cluster # 8238

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Schistosoma mansoni
cluster # 8238 cluster # 8238 Sequences # 6 consensus # 3

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_8238#0 length = 975 sequences # 1

consensus_8238#1 length = 869 sequences # 3
consensus_8238#2 length = 652 sequences # 2

consensusID : consensus_8238#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 975
fasta sequence

                              [ACAGGCCAANAATTTGGCACGAGGGGCTATATGACTCTTCGCAAATCGTTATTTAAAGATAAATAAAGACATGTTTTAGGATAATTCCTTTAATTATTCGAATTATGTCATGAGGATTAAAAACAGTTATCTTCATTATCCTTAAATATTTTAAAATAAACTACTCTGTTTTCTAGATATTAGCTCGAAATAGCCCGCATATAACTGAACCTTCTAACTATTCATCCATTGCACCCTTATGTCTCAGTGATGCACAAAAGTTATGGAAAGCAGTTTCACCTGATGAAATGATACGCATTCAAAAGGATGGATTATCAATTGTAACTAGATATCTACCAAGTGGTATTACTAGTCTACAAAATCTCTGTAATTTAGGTTTGACTAGTCCAATTATTGAAGGATGCTTAACGGAAAATACTAAAACAATGAACCACTTCTATTTAAGAGATCGTGCAGAGCATGTATACTCTGAAGCTGAACGGGTTTTTAAATTTTATAATATATGCAAAAAGATATTCAGTATTGATGATTCACAAACGAATTCTATTAATTATATGCAGTTGTTAGGAGATTTAATGAATCAAAGTCAATTATCTTGTGCTAATCTTTATCAGTGTTCTTGTCGTGAATTGGATAAATTAATAAGTGTTTGCAGATCAGCTGGTGCTTTTGGCAGTCGTCTAACTGGAGCTGGTTGGGGTGGCTGCACTGTATCATTAGTGAAAAAATCTAATGCTGAGNCAATCATTGCANAAGTACGCGAAGAATTNCTATATGTGATTGATGGGTACAGCNNATACGACTTGATATTCNGTAGTCAGCCAGGTCGTCCAGCTGGAAATATGGNTANNTCATGATAAGTGATNCTTNTGCTACGCTTATATAAAAATNGTCTCATTACTTNNTGGATGATAATTTTTAATTATTGGTAGATGGACTTTCTTAAATATTNGATGTNCATAAATACATAAATTG]

[+] EMBL CD081078             [ACAGGCCAANAATTTGGCACGAGGGGCTATATGACTCTTCGCAAATCGTTATTTAAAGATAAATAAAGACATGTTTTAGGATAATTCCTTTAATTATTCGAATTATGTCATGAGGATTAAAAACAGTTATCTTCATTATCCTTAAATATTTTAAAATAAACTACTCTGTTTTCTAGATATTAGCTCGAAATAGCCCGCATATAACTGAACCTTCTAACTATTCATCCATTGCACCCTTATGTCTCAGTGATGCACAAAAGTTATGGAAAGCAGTTTCACCTGATGAAATGATACGCATTCAAAAGGATGGATTATCAATTGTAACTAGATATCTACCAAGTGGTATTACTAGTCTACAAAATCTCTGTAATTTAGGTTTGACTAGTCCAATTATTGAAGGATGCTTAACGGAAAATACTAAAACAATGAACCACTTCTATTTAAGAGATCGTGCAGAGCATGTATACTCTGAAGCTGAACGGGTTTTTAAATTTTATAATATATGCAAAAAGATATTCAGTATTGATGATTCACAAACGAATTCTATTAATTATATGCAGTTGTTAGGAGATTTAATGAATCAAAGTCAATTATCTTGTGCTAATCTTTATCAGTGTTCTTGTCGTGAATTGGATAAATTAATAAGTGTTTGCAGATCAGCTGGTGCTTTTGGCAGTCGTCTAACTGGAGCTGGTTGGGGTGGCTGCACTGTATCATTAGTGAAAAAATCTAATGCTGAGNCAATCATTGCANAAGTACGCGAAGAATTNCTATATGTGATTGATGGGTACAGCNNATACGACTTGATATTCNGTAGTCAGCCAGGTCGTCCAGCTGGAAATATGGNTANNTCATGATAAGTGATNCTTNTGCTACGCTTATATAAAAATNGTCTCATTACTTNNTGGATGATAATTTTTAATTATTGGTAGATGGACTTTCTTAAATATTNGATGTNCATAAATACATAAATTG]




