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Schistosoma mansoni
cluster # 8236 cluster # 8236       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8236#0 length = 1164 sequences # 6  
consensusID : consensus_8236#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1164
fasta sequence 
                              [TTTTATAAAACAAGAATTTGATCGTAGTTTTATATTATCGGATCCAGGTATGGGCTCCGAATTGTTCGTTGATCCTGCACAAGAAGATCGTGAAATGATATGGCGTACTAATGAATATCCGACATTAGATCGTCTACATTTATCCAATTCATTCGGAAGTTCAAACCACCAACCTATCATTATGTGCACACGAGATCAACGTCGCAGGATAATTCAACAAAGTAATATTATGCCAGATTACATTTTATGCCGTCAGCAAACAATACCTATCTTGAGATTGCCTACTCCTGCACGTACAGTGGTATCTTTAGGACGACCACAGCAGCAGTCCTGACATGTTTTCTATATTAGTACCAATTTNNCGCCAGTTTTACTTAATGATCTCGTCTTTTCCTCTGTCTTGCTTAATACAATGAGTTCAAAGTAGGGATATAACATAACTACTTTTGCAACCACACAATTAGGCCTTAAACGCATGTCTTGTTAACTACTAGCAGTTTTCATGCGCATCTTGTATATTTACTGTTTCTATAACCTATTGAGTTGTCTCAGTTTATTTTGTCAAATAATTAGTTTCATTGTTCCTAAACTGCCCCCTCAGCATAAATTTGTACAAATCGAAATCGACCTATCTGGTCCCTTTTACAGAAATCTAAATGCTTGACACTAATATACTGGTTATTGCCGATTATTCTTTCCAAACACTTCATGGAACCTACTGGTCATTTCCTGCGCCTACATGTTTTTAATCTTTTAGTGTTTTCCCAGTGAGGTAAATCGTGTAGTGCCCGAAGGAAATCTTTTTTAGTCTTCTATGTACACAGTTGTTTTTCATGTACAGACTTCCAGATAATCTGTGATTTTTTCGAACTCAAGTTTAATGATGTATGGTTGTGGGGTCGATTCATATTTTTGACTCCTTGCAGTAATATTTATTGTACGACATAATATTTCATTCCTAAACAATAAGAATAATCAAACTATTTTACAACTTGTTTCCTCAGAACATACGTCATCAAAGTATATTTGCTCACCATTTTTTAACTGAATGTTTTGCAGTTACTTTAACATGATTCTGTATAGTGAAAAGTCCCTGCTGTATACCTTTATACCCGTCACTTATTACAATGTTTCGTATTTAACACTATGATGACCCCCCGTCAA]

[+] EMBL CD149423             [TTTTATAAAACGGGAGTTTGATCGTAGTTTTATATTATCGGATCCAGGTATGGGCTCCGAATTGTTCGTTGATCCTGCACAAGAAGATCGTGAAATGATATGGCGTACTAATGAATATCCGACATTAGATCGTCTACATTTATCCAATTCATTCGGAAGTTCAAACCACCAACCTATCATTATGTGCACACGAGATCAACGTCGCAGGATAATTCAACAAAGTAATATTATGCCAGATTACATTTTATGCCGTCAGCAAACAATACCTATCTTGAGATTGCCTACTCCTGCACGTACAGTGGTATCTTTAGGACGACCACAGCAGCAGTCCTGACATGTTTTCTATATTACTACCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD198806             [      AAAACAAGAATTTGATCGTAGTTTTATATTATCGGATCCAGGTATGGGCTCCGAATTGTTCGTTGATCCTGCACAAGAAGATCGTGAAATGATATGGCGTACTAATGAATATCCGACATTAGATCGTCTACATTTATCCAATTCATTCGGAAGTTCAAACCACCAACCTATCATTATGTGCACACGAGATCAACGTCGCAGGATAATTCAACAAAGTAATATTATGCCAGATTACATTTTATGCCGTCAGCAAACAATACCTATCTTGAGATTGCCTACTCCTGCACGTACAGTGGTATCTTTAGGACGACCACAGCAGCAGTCCTGACATGTTTTCTATATNAGTACCAATTTNNC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD198710             [      AAAACAAGAATTTGATCGTAGTTTTATATTATCGGATCCAGGTGTGGGCTCCGAATTGTTCGTTGATCCTGCACAAGAAGATCGTGAAATGATATGGCGTACTAATGAATATCCGACATTAGATCGTCTACATTTATCCAATTCATTCGGAAGTTCAAACCACCAACCTATCATTATGTGCACACGAGATCAACGTCGCAGGATAATTCAACAAAGTAATATTATGCCAGATTACATTTTATGCCGTCAGCAAACAATACCTATCTTGAGATTGCCTACTCCTGCACGTACAGTGGTATCTTTAGGACGACCACAGCAGCAGTCCTGACATGTTTTCTATATTAGTACCAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD082878             [                                                                                                                                 