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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8329#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 657 fasta sequence
[ATATATGAGAGACATTATTAAGAACAGCATCTAATGATTGAGCTCATTAGTCAGTAATAATCAAAACAGTTTTTAACACCATCCAGATTCATACCGCCAAGTATTTTTAAAACATTTCTTTTAATTTTAGTTCTATATAACAGAAGCTCATCGATTCCCGACCGTTGTTCAACTAATTGAGCACCATTCTCGTTCTGCTGATGGTTTGGTTTGTCCACTTCTTTATTCAGTACCGAAACCGCAATTTTTAAACCAACCTATGCAACAATCTTGCTATTCATCTGTCCCTCAAACATTACCCAGTTCAAGAATACCCGGTCCAAATCAATTTGAAGTCAATCCCATTGTTCACCAATCAAATGCTGAAATATCTAACTTCCCTTTAACTCATATAAATCCCGTATCACATGTGCCTAGACCATTTCATCCAAGTCATATAAACAATTCAGAAAGATTAAGTGCTTGTAGTGATTCTATCGGAAGTATGGAATTTGATGGATGGGAAATTGATAGGTCCGAAATTATAATGCGTCAAAAATTGGGCTGTGGTCAATATGGTGATGTATATGAAGCTGTTTGGAAACGTTTCAATTCTGTTGTTGCAGTAAAAACACTGAAACAAGATGTTAATCTGAATGTGAATGATTTTCTCAAAGA]
[+] EMBL CD185524 [ATATATGAGAGACATTATTAAGAACAGCATCTAATGATTGAGCTCATTAGTCAGTAATAATCAAAACAGTTTTTAACACCATCCAGATTCATACCGCCAAGTATTTTTAAAACATTTCTTTTAATTTTAGTTCTATATAACAGAAGCTCATCGATTCCCGACCGTTGTTCAACTAATTGAGCACCATTCTCGTTCTGCTGATGGTTTGGTTTGTCCACTTCTTTATTCAGTACCGAAACCGCAATTTTTAAACCAACCTATGCAACAATCTTGCTATTCATCTGTCCCTCAAACATTACCCAGTTCAAGAATACCCGGTCCAAATCAATTTGAAGTCAATCCCATTGTTCACCAATCAAATGCTGAAATATCTAACTTCCCTTTAACTCATATAAATCCCGTATCACATGTGCCTAGACCATTTCATCCAAGTCATATAAACAATTCAGAAAGATTAAGTGCTTGTAGTGATTCTATCGGAAGTATGGAATTTGATGGATGGGAAATTGATAGGTCCGAAATTATAATGCGTCAA ]
[+] EMBL CD133800 [ATATATGAGAGACATTATTAAGAACAGCATCTAACGATTGAGCTCATTAGTCAGCAATAATCAAAACAGTTTTTAACACCATCCAGATTCATACCGCCAAGTATTTTTAAAACATTTCTTTTAATTTTAGTTCTATATAACAGAAGCTCATCGATTCCCGACCGTTGTTCAACTAATTGAGCACCATTCTCGTTCTGCTGATGGTTTGGTTTGTCCACTTCTTTATTCAGTACCGAAACCGCAATTTTTAAACCAACCTATGCAACAATCTTGCTATTCATCTGTCCCTCAAACATTACCCAGTTCAAGAATACCCGGTCCAAATCAATTTGAAGTCAATCCCATTGTTCACCAATCAAATGCTGAAATATCTAACTTCCCTTTAACTCATATAAATCCCGTATCACATGTGCCTAGATCATTTCATCCAAGTCATATAAACAATTCAGAAAGATTAAGTGCTTGTAGTGATTCTATCGGAAGTATGGAATTTGATGGATGGGAAATTGATAGGTCCGAAATT ]
[-] EMBL CD185606 [ TATATGAGAGACATTATTAAGAACAGCATCTAATGATCGAGCTCATTAGTCAGTAATAATCAAAACAGTTTTTAACACCATCCAGATTCATACCGCCAAGTATTTTTAAAACATTTCTTTTAATTTTAGTTCTATATAACAGAAGCTCATCGATTCCCGATCGTTGTTCAACTAATTGAACACCATTCTCGTTCTGCTGATGGTTTGGTTTGTCCACTTCTTTATTCAGTACCGAAACCGCAATTTTTAAACCAACCTATGCAACAATCTTGCTATTCATCTGTCCCTCAAACATTACCCAGTTCAAGAATACCCGGTCCAAATCAATTTGAAGTCAATCCCATTGTTCACCAATCAAATGCTGAAATATCTAACTTCCCTTTAACTCATATAAATCCCGTATCACATGTGCCTAGACCATTTCATCCAAGTCATATAAACAATTCAGAAAGATTAAGTGCTTGTAGTGATTCTATCGGAAGTATGGAGTTTGATGGATGGGAAATTGATAGGTCCGAAATTA ]
[+] EMBL CD119985 [ TATCACATGTGCCTAGACCATTTCATCCAAGTCATATAAACAATTCAGAAAGATTAAGTGCTTGTAGTGATTCTATCGGAAGTATGGAATTTGATGGATGGGAAATTGATAGGTCCGAAGTTATAATGCGTCAAAAATTGGGCTGTGGTCAATATGGTGATGTATATGAAGCTGTTTGGAAACGTTTCAATTCTGTTGTTGCAGTAAAAACACTGAAACAAGATGTTAATCTGAATGTGAATGATTTTCTCAAAag]
[-] EMBL CD120207 [ ATCACATGTGCCTAGACCATTTCATCCAAGTCATATAAACAATTCAGAAAGATTAAGTGCTTGTAGTGATTCTATCGGAAGTATGGAATTTGATGGATGGGAAATTGATAGGTCCGAAATTATAATGCGTCAAAAATTGGGCTGTGGTCAATATGGTGATGTATATGAAGCTGTTTGGAAACGTTTCAATTCTGTTGTTGCAGTAAAAACACTGAAACAAGATGTTAATCTGAATGTGAATGATTTTCTCAAAGA]
[-] EMBL CD120307 [ ATCACATGTGCCTAGACCATTTCATCCAAGTCATATAAACAATTCAGAAAGATTAAGTGCTTGTAGTGATTCTATCGGAAGTATGGAATTTGATGGATGGGAAATTGATAGGTCCGAAATTATAATGCGTCAAAAATTGGGCTGTGGTCAATATGGTGATGTATATGAAGCTGTTTGGAAACGTTTCAATTCTGTTGTTGCAGTAAAAACACTGAAACAAGATGTTAATCTGAATGTGAATGATTTTCTCAAAGA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||