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Schistosoma mansoni
cluster # 8188 cluster # 8188       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8188#0 length = 923 sequences # 6  
consensusID : consensus_8188#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 923
fasta sequence 
                              [AGTAGATCCAAATATTATCGGAACTTCTAGTATCGATACTACATGCACTATCTGGGCCCTTGAAACGGAGCAGGTGATCGGCCATGCAAATGTCGTAAGTGGACGCGTAGAATCTCAGTTAATAGCCCATGACAAAGAAGTATATGACATAGCTTTCAGTCGTGCTGGAGGCGGAAGAGATGTTTTCGCTAGTGTTGGCGCAGATGGTTCTGTACGTATGTTTGATCTTCGGCATTTGGAGCATTCTAATATTGTGTATGAGGATTCAAATCATTCCCCACTTTTACGCTTAGCTTGGAATAAACAAGATGCAAATTATCTAGCGACATTTGCAATGGACTCCGTAGAAATAATTATTTTAGATTTACGCGTACCATGCACTCCAGTAGCTCGTTTAAACAATCATAGAGCATTTGTAAATGGATTAGCATGGGCACCACATTCAAGTTGTCATTTATGTACTGCATCTGAAGATTGTCAAGCTCTTATCTGGGATATTCAGTCAATGCCAAGAGCAATAGAAGATCCTATTCTAGCATATACAGCTGCC-GGTGAAATTAATCAAATCCAATGGTCGTCAACACAACCAGATTGGATAGCTATTTGTTATAATAATTCGTTAGAAATTTTACGAGTATAATGTTTACTGTTTATTTCTTATTTTATCAACTGATTTAAAGGTATCCTATAATTATGATCAAATGTTATTTCTTCCTTTATGCTTACTAATTATCGTATGTTATTTTCATGCGTTTCATTATTATTCTTTTCTAAATATTCTGGATAATTTAACTGAGTACTATTATCGAGATACATGTGTTGGTTCTAGTAAAAGTAAGTCTTGACTACATATGAATCAATTTCAAATGTTTTGTATATTTACTTAAAAAAATATTTGTGTTTGTCTAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CD079085             [AGTAGATCCAAATATTATCGGAACTTCTAGTATCGATACTACATGCACTATCTGGGCCCTTGAAACGGAGCAGGTGATCGGCCATGCAAATGTCGTAAGTGGACGCGTAGAATCTCAGTTAATAGCCCATGACAAAGAAGTATATGACATAGCTTTCAGTCGTGCTGGAGGCGGAAGAGATGTTTTCGCTAGTGTTGGCGCAGATGGTTCTGTACGTATGTTTGATCTTCGGCATTTGGAGCATTCTAATATTGTGTATGAGGATTCAAATCATTCCCCACTTTTACGCTTAGCTTGGAATAAACAAGATGCAAATTATCTAGCGACATTTGCAATGGACTCCGTAGAAATAATTATTTTAGATTTACGCGTACCATGCACTCCAGTAGCTCGTTTAAACAATCATAGAGCATTTGTAAATGGATTAGCATGGGCACCACATTCAAGTTGTCATTTATGTACTGCATCTGAAGATTGTCAAGCTCTTATCTGGGATATTCAGTCAATGCCAAGAGCAATAGAAGATCCTATTCTAGCATATACAGCTGCC GGTGAAATTAATCANATCCAATGGTCGTCAACACAACCAGATTGGATAGCTATTTGNTATAATAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD079075             [AGTAGATCCAAATATTATCGGAACTTCTAGTATCGATACTACATGCACTATCTGGGCCCTTGAAACGGAGCAGGTGATCGGCCATGCAAATGTCGTAAGTGGACGCGTAGAATCTCAGTTAATAGCCCATGACAAAGAAGTATATGACATAGCTTTCAGTCGTGCTGGAGGCGGAAGAGATGTTTTCGCTAGTGTTGGCGCAGATGGTTCTGTACGTATGTTTGATCTTCGGCATTTGGAGCATTCTAATATTGTGTATGAGGATTCAAATCATTCCCCACTTTTACGCTTAGCTTGGAATAAACAAGATGCAAATTATCTAGCGACATTTGCAATGGACTCCGTAGAAATAATTATTTTAGATTTACGCGTACCATGCACTCCAGTAGCTCGTTTAAACAATCATAGAGCATTTGTAAATGGATTAGCATGGGCACCACATTCAAGTTGTCATTTATGTACTGCATCTGAAGATTGTCAAGCTCTTATCTGGGATATTCAGTCAATGCCAAGAGCAATAGAAGATCCTATTCTAGCATATACAGCTGCC GGTGAAATTAATCANATCCAATGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD201105             [                                  GATACTACATGCACTATCTGGGCCCTTGAAACGGAGCAGGTGGTCGGCCATGCAAATGTCGTAAGTGGACGCGTAGAATCTCAGTTAATAGCCCATAACAAAGAAGTATATGACATAGCTTTCAGTCGTGCTGGAGGCGGAAGAGATGTTTTCGCTAGTGTTGGCGCAGATGGTTCTGTACGTATGTTTGATCTTCGGCATTTGGAGCATTCTAATATTGTGTATGAGGATTCAAATCATTCCCCACTTTTACGCTTAGCTTGGAATAAACAAGATGCAAATTATCTAGCGACATTTGCAATGGACTCCGTAGAAATAATTATTTTAGATTTACGCGTACCATGCGCTCCAGTAGCTCGTTTAAACAATCATAGAGCATTTGTAAATGGATTAGCATGGGCACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD073538             