cluster # 8375

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Schistosoma mansoni
cluster # 8375 cluster # 8375 Sequences # 6 consensus # 3

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consensus_8375#0 length = 846 sequences # 2

consensus_8375#1 length = 808 sequences # 3
consensus_8375#2 length = 660 sequences # 1

consensusID : consensus_8375#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 846
fasta sequence

                              [GGAGCCAATATTCGGCACGACGTGAATTAGGGTACTAAAAACACAACTTTGAATTGTTCTACATCTTTTTTTAAAAAACTATCTGTACATAATTATCCCAGTTCATTCAAAGTTACTTTGTCCAGTTGTTTCTTTGAATGAGATAAACAAAATTATATTTATCTATTTCTATCTATTTGTCCGCCAAAAATGTTATTGTCTGTTAACGAGTATCTTAGACTTATTTTTTTCTTTCAATCTGTGTGTAATCATCATCATAATAATAATGCTACCACCTTGTTTTTGTAAAATGTTTATTATTGTCTAATTTGTTTGTATGCGCTTATGCTTGTATGTGTGTGTGTGTGTCTATGAATCAATCTTGATGGAATATTCTGTGTGTGTGTGTATGCGAGTTTGTGTGTTTGCATGTGCATACGTGTGTATGTGTATTTGTTTGAGTATTTTCTTTTCTTTTTTTTCTATATTTTCAGACGTGTTATGTGATGAGTTTTTGTTTTGTTTATTTGTATTTTTTTTTGTTTTTTTTGTTGGTTACTGTGCACTTAAAAATTGACGGTTTGAAAACAACAATAATAATAATAAATGCATTAATTATTGATTACTGATCTGATCATTAACAATGGGGCAAACCAACATGAGGAATCAGAAGATTAAATATTGCTAGCTTTGGCGTGTATCTACGGTAATCTGTGAATTTGTCTCCGTGTCATATATATATATATATAGGTTGGATTTCCAATTACTCATTATGATCATGTACATTTGAAAAAATTACCTTTCGTATATCACTTTTATTATTTTTAAATATGCTTCTCTTTTAAAAATAAATTAATAATATAAACA]

[+] EMBL CD081674             [GGAGCCAATATTCGGCACGACGTGAATTAGGGTACTAAAAACACAACTTTGAATTGTTCTACATCTTTTTTTAAAAAACTATCTGTACATAATTATCCCAGTTCATTCAAAGTTACTTTGTCCAGTTGTTTCTTTGAATGAGATAAACAAAATTATATTTATCTATTTCTATCTATTTGTCCGCCAAAAATGTTATTGTCTGTTAACGAGTATCTTAGACTTATTTTTTTCTTTCAATCTGTGTGTAATCATCATCATAATAATAATGCTACCACCTTGTTTTTGTAAAATGTTTATTATTGTCTAATTTGTTTGTATGCGCTTATGCTTGTATGTGTGTGTGTGTGTCTATGAATCAATCTTGATGGAATATTCTGTGTGTGTGTGTATGCGAGTTTGTGTGTTTGCATGTGCATACGTGTGTATGTGTATTTGTTTGAGTATTTTCTTTTCTTTTTTTTCTATATTTTCAGACGTGTTATGTGATGAGTTTTTGTTTTGTTTATTTGTATTTTTTTTTGTTTTTTTTGTTGGTTACTGTGCACTTAAAAATTGACGGTTTGAAAACAACAATAATAATAATAAATGCATTAATTATTGATTACTGATCTGATCATTAACAATGGGGCAAACCAACATGAGGAATCAGAAGATTAAATATTGCTAGCTTTGGCGTGTATCTACGGTAATCTGTGAATTTGTCTCCGTGTCATATATATATATATATAGGTTGGATTTCCAATTACTCATTATGATCATGTACATTTGAAAAAATTACCTTTCGTATATCACTTTTATTATTTTTAAATATGCTTCTCTTTTAAAAATAAATTAATAATATAAACA]
[+] EMBL CD091759             [                                                                                                                                                                   TATTTCTATCTATTTGTCCGCCAAAAATGTTATTGTCTGTTAACGAGTATCTTAGACTCATAGGCTGCTTTCAATCTGTGGGTAATCGTCATCATAATAATAATGCTACCACCTTGTTTTTGTAAAATGTTTATTATTGTCTAATTTGTTTGTATGCGCTTATGCTTGTATGTGTGTGTGTGTGTCTGTGATTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]




