cluster # 8139

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Schistosoma mansoni
cluster # 8139 cluster # 8139 Sequences # 6 consensus # 2

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consensus_8139#0 length = 939 sequences # 5

consensus_8139#1 length = 657 sequences # 1

consensusID : consensus_8139#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 939
fasta sequence

                              [TACATGATTTGGGTTTGTCTTTTGTTGGCCAGCGACATCGTGGTTTAGATGATGCTATTAATATACTACGTATCGTACGTGTACTATTATCTGATGGGTGTTCGCTACGTGTAAATGAACGTATTGATTTTGACAGACCTCCTTCTTTTGTCTCCTCTGTACCAAGGCATATGACGCAGGTCACATCAGGTTTAATGGGGAGCAAACTGGTTTTACTATCACCATCTCCAAGAAAAAACAAACCGAAGAGTTCCGAGATTAGTCGTCACAATCGTACTGTTGGAAACAAACACGTAACTCCAAGTGATCTTGACGACAGCAATCGAGAATCGTTATTATGGTTGGCCAATGTTCAGAAAACTCGGATAAACAGAGATAATTAAGCATGTTCAGATCTTCATATTTCATATACTCCCTCTTTCAATGTTTAGCGTAATAGTTGTCGTCTTTTTATCAGTTACATTTGTTTCTATTTTTATGCATAACTAATGTGTCCTACTGTATGCTTATTTTGACTGTTTTCTATTATTTGAATACTGTAAATCTACTGCACAGAAATATATGCAGTTGGAAGTTAGCAAATTGACCAGAAACTAAGTAACTTATTCGGTTGGATTATTTGCCTCTAAATATTTTTAAAAAGTAATTATGTGGAGATTTATTTTTCGTGTGTGTTTATGATTTCTCTCCCTAATTNTATGTTTTATTTTCAGCTTCTTACCAAAAAACCTGTATGATTGATTGCCTCAGCTGANAGGGAGTGATGATAATGAAATAGTTAACCAAACTTTTATTATTTGTTTTTTCTGCTTTCTATCAATTTCCTTTTTGACGTTATATGATAACGATGTGTAATCCTCATTATTTTTGTTGTCTTAAAAAAATTTCAGGTTTTATTGTGCCAACAAAATTTTGTGATAGCCTTGGGTTAATACCAAA]

