cluster # 8348

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Schistosoma mansoni
cluster # 8348 cluster # 8348 Sequences # 6 consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_8348#0 length = 1231 sequences # 5

consensus_8348#1 length = 411 sequences # 1

consensusID : consensus_8348#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1231
fasta sequence

                              [CCAANAATTCGGCACGAGGTCTGTAGAAGTGATCTTCTTACCCCCCCTCCAAATAAAGAGCAATCTCTCCTCAAAGATATTTGTCCGCTTGTACAATTCGTTGACTTTCATGCTGTTATCTTTATTATTTTCCATTTGAATTTATCCACCGTGATCTTTCGTTGCTTATTTGTTTGTTCATTGACTCTAGATATATTTGCCATGGCGTATTGATTTGGTTTTGTTCTTATCTACTTCCTGTCTTGTTGCTATCCATGTGATACCACCATTGAATGATGCTTAAAATCAGTATTTTTTTTGCTCTTTAGAATAAGTTTTGCTTAATATTCTATTTTTTTAATTAGTTTCCCGATTCTTCTCTTTTTATCTATCTACCTGTGTGTGTGTGCCTGTACTTTGTTTTAACTCCATCATCTCAAACTTTGTCGTTGCATTTTAAATTATCCCCATTAACCTATCAGTGTGTGTGTGTATACTTCTGAATGGCTTGCTAGTCAGTCTTGAAATAAGAACTAACAATAATATATAATTACTTTCTATTGTGTTTATTTTTTTTCTCGTAGATTGTGTTATGTACGTGCCTTTTATCATGCTTATTACCTACCGTTATGTTGTCTTATATATTTTTTTCCAATTCCACTTTTATTATTATCTACAAAAAAATGGGCTGTTGTAACTTAAACGCGAATCTCTGTTTACATTCTGTATTTCTGTTCTTAGTATATTTGTGCATTTGTTTGTAAATGGATAAGTGTCTGTGCATACCTTTTATTAACTTATAGTTGGTTATTAAACATCTGTCCACCTTTTATTCGTAAATTATTGCATAATTGTAATCGACAGCTGTTATTTCACAGTGATCCTAGTCTACCCCCATGAAAGTCCGATGTTTTCTTCTCGTTGTGTTTCTTCTTTTATATTTTCTTTCTTATTAGAATAATTTTCTAAGATTGTTTTTTTATTATATCTGTATGGATTGTGTTAGAATAATTTACCTGTATGCACGTACATGCTACCTGTGTTTCTTCTATTTTTACATTGTGTTTCTTATATACATAGATATCTTAATACGTATTCTGTTGAATGATTTTCGTTTTCTGCCTGTTTTGTGTACGTTTGTGTCTTTGTTTTGTCTGTCTAACTATCCATCTGTTTTAAATTACTCAACCACGTCTATCTATGTAGTTTTGTGCTTGAATAATGGATGAACTCTTTTTGAATAAAAATATAT]