>consensus_8375#0
GGAGCCAATATTCGGCACGACGTGAATTAGGGTACTAAAAACACAACTTTGAATTGTTCT
ACATCTTTTTTTAAAAAACTATCTGTACATAATTATCCCAGTTCATTCAAAGTTACTTTG
TCCAGTTGTTTCTTTGAATGAGATAAACAAAATTATATTTATCTATTTCTATCTATTTGT
CCGCCAAAAATGTTATTGTCTGTTAACGAGTATCTTAGACTTATTTTTTTCTTTCAATCT
GTGTGTAATCATCATCATAATAATAATGCTACCACCTTGTTTTTGTAAAATGTTTATTAT
TGTCTAATTTGTTTGTATGCGCTTATGCTTGTATGTGTGTGTGTGTGTCTATGAATCAAT
CTTGATGGAATATTCTGTGTGTGTGTGTATGCGAGTTTGTGTGTTTGCATGTGCATACGT
GTGTATGTGTATTTGTTTGAGTATTTTCTTTTCTTTTTTTTCTATATTTTCAGACGTGTT
ATGTGATGAGTTTTTGTTTTGTTTATTTGTATTTTTTTTTGTTTTTTTTGTTGGTTACTG
TGCACTTAAAAATTGACGGTTTGAAAACAACAATAATAATAATAAATGCATTAATTATTG
ATTACTGATCTGATCATTAACAATGGGGCAAACCAACATGAGGAATCAGAAGATTAAATA
TTGCTAGCTTTGGCGTGTATCTACGGTAATCTGTGAATTTGTCTCCGTGTCATATATATA
TATATATAGGTTGGATTTCCAATTACTCATTATGATCATGTACATTTGAAAAAATTACCT
TTCGTATATCACTTTTATTATTTTTAAATATGCTTCTCTTTTAAAAATAAATTAATAATA
TAAACA

consensusID : consensus_8375#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 808
fasta sequence

                              [GACACAATTCATCTTTAAAGAGGCCGACACACGCGTATATATATATATATACGCGTGTGTGTACAGTGCTATGTGAAAAGTTATGGTTCTACGAAAACAAATCAGTCTTTCTATCTCTTTAATCCCTGTTTTCATAAAGTACTATTGTTAGGATAATGATAATTACTATACTGCCTAATTGTCATTTTCAATTGTAACTTTACTATTATGTATCTGTTTACCATCCCATCTTACCCTACAACATAGTCATCGTTCAGTCATATGTTTATATTTGAAAAATCCCGGTCATCGACCTATGCGTTTATCTCTTATCTTATTGTAAGTTTTAATTTTTTCTTGAACTCATTTAATTTCTTTCTCGGTTTTTATTTACTTCTTAAAAATATGACTTTCGTTGCAAACACACACACACACATGTCAGAATGCACATAATTCTTAACAGATACAAACAGATGAAATTGTACTTTCTGAATACACAGTCTCAAAAGTCATCAACGATAATAATAACAACAGTTCTTTTTGAAACACATACAACTGGTTTCGAATCTTTTCATTTTGAATTAGGGTACTAAAAACACAACTTTGAATTGTTCTACATCTTTTTTTAAAAAACTATCTGTACATAATTATCCCAGTTCATTCAAAGTTACTTTGTCCAGTTTCTTTGAATGAGATAAACAAAATTATATTTATCTATTTCTATCTATTTGTCCGCCAAAAATGTTATTGTCTGTTAACGAGTATCTTAGACTTATTTTTTTCTTTCAATCTGTGTGTAATCATCATCATAATAATAATGCTACCACCT]

[-] EMBL CD196209             [GACACAATTCATCTTTAAAGAGGCCGACACACGCGTATATATATATATATACGCGTGTGTGTACAGTGCTATGTGAAAAGTTATGGTTCTACGAAAACAAATCAGTCTTTCTATCTCTTTAATCCCTGTTTTCATAAAGTACTATTGTTAGGATAATGATAATTACTATACTGCCTAATTGTCATTTTCAATTGTAACTTTACTATTATGTATCTGTTTACCATCCCATCTTACCCTACAACATAGTCATCGTTCAGTCATAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD076283             [                                                                                                                                                                                                    ACTTTACTATANTGTATCTGTTTACCATCCCATCTTACCCTACAACATAGTCATCGTTCAGTCATATGTTTATATTTGAAAAATCCCGGTCATCGACCTATGCGTTTATCTCTTATCTTATTGTAAGTTTTAATTTTTTCTTGAACTCATTTAATTTCTTTCTCGGTTTTTATTTACTTCTTAAAAATATGACTTTCGTTGCAAACACACACACACACATGTCAGAATGCACATAATTCTTAACAGATACAAACAGATGAAATTGTACTTTCTGAATACACAGTCTCAAAAGTCATCAACGATAATAATAACAACAGTTCTTTTTGAAACACATACAACTGGTTTCGAATCTTTTCATTTTGAATTAGGGTACTAAAAACACAACTTTGAATTGTTCTACATCTTTTTTTAAAAAACTATCTGTACATAATTATCCCAGTTCATTCAAAGTTACTTTGTCCAGTTTCTTTGAATGAGATAAACAAAATTATATTTATCTATTTCTATCTATTTGTCCGCCAAAAATGTTATTGTCTGTTAACGAGTATCTTAGACTTATTTTTTTCTTTCAATCTGTGTGTAATCATCATCATAATAATAATGCTACCACCT]
[+] EMBL CD168387             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TCATTTAATTTCTTTCTCCGTTTTTATTTACTTCTTAAAAATATGACTTTCATTGCAAACACACACACACACATGTCAGAATGCACATAATTCTTAACAGATACAAACAGATGAAATTGTACTTTCTGAATACACAGTCTCAAAAGTCATCAACGATTATAATAACACCAGTTCTTTTTGAAACACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]