[+] EMBL CD196029             [TACATGATTTGGGTTTGTCTTTTGTTGGCCAGCGACATCGTGGTTTAGATGATGCTATTAATATACTACGTATCGTACGTGTACTATTATCTGATGGGTGTTCGCTACGTGTAAATGAACGTATTGATTTTGACAGACCTCCTTCTTTTGTCTCCTCTGTACCAAGGCATATGACGCAGGTCACATCAGGTTTAATGAGGAGCAAACTGGTTTTACTATCACCATCTCCAAG ACAAACAAACCGAAGAGGTCGGAGATTAGTCGTCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD188298             [                    TTTGTTGGCCAGCGACATCGTGGTTTAGATGATGCTATTAATATACTACGTATCGTACGTGTACTATTATCTGATGGGTGTTCGCTACGTGTAAATGAACGTATTGATTTTGACAGACCTCCTTCTTTTGTCTCCTCTGTACCAAGGCATATGACTCAGGTCACATCAGGTTTAATGGGGAGCAAACTGGTTTTACTATCACCATCTCCAAGAAAAAACAAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AI976496             [                                                                                                                                                                    AGGCATATGACGCAGGTCACATCAGGTTTAATGGGGAGCAAACTGGTTTTACTATCACCATCTCCAAGAAAAAACAAACCGAAGAGTTCCGAGATTAGTCGTCACAATCGTACTGTTGGAAACAAACACGTAACTCCAAGTGATCTTGACGACAGCAATCGAGAATCGTTATTATGGTTAGCCAATGTTCAGAAAACTCGGATAAACAGAGATAATTAAGCATGTTCAGATCTTCATATTTCATATACTCCCTCTTTCAATGTTTAGCGTAATAGTTGTCGTCTTTTTATCAGTTACATTTGTTTCTATTTTTATGCATAACTAATGTGTCCTACTGTATGCTTATTTTGACTGTTTTCTATTATTTGAATACTGTAAATCTACTGCACAGAAATATATGCAGTTGGAAGTTAGCAAATTGACCAGAAACTAAGTAACTTATTCGGTTGGATTATTTGCCTCTAAATATTNNTAAAAAGTAATTATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD078443             [                                                                                                                                                                                                                   TTTACTATCACCATCTCCAAGAAAAAACAAACCGAAGAGTTCCGAGATTAGTCGTCACAATCGTACTGTTGGAAACAAACACGTAACTCCAAGTGATCTTGACGACAGCAATCGAGAATCGTTATTATGGTTGGCCAATGTTCAGAAAACTCGGATAAACAGAGATAATTAAGCATGTTCAGATCTTCATATTTCATATACTCCCTCTTTCAATGTTTAGCGTAATAGTTGTCGTCTTTTTATCAGTTACATTTGTTTCTATTTTTATGCATAACTAATGTGTCCTACTGTATGCTTATTTTGACTGTTTTCTATTATTTGAATACTGTAAATCTACTGCACAGAAATATATGCAGTTGGAAGTTAGCAAATTGACCAGAAACTAAGTAACTTATTCGGTTGGATTATTTGCCTCTAAATATTTTTAAAAAGTAATTATGTGGAGATTTATTTTTCGTGTGTGTTTATGATTTCTCTCCCTAATTNTATGTTTTATTTTCAGCTTCTTACCAAAAAACCTGTATGATTGATTGCCTCAGCTGANAGGGAGTGATGATAATGAAATAGTTAACCAAACTTT                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD178186             [                                                                                                                                                                                                                                    CAAGAAAAAACAAACCGAAGAGTTCCGAGATTAGTCGTCACAATCGTACTGTTGGAAACAAACACGTAACTCCAAGTGATCTTGACGACAGCAATCGAGAATCGTTATTATGGTTGGCCAATGTTCAGAAAACTCGGATAAACAGAGATAATTAAGCATGTTCAGATCTTCATATTTCATATACTCCCTCTTTCAATGTTTAGCGTAATAGTTGTCGTCTTTTTATCAGTTACATTTGTTTCTATTTTTATGCATAACTAATGTGTCCTACTGTATGCTTATTTTGACTGTTTTCTATTATTTGAATACTGTAAATCTACTGCACAGAAATATATGCAGTTGGAAGTTAGCAAACTGACCAGAAACTAAGTAACTTATTCGGTTGGATTATTTGCCTCTAAATATTTTTAAAAAGTAATTATGTGGAGATTTATTTTTCGTGTGTGTTTATGATTTCTCTCCCTAATTTTATGTTTTATTTTCAGCTTCTTACCAAAAAACCTGTATGATTGATTGCCTCAGCTGAAAGGGAGTGATGATAATGAAATAGTTAACCAAACTTTTATTATTTGTTTTTTCTGCTTTCTATCAATTTCCTTTTTGACGTTATATGATAACGATGTGTAATCCTCATTATTTTTGTTGTCTTAAAAAAATTTCAGGTTTTATTGTGCCAACAAAATTTTGTGATAGCCTTGGGTTAATACCAAA]




>consensus_8139#0
TACATGATTTGGGTTTGTCTTTTGTTGGCCAGCGACATCGTGGTTTAGATGATGCTATTA
ATATACTACGTATCGTACGTGTACTATTATCTGATGGGTGTTCGCTACGTGTAAATGAAC
GTATTGATTTTGACAGACCTCCTTCTTTTGTCTCCTCTGTACCAAGGCATATGACGCAGG
TCACATCAGGTTTAATGGGGAGCAAACTGGTTTTACTATCACCATCTCCAAGAAAAAACA
AACCGAAGAGTTCCGAGATTAGTCGTCACAATCGTACTGTTGGAAACAAACACGTAACTC
CAAGTGATCTTGACGACAGCAATCGAGAATCGTTATTATGGTTGGCCAATGTTCAGAAAA
CTCGGATAAACAGAGATAATTAAGCATGTTCAGATCTTCATATTTCATATACTCCCTCTT
TCAATGTTTAGCGTAATAGTTGTCGTCTTTTTATCAGTTACATTTGTTTCTATTTTTATG
CATAACTAATGTGTCCTACTGTATGCTTATTTTGACTGTTTTCTATTATTTGAATACTGT
AAATCTACTGCACAGAAATATATGCAGTTGGAAGTTAGCAAATTGACCAGAAACTAAGTA
ACTTATTCGGTTGGATTATTTGCCTCTAAATATTTTTAAAAAGTAATTATGTGGAGATTT
ATTTTTCGTGTGTGTTTATGATTTCTCTCCCTAATTNTATGTTTTATTTTCAGCTTCTTA
CCAAAAAACCTGTATGATTGATTGCCTCAGCTGANAGGGAGTGATGATAATGAAATAGTT
AACCAAACTTTTATTATTTGTTTTTTCTGCTTTCTATCAATTTCCTTTTTGACGTTATAT
GATAACGATGTGTAATCCTCATTATTTTTGTTGTCTTAAAAAAATTTCAGGTTTTATTGT
GCCAACAAAATTTTGTGATAGCCTTGGGTTAATACCAAA

consensusID : consensus_8139#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 657
fasta sequence