>consensus_8238#0
ACAGGCCAANAATTTGGCACGAGGGGCTATATGACTCTTCGCAAATCGTTATTTAAAGAT
AAATAAAGACATGTTTTAGGATAATTCCTTTAATTATTCGAATTATGTCATGAGGATTAA
AAACAGTTATCTTCATTATCCTTAAATATTTTAAAATAAACTACTCTGTTTTCTAGATAT
TAGCTCGAAATAGCCCGCATATAACTGAACCTTCTAACTATTCATCCATTGCACCCTTAT
GTCTCAGTGATGCACAAAAGTTATGGAAAGCAGTTTCACCTGATGAAATGATACGCATTC
AAAAGGATGGATTATCAATTGTAACTAGATATCTACCAAGTGGTATTACTAGTCTACAAA
ATCTCTGTAATTTAGGTTTGACTAGTCCAATTATTGAAGGATGCTTAACGGAAAATACTA
AAACAATGAACCACTTCTATTTAAGAGATCGTGCAGAGCATGTATACTCTGAAGCTGAAC
GGGTTTTTAAATTTTATAATATATGCAAAAAGATATTCAGTATTGATGATTCACAAACGA
ATTCTATTAATTATATGCAGTTGTTAGGAGATTTAATGAATCAAAGTCAATTATCTTGTG
CTAATCTTTATCAGTGTTCTTGTCGTGAATTGGATAAATTAATAAGTGTTTGCAGATCAG
CTGGTGCTTTTGGCAGTCGTCTAACTGGAGCTGGTTGGGGTGGCTGCACTGTATCATTAG
TGAAAAAATCTAATGCTGAGNCAATCATTGCANAAGTACGCGAAGAATTNCTATATGTGA
TTGATGGGTACAGCNNATACGACTTGATATTCNGTAGTCAGCCAGGTCGTCCAGCTGGAA
ATATGGNTANNTCATGATAAGTGATNCTTNTGCTACGCTTATATAAAAATNGTCTCATTA
CTTNNTGGATGATAATTTTTAATTATTGGTAGATGGACTTTCTTAAATATTNGATGTNCA
TAAATACATAAATTG

consensusID : consensus_8238#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 869
fasta sequence

                              [ATGGGAATTGGCCTCGAGGCCAGAATCGGCACGAGGCTCGAAATAGCCCGCATATACTGAACCTTCTAACTATTCATCCATTGCACCCTTATGTCTCAGTGATCACAAAAGTTATGGAAAGCAGTTTCACCTGATGAAATGATACGCATTCAAAAGGATGGATTATCAATTGTAACTAGATATCTACCAAGTGGTATTACTAGTCTACAAAATCTCTGTAATTTAGGTTTGACTAGTCCAATTATTGAAGGATGCTTAACGGAAAATACTAAAACAATGAACCACTTCTATTTAAGAGATCGTGCAGAGCATGTATACTCTGAAGCTGAACGGGTTTTTAAATTTTATAATATATGCAAAAAGATATTCAGTATTGATGATTCACAAACGAATTCTATTAATTATATGCAGTTGTTAGGAGATTTAATGAATCAAAGTCAATTATCTTGTGCTAATCTTTATCAGTGTTCTTGTCGTGAATTGGATAAATTAATAAGTGTTTGCAGATCAGCTGGTGCTTTTGGCAGTCGTCTAACTGGAGCTGGTTGGGGTGGCTGCACTGTATCATTAGTGAAAAAATCTAATGCTGAGCAATTCA-TTGCAAAAGTACGCGAAGAA-TTCTATAATGTGATTGATGGTAACAGCAATAACGACTTGATATTCGTTAGTCAGCCAGGTCGTCCAGCTGGAATAATGGTTATTCAATGAATAAAGTGATTCCTTTTGCTAACGCTTTATTATAAAAATTTGTTCTTCATTTACTTTTGTGATTGATTTAATTTTTTTAATTTTATTTGTTATGATTTGGACTTTTCTTTAAAAATTATTTGATTTGTTTCCACTTAGATTATACAATAAAATGTTTGTTT]

