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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8242#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 817 fasta sequence
[GAATTTTGAAGTGATAGAGCTGTCAATGCTGAAAAAGCATATGTTTTTTCCTCTTTCTGGTTTGGGGAATTTTACTGCCCAGACTCTATTATATCCATTTGTTTTGCTTCGTACGAGACTCCAACTTCAAGAAGGTGCCCAGGTTTATCGTGGTCTTGTACATGCAATTTCTTCTGTTGTCAAGGAAGAGGGTTTTCGAGGATTGTATAGTGGCTACTTGGTTCGATCATTTCACATATTCTCAGGTACCATTTACGTTTCCACATATGAAGTAGCCAGACAAGCATGTACAGTCTTTCCAACACTAAGTCCTATTCACCGATCTTTTGTTGGTGGTGCAGTGGCTTCATGTGTTGCTCAAGGTTTTTTTGTTCCTATTGATGTTGTGTCTCAACATTTAATGGTTGTGAATTGTAATCGTATTCATACAAATATGGTTTACAAAAATTCGAATTTATCATCTAACCCACACCGTTTTCGTCCATTAACTCCGGTTCATTTAACAGAAAATGAAATGAATTCCAATTGGGGTCGTCTTTGTGGCGTAATTCGTTATATCAAACAAACTCACGGGCTAAAAGGTTTCTACAAAGGTTGCCTGATATCTATGTGCACTTTTGTACCTAGTTCGGCATTGTGGTGGTCTTTTTATGATAAATTTTGTGGTCTAATTCATTTTATTTCAAAGAAAATGTGTAAGGAACATGTTCAAGACTCGGTATTGTTGCCATCAAACGATGATTCTGCTCCAGTTCCTAGATTATTGATTCAGTTGATTTCGGCTCCTCTAGCTGGCATTTCATCTGCTATCATTGTT]
[+] EMBL CD148756 [GAATTTTGAAGTGATAGAGCTGTCAATGCTGAAAAAGCATATGTTTTTTCCTCTTTCTGGTTTGGGGAATTTTACTGCCCAGACTCTATTATATCCATTTGTTTTGCTTCGTACGAGACTCCAACTTCAAGAAGGTGCCCAGGTTTATCGTGGTCTTGTACATGCAATTTCTTCTGTTGTCAAGGAAGAGGGTTTTCGAGGATTGTATAGTGGCTACTTGGTTCGATCATTTCACATATTCTCAGGTACCATTTACGTTTCCACATATGAAGTAGCCAGACAAGCA ]
[-] EMBL CD193967 [ CTATTATATCCATTTGTTTTGCTTCGTACGAGACTCCAACTTCAAGAAGGTGCCCAGGTTTATCGTGGTCTTGTACATGCAATTTCTTCTGTTGTCAAGGAAGAGGGTTTTCGAGGATTGTATAGTGGCTACTTGGTTCGATCATTTCACATATTCTCAGGTACCATTTACGTTTCCACATATGAAGTAGCCAGACAAGCATGTACAGTCTTTCCAACACTAAGTCCTATTCACCGATCTTTTGTTGGTGGTGCAGTGGCTTCATGTGTTGCTCAAGGTTTTTTTGTTCCTATTGATGTTGTGTCTCAACATTTAATGGTTGTG ]
[+] EMBL CD148681 [ TTTACGTTTCCACATATGAAGTAGCCAGACAAGCATGTACAGTCTTTCCAACACTAAGTCCTATTCACCGATCTTTTGTTGGTGGTGCAGTGGCTTCATGTGTTGCTCAAGGTTTTTTTGTTCCTATTGATGTTGTGTCTCAACATTTAATGGTTGTGAATTGTAATCGTATTCATACAAATATGGTTTACAAAAATTCGAATTTATCATCTAACCCACACCGTTTTCGTCCATTAACTCCGGTTCATTTAACAGAAAATGAAATGAATTCCAATTGGGGTCGTCTTTGTGGCGTAATTCGTTATATCAAACAAACTCACGGGCTAAAAGGTTTCTACAAAGGTTGCCTGATATCTATGTGCACTTTTGTACCTAGTTCGGCATTGTGGTGGTCTTTTTATGATAAATTTTGTGGTCTAATTCATTTTATTTCAAAGAAAATGTGTAAGGAACATGTTCAAGACTCGGTATTGTTGCCATCAAACGATGATTC ]
[+] EMBL CD119009 [ TTTGTTGGTGGTGCAGTGGCTTCATGTGTTGCTCAAGGTTTTTTTGTTCCTATTGATGTTGTGTCTCAACATTTAATGGTTGTGAATTGTAATCGTATTCATACAAATATGGTTTACAAAAATTCGAATTTATCATCTAACCCACACCGTTTTCGTCCATTAACTCCGGTTCATTTAACGGAAAATGAAATGAATTCCAATTGGGGTCGTCTTTGTGGCGTAATTCGTTATATCAAACAAACTCACGGGCTAAAAGGTTTCTACAAAGGTTGCCTGATATCTATGTGCACTTTTGTACCTAGTTCGGCATTGTGGTGGTCTTTTTATGATAAATTTTGTGGTCTAATTCATTTTATTTCAAAGAAAATGTGTCAGGAACATGTTCAAGACTCGGTATTGTTGCCATCAAACGATGATTCTGC ]
[-] EMBL CD119205 [ nGATGTTGTGTCTCAACATTTAATGGTTGTGAATTGTAATCGTATTCATACAAATATGGTTTACAAAAATTCGAATTTATCATCTAACCCACACCGTTTTCGTCCATTAACTCCGGTTCATTTAACAGAAAATGAAATGAATTCCAATTGGGGTCGTCTTTGTGGCGTAATTCGTTATACCAAACAAACTCACGGGCTAAAAGGTTTCTACAAAGGTTGCCTGATATCTATGTGCACTTTTGTACCTAGTTCGGCATTGTGGTGGTCTTTTTATGATAAATTTTGTGGTCTAATTCATTTTATTTCAAAGAAAATGTGTAAGGAACATGTTCAAGACTCGGTATTGTTGCCATCAAACGATGATTCTGCTCCAGTTCCTAGATTATTGATTCAGTTGATTTCGGCTCCTCTAGCTGGCATTTCATCTGCTATCATTGTT]
[-] EMBL CD119239 [ TATGGTTTACAAAAATTCGAATTTATCATCTAACCCACACCGTTTTCGTCCATTAACTCCGGTTCATTTAACAGAAAATGAAATGAATTCCAATCGGGGTCGTCTTTGTGGCGTAATTCGTTATATCAAACAAACTCACGGGCTAAAAGGTTTCTACAAAGGTTGCCTGATATCTATGTGCACTTTTGTACCTAGTTCGGCATTGTGGTGGTCTTTTTATGATAAATTTTGTGGTCTAATTCATTTTATTTCAAAGAAAATGTGTAAGGAACATGTTCAAGACTCGGTATTGTTGCCATCAAACGATGATTCTGCTCCAGTTCCTAGATTATTGATTCAGTTGATTTCGGCTCCTCTAGCTGGCATTTCATCTGCTATCATTGTT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||