                              [CCCCCCTTTCTTTACATGTTTAAGGGAAAAAGTTGTGGTCCTTTTTATCAGTAACATTTGTTTCTAATTTTTATGCAAAAACTAATGTTGCCTACCCGTAGGCTTATTTTTGACTGGTTTTCAATTTTTTGGAACACTGTAATTCCTCCGCCCAGAAATATATGCCAGTTGGAAGTTAGCAACTTCGCCAGAAAACTAAGTACCTATCCGGGTTGAATTATTTGCCTTATAAATATTNTTAAAAAGTAATTATGTGAAGATTTATTTTTCGTGTGGGTCTATGATTTCTCTCCCTAATTTTATGTTTTATTTTCAGCTTCTTACCAAAAAACCTGTATGATTGATTGCCTCAGCTGAAAGGGAGTGATGATAATGAAATAGTTAACCAAACTTTTATTATTTGTTTTTCAGCTTTCTATCAGTTTCCTTTTGACGTTATATGATAGCCATGTGTAATCCTCATTATTTTTGTTGTCTTAAAAAAATTTCAGGTTTTATTGTGCACACAAGAATTTTGTGATAGCCTATGGATTAATACCACAAAATCCTTTCTTCCTATGCTCCTTATCTGTATGTATTAGCTTCTTTTATTTAGAACTTTTTGTTCAAATACTTTTATTATGGACTGATGCGATGTAATATAGAGTAATTGAATTA]

[-] EMBL CD076898             [CCCCCCTTTCTTTACATGTTTAAGGGAAAAAGTTGTGGTCCTTTTTATCAGTAACATTTGTTTCTAATTTTTATGCAAAAACTAATGTTGCCTACCCGTAGGCTTATTTTTGACTGGTTTTCAATTTTTTGGAACACTGTAATTCCTCCGCCCAGAAATATATGCCAGTTGGAAGTTAGCAACTTCGCCAGAAAACTAAGTACCTATCCGGGTTGAATTATTTGCCTTATAAATATTNTTAAAAAGTAATTATGTGAAGATTTATTTTTCGTGTGGGTCTATGATTTCTCTCCCTAATTTTATGTTTTATTTTCAGCTTCTTACCAAAAAACCTGTATGATTGATTGCCTCAGCTGAAAGGGAGTGATGATAATGAAATAGTTAACCAAACTTTTATTATTTGTTTTTCAGCTTTCTATCAGTTTCCTTTTGACGTTATATGATAGCCATGTGTAATCCTCATTATTTTTGTTGTCTTAAAAAAATTTCAGGTTTTATTGTGCACACAAGAATTTTGTGATAGCCTATGGATTAATACCACAAAATCCTTTCTTCCTATGCTCCTTATCTGTATGTATTAGCTTCTTTTATTTAGAACTTTTTGTTCAAATACTTTTATTATGGACTGATGCGATGTAATATAGAGTAATTGAATTA]




>consensus_8139#1
CCCCCCTTTCTTTACATGTTTAAGGGAAAAAGTTGTGGTCCTTTTTATCAGTAACATTTG
TTTCTAATTTTTATGCAAAAACTAATGTTGCCTACCCGTAGGCTTATTTTTGACTGGTTT
TCAATTTTTTGGAACACTGTAATTCCTCCGCCCAGAAATATATGCCAGTTGGAAGTTAGC
AACTTCGCCAGAAAACTAAGTACCTATCCGGGTTGAATTATTTGCCTTATAAATATTNTT
AAAAAGTAATTATGTGAAGATTTATTTTTCGTGTGGGTCTATGATTTCTCTCCCTAATTT
TATGTTTTATTTTCAGCTTCTTACCAAAAAACCTGTATGATTGATTGCCTCAGCTGAAAG
GGAGTGATGATAATGAAATAGTTAACCAAACTTTTATTATTTGTTTTTCAGCTTTCTATC
AGTTTCCTTTTGACGTTATATGATAGCCATGTGTAATCCTCATTATTTTTGTTGTCTTAA
AAAAATTTCAGGTTTTATTGTGCACACAAGAATTTTGTGATAGCCTATGGATTAATACCA
CAAAATCCTTTCTTCCTATGCTCCTTATCTGTATGTATTAGCTTCTTTTATTTAGAACTT
TTTGTTCAAATACTTTTATTATGGACTGATGCGATGTAATATAGAGTAATTGAATTA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_8139#0      TACATGATTTGGGTTTGTCTTTTGTTGGCCAGCGACATCGTGGTTTAGATGATGCTATTA 60
consensus_8139#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8139#0      ATATACTACGTATCGTACGTGTACTATTATCTGATGGGTGTTCGCTACGTGTAAATGAAC 120
consensus_8139#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8139#0      GTATTGATTTTGACAGACCTCCTTCTTTTGTCTCCTCTGTACCAAGGCATATGACGCAGG 180
consensus_8139#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8139#0      TCACATCAGGTTTAATGGGGAGCAAACTGGTTTTACTATCACCATCTCCAAGAAAAAACA 240
consensus_8139#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8139#0      AACCGAAGAGTTCCGAGATTAGTCGTCACAATCGTACTGTTGGAAACAAACACGTAACTC 300
consensus_8139#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8139#0      CAAGTGATCTTGACGACAGCAATCGAGAATCGTTATTATGGTTGGCCAATGTTCAGAAAA 360
consensus_8139#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8139#0      CTCGGATAAACAGAGATAATTAAGCATGTTCAGATCTTCATATTTCATATACTCCCTCTT 420
consensus_8139#1      ------------------------------------------------CCCCCCTTTCTT 12
                                                                         * *  ****