[+] EMBL CD083829             [ATGGGAATTGGCCTCGAGGCCAGAATCGGCACGAGGCTCGAAATAGCCCGCATATACTGAACCTTCTAACTATTCATCCATTGCACCCTTATGTCTCAGTGATCACAAAAGTTATGGAAAGCAGTTTCACCTGATGAAATGATACGCATTCAAAAGGATGGATTATCAATTGTAACTAGATATCTACCAAGTGGTATTACTAGTCTACAAAATCTCTGTAATTTAGGTTTGACTAGTCCAATTATTGAAGGATGCTTAACGGAAAATACTAAAACAATGAACCACTTCTATTTAAGAGATCGTGCAGAGCATGTATACTCTGAAGCTGAACGGGTTTTTAAATTTTATAATATATGCAAAAAGATATTCAGTATTGATGATTCACAAACGAATTCTATTAATTATATGCAGTTGTTAGGAGATTTAATGAATCAAAGTCAATTATCTTGTGCTAATCTTTATCAGTGTTCTTGTCGTGAATTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD074900             [                                                                                                                                                                                                                                                                                      GAACCACTTCTATTTAAGAGATCGTGCAGAGCATGTATACTCTGAAGCTGAACGGGTTTTTAAATTTTATAATATATGCAAAAAGATATTCAGTATTGATGATTCACAAACGAATTCTATTAATTATATGCAGTTGTTAGGAGATTTAATGAATCAAAGTCAATTATCTTGTGCTAATCTTTATCAGTGTTCTTGTCGTGAATTGGATAAATTAATAAGTGTTTGCAGATCAGCTGGTGCTTTTGGCAGTCGTCTAACTGGAGCTGGTTGGGGTGGCTGCACTGTATCATTAGTGAAAAAATCTAATGCTGAGCAATTCA TTGCAAAAGTACGCGAAGAA TTCTATAATGTGATTGATGGTAACAGCAATAACGACTTGATATTCGTTAGTCAGCCAGGTCGTCCAGCTGGAATAATGGTTATTCAATGAATAAAGTGATTCCTTTTGCTAACGCTTTATTATAAAAATTTGTTCTTCATTTACTTTTGTGATTGATTTAATTTTTTTAATTTTATTTGTTATGATTTGGACTTTTCTTTAAAAATTATTTGATTTGTTTCCACTTAGATTATACAATAAAATGTTTGTTT]
[+] EMBL CD181498             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAAATTTTATAATATATGCAAAAAGATATTCAGTATTGATGATTCACAAACGAATTCTATTAATTATATGCAGTTGTTAGGAGATTTAATGAATCAAAGTCAATTATCTTGTGCTAATCTTTATCAGTGTTCTTGTCGTGAATTGGATAAATTAATAAGTGTTTGCAGATCAGCTGGTGCTTTTGGCAGTCGTCTAACTGGAGCTGGTTGNGGTGGCTGCACTGTATCATTAGTG AAAAATCTAATGCTGAGCAATTCATTTGC AAAGTACGCGAAGAATTTCTAT ATGTGATTGATGGAAACAGCAATAACGACTTGA                                                                                                                                                                                                                   ]




