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Schistosoma mansoni
cluster # 8333 cluster # 8333       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8333#0 length = 1034 sequences # 6  
consensusID : consensus_8333#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1034
fasta sequence 
                              [ACCTGACTTGCTCGATTCACTGTCAGAAGTAGATTTGGATGAAATAGTTGACCTCGTATTGAGTTGTCAGAAAAAGTGTGGTGGATTCGCTCCTTGCCCCAAACATGATGCCCATCTGCTCTCAACTTTAAGCGCTATCCAAATACTTGCAATGTATGACTGCTTAAACAAGG-TGAA-TGTTGAGGCCGTGTGTGCATTCGTTTCCAAATTACAGG-TGAGA-TGTGTACGGGTTTACAAGTTTTCCTTAATGCTCAAACTGA-TAGTAG-TGTGATGCCTCTGTAGCTCTCATACTTGTTGAGACCTTTCTTTGGTATATAGATGAACAACCAGATGGAAGTTTCGCTGGAGATATTTGGGGGGAAATCGACACTCGTTTTTCATTTTGTGCCGTTGCTACACTGCATATACTTGGAATGCTTTCTAAAAATACTATTGACATTGAAGCTTGTGCTTCATACCTCGAAAAGTGTCAAAATTTGGATGGATGTTTCGGAACTCGACCTGGAAGTGAATCCCATGCAGGTCAAGCATATTGTGTCGTGGGAGCTCTGGCTATACTTCGTCAACTACATCGGTTAAATATAGACCGTGCTGCTTGGTGGCTGGCCGAACGTCAGCTTCCTAGCGGAGGTTTAAATGGAAGACCGGAAAAACACCCTGGTGTGTGCTATTCATGGTGGACTGTAGCTACTCTTGCTATTTTTGGTCGTTTGACATGGATTAAGCAAACTGACCTTACTCGGTTCATCTTAGCTTCTCAAGATGACCAAACTGGCGGTATAGCAGATAAACCCGGAAATATTCCTGACCCATTTCATACTTTATTTGGTCTTGCTGGTCTCTCTTTATTAGCCCAGGTTGACTCATATTTTTCCTCACCAAAGAAAATGGAAAATGGATTAAATGGTGTCGAAGATCCAGCCTTTGTTGCTTTACAAACGGCTAGAAATAAGTTGAAGACTATTAATCCAGTATTATGCATGCCCCAATACATAATAGATCGACTGCAGCTCAAATTTCAACTACTGTAAATA]

[+] EMBL CD082251             [ACCTGACTTGCTCGATTCACTGTCAGAAGTAGATTTGGATGAAATAGTTGACCTCGTATTGAGTTGTCAGAAAAAGTGTGGTGGATTCGCTCCTTGCCCCAAACATGATGCCCATCTGCTCTCAACTTTAAGCGCTATCCAAATACTTGCAATGTATGACTGCTTAAACAAGG TGAA TGTTGAGGCCGTGTGTGCATTCGTTTCCAAATTACAGG TGAGA TGTGTACGGGTTTACAAGTTTTCCTTAATGCTCAAACTGA TAGTAG TGTGATGCCTCTGTAGCTCTCATACTTGTTGAGACCTTTCTTTGGTATATAGATGAACAACCAGATGGAAGTTTCGCTGGAGATATTTGGGGGGAAATCGACACTCGTTTTTCATTTTGTGCCGTTGCTACACTGCATATACTTGGAATGCTTTCTAAAAATACTATTGACATTGAAGCTTGTGCTTCATACCTCGAAAAGTGTCAAAATTTGGATGGATGTTTCGGAACTCGACCTGGAAGTGAATCCCATGCAGGTCAAGCATATTGTGTCGTGGGAGCTCTGGCTATACTTCGTCAACTACATCGGTTAAATATAGACCGTGCTGCTTGGTGGCTGGCCGAACGTCAGCTTCCTAGCGGAGGTTTAAATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD171440             [                                                                                                                                                         tatTGACTGCTTAAACAAGGTTGAATTGTTGAGGCCGTGTGTGCATTCGTTTCCAAATTACAGGTTGAGATTGTGTACGGGTTTACAAGTTTTCCTTAATGCTCAAACTGATTAGTAGTTGTGATGCCTCTGTAGCTCTCATACTTGTTGAGACCATTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD170818             