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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8165#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 748 fasta sequence
[TCAAAGAGTACAAGATAATTGGGCTTTCTTGTTCGCTCAACGCTTAGCATTGAAATTTAAAGTCCCACTACACGTTTGTTTCTGTTTGGTTCCGAAATTTCAAGCCGAAACGTTACGACATTATACCTTTATGGTTGAAGGATTGAAAGAAGTAGAGAAAGAATGTCGTGAACTTTGTATACCATTTCATATTACATCAGCTATCACTAACAGCTCATCGAACAATCAGCCAGTCAAAACGGGCGTTAAGCGTAAATTACCGGAATCGGTGAATGATTATTGTCACGCTGATACAGTCGCTCAGTCCGTTTTAAGTTTGATACAAAGTGTTAATATCAGCTGTATCATAACAGATTTTTTTCCTTTACGTGAACCTACAGCTTGGATAAAACAGTTGGCTGAACTGCTACCAGAAAATATTCCGTTTTGTCAGGTGGATGCACATAATGTTGTTCCTGTTTGGCATGCATCAGATCACTTAGAATATGCGGCTCGTACAATTAGACCTAAATTACATCAAAAAGCAAACAACTTAATGACTGAGTTCCCGCCGTTGATTAGACATCCCTACTGCCATCAATCAAGTTTATCACCAATAGATTGGAATTATTGGATATCAAAATTTTCGGGAGATTTATCAGTTAAACCAGTTGATTGGGCAATTCCAGGAACCAGTGGGGGTCTCACAACGTTACACACATTCATTTATGAAAGACTGCCTAAATACGCTGATTGTCGTAACGACCCC]
[+] EMBL CD120736 [TCAAAGAGTACAAGATAATTGGGCTTTCTTGTTCGCTCAACGCTTAGCATTGAAATTTAAAGTCCCACTACACGTTTGTTTCTGTTTGGTTCCGAAATTTCAAGCCGAAACGTTACGACATTATACCTTTATGGTTGAAGGATTGAAAGAAGTAGAGAAAGAATGTCGTGAACTTTGTATACCATTTCATATTACATCAGCTATCACTAACAGCTCATCGAACAATCAGCCAGTCAAAACGGGCGTTAAGCGTAAATTACCGGAATCGGTGAATGATTATTGTCACGCTGATACAGTCGCTCAGTCCGTTTTAAGTTTGATACAAAGTGTTAATATCAGCTGTATCATAACAGATTTTTTTCCTTTACGTGAACCTACAGCTTGGATAAAACAGTTGGCTGAACTGCTACCAGAAAATATTCCGTTTTGTCAGGTGGATGCACATAATGTTGTTCCTGTTTGGCATGCATCAGATCACTTAGAATATGCGGCTC ]
[+] EMBL CD130400 [ GAACAATCAGCCAGTCAAAACGGGCGTTAAGCGTAAATTACCGGAGTCGGTGAATGATTATTGTCACGCTGATACAGTCGCTCAGTCCGTTTTAAGTTTGATACAAAGTGTTAATATCAGCTGTATCATAACAGATTTTTTTCCTTTACGTGAACCTACAGCTTGGATAAAACAGTT GCTGAACTGCTACCAGAAAATATTCCGTTTTGTCAGGTGGATGCACATAATGTTGTTCCTGTTTGGCATGC ]
[-] EMBL CD130306 [ AACAATCAGCCAGTCAAAACGGGCGTTAAGCGTAAATTACCGGAATCGGTGAATGATTATTGTCACGCTGATACAGTCGCTCAGTCCGTTTTAAGTTTGATACAAAGTGTTAATATCAGCTGTATCATAACAGATTTTTTTCCTTTACGTGAACCTACAGCTTGGATAAAACAGTTGGCTGAACTGCTACCAGAAAATATTCCGTTTTGTCAGGTGGATGCACATAATGTTGTTCCTGTTTGGCATGCATCAGATC CCTAGAATATGCGG ]
[+] EMBL CD079042 [ CCAGTCAAAACGGGCGTTAAGCGTAAATTACCGGAATCGGTGAATGATTATTGTCACGCTGATACAGTCGCTCAGTCCGTTTTAAGTTTGATACAAAGTGTTAATATCAGCTGTATCATAACAGATTTTTTTCCTTTACGTGAACCTACAGCTTGGATAAAACAGTTGGCTGAACTGCTACCAGAAAATATTCCGTTTTGTCAGGTGGATGCACATAATGTTGTTCCTGTTTGGCATGCATCAGATCACTTAGAATATGCGGCTCGTACAATTAGACCTAAATTACATCAAAAAGCAAACAACTTAATGACTGAGTTCCCGCCGTTGATTAGACATCCCTACTGCCATCAATCAAGTTTATCACCAATAGATTGGAATTATTGGATATCAAAATTTTCGGGAGATTTATCAGTTAAACCAGTTGATTGGGCAATTCCAGGAACCAGTGGGGGTCTCACAACGTTACACACATTCATTTATGAAAGACTGCCTAAATACGCTGATTGTCGTAACGACCC ]
[-] EMBL CD073495 [ CAGTCAAAACGGGCGTTAAGCGTAAATTACCGGAATCGGTGAATGATTATTGTCACGCTGATACAGTCGCTCAGTCCGTTTTAAGTTTGATACAAAGTGTTAATATCAGCTGTATCATAACAGATTTTTTTCCTTTACGTGAACCTACAGCTTGGATAAAACAGTTGGCTGAACTGCTACCAGAAAATATTCCGTTTTGTCAGGTGGATGCACATAATGTTGTTCCTGTTTGGCATGCATCAGATCACTTAGAATATGCGGCTCGTACAATTAGACCTAAATTACATCAAAAAGCAAACAACTTAATGACTGAGTTCCCGCCGTTGATTAGACATCCCTACTGCCATCAATCAAGTTTATCACCAATAGATTGGAATTATTGGATATCAAAATTTTCGGGAGATTTATCAGTTAAACCAGTTGATTGGGCAATTCCAGGAACCAGTGGGGGTCTCACAACGTTACACACATTCATTTATGAAAGACTGCCTAAATACGCTGATTGTCGTAACGACCCC]
[-] EMBL CD130379 [ TGAATGATTATTGTCACGCTGATACAGTCGCTCAGTCCGTTTTAAGTTTGATACAAAGTGTTAATATCAGCTGTATCATAACAGATTTTTTTCCTCTACGTGAACCTACAGCTTGGATAAAACAGTTGGCTGAACTGCTACCAGAAAATATTTCGTTTTGTCAGGTGGATGCACATAACGTTGTTCCTGTTTGGCATGCATCAGATCAC TAGAATATGCGG ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||