>consensus_8238#1
ATGGGAATTGGCCTCGAGGCCAGAATCGGCACGAGGCTCGAAATAGCCCGCATATACTGA
ACCTTCTAACTATTCATCCATTGCACCCTTATGTCTCAGTGATCACAAAAGTTATGGAAA
GCAGTTTCACCTGATGAAATGATACGCATTCAAAAGGATGGATTATCAATTGTAACTAGA
TATCTACCAAGTGGTATTACTAGTCTACAAAATCTCTGTAATTTAGGTTTGACTAGTCCA
ATTATTGAAGGATGCTTAACGGAAAATACTAAAACAATGAACCACTTCTATTTAAGAGAT
CGTGCAGAGCATGTATACTCTGAAGCTGAACGGGTTTTTAAATTTTATAATATATGCAAA
AAGATATTCAGTATTGATGATTCACAAACGAATTCTATTAATTATATGCAGTTGTTAGGA
GATTTAATGAATCAAAGTCAATTATCTTGTGCTAATCTTTATCAGTGTTCTTGTCGTGAA
TTGGATAAATTAATAAGTGTTTGCAGATCAGCTGGTGCTTTTGGCAGTCGTCTAACTGGA
GCTGGTTGGGGTGGCTGCACTGTATCATTAGTGAAAAAATCTAATGCTGAGCAATTCATT
GCAAAAGTACGCGAAGAATTCTATAATGTGATTGATGGTAACAGCAATAACGACTTGATA
TTCGTTAGTCAGCCAGGTCGTCCAGCTGGAATAATGGTTATTCAATGAATAAAGTGATTC
CTTTTGCTAACGCTTTATTATAAAAATTTGTTCTTCATTTACTTTTGTGATTGATTTAAT
TTTTTTAATTTTATTTGTTATGATTTGGACTTTTCTTTAAAAATTATTTGATTTGTTTCC
ACTTAGATTATACAATAAAATGTTTGTTT

consensusID : consensus_8238#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 652
fasta sequence

                              [GATTTGGATAAGATCGTTCTTAGAAGCACAGATACTCAATACAGGCCTGTTAAAATTTCGATTACAGAAGCCATTACATTTGGTTGTGAAGGGTCGCCTGACTCACCTGAATGGTTTCATTATTTTCAGTGCGCATATCGAGGAATAAAAGACTATGTAGTCAAGTCGAATTTGGATTGGACTCCTCCTAGTATAAATGTTCTAGTTGGTGATGTTGAATACGGTGGTTTATGGCCACCTGCTGGTCTTTCAAGCAGTAGCGCTTTTGTAGTTGCTTCTGCCATAGCAATTATGCGAATATCCTGGTTTACCAATAAGTAGGCATGAATTAGCCAGTTTATGTGCGAAATGTGAGCAATATATTGGTATGCAAGGTGGTGGGATGGATCAAGCTGCAAGTGTTTTAGCAGTTGAAAATAATGCTTTAATGATTGAGTTTATCAAACCCTTTGTCACAGTCAGTCCTATTCAATTACCATCTGATATGGTTTTTGTGATAGCTCATTCGGGTGTCCACGCTCGGAAAGCTGCTCCATCATATTATAACGAACGTGTGGCAGAATGTCGATTAGCGGCTAAAATATTAGCTCGAAATAGCCCGCATATAACTGAACCTTCTAACTATTCATCCATTGCACCCTTATGTCTCAGT]

