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Schistosoma mansoni
cluster # 8365 cluster # 8365       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8365#0 length = 1061 sequences # 6  
consensusID : consensus_8365#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1061
fasta sequence 
                              [TTTGACTCACTACTTCCATTTCCTACCCCTTTTGTCCAGTACCTAACATACGGACTTCGGCAGAACACCGTTCTTTCAGAGGAACTACACAGGTAATATCTTTGTAGTCGTGAATAAGAGTCACTTTTACAAATAGCCACAAATTGTCTCAATTCTTGTGTTATTACCAATCATATACCGATAACCAGTGTTATTTTAAAGCGTTACTGGGGTGTACTTCGTATTCAACGATGCGTTTGGTCGAATTCTCTTAACCTGGTTTGGATACTTTGATTATGTTTAATATATATTTCTATTAAAAGAGTCGATGCAACAAAAAGCGAGAGTAAACCATTATGGAAAGCAATCTTAAATAGTGCAGTCAGTTATTTATTCTGCCTACCTTAAGAATTATAAAATACTTAAGGAACCGAGTTTTCGAAACAGTTGTGGCAGACTCCAAACACCATGATGTTTACTCCATTCATATACTTTATTCTCCACTACATATCACTTATAAACATAGTCATTATTAAAAGCATGAAGTTCAGCGAAGGGGTTTTACAACAAAGAGATCCCTTCACTGAACTTCGTGTTTTTAATTTCTAATATTTAAGTGGGAATTATTTGTCAATAGTTATTATTGACATACATTTATGTATTGACTTTAATAAACCAGTAAAAATACAGACATTTGCTTCTGTCGACTAAATAGCTTGTCAGCATCTATAGTGAACTTTTACTTAGGAAATTTGTTGAAAGGTTGCTCTTCAGTTGTATCACATGGATCAAATTTGTTTGCATGCCATGTACTGATGAGTCATTTCTCTTTGTTGTCGCAGGTCCTATCGCGTTATCCCTGGCGTCGACTATTTGAATTACTTTTCATCAGATCGTAGTCATATGCAGCGTGAGGATGGCAACTGGATAGCACCACCACCAACCTATGAATGCATACGTGGACAGAGTTCAAGTTCGCCGCATACTTTACCCTTCTACTTGGATATGACATCTAATGTAGTTGAGGACTTATCACTGACGAGCAGTGTATATGGAACTGTTTTAACTGAAAGCGAGTTTTT]

[+] EMBL CD081954             [TTTGACTCACTACTTCCATTTCCTACCCCTTTTGTCCAGTACCTAACATACGGACTTCGGCAGAACACCGTTCTTTCAGAGGAACTACACAGGTAATATCTTTGTAGTCGTGAATAAGAGTCACTTTTACAAATAGCCACAAATTGTCTCAATTCTTGTGTTATTACCAATCATATACCGATAACCAGTGTTATTTTAAAGCGTTACTGGGGTGTACTTCGTATTCAACGATGCGTTTGGTCGAATTCTCTTAACCTGGTTTGGATACTTTGATTATGTTTAATATATATTTCTATTAAAAGAGTCGATGCAACAAAAAGCGAGAGTAAACCATTATGGAAAGCAATCTTAAATAGTGCAGTCAGTTATTTATTCTGCCTACCTTAAGAATTATAAAATACTTAAGGAACCGAGTTTTCGAAACAGTTGTGGCAGACTCCAAACACCATGATGTTTACTCCATTCATATACTTTATTCTCCACTACATATCACTTATAAACATAGTCATTATTAAAAGCATGAAGTTCAGCGAAGGGGTTTTTCAACAAAGAGATCCCTTCACTGAACTTCGTGTTTTTAATTTCTAATATTTAAGTGGGAATTATTTGTCAATAGTTATTATTGACATACATTTATGTATTGACTNTAATANACCAGTAAAAATACAGACATTTGCTTCTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD140340             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATGGAAAGCAATCTTAAATAGTGCAGTCAGTTATTTATTCTGCCTACCTTAAGAATTATAAAATACTTAAGGAACCGAGTTTTCGAAACAGTTGTGGCAGACTCCAAACACCATGATGTTTACTCCATTCATATACTTTATTCTCCACTACATATCACTTATAAACATAGTCATTATTAAAAGCATGAAGTTCAGCGAAGGGGTTTTACAACAAAGAGATCCCTTCACTGAACTTCGTGTTTTTAATTTCTAATATTTAAGTGGGAATTATTTGTCAATAGTTATTATTGACATACATTTATGTATTGACTTTAATAAACCAGTAAAAATACAGACATTTGCTTCTGTCGACTAAATAGCTTGTCAGCATCTATAGTGAACTTTTACTTAGGAAATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD140441             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGGAAAGCAATCTTAAATAGTGCAGTCAGTTATTTATTCTGCCTACCTTAAGAATTAT