consensus_8139#0      TCAATGTTTA-GCGTAATAGTTGTCGTC-TTTTTATCAGTTACATTTGTTTCTA-TTTTT 477
consensus_8139#1      TACATGTTTAAGGGAAAAAGTTGTGGTCCTTTTTATCAGTAACATTTGTTTCTAATTTTT 72
                      *  ******* * * ** ****** *** *********** ************* *****

consensus_8139#0      ATGCATAA-CTAATGTGTCCTACT-GTATGCTTATTTT-GACTG-TTTTCTATTATTTG- 532
consensus_8139#1      ATGCAAAAACTAATGTTGCCTACCCGTAGGCTTATTTTTGACTGGTTTTCAATTTTTTGG 132
                      ***** ** *******  *****  *** ********* ***** ***** *** **** 

consensus_8139#0      AATACTGTAAATCTACTGCACAGAAATATATGC-AGTTGGAAGTTAGCAAATTGACCAGA 591
consensus_8139#1      AACACTGTAATTCCTCCGCCCAGAAATATATGCCAGTTGGAAGTTAGCAACTTCGCCAGA 192
                      ** ******* **  * ** ************* **************** **  *****

consensus_8139#0      AA-CTAAGTAACTTATTCGGTTGGATTATTTGCCTC-TAAATATTTTTAAAAAGTAATTA 649
consensus_8139#1      AAACTAAGTACCTATCCGGGTTGAATTATTTGCCTTATAAATATTNTTAAAAAGTAATTA 252
                      ** ******* **     ***** ***********  ******** **************

consensus_8139#0      TGTGGAGATTTATTTTTCGTGTGTGTTTATGATTTCTCTCCCTAATTNTATGTTTTATTT 709
consensus_8139#1      TGTGAAGATTTATTTTTCGTGTGGGTCTATGATTTCTCTCCCTAATTTTATGTTTTATTT 312
                      **** ****************** ** ******************** ************

consensus_8139#0      TCAGCTTCTTACCAAAAAACCTGTATGATTGATTGCCTCAGCTGANAGGGAGTGATGATA 769
consensus_8139#1      TCAGCTTCTTACCAAAAAACCTGTATGATTGATTGCCTCAGCTGAAAGGGAGTGATGATA 372
                      ********************************************* **************

consensus_8139#0      ATGAAATAGTTAACCAAACTTTTATTATTTGTTTTTTCTGCTTTCTATCAATTTCCTTTT 829
consensus_8139#1      ATGAAATAGTTAACCAAACTTTTATTATTTGTTTTT-CAGCTTTCTATCAGTTTCCTTTT 431
                      ************************************ * *********** *********

consensus_8139#0      TGACGTTATATGATAACGATGTGTAATCCTCATTATTTTTGTTGTCTTAAAAAAATTTCA 889
consensus_8139#1      -GACGTTATATGATAGCCATGTGTAATCCTCATTATTTTTGTTGTCTTAAAAAAATTTCA 490
                       ************** * ******************************************

consensus_8139#0      GGTTTTATTGTGCCAACAA-AATTTTGTGATAGCCT-TGGGTTAATACCAAA-------- 939
consensus_8139#1      GGTTTTATTGTGCACACAAGAATTTTGTGATAGCCTATGGATTAATACCACAAAATCCTT 550
                      *************  **** **************** *** ********* *        

consensus_8139#0      ------------------------------------------------------------
consensus_8139#1      TCTTCCTATGCTCCTTATCTGTATGTATTAGCTTCTTTTATTTAGAACTTTTTGTTCAAA 610
                                                                                  

consensus_8139#0      -----------------------------------------------
consensus_8139#1      TACTTTTATTATGGACTGATGCGATGTAATATAGAGTAATTGAATTA 657