[-] EMBL CD066251             [GATTTGGATAAGATCGTTCTTAGAAGCACAGATACTCAATACAGGCCTGTTAAAATTTCGATTACAGAAGCCATTACATTTGGTTGTGAAGGGTCGCCTGACTCACCTGAATGGTTTCATTATTTTCAGTGCGCATATCGAGGAATAAAAGACTATGTAGTCAAGTCGAATTTGGATTGGACTCCTCCTAGTATAAATGTTCTAGTTGGTGATGTTGAATACGGTGGTTTATGGCCACCTGCTGGTCTTTCAAGCAGTAGCGCTTTTGTAGTTGCTTCTGCCATAGCAATTATGCGAATATCCTGGTTTACCAATAAGTAGGCATGAATTAGCCAGTTTATGTGCGAAATGTGAGCAATATATTGGTATGCAAGGTGGTGGGATGGATCAAGCTGCAAGTGTTTTAGCAGTTGAAAATAATGCTTTAATGATTGAGTTTATCAAACCCTTTGTCACAGTCAGTCCTATTCAATTACCATCTGATATGGTTTTTGTGATAGCTCATTCGGGTGTCCACGCTCGGAAAGCTGCTCCATCATATTATAACGAACGTGTGGCAGAAT                                                                                         ]
[+] EMBL AI975283             [                                                                                    TGTGAAGGGTCGCCTGACTCACCTGAATGGTTTCATTATTTTCAGTGCGCATATCGAGGAATAAAAGACTATGTAGACAAGTCGAATTTGGATTGGACTCCTCCTAGTATAAATGTTCTAGTTGGTGATGTTGAATACGGTGGTTTATGGCCAGCTGCTGGTCTTTCAAGCAGTAGCGCTTTCGTAGTTGCTTCTGCCATAGCAATTATGCGAATAT CTGGTTTACAAATAAGTAGGCATGAATTAGCAAGTTTATGTGCGAAATGTGAGCAATATATTGGTATGCAAGGTGGTGGGATGGATCAAGCTGCAAGTGTTCTAGCAGTTGAAAATAATGCTTTAATGATTGAGTTTACCAAACCATTTGTCACAGTCAGTCCTATACAATTACCATCTGATATGGTTTTTGTGATAGCTCATTCGGGTGTACACGCTCGGAAAGCTGCTACATCATATTATAACGAACGTGTGGCAGAATGTCGATTAGCGGCTAAAATATTAGCTCGAAATAGCCCGCATATAACTGAACCTTCTAACTATTCATCCATTGCACCCTTATGTCTCAGT]




>consensus_8238#2
GATTTGGATAAGATCGTTCTTAGAAGCACAGATACTCAATACAGGCCTGTTAAAATTTCG
ATTACAGAAGCCATTACATTTGGTTGTGAAGGGTCGCCTGACTCACCTGAATGGTTTCAT
TATTTTCAGTGCGCATATCGAGGAATAAAAGACTATGTAGTCAAGTCGAATTTGGATTGG
ACTCCTCCTAGTATAAATGTTCTAGTTGGTGATGTTGAATACGGTGGTTTATGGCCACCT
GCTGGTCTTTCAAGCAGTAGCGCTTTTGTAGTTGCTTCTGCCATAGCAATTATGCGAATA
TCCTGGTTTACCAATAAGTAGGCATGAATTAGCCAGTTTATGTGCGAAATGTGAGCAATA
TATTGGTATGCAAGGTGGTGGGATGGATCAAGCTGCAAGTGTTTTAGCAGTTGAAAATAA
TGCTTTAATGATTGAGTTTATCAAACCCTTTGTCACAGTCAGTCCTATTCAATTACCATC
TGATATGGTTTTTGTGATAGCTCATTCGGGTGTCCACGCTCGGAAAGCTGCTCCATCATA
TTATAACGAACGTGTGGCAGAATGTCGATTAGCGGCTAAAATATTAGCTCGAAATAGCCC
GCATATAACTGAACCTTCTAACTATTCATCCATTGCACCCTTATGTCTCAGT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_8238#0      ACAGGCCAANAATTTGGCACGAGGGGCTATATGACTCTTCGCAAATCGTTATTTAAAGAT 60
consensus_8238#1      ------------------------------------------------------------
consensus_8238#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8238#0      AAATAAAGACATGTTTTAGGATAATTCCTTTAATTATTCGAATTATGTCATGAGGATTAA 120
consensus_8238#1      ------------------------------------------------------------
consensus_8238#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8238#0      AAACAGTTATCTTCATTATCCTTAAATATTTTAAAATAAACTACTCTGTTTTC-TAGATA 179
consensus_8238#1      -----------------------------ATGGGAATTGGCCTCGAGGCCAGAATCGGCA 31
consensus_8238#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8238#0      TTAG-CTCGAAATAGCCCGCATATAACTGAACCTTCTAACTATTCATCCATTGCACCCTT 238
consensus_8238#1      CGAGGCTCGAAATAGCCCGCATATA-CTGAACCTTCTAACTATTCATCCATTGCACCCTT 90
consensus_8238#2      ---GATTTGGATAAGATCGTTCTTA---GAAGCAC--AGATACTCAATACAGGCCTGTTA 52
                         *  * * *  **  **    **   *** *    *  ** ***      **    * 