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCCGTAGAAATAATTATTTTAGATTTACGCGTACCATGCACTCCAGTAGCTCGTTTAAACAATCATAGAGCATTTGTAAATGGATTAGCATGGGCACCACATTCAAGTTGTCATTTATGTACTGCATCTGAAGATTGTCAAGCTCTTATCTGGGATATTCAGTCAATGCCAAGAGCAATAGAAGATCCTATTCTAGCATATACAGCTGCC GGTGAAATTAATCAAATCCAATGGTCGTCAACACAACCAGATTGGATAGCTATTTGTTATAATAATTCGTTAGAAATTTTACGAGTATAATGTTTACTGTTTATTTCTTATTTTATCAACTGATTTAAAGGTATCCTATAATTATGATCAAATGTTATTTCTTCCTTTATGCTTACTAATTATCGTATGTTATTTTCATGCGTTTCATTATTATTCTTTTCTAAATATTCTGGATAATTTAACTGAGTACTATTATCGAGATACATGTGTTGGTTCTAGTAAAAGTAAGTCTTGACTACATATGAATCAATTTCAAATGTTTTGTATATTTACTTAAAAAAATATTTG                         ]
[-] EMBL CD073530             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTATTTTAGATTTACGCGTACCATGCACTCCAGTAGCTCGTTTAAACAATCATAGAGCATTTGTAAATGGATTAGCATGGGCACCACATTCAAGTTGTCATTTATGTACTGCATCTGAAGATTGTCAAGCTCTTATCTGGGATATTCAGTCAATGCCAAGAGCAATAGAAGATCCTATTCTAGCATATACAGCTGCC GGTGAAATTAATCAAATCCAATGGTCGTCAACACAACCAGATTGGATAGCTATTTGTTATAATAATTCGTTAGAAATTTTACGAGTATAATGTTTACTGTTTATTTCTTATTTTATCAACTGATTTAAAGGTATCCTATAATTATGATCAAATGTTATTTCTTCCTTTATGCTTACTAATTATCGTATGTTATTTTCATGCGTTTCATTATTATTCTTTTCTAAATATTCTGGATAATTTAACTGAGTACTATTATCGAGATACATGTGTTGGTTCTAGTAAAAGTAAGTCTTGACTACATATGAATCAATTTCAAATGTTTTGTATATTTACTTAAAAAAATATTTG                         ]
[-] EMBL AI395506             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCCTATTCTAGCATATACAGCTGCCGGGTGAAATTAATCAAATCCAATGGTCGTCAACACAACCAGATTGGATAGCTATTTGTTATAATAATTCGTTAGAAATTTTACGAGTATAATGTTTACTGTTTATTTCTTATTTTATCAACTGATTTAAAGGTATCCTATAATTATGATCAAATGTTATTTCTTCCTTTATGCTTACTAATTATCGTATGTTATTTTCATGCGTTTCATTATTATTCTTTTCTAAATATTCTGGATAATTTAACTGAGTACTATTATCGAGATACATGTGTTGGTTCTAGTAAAAGTAAGTCTTGACTACATATGAATCAATTTCAAATGTTTTGTATATTTACTT  AAAAATATTTGTGTTTGTCTAAAAAAAAAAAAAAAA]




>consensus_8188#0
AGTAGATCCAAATATTATCGGAACTTCTAGTATCGATACTACATGCACTATCTGGGCCCT
TGAAACGGAGCAGGTGATCGGCCATGCAAATGTCGTAAGTGGACGCGTAGAATCTCAGTT
AATAGCCCATGACAAAGAAGTATATGACATAGCTTTCAGTCGTGCTGGAGGCGGAAGAGA
TGTTTTCGCTAGTGTTGGCGCAGATGGTTCTGTACGTATGTTTGATCTTCGGCATTTGGA
GCATTCTAATATTGTGTATGAGGATTCAAATCATTCCCCACTTTTACGCTTAGCTTGGAA
TAAACAAGATGCAAATTATCTAGCGACATTTGCAATGGACTCCGTAGAAATAATTATTTT
AGATTTACGCGTACCATGCACTCCAGTAGCTCGTTTAAACAATCATAGAGCATTTGTAAA
TGGATTAGCATGGGCACCACATTCAAGTTGTCATTTATGTACTGCATCTGAAGATTGTCA
AGCTCTTATCTGGGATATTCAGTCAATGCCAAGAGCAATAGAAGATCCTATTCTAGCATA
TACAGCTGCCGGTGAAATTAATCAAATCCAATGGTCGTCAACACAACCAGATTGGATAGC
TATTTGTTATAATAATTCGTTAGAAATTTTACGAGTATAATGTTTACTGTTTATTTCTTA
TTTTATCAACTGATTTAAAGGTATCCTATAATTATGATCAAATGTTATTTCTTCCTTTAT
GCTTACTAATTATCGTATGTTATTTTCATGCGTTTCATTATTATTCTTTTCTAAATATTC
TGGATAATTTAACTGAGTACTATTATCGAGATACATGTGTTGGTTCTAGTAAAAGTAAGT
CTTGACTACATATGAATCAATTTCAAATGTTTTGTATATTTACTTAAAAAAATATTTGTG
TTTGTCTAAAAAAAAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)