATATGAGAAACAGGAAGTGTATGGTGACAACATTAAATATAATCAAAAATTAAGAGAATAATAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD069129             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CAATATTGAATAACGTAAGGCAACAGACATTGATGGCTAGTAGGAAGCATATAAGTCAATTTTTAGGAACATAAACAGTTGAGTCCCCAAATGTAAACACCGAAACACAAAAGCTACAAAAACATTTAAGATTTTCGTTTGATTCATATGAACTGAAAAAA CAAGTAACTGTAATTACCGACTCACTAACAGATATATGTATATGAAAATATGAACGGAGTAGTACAGTGCAGGAATTAAGAAAATATGAGAAACAGGAAGTGTATGGTGACAACATTAAATATAATCAAAAATTAAGAGAATAATAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL SM016                [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CATAAACAGTTGAGTCCCCAAATGTAAACACCGAAACACAAAAGCTACTTTTTCATTTAAGATTTTCGTTTGATTCATATGAACTGAAAAAA CAAGTAACTGTAATTACCGACTCACTAACAGATATATGTATATGAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]




>consensus_8005#0
ATATATGTATTTTTGTGGGACAATTATCGTCTCGGTTTAAAGGGTTAAGAACTGCAAAAT
AATTTGGCGTAAAATTAAAACGAAAAATAAAGAAGTGAAAATCAGGATTTCAGGTTAAGC
ATAAGCGCAGATAAGAAAGGGATGATTATTCAAAAGCTTATTTATGTAATATGATTTATT
AAATGAAACATTTACTTAAGAAGCATAAAATTATGTGTAACGAACTAAGTAGCAAGGGTA
AAAACATGTGAACTTGACAATAATTAACAACTATACAGGTAAAACAAAATGACGCGGAAA
GAAAACAATATTGAATAACGTAAGGCAACAGACATTGATGGCTAGTAGGAAGCATATAAG
TCAATTTTTAGGAACATAAACAGTTGAGTCCCCAAATGTAAACACCGAAACACAAAAGCT
ACAAAAACATTTAAGATTTTCGTTTGATTCATATGAACTGAAAAAACAAGTAACTGTAAT
TACCGACTCACTAACAGATATATGTATATGAAAATATGAACGGAGTAGTACAGTGCAGGA
ATTAAGAAAATATGAGAAACAGGAAGTGTATGGTGACAACATTAAATATAATCAAAAATT
AAGAGAATAATACTTTACATGTAATTTTAAAAATTATTTGAATTTTAGTAAGCAGGAAGT
GGGAATAAATCAGAACAGCAGGAGGAAAGGGAAGTGATCTTCCAGTAATACATTACTTCC
AAAATCAAATATCCTAAACAAAACATTGTGTAATTTTCTCAAGGGAAAGAGAAGCATATT
AATTAGCTGAAATATAATAGTATCAACGAACAAACAAATTCAGAAGATCCAATACAAAAG
CATTGCTTTTCATCGTCTATTCTACTACCTTGNGAAACTTCCATGTGATGTAGGGAAGAT
GTGAAG
clustalw multiple alignements is not computed in this case