consensus_8238#0      ATGTCTCAGTGATGCACAAAAGTTATGGAAAGCAGTTTCACCTGATGAAATGATACGCAT 298
consensus_8238#1      ATGTCTCAGTGAT-CACAAAAGTTATGGAAAGCAGTTTCACCTGATGAAATGATACGCAT 149
consensus_8238#2      AAATTTCGAT----TACAGAAGCCATTACATTTGGTTGTGAAGGGTCGCCTGACTCACCT 108
                      *  * **  *     *** ***  **   *    ***      * *    ***  * * *

consensus_8238#0      TCAAAAGGATGGATTATCAATTGTAACTAGATATCTACCAAGTGGTATTACTAGTCTACA 358
consensus_8238#1      TCAAAAGGATGGATTATCAATTGTAACTAGATATCTACCAAGTGGTATTACTAGTCTACA 209
consensus_8238#2      ------GAATGGTTTCATTATTTTCAGTGCGCAT--ATCGAGGAATAAAA---GACTATG 157
                            * **** **    *** * * *    **  * * **   **  *   * ***  

consensus_8238#0      AAATCTC-TGTAATTTAGGTTTGACTAGTCCAATTATTGAAGGATGCTTAACGGAAAATA 417
consensus_8238#1      AAATCTC-TGTAATTTAGGTTTGACTAGTCCAATTATTGAAGGATGCTTAACGGAAAATA 268
consensus_8238#2      TAGTCAAGTCGAATTTGGATTGGACTCCTCCTAGTAT--AAATGTTCTAGTTGGTGATGT 215
                       * **   *  ***** * ** ****  *** * ***  **   * **    **  *   

consensus_8238#0      CTAAAACAATGAACCACTTCTATTTAAGAGATCGT------GCAGAGCATGTATACT--C 469
consensus_8238#1      CTAAAACAATGAACCACTTCTATTTAAGAGATCGT------GCAGAGCATGTATACT--C 320
consensus_8238#2      TGAATACGGTGGTTTATGGCCACCTGCTGGTCTTTCAAGCAGTAGCGCTTTTGTAGTTGC 275
                        ** **  **    *   * *  *    *    *      * ** ** * * ** *  *

consensus_8238#0      TGAAGCTG-AACGGGTTTTTAAATTTTATAATATATGCAAAAAGATATTCAGTATTGATG 528
consensus_8238#1      TGAAGCTG-AACGGGTTTTTAAATTTTATAATATATGCAAAAAGATATTCAGTATTGATG 379
consensus_8238#2      TTCTGCCATAGCAATTATGCGAATATCCTGGTTTACCAATAAGTAGGCATGAATTAGCCA 335
                      *   **   * *   * *   *** *  *  * **   * **  *         * *   