AAATACTTAAGGAACCGAGTTTTCGAAACAGTTGTGGCAGACTCCAAACACCATGATGTTTACTCCATTCATATACTTTATTCTCCACTACATATCACTTATAAACATAGTCATTATTAAAAGCATGAAGTTCAGCGAAGGGGCTTTACAACAAAGAGATCCCTTCACTGAACTTCGTGTNTTTAATTTCTAATATTTAAGTGGGAATTATTTGTCAATAGTTATTATTGACATACATTTATGTATTGACTTTAATAAACCAGTAAAAATACAGACATTTGCTTCTGTCGACTAAATAGCTTGTCAGCATCTATAGTGAACTTTTACTTAGGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD140425             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTTTAATAAACCAGTAAAAATACAGACATTTGCTTCTGTCGACTAAATAGCTTGTCAGCATCTATAGTGAACTTTTACTTAGGAAATTTGTTGAAAGGTTGCTCTTCAGTTGTATCACATGGATCAAATTTGTTTGCATGCCATGTACTGATGAGTCATTTCTCTTTGTTGTCGCAGGTCCTATCGCGTTATCCCTGGCGTCGACTATTTGAATTACTTTTCATCAGATCGTAGTCATATGCAGCGTGAGGATGGCAACTGGATAGCACCACCACCAACCTATGAATGCATACGTGGACAGAGTTCAAGTTCGCCGCATACTTTACCCTTCTACTTGGATATGACATCTAATGTAGTTGAGGACTTATCACTGACGAGCAGTGTATATGGAACTGTTTTAACTGAAAGCGAGTTTTT]
[-] EMBL CD140394             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TAAACCAGTAAAAATACAGACATTGGCTTCTGTGGACTAAATAGCTTGTCAGAATCTATAGTGAACTTTTACTTAGGAAATTCGTTGAAAGGTTGCTCTTCAGTTGTATCACATGGATCAAATTTGTTTGCATGCCATGTACTGATGAGTCATTTCTCTTTGTTGTCGCAGGTCCTATCGCGTTATCCCTGGCGTCGACTATTTGAATTACTTTTCATCAGATCGTAGTCATATGCAGCGTGAGGATGGCAACTGGATAGCACCACCACCAACCTATGAATGCATACGTGGACAGAGTTCAAGTTCGCCGCATACTTTACCCTTCTACTTGGATATGACATCTAATGTAGTTGAGGACTTATCACTGACGAGCAGTGTATATGGAACTGTTTTAACTGAAAGCGAGTTTTT]
[-] EMBL CD140353             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATACAGACATTTGCTTCTGTGGACTAAATAGCTTGTCAGCATCTATAGTGAACTTTTACTTAGGAAATTTGTTGAAAGGTTGCTCTTCAGTTGTATCACATGGATCAAATTTGTTTGCATGCCATGTACTGATGAGTCATTTCTCTTTGTTGTCGCAGGTCCTATCGCGTTATCCCTGGCGTCGACTATTTGAATTACTTTTCATCAGATCGTAGTCATATGCAGCGTGAGGATGGCAACTGGATAGCACCACCACCAACCTATGAATGCATACGTGGACAGAGTTCAAGTTCGCCGCATACTTTACCCTTCTACTTGGATATGACATCTAATGTAGTTGAGGACTTATCACTGACGAGCAGTGTATATGGAACTGTTTTAACTGAAAGCGAGTTTTT]




>consensus_8365#0
TTTGACTCACTACTTCCATTTCCTACCCCTTTTGTCCAGTACCTAACATACGGACTTCGG
CAGAACACCGTTCTTTCAGAGGAACTACACAGGTAATATCTTTGTAGTCGTGAATAAGAG
TCACTTTTACAAATAGCCACAAATTGTCTCAATTCTTGTGTTATTACCAATCATATACCG
ATAACCAGTGTTATTTTAAAGCGTTACTGGGGTGTACTTCGTATTCAACGATGCGTTTGG
TCGAATTCTCTTAACCTGGTTTGGATACTTTGATTATGTTTAATATATATTTCTATTAAA
AGAGTCGATGCAACAAAAAGCGAGAGTAAACCATTATGGAAAGCAATCTTAAATAGTGCA
GTCAGTTATTTATTCTGCCTACCTTAAGAATTATAAAATACTTAAGGAACCGAGTTTTCG
AAACAGTTGTGGCAGACTCCAAACACCATGATGTTTACTCCATTCATATACTTTATTCTC
CACTACATATCACTTATAAACATAGTCATTATTAAAAGCATGAAGTTCAGCGAAGGGGTT
TTACAACAAAGAGATCCCTTCACTGAACTTCGTGTTTTTAATTTCTAATATTTAAGTGGG
AATTATTTGTCAATAGTTATTATTGACATACATTTATGTATTGACTTTAATAAACCAGTA
AAAATACAGACATTTGCTTCTGTCGACTAAATAGCTTGTCAGCATCTATAGTGAACTTTT
ACTTAGGAAATTTGTTGAAAGGTTGCTCTTCAGTTGTATCACATGGATCAAATTTGTTTG
CATGCCATGTACTGATGAGTCATTTCTCTTTGTTGTCGCAGGTCCTATCGCGTTATCCCT
GGCGTCGACTATTTGAATTACTTTTCATCAGATCGTAGTCATATGCAGCGTGAGGATGGC
AACTGGATAGCACCACCACCAACCTATGAATGCATACGTGGACAGAGTTCAAGTTCGCCG
CATACTTTACCCTTCTACTTGGATATGACATCTAATGTAGTTGAGGACTTATCACTGACG
AGCAGTGTATATGGAACTGTTTTAACTGAAAGCGAGTTTTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)