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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8220#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 751 fasta sequence
[ATAGAGAAAAAGACAAGCAAGTGAGCAATCGAAACTGTTAATTACGACTAGAATATACATTTACAATAACTAATCATTCCAAAATGAATTAATCAGTGAAAGAAAAGAGAATTCACTCTGTATTAATCATGGATCGATTTGATTTAATCAGCCTTATTTCAGATTATTTTAGCAATTAAGCTATTTGTACAGGGTCATTGTATTCTTAACGGAGTGTTAAGAGGGTAAATATTTGGGGATTTTATATGATTGTTTTGATATTATTATTGATATTGTGAAGATGATGGTAGCAGTGTGGTTGTTGTTGGTGGTGGTAAACGATGATTACCGTCATCGACTGAATTACGAACACGTCTGAAGTGAACAGGTGGCTTGCTATTCGTTCCATTATTGATATTTCTAAATTCTTGATTTATTGAAGGATGCATAGTTCCACTAGACGAAGGAGGATGAGAGGTAGTTGGTGCAGAATTGGGAGGTTCTTGAGATAATGTAGTAGTAGAAGTCGGTTTACTTGTAAATCGTTCAACGATATGTTTTGGATGTGTAGTCCATTTAATCATAGTCTCTGATGAACGATAAAGGAAGAAAAGTTTTGCCAC-AACTGTTCCTCTAATAATAGTAAGTTATTTTCACGTACAAGATAAATTTCATGGCATAAATTCAAAATACGATCCACATGAGGTAATTCTTCAAGACGAATCACATAAGAAATATTACTGTACGCAGTACGTAGCAGCCGACTAGCTAA]
[-] EMBL CD059567 [ATAGAGAAAAAGACAAGCAAGTGAGCAATCGAAACTGTTAATTACGACTAGAATATACATTTACAATAACTAATCATTCCAAAATGAATTAATCAGTGAAAGAAAAGAGAATTCACTCTGTATTAATCATGGATCGATTTGATTTAATCAGCCTTATTTCAGATTATTTTAGCAATTAAGCTATTTGTACAGGGTCATTGTATTCTTAACGGAGTGTTAAGAGGGTAAATATTTGGGGA ]
[+] EMBL CD194458 [ AACTGTTAATTACGACTAGACTATACATTTACAATAACTAATCATTCCAAAATGAATTAATCAGTGAAAGAAAAGAAAATTCACTCTGTATTAATCATGGATCGATTTGATTTAATCAGTCTTATTTCAGATTATTTTAACAATTAAGCTATTTGTACAGGGCCATTGTATTCTTAACGGAGTGTTAAGAGGGTAAATATTTGGGGATTTTATATGATTGTTTTGATATTATTATTGATATTGTGAAGATGATGGTAGCAGTGTGGTTGTTGTTGGTGGTGGTAAACGATGATTACCGTCATCGACTGAATTACGAACACGTCTGAAGTGAACAGGTGGCTTGCTATTCGTTCCATTATTGATATTTCTAAATTCTTGATTTATTGAAGGATGCATAGTTCCACTAGACGAAGGA ]
[-] EMBL CD144761 [ cACGGAGTGTTAAGAGGGTAAATATTTGGGGATTTTATATGATTGTTTTGTTATTATTATTGATATTGTGAAGATGATGGTAGCAGTGTGGTTGTTGTTGGTGGTGGTAAACGATGATTACCGTCATCGACTGAATTACGAACACGTCTGAAGTGAACAGGTGGCTTGCTATTCGTTCCATTATTGATATTTCTAAATTCTTGATTTATTGAAGGATGCATAGTTCCACTAGACGAAGGAGGATGAGAGGTAGTTGGTGCAGAATTGGGAGGTTCTTGAGATAATGTAGTAGTAGAAGTCGGTTTACTTGTAAATCGTTCAACGATATGTTTTGGATGTGTAGTCCATTTAATCATAGTCTCTGATGAGCGATAAAGGAAGAAAAGTTTTGCCAC ctccgtgg ]
[+] EMBL CD144611 [ GGTAAATATTTGGGGATTTTATATGATTGTTTTGATATTATTATTGATATTGTGAAGATGATGGTAGCAGTGTGGTTGTTGTTGGTGGTGGTAAACGATGATTACCGTCATCGACTGAATTACGAACACGTCTGAAGTGAACAGGTGGCTTGCTATTCGTTCCATTATTGATATTTCTAAATTCTTGATTTATTGAAGGATGCATAGTTCCACTANACGAAGGAGGATGAGAGGTAGTTGGTGCATAATTGGGAGGTTCTTGAGATAATGTAGTAGTAGAAGTCGGTTTACTTGTAAATCGTTCAACGATATGTTCTGGATGTCTAGTCCATTTAATCATAGTCTCTGATGAACGATAAAGGAAGAAAA ]
[-] EMBL CD193356 [ GGATGAGAGGTAGTTGGTGCAGAATTGGGAGGTTCTTGAGATAATGTAGTAGTAGAAGTCGGTTTACTTGTAAATCGTTCAACGATATGTTTTGGATGTGTAGTCCATTTAATCATAGTCTCTGATGAACGATAAAGGAAGAAAAGTTTTGCCACTAACTGTTCCTCTAATAATAGTAAGTTATTTTCACGTACAAGATAAATTTCATGGCATAAATTCAAAATACGATCCACATGAGGTAATTCTTCAAGACGAATCACATAAGAAATATTACTGTACGCAGTACGTAGCAGCCGACTAGCTAA]
[-] EMBL CD112452 [ AGGTTCTTGAGATAATGTAGTAGTAGAAGTCGGTTTACTTGTAAATCGTTCAACGATATGTTTTGGATGTCTAGTCCATTTAATCATAGTCTCTGATGAACGATAAAGGAAGAAAAGTTTTGCCACTAACTGTTCCTCTAATAATAGTAAGTTATTTTCACGTACAAGATAAATTTCATGGCATAAATTCAA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||