[+] EMBL CD081433             [CCAANAATTCGGCACGAGGTCTGTAGAAGTGATCTTCTTACCCCCCCTCCAAATAAAGAGCAATCTCTCCTCAAAGATATTTGTCCGCTTGTACAATTCGTTGACTTTCATGCTGTTATCTTTATTATTTTCCATTTGAATTTATCCACCGTGATCTTTCGTTGCTTATTTGTTTGTTCATTGACTCTAGATATATTTGCCATGGCGTATTGATTTGGTTTTGTTCTTATCTACTTCCTGTCTTGTTGCTATCCATGTGATACCACCATTGAATGATGCTTAAAATCAGTATTTTTTTTGCTCTTTAGAATAAGTTTTGCTTAATATTCTATTTTTTTAATTAGTTTCCCGATTCTTCTCTTTTTATCTATCTACCTGTGTGTGTGTGCCTGTACTTTGTTTTAACTCCATCATCTCAAACTTTGTCGTTGCATTTTAAATTATCCCCATTAACCTATCAGTGTGTGTGTGTATACTTCTGAATGGCTTGCTAGTCAGTCTTGAAATAAGAACTAACAATAATATATAATTACTTTCTATTGTGTTTATTTTTTTTCTCGTAGATTGTGTTATGTACGTGCCTTTTATCATGCTTATTACCTACCGTTATGTTGTCTTATATATTTTTTTCCAATTCCACTTTTATTATTATCTACAAAAAAATGGGCTGTTGTAACTTAAACGCGAATCTCTGTTTACATTCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD119883             [              tcttattTGTAGAAGTGATCTTCTTACCCCCCCTCCAAAAAAAGAGCAATCTCTCCTCAAAGATATTTGTCCGCTTGTACAATTCGTTGACTTTCATGCTGTTATCTTTATTATTTTCCATTTGAATTTATCCACCGTGATCTTTCGTTGCTTATTTGTTTGTTCATTGACTCTAGATATATTTGCCATGGCGTATTGATTTGGTTTTGTTCTTATCTACTTCCTGTCTTGTTGCTATCCATGTGATACCACCATTGAATGATGCTTAAAATCAGTATTTTTTTTGCTCTTTAGAATAAGTTTTGCTTAATATTCTATTTTTTTAATTAGTTTCCCGATTCTTCTCTTTTTATCTATCTACCTGTGTGTGTGTGCCTGTACTTTGTTTTAACTCCATCATCTCAAACTTTGTCGTTGCATTTTAAATTATCCCCATTAACCTATCAGTGTGTGTGTGTATACTTCTGAATGGCTTGCTAGTCAGTCTTGAAATAAGAACTAACAATAATATATAATTACTTTCTATTGTGTTTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD156667             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACCTACCGTTATGTTGTCTTATATATTTTTTTCCAATTCCACTTTTATTATTATCTACAAAAAAATGGGCTGTTGTAACTTAAACGCGAATCTCTGTTTACATTCTGTATTTCTGTTCTTAGTATATTTGTGCATTTGTTTGTAAATGGATAAGTGTCTGTGCATACCTTTTATTAACTTATAGTTGGTTATTAAACATCTGTCCACCTTTTATTCGTAAATTATTGCATAATTGTAATCGACAGCTGTTATTTCACAGTGATCCTAGTCTACCCCCATGAAAGTCCGATGTTTTCTTCTCGTTGTGTTTCTTCTTTTATATTTTCTTTCTTATTAGAATAATTTTCTAAGATTGTTTTTTTATTATATCTGTATGGATTGTGTTAGAATAATTTACCTGTATGCACGTACATGCTACCTGTGTTTCTTCTATTTTTACATTGTGTTTCTTATATACATAGAT                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD156777             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACCTACCGTTATGTTGTCTTATATATTTTTTTCCAATTCCACTTTTATTATTATCTACAAAAAAATGGGCTGTTGTAACTTAAACGCGAATCTCTGTTTACATTCTGTATTTCTGTTCTTAGTATATTTGTGCATTTGTTTGTAAATGGATAAGTGTCTGTGCATACCTTTTATTAACTTATAGTTGGTTATTAAACATCTGTCCACCTTTTATTCGTAAATTATTGCATAATTGTAATCGACAGCTGTTATTTCACAGTGATCCTAGTCTACCCCCATGAAAGTCCGATGTTTTCTTCTCGTTGTGTTTCTTCTTTTATATTTTCTTTCTTATTAGAATAATTTTCTAAGATTGTTTTTTTATTATATCTGTATGGATTGTGTTAGAATAATTTACCTGTATGCACGTACATGCTACCTGTGTTTCTTCTATTTTTACATTGTGTTTCTTATATACATAGAT                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD075260             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTGTAAATGGATAAGTGTCTGTGCATACCTTTTATTAACTTATAGTTGGTTATTAAACATCTGTCCACCTTTTATTCGTAAATTATTGCATAATTGTAATCGACAGCTGTTATTTCACAGTGATCCTAGTCTACCCCCATGAAAGTCCGATGTTTTCTTCTCGTTGTGTTTCTTCTTTTATATTTTCTTTCTTATTAGAATAATTTTCTAAGATTGTTTTTTTATTATATCTGTATGGATTGTGTTAGAATAATTTACCTGTATGCACGTACATGCTACCTGTGTTTCTTCTATTTTTACATTGTGTTTCTTATATACATAGATATCTTAATACGTATTCTGTTGAATGATTTTCGTTTTCTGCCTGTTTTGTGTACGTTTGTGTCTTTGTTTTGTCTGTCTAACTATCCATCTGTTTTAAATTACTCAACCACGTCTATCTATGTAGTTTTGTGCTTGAATAATGGATGAACTCTTTTTGAATAAAAATATAT]