TCGTCTACATTTATCCAATTCATTCGGAAGTTCAAACCACCAACCTATCATTATGTGCACACGAGATCAACGTCGCAGGATAATTCAACAAAGTAATATTATGCCAGATTACATTTTATGCCGTCAGCAAACAATACCTATCTTGAGATTGCCTACTCCTGCACGTACAGTGGTATCTTTAGGACGACCACAGCAGCAGTCCTGACATGTTTTCTATATTAGTACCAATTTCCAGCCAGTTTTACTTAATGATCTCGTCTTTTCCTCTGTCTTGCTTAATACAATGAGTTCAAAGTAGGGATATAACATAACTACTTTTGCAACCACACAATTAGGCCTTAAACGCATGTCTTGTTAACTACTAGCAGTTTTCATGCGCATCTTGTATATTTACTGTTTCTATAACCTATTGAGTTGTCTCAGTTTATTTTGTCAAATAATTAGTTTCATTGTTCCTAAACTGCCCCCTCAGCATAAATTTGTACAAATCGAAATCGACCTATCTGGTCCCTTTTACAGAAATCTAAATGCTTGACACTAATATACTGGTTATTGCCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD076463             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTAAACGCATGTCTTGTTAACTACTAGCAGTTNTCATGCGCATCTTGTATATTTACTGTTTCTATAACCTATTGAGTTGTCTCAGTTTATTTTGTCAAATAATTAGTTTCATTGTTCCTAAACTGCCCCCTCAGCATAAATTTGTACAAATCGAAATCGACCTATCTGGTCCCTTTTACAGAAATCTAAATGCTTGACACTAATATACTGTTTATTGCCGATTATTCTTTCCAAACACTTCATGGAACCTACTGGTCATTTCCTGCGCCTACATGTTTTTAATCTTTTAGTGTTTTCCCAGTGAGGTAAATCGTGTAGTGCCCGAAGGAAATCTTTTTTAGTCTTCTATGTACACAGTTGTTTTTCATGTACAGACTTCCAGATAATCTGTGATTTTTTCGAACTCAAGTTTAATGATGTATGGTTGTGGGGTCGATTCATATTTTTGACTCCTTGCAGTAATATTTATTGTACGACATAATATTTCATTCCTAAACAATAAGAATAATCA                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BG931061             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTCGATTCATATTTTTGACTCCTTGCAGTAATATTTATTGTACGACATAATATTTCATTCCTAAACAATAAGAATAATCAAACTATTTTACAACTTGTTTCCTCAGAACATACGTCATCAAAGTATATTTGCTCACCATTTTTTAACTGAATGTTTTGCAGTTACTTTAACATGATTCTGTATAGTGAAAAGTCCCTGCTGTATACCTTTATACCCGTCACTTATTACAATGTTTCGTATTTAACACTATGATGACCCCCCGTCAA]




>consensus_8236#0
TTTTATAAAACAAGAATTTGATCGTAGTTTTATATTATCGGATCCAGGTATGGGCTCCGA
ATTGTTCGTTGATCCTGCACAAGAAGATCGTGAAATGATATGGCGTACTAATGAATATCC
GACATTAGATCGTCTACATTTATCCAATTCATTCGGAAGTTCAAACCACCAACCTATCAT
TATGTGCACACGAGATCAACGTCGCAGGATAATTCAACAAAGTAATATTATGCCAGATTA
CATTTTATGCCGTCAGCAAACAATACCTATCTTGAGATTGCCTACTCCTGCACGTACAGT
GGTATCTTTAGGACGACCACAGCAGCAGTCCTGACATGTTTTCTATATTAGTACCAATTT
NNCGCCAGTTTTACTTAATGATCTCGTCTTTTCCTCTGTCTTGCTTAATACAATGAGTTC
AAAGTAGGGATATAACATAACTACTTTTGCAACCACACAATTAGGCCTTAAACGCATGTC
TTGTTAACTACTAGCAGTTTTCATGCGCATCTTGTATATTTACTGTTTCTATAACCTATT
GAGTTGTCTCAGTTTATTTTGTCAAATAATTAGTTTCATTGTTCCTAAACTGCCCCCTCA
GCATAAATTTGTACAAATCGAAATCGACCTATCTGGTCCCTTTTACAGAAATCTAAATGC
TTGACACTAATATACTGGTTATTGCCGATTATTCTTTCCAAACACTTCATGGAACCTACT
GGTCATTTCCTGCGCCTACATGTTTTTAATCTTTTAGTGTTTTCCCAGTGAGGTAAATCG
TGTAGTGCCCGAAGGAAATCTTTTTTAGTCTTCTATGTACACAGTTGTTTTTCATGTACA
GACTTCCAGATAATCTGTGATTTTTTCGAACTCAAGTTTAATGATGTATGGTTGTGGGGT
CGATTCATATTTTTGACTCCTTGCAGTAATATTTATTGTACGACATAATATTTCATTCCT
AAACAATAAGAATAATCAAACTATTTTACAACTTGTTTCCTCAGAACATACGTCATCAAA
GTATATTTGCTCACCATTTTTTAACTGAATGTTTTGCAGTTACTTTAACATGATTCTGTA
TAGTGAAAAGTCCCTGCTGTATACCTTTATACCCGTCACTTATTACAATGTTTCGTATTT
AACACTATGATGACCCCCCGTCAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)