>consensus_8375#1
GACACAATTCATCTTTAAAGAGGCCGACACACGCGTATATATATATATATACGCGTGTGT
GTACAGTGCTATGTGAAAAGTTATGGTTCTACGAAAACAAATCAGTCTTTCTATCTCTTT
AATCCCTGTTTTCATAAAGTACTATTGTTAGGATAATGATAATTACTATACTGCCTAATT
GTCATTTTCAATTGTAACTTTACTATTATGTATCTGTTTACCATCCCATCTTACCCTACA
ACATAGTCATCGTTCAGTCATATGTTTATATTTGAAAAATCCCGGTCATCGACCTATGCG
TTTATCTCTTATCTTATTGTAAGTTTTAATTTTTTCTTGAACTCATTTAATTTCTTTCTC
GGTTTTTATTTACTTCTTAAAAATATGACTTTCGTTGCAAACACACACACACACATGTCA
GAATGCACATAATTCTTAACAGATACAAACAGATGAAATTGTACTTTCTGAATACACAGT
CTCAAAAGTCATCAACGATAATAATAACAACAGTTCTTTTTGAAACACATACAACTGGTT
TCGAATCTTTTCATTTTGAATTAGGGTACTAAAAACACAACTTTGAATTGTTCTACATCT
TTTTTTAAAAAACTATCTGTACATAATTATCCCAGTTCATTCAAAGTTACTTTGTCCAGT
TTCTTTGAATGAGATAAACAAAATTATATTTATCTATTTCTATCTATTTGTCCGCCAAAA
ATGTTATTGTCTGTTAACGAGTATCTTAGACTTATTTTTTTCTTTCAATCTGTGTGTAAT
CATCATCATAATAATAATGCTACCACCT

consensusID : consensus_8375#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 660
fasta sequence

                              [CTCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGATTGTCGTAAACTTCGACAGTTGGATTTATACGATTGTCAATTGATAACGAAACAAGGAATCAACAGTTTAGAGTTACATTATCCCCAACTTCAAATTCATGCCTATTTCGCTCCTGGTACTCCGCCTGCACTGACTTTTGCAAGACGACGTCGTTATTGTCGGTGTTGTCGCATAATATAACTTTGTATGTTTATTTGTCTTTTTCCCCCACTCACACCTCTATCGTTCTATTGACCAAGTTGCCAATTTGATTCTATTGTCTTCTAGTTTAATTTTCCTCCAATTTTTATTTCTCTCAGGTTACCTAACCATTACACAGTAATGGAGAGAAGAATAGTAGCCTGAATGAATAAATACCCAGAAATTTTATAGTTTGTTATAATATCTCCCTTGTGACCTTGAATCGTTGCTTTTTATATAAGATCATTACAACTTATATATATATATATATATACGCGTGTGTGTACAGTGCTATGTGAAAAGTTATGGTTCTACGAAAACAAATCAGTCTTTCTATCTCTTTAATCCCTGTTTTCATAAAGTACTATTGTTAGGATAATGATAATTACTATACTGCCTAATTGTCATTNTCAATTGTAACTNTACTATTATGTATCTGTTTACCATCCCATC]

[+] EMBL CD082692             [CTCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGATTGTCGTAAACTTCGACAGTTGGATTTATACGATTGTCAATTGATAACGAAACAAGGAATCAACAGTTTAGAGTTACATTATCCCCAACTTCAAATTCATGCCTATTTCGCTCCTGGTACTCCGCCTGCACTGACTTTTGCAAGACGACGTCGTTATTGTCGGTGTTGTCGCATAATATAACTTTGTATGTTTATTTGTCTTTTTCCCCCACTCACACCTCTATCGTTCTATTGACCAAGTTGCCAATTTGATTCTATTGTCTTCTAGTTTAATTTTCCTCCAATTTTTATTTCTCTCAGGTTACCTAACCATTACACAGTAATGGAGAGAAGAATAGTAGCCTGAATGAATAAATACCCAGAAATTTTATAGTTTGTTATAATATCTCCCTTGTGACCTTGAATCGTTGCTTTTTATATAAGATCATTACAACTTATATATATATATATATATACGCGTGTGTGTACAGTGCTATGTGAAAAGTTATGGTTCTACGAAAACAAATCAGTCTTTCTATCTCTTTAATCCCTGTTTTCATAAAGTACTATTGTTAGGATAATGATAATTACTATACTGCCTAATTGTCATTNTCAATTGTAACTNTACTATTATGTATCTGTTTACCATCCCATC]