consensus_8238#0      ATTCACAAACGAATTCTATTAATTATATGCAGTTGTTAGGAGATTTAATGAATCAAAGT- 587
consensus_8238#1      ATTCACAAACGAATTCTATTAATTATATGCAGTTGTTAGGAGATTTAATGAATCAAAGT- 438
consensus_8238#2      GTTTATGTGCGAAATGTGAGCAATATATTGGTATGCAAGGTGGTGGGATGGATCAAGCTG 395
                       ** *    **** * *    * *****     **  *** * *   *** *****  * 

consensus_8238#0      CAATTATCTTGTGCTAATCTTTATCAGTGTTCTTGTCGTGAATTGGATAAATTAATAAGT 647
consensus_8238#1      CAATTATCTTGTGCTAATCTTTATCAGTGTTCTTGTCGTGAATTGGATAAATTAATAAGT 498
consensus_8238#2      CAAGTGTTTTAG--CAGTTGAAAATAATGCTTTAAT----GATTGAGTTTATCA--AACC 447
                      *** * * **     * *    *  * ** * *  *     ****  *  ** *  **  

consensus_8238#0      GTTTGCAGATCAGCTGGTGCT-TTTGGCAGTCGTCTAACTGGAGCTGGTTGGGGTGGCTG 706
consensus_8238#1      GTTTGCAGATCAGCTGGTGCT-TTTGGCAGTCGTCTAACTGGAGCTGGTTGGGGTGGCTG 557
consensus_8238#2      CTTTGTCA--CAGTCAGTCCTATTCAATTACCATCTGATATGGTTT--TTGTGATAGCTC 503
                       ****     ***   ** ** **       * *** *   *   *  *** * * *** 

consensus_8238#0      CACTGTATCATTA-GTGAAAAAATCTAATGCTGAGNCAATCATTGCANAAGTACGCGAAG 765
consensus_8238#1      CACTGTATCATTA-GTGAAAAAATCTAATGCTGAGCAATTCATTGCAAAAGTACGCGAAG 616
consensus_8238#2      ATTCGGGTGTCCACGCTCGGAAAGCTGCTCC--ATCATATTATAACGAACGTGTG-GCAG 560
                          *  *    * *     *** **  * *  *     * **  *  * **  * * **

consensus_8238#0      AATTNCTATATGTGATTGATGGGTACAGCNNATACGACTTGATATTCNGTAGTCAGCCAG 825
consensus_8238#1      AATTCTATAATGTGATTGATGGTAACAGCAATAACGACTTGATATTCGTTAGTCAGCCAG 676
consensus_8238#2      AATGTC-------GATTAGCGGCTAAAATATTAGCT-CGAAATAGCCCGCATATAACTGA 612
                      ***          ****   **  * *       *  *   ***  *   *   * *   

consensus_8238#0      GTCGTCCAGCTGG--AAATATGGNTANNTCATGAT--AAGTGATNC-TTNTGCTA-CGCT 879
consensus_8238#1      GTCGTCCAGCTGG--AATAATGGTTATTCAATGAATAAAGTGATTCCTTTTGCTAACGCT 734
consensus_8238#2      ACCTTCTAACTATTCATCCATTGCACCCTTATGTCT-CAGT------------------- 652
                        * ** * **    *   ** *       ***     ***                   

consensus_8238#0      TA--TATAAAAATNGTCTCATTACTTNNT-----GGATGAT--AATTTTT--------AA 922
consensus_8238#1      TTATTATAAAAATTTGTTCTTCATTTACTTTTGTGATTGATTTAATTTTTTTAATTTTAT 794
consensus_8238#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8238#0      TTATTGGTAGATGGACTTTC--TTAAATATTNGATG-TNCATAAATACATAAATTG---- 975
consensus_8238#1      TTGTTATGATTTGGACTTTTCTTTAAAAATTATTTGATTTGTTTCCACTTAGATTATACA 854
consensus_8238#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8238#0      ---------------
consensus_8238#1      ATAAAATGTTTGTTT 869
consensus_8238#2      ---------------