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGCTTCATACCTCGAAAAGTGTCAAAATTTGGATGGATGTTTCGGAACTCGACCTGGAAGTGAATCCCATGCAGGTCAAGCATATTGTGTCGTGGGAGCTCTGGCTATACTTCGTCAACTACATCGGTTAAATATAGACCGCGCTGCTTGGTGGCTGGCCGAACGTCAGCTTCCTAGCGGAGGTTTAAATGGAAGACCGGAAAAACACCCTGGTGTGTGCTATTCATGGTGGACTGTAGCTACTCTTGCTATTTTTGGTCGTTTGACATGGATTAAGCAAACTGACCTTACTCGGTTCATCTTAGCTTCTCAAGATGACCAAACTGGCGGTATAGCAGATAAACCCGG                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD083330             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTATACTTCGTACACTACATCGGTTAAATATAGACCGTGCTGCTTGGTGGCTGGCCGAACGTCAGCTTCCTAGCGGAGGTTTAAATGGAAGACCGGAAAAACACCCTGATGTGTGCTATTCATGGTGGACTGTAGCTACTCTTGCTATTTTTGGTCGTTTGACATGGATTAAGCAAACTGACCTTACTCGGTTCATCTTAGCTTCTCAAGATGACCAAACTGGCGGTATAGCAGATAAACCCGGAAATATTCCTGACCCATTTCATACTTTATTTGGTCTTGCTGGTCTCTCTTTATTAGCCCAGGTTGACTCATATTTTTCCTCACCAAAGAAAATGGAAAATGGATTAAATGGTGTCGAAGATCCAGCCTTTGTTGCTTTACAAACGGCTAGAAATAAGTTGAAGACTATTAATCCAGTATTATGCATGCCCCAATACATAATAGATCGACTGCAGCTCAAATTTCAACTACTGTAAATA]
[+] EMBL CD083403             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGTGTGCTATTCATGGTGGACTGTAACTACTCTTGCTATTGTTGGTCGTTTGACATGGATTAAGCAAACTGACCTTACTCGGTTCATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD141490             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CATGGATTAAGCAAACTGACCTTACTCGGTTCATCTTAGCTTCTCAAGATGACCAAACTGGCGGTATAGCAGATAACCCCGGAAATATTCCTGACCCATTTCATACTTTATTTGGTCTTGCTGGTCTCTCTTTATTAGCCCAGGTTGACTCATATTTTTCCTCACCAAAGAAAATGGAAAATGGATTAAATGGTGTCGAAGATCCAGCCTTTGTTGCTTTACAAACGGCTAGAAATAAGTTGAAGACTATTAATCCAGTATTATGCATGCCCCAATACATAATAGATCGACTGCAGCTCAAATTTCAACTACTG      ]




>consensus_8333#0
ACCTGACTTGCTCGATTCACTGTCAGAAGTAGATTTGGATGAAATAGTTGACCTCGTATT
GAGTTGTCAGAAAAAGTGTGGTGGATTCGCTCCTTGCCCCAAACATGATGCCCATCTGCT
CTCAACTTTAAGCGCTATCCAAATACTTGCAATGTATGACTGCTTAAACAAGGTGAATGT
TGAGGCCGTGTGTGCATTCGTTTCCAAATTACAGGTGAGATGTGTACGGGTTTACAAGTT
TTCCTTAATGCTCAAACTGATAGTAGTGTGATGCCTCTGTAGCTCTCATACTTGTTGAGA
CCTTTCTTTGGTATATAGATGAACAACCAGATGGAAGTTTCGCTGGAGATATTTGGGGGG
AAATCGACACTCGTTTTTCATTTTGTGCCGTTGCTACACTGCATATACTTGGAATGCTTT
CTAAAAATACTATTGACATTGAAGCTTGTGCTTCATACCTCGAAAAGTGTCAAAATTTGG
ATGGATGTTTCGGAACTCGACCTGGAAGTGAATCCCATGCAGGTCAAGCATATTGTGTCG
TGGGAGCTCTGGCTATACTTCGTCAACTACATCGGTTAAATATAGACCGTGCTGCTTGGT
GGCTGGCCGAACGTCAGCTTCCTAGCGGAGGTTTAAATGGAAGACCGGAAAAACACCCTG
GTGTGTGCTATTCATGGTGGACTGTAGCTACTCTTGCTATTTTTGGTCGTTTGACATGGA
TTAAGCAAACTGACCTTACTCGGTTCATCTTAGCTTCTCAAGATGACCAAACTGGCGGTA
TAGCAGATAAACCCGGAAATATTCCTGACCCATTTCATACTTTATTTGGTCTTGCTGGTC
TCTCTTTATTAGCCCAGGTTGACTCATATTTTTCCTCACCAAAGAAAATGGAAAATGGAT
TAAATGGTGTCGAAGATCCAGCCTTTGTTGCTTTACAAACGGCTAGAAATAAGTTGAAGA
CTATTAATCCAGTATTATGCATGCCCCAATACATAATAGATCGACTGCAGCTCAAATTTC
AACTACTGTAAATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)