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Schistosoma mansoni
cluster # 8166 cluster # 8166       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8166#0 length = 869 sequences # 6  
consensusID : consensus_8166#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 869
fasta sequence 
                              [ATGTCGTCATCGAGAACTTCATTTGAATAAAAAAACATGCTGTGGTTCAATTAAAGCCTGTTGGGATTCTGCCTCTGGATGGTTTTGTGTATTATGTGTCGGTTTGTTAACAGGTTTCATTGCTTGTATCATTGATATTGGTTGTACTTGGATGTCTGATTTAAAAGAGGGTGTTTGTCTAGATGCATTTTGGTTCAACCGTGAACAGTGTTGTTGGTCATCAAGTCAAGCGGATGATGTCTGTGATCAATGGTATTCATGGTCTCGTCTTTTTATGAACAAAGATCCAACGGGTGAATATCCAGATGCTTACTTTGTTGGTTACCTGTTCTACATTATTTATGCTGTGTTATTTGCTCTAGTTTGTGTATTTCTTGTTCGTATGTTTGCTCCTTATGCTTGTGGTAGCGGTATTCCTGAAATTAAGACTATTCTTGGTGGATTCATTATACGTGGTTACTTAGGGAAATGGACTCTTCTGAT-AAATCGGTTGGTATGATTCTCGGAGTAAGTGCTGGTTTAAATCTTGGTAAAGAAGGACCCATGGTTCATATGGCTGCCTGTGTTGGAAACATATTTGCTCATTTCTTTCCCAAATATGGTCAGAATGAAGCTAAAAAACGTGAGATCCTTTCAGCTTCAGCGGCTGCTGGAGTTGCTGTTGCATTTGGTGCACCAATTGGTGGTGTTCTTTTTTCACTAGAAGAAGCTAGTTATTATTTTCCGATGAAAACAATGTTTCGATCATTTTTTTGTGCCATGGTATCAGCTAATGTTTTGCGTATTCTAAATCCATATGGTAGTGATAATATGATTATGTTCTATGTCGATTATCAAGCACAATGGCATGTAATGGAATTAATTCCATT]

[+] EMBL CD165896             [ATGTCGTCATCGAGAACTTCATTTGAATAAAAGAACATGCTGTGGTTCAATTAAAGCCTGTTGGGATTCTGCCTCTGGATGGTTTTGTGTATTATGTGTCGGTTTGTTAACAGGTTTCATTGCTTGTATCATTGACATTGGTTGTACTTGGATGTCTGATTTAAAAGAGGGTGTTTGTCTAGATGCATTTTGGTTCAACCGTGAACAGTGTTGTTGGTCATCAAGTCAAGCGGATGATGTCTGTGATCAATGGTATTCATGGTCTCGTCTTTTTATGAACAAAGATCCAACGGGTGAATATCCAGATGCTTACTTTGTTGGTTACCTGTTCTACATTATTTATGCTGTGTTATTTGCTCTAGTTTGTGTATTTCTTGTTCGTATGTTTGCTCCTTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD163992             [             GAACTTCATTTGAATAAAAAAACATGCTGTGGTTCAATTAAAGCCTGTTGGGATTCTGCCTCTGGATGGTTTTGTGTATTATGTGTCGGTTTGTTAACAGGTTTCATTGCTTGTATCATTGATATTGGTTGTACTTGGATGTCTGATTTAAAAGAGGGTGTTTGTCTAGATGCATTTTGGTTCAACCGTGAACAGTGTTGTTGGTCATCAAGTCAAGCGGATGATGTCTGTGATCAATGGTATTCATGGTCTCGTCTTTTTATGAACAAAGATCCAACGGGTGAATATCCAGATGCTTACTTTGTTGGTTACCTGTTCTACATTATTTATGCTGTGTTATTTGCTCTAGTTTGTGTATTTCTTGTTCGTATGTTTGCTCCTTATGCTTGTGGTAGCGGTATTCCTGAAATTAAGACTATTCTTGGTGGATTCATTATACGTGGTTACTTAAGGAAATGGACTCTTCTGAT AAATCGGTTGGTATGATTCTCGGAGTAAGTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD112638             [             GAACTTCATTTGAATAAAAAAACATGCTGTGGTTCAATTAAAGCCTGTTGGGATTCTGCCTCTGGATGGTTTTGTGTATTATGTGTCGGTTTGTTAACAGGTTTCATTGCTTGTATCATTGATATTGGTTGTACTTGGATGTCTGATTTAAAAGAGGGTGTTTGTCTAGATGCATTTTGGTTCAACCGTGAACAGTGTTGTTGGTCATCAAGTCAAGCGGATGATGTCTGTGATCAATGGTATTCATGGTCTCGTCTTTTTATGAACAAAGATCCAACGGGTGAATATCCAGATGCTTACTTTGTTGGTTACCTGTTCTACATTATTTATGCTGTGTTATTTGCTCTAGTTTGTGTATTTCTTGTTCGTATGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD197012             [                                                         CTGTTGGGATTCTGCCTCTGGATGTTTTTGTGTATTATGTGTCGGTTTGTTAACAGGTTTCATTGCTTGTATCATTGATATTGGTTGTACTTGGATGTCTGATTTAAAAGAGGGTGTTTGTCTAGATGCATTTTGGTTCAACCGTGAACAGTGTTGTTGGTCATCAAGTCAAGCGGATGATGTCTGTGATCAATGGTATTCATGGTCTCGTCTTTTTATGAACAAAGATCCAACGGGTGAATATCCAGATGCTTACTTTGTTGGTTACCTGTTCTACATTATTTATGCTGTGTTATTTGCTCTAGTTTGTGTATTTCTTGTTCGTATGTTTGCTCCTTATGCTTGTGGTAGCGGTATTCCTGAAATTAAGACTATTCTTGGTGGATTCATTATACGTGGTTACTTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD112102             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTCCTGAAATTAAGACTATTCTTGGTGGATTCATTATACGTGGTTACTTAGGGAAATGGACTCTTCTGATAAAATCGGTTGGTATGATTCTCGGAGTAGGTGCTGGTTTAAATCTTGGTAAAGAAGGACCCATGGTTCATATGGCTGCCTGTGTTGGAAACATATTTGCTCATTTCTTTCCCAAATATGGTCAGAATGAAGCTAAAAAACGTGAGATCCTTTCAGCTTCAGCGGCTGCTGGAGTTGCTGTTGCATTTGGTGCACCAATTGGTGGTGTTCTTTTTTCACTAGAAGAAGCTAGTTATTATTTTCCGATGAAAACAATGTTTCGATCATTTTTTTGTGCCATGGTATCAGCTAATGTTTTGCGTATTCTAAATCCATATGGTAGTGATAATATGATTATGTTCTATGTC                                         ]
[-] EMBL CD126506             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGGTTTAAATCTTGGTAAAGAAGGACCCATGGTTCATATGGCTGCCTGTGTTGGAAATATATTTGCTCATTTCTTTCCCAAATATGGTCAGAATGAAGCTAAAAAACGTGAGATCCTTTCAGCTTCAGCGGCTGCTGGAGTTGCTGTTGCATTTGGTGCACCAATTGGTGGTGTTCTTTTTTCACTAGAAGAAGCTAGTTATTATTTTCCGATGAAAACAATGTTTCGATCATTTTTTTGTGCCATGGTATCAGCTAATGTTTTGCGTATTTTAAATCCATATGGTAGTGATAATATGATTATGTTCTATGTCGATTATCAAGCACAATGGCATGTAATGGAATTAATTCCATT]




>consensus_8166#0
ATGTCGTCATCGAGAACTTCATTTGAATAAAAAAACATGCTGTGGTTCAATTAAAGCCTG
TTGGGATTCTGCCTCTGGATGGTTTTGTGTATTATGTGTCGGTTTGTTAACAGGTTTCAT
TGCTTGTATCATTGATATTGGTTGTACTTGGATGTCTGATTTAAAAGAGGGTGTTTGTCT
AGATGCATTTTGGTTCAACCGTGAACAGTGTTGTTGGTCATCAAGTCAAGCGGATGATGT
CTGTGATCAATGGTATTCATGGTCTCGTCTTTTTATGAACAAAGATCCAACGGGTGAATA
TCCAGATGCTTACTTTGTTGGTTACCTGTTCTACATTATTTATGCTGTGTTATTTGCTCT
AGTTTGTGTATTTCTTGTTCGTATGTTTGCTCCTTATGCTTGTGGTAGCGGTATTCCTGA
AATTAAGACTATTCTTGGTGGATTCATTATACGTGGTTACTTAGGGAAATGGACTCTTCT
GATAAATCGGTTGGTATGATTCTCGGAGTAAGTGCTGGTTTAAATCTTGGTAAAGAAGGA
CCCATGGTTCATATGGCTGCCTGTGTTGGAAACATATTTGCTCATTTCTTTCCCAAATAT
GGTCAGAATGAAGCTAAAAAACGTGAGATCCTTTCAGCTTCAGCGGCTGCTGGAGTTGCT
GTTGCATTTGGTGCACCAATTGGTGGTGTTCTTTTTTCACTAGAAGAAGCTAGTTATTAT
TTTCCGATGAAAACAATGTTTCGATCATTTTTTTGTGCCATGGTATCAGCTAATGTTTTG
CGTATTCTAAATCCATATGGTAGTGATAATATGATTATGTTCTATGTCGATTATCAAGCA
CAATGGCATGTAATGGAATTAATTCCATT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)