>consensus_8348#0
CCAANAATTCGGCACGAGGTCTGTAGAAGTGATCTTCTTACCCCCCCTCCAAATAAAGAG
CAATCTCTCCTCAAAGATATTTGTCCGCTTGTACAATTCGTTGACTTTCATGCTGTTATC
TTTATTATTTTCCATTTGAATTTATCCACCGTGATCTTTCGTTGCTTATTTGTTTGTTCA
TTGACTCTAGATATATTTGCCATGGCGTATTGATTTGGTTTTGTTCTTATCTACTTCCTG
TCTTGTTGCTATCCATGTGATACCACCATTGAATGATGCTTAAAATCAGTATTTTTTTTG
CTCTTTAGAATAAGTTTTGCTTAATATTCTATTTTTTTAATTAGTTTCCCGATTCTTCTC
TTTTTATCTATCTACCTGTGTGTGTGTGCCTGTACTTTGTTTTAACTCCATCATCTCAAA
CTTTGTCGTTGCATTTTAAATTATCCCCATTAACCTATCAGTGTGTGTGTGTATACTTCT
GAATGGCTTGCTAGTCAGTCTTGAAATAAGAACTAACAATAATATATAATTACTTTCTAT
TGTGTTTATTTTTTTTCTCGTAGATTGTGTTATGTACGTGCCTTTTATCATGCTTATTAC
CTACCGTTATGTTGTCTTATATATTTTTTTCCAATTCCACTTTTATTATTATCTACAAAA
AAATGGGCTGTTGTAACTTAAACGCGAATCTCTGTTTACATTCTGTATTTCTGTTCTTAG
TATATTTGTGCATTTGTTTGTAAATGGATAAGTGTCTGTGCATACCTTTTATTAACTTAT
AGTTGGTTATTAAACATCTGTCCACCTTTTATTCGTAAATTATTGCATAATTGTAATCGA
CAGCTGTTATTTCACAGTGATCCTAGTCTACCCCCATGAAAGTCCGATGTTTTCTTCTCG
TTGTGTTTCTTCTTTTATATTTTCTTTCTTATTAGAATAATTTTCTAAGATTGTTTTTTT
ATTATATCTGTATGGATTGTGTTAGAATAATTTACCTGTATGCACGTACATGCTACCTGT
GTTTCTTCTATTTTTACATTGTGTTTCTTATATACATAGATATCTTAATACGTATTCTGT
TGAATGATTTTCGTTTTCTGCCTGTTTTGTGTACGTTTGTGTCTTTGTTTTGTCTGTCTA
ACTATCCATCTGTTTTAAATTACTCAACCACGTCTATCTATGTAGTTTTGTGCTTGAATA
ATGGATGAACTCTTTTTGAATAAAAATATAT

consensusID : consensus_8348#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 411
fasta sequence

                              [GCTGTTGTAACTTANACGCGAATCTCTGTTCACATTCTGTATTTCTGTTCTTAGTATATTTGCGCATTTGTTTGTAAATGGATAAGTGTCTGTGCATACCTTTTATTAACTTATAGTTGGTTATTAAACATCTGTCCACCTTTTATTCGTAAATTATTGCATAATTGTAATCGACAGCTGTTATTTCACAGTGATCATAGTCTACCCCCATGAAAGTCCGATGTTTTCTTCTCGATGTGTTCCGTCTTTTAGACTTTCTTTCTTATTAGAATAATTTTCTAAGATTGTTCTTTTATTATATCTGTACGGATTGTGTTAGAATAATTTACCTGTATGCACGTACATGCTACCTGTGTTTCTTCTATTTTCACAGTGTGTTTCTTATATACATAGATGGTAAGACCCAATCGA]

[-] EMBL CD067683             [GCTGTTGTAACTTANACGCGAATCTCTGTTCACATTCTGTATTTCTGTTCTTAGTATATTTGCGCATTTGTTTGTAAATGGATAAGTGTCTGTGCATACCTTTTATTAACTTATAGTTGGTTATTAAACATCTGTCCACCTTTTATTCGTAAATTATTGCATAATTGTAATCGACAGCTGTTATTTCACAGTGATCATAGTCTACCCCCATGAAAGTCCGATGTTTTCTTCTCGATGTGTTCCGTCTTTTAGACTTTCTTTCTTATTAGAATAATTTTCTAAGATTGTTCTTTTATTATATCTGTACGGATTGTGTTAGAATAATTTACCTGTATGCACGTACATGCTACCTGTGTTTCTTCTATTTTCACAGTGTGTTTCTTATATACATAGATGGTAAGACCCAATCGA]




>consensus_8348#1
GCTGTTGTAACTTANACGCGAATCTCTGTTCACATTCTGTATTTCTGTTCTTAGTATATT
TGCGCATTTGTTTGTAAATGGATAAGTGTCTGTGCATACCTTTTATTAACTTATAGTTGG
TTATTAAACATCTGTCCACCTTTTATTCGTAAATTATTGCATAATTGTAATCGACAGCTG
TTATTTCACAGTGATCATAGTCTACCCCCATGAAAGTCCGATGTTTTCTTCTCGATGTGT
TCCGTCTTTTAGACTTTCTTTCTTATTAGAATAATTTTCTAAGATTGTTCTTTTATTATA
TCTGTACGGATTGTGTTAGAATAATTTACCTGTATGCACGTACATGCTACCTGTGTTTCT
TCTATTTTCACAGTGTGTTTCTTATATACATAGATGGTAAGACCCAATCGA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_8348#0      CCAANAATTCGGCACGAGGTCTGTAGAAGTGATCTTCTTACCCCCCCTCCAAATAAAGAG 60
consensus_8348#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8348#0      CAATCTCTCCTCAAAGATATTTGTCCGCTTGTACAATTCGTTGACTTTCATGCTGTTATC 120
consensus_8348#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8348#0      TTTATTATTTTCCATTTGAATTTATCCACCGTGATCTTTCGTTGCTTATTTGTTTGTTCA 180
consensus_8348#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8348#0      TTGACTCTAGATATATTTGCCATGGCGTATTGATTTGGTTTTGTTCTTATCTACTTCCTG 240
consensus_8348#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8348#0      TCTTGTTGCTATCCATGTGATACCACCATTGAATGATGCTTAAAATCAGTATTTTTTTTG 300
consensus_8348#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8348#0      CTCTTTAGAATAAGTTTTGCTTAATATTCTATTTTTTTAATTAGTTTCCCGATTCTTCTC 360
consensus_8348#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8348#0      TTTTTATCTATCTACCTGTGTGTGTGTGCCTGTACTTTGTTTTAACTCCATCATCTCAAA 420
consensus_8348#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8348#0      CTTTGTCGTTGCATTTTAAATTATCCCCATTAACCTATCAGTGTGTGTGTGTATACTTCT 480
consensus_8348#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8348#0      GAATGGCTTGCTAGTCAGTCTTGAAATAAGAACTAACAATAATATATAATTACTTTCTAT 540
consensus_8348#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8348#0      TGTGTTTATTTTTTTTCTCGTAGATTGTGTTATGTACGTGCCTTTTATCATGCTTATTAC 600
consensus_8348#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8348#0      CTACCGTTATGTTGTCTTATATATTTTTTTCCAATTCCACTTTTATTATTATCTACAAAA 660
consensus_8348#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8348#0      AAATGGGCTGTTGTAACTTAAACGCGAATCTCTGTTTACATTCTGTATTTCTGTTCTTAG 720
consensus_8348#1      ------GCTGTTGTAACTTANACGCGAATCTCTGTTCACATTCTGTATTTCTGTTCTTAG 54
                            ************** *************** ***********************

consensus_8348#0      TATATTTGTGCATTTGTTTGTAAATGGATAAGTGTCTGTGCATACCTTTTATTAACTTAT 780
consensus_8348#1      TATATTTGCGCATTTGTTTGTAAATGGATAAGTGTCTGTGCATACCTTTTATTAACTTAT 114
                      ******** ***************************************************

consensus_8348#0      AGTTGGTTATTAAACATCTGTCCACCTTTTATTCGTAAATTATTGCATAATTGTAATCGA 840
consensus_8348#1      AGTTGGTTATTAAACATCTGTCCACCTTTTATTCGTAAATTATTGCATAATTGTAATCGA 174
                      ************************************************************

consensus_8348#0      CAGCTGTTATTTCACAGTGATCCTAGTCTACCCCCATGAAAGTCCGATGTTTTCTTCTCG 900
consensus_8348#1      CAGCTGTTATTTCACAGTGATCATAGTCTACCCCCATGAAAGTCCGATGTTTTCTTCTCG 234
                      ********************** *************************************

consensus_8348#0      TTGTGTTTCTTCTTTTATATTTTCTTTCTTATTAGAATAATTTTCTAAGATTGTTTTTTT 960
consensus_8348#1      ATGTGTTCCGTCTTTTAGACTTTCTTTCTTATTAGAATAATTTTCTAAGATTGTTCTTTT 294
                       ****** * ******* * *********************************** ****

consensus_8348#0      ATTATATCTGTATGGATTGTGTTAGAATAATTTACCTGTATGCACGTACATGCTACCTGT 1020
consensus_8348#1      ATTATATCTGTACGGATTGTGTTAGAATAATTTACCTGTATGCACGTACATGCTACCTGT 354
                      ************ ***********************************************

consensus_8348#0      GTTTCTTCTATTTTTACATTGTGTTTCTTATATACATAGATATCTTAATACGTATTCTGT 1080
consensus_8348#1      GTTTCTTCTATTTTCACAGTGTGTTTCTTATATACATAGATG--GTAAGACCCAATCGA- 411
                      ************** *** **********************    *** **  * **   

consensus_8348#0      TGAATGATTTTCGTTTTCTGCCTGTTTTGTGTACGTTTGTGTCTTTGTTTTGTCTGTCTA 1140
consensus_8348#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8348#0      ACTATCCATCTGTTTTAAATTACTCAACCACGTCTATCTATGTAGTTTTGTGCTTGAATA 1200
consensus_8348#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8348#0      ATGGATGAACTCTTTTTGAATAAAAATATAT 1231
consensus_8348#1      -------------------------------