>consensus_8375#2
CTCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGATTGTCGTAAACTTCGACAGTTGGATTTATACGAT
TGTCAATTGATAACGAAACAAGGAATCAACAGTTTAGAGTTACATTATCCCCAACTTCAA
ATTCATGCCTATTTCGCTCCTGGTACTCCGCCTGCACTGACTTTTGCAAGACGACGTCGT
TATTGTCGGTGTTGTCGCATAATATAACTTTGTATGTTTATTTGTCTTTTTCCCCCACTC
ACACCTCTATCGTTCTATTGACCAAGTTGCCAATTTGATTCTATTGTCTTCTAGTTTAAT
TTTCCTCCAATTTTTATTTCTCTCAGGTTACCTAACCATTACACAGTAATGGAGAGAAGA
ATAGTAGCCTGAATGAATAAATACCCAGAAATTTTATAGTTTGTTATAATATCTCCCTTG
TGACCTTGAATCGTTGCTTTTTATATAAGATCATTACAACTTATATATATATATATATAT
ACGCGTGTGTGTACAGTGCTATGTGAAAAGTTATGGTTCTACGAAAACAAATCAGTCTTT
CTATCTCTTTAATCCCTGTTTTCATAAAGTACTATTGTTAGGATAATGATAATTACTATA
CTGCCTAATTGTCATTNTCAATTGTAACTNTACTATTATGTATCTGTTTACCATCCCATC

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_8375#0      ---GGAGCCAATATTCGGCACGACGTGAATTAGGGTACTAAAAACACAACTTTGAATTGT 57
consensus_8375#1      GACACAATTCATCTTTAAAGAGGCCGACACACGCGTA-TATATATATATATACGCGTGTG 59
consensus_8375#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8375#0      TCTACATCTTTTTTTAAAAAACTAT--CTGTACATAATTATCCCAGTTCATTCAAAGTTA 115
consensus_8375#1      TGTACAGTGCTATGTGAAAAGTTATGGTTCTACGAAAACAAATCAGTCTTTCTA---TCT 116
consensus_8375#2      --------CTCGAGCCAANAATT----CGGCACGAGGATTGTCGTAAACTTCGACAGTTG 48
                                      ** *  *        **                 *  *   *  

consensus_8375#0      CTTTGTCCAGTTGTTTCTTTGAATGAGATAAACAAAATTATATTTATCTATTT-CTATCT 174
consensus_8375#1      CTTTAATCCCTGTTTTCATAAAGTACTATTGTTAGGATAATGATAATTACTATACTGCCT 176
consensus_8375#2      GATTTATACGATTGTCAATTGATAACGA--AACAAGGAATCAACAGTTTAGAG-TTACAT 105
                        **          *   *  *     *     *            *        *   *

consensus_8375#0      ATTTGTCCGCCAAAAAT--GTTATTGTCTGTTAACGAGTATCTTAGACTTATTTTTTTCT 232
consensus_8375#1      AATTGTCATTTTCAATT--GTAACT--TTACTATTATGTATCT---GTTTACCATCCCAT 229
consensus_8375#2      TATCCCCAACTTCAAATTCATGCCTATTTCGCTCCTGGTACTCCGCCTGCACTGACTTTT 165
                        *   *      ** *   *   *   *        ***          *        *

consensus_8375#0      TTCAATCTGTG-TGTAATCATCATCATAATAATAATGCTACCACCTTGTTT-TTGTAAAA 290
consensus_8375#1      CTTACCCTACAACATAGTCATCGTT-CAGTCATA-TGTT-------TATAT-TTGAAAAA 279
consensus_8375#2      GCAAGACGACGTCGTTATTGTCGGTGTTGTCGCA-TAATATAACTTTGTATGTTTATTTG 224
                         *  *       *  *  **       *   * *  *       * * * **      

consensus_8375#0      TGTTTATTATTGTCTAATTTGTTTGTA-TGCGCTTATGCTTGTATGTGTGTGTGTGTGTC 349
consensus_8375#1      TCCCGGTCATCGACCTATGCGTTTATC-T---CTTATCTTATTGTAAGTTTTAATTTTTT 335
consensus_8375#2      TCTTTTTCCCCCACTCACACCTCTATCGTTCTATTGACCAAGTTGCCAATTTGATTCTAT 284
                      *     *      *  *    * * *  *    **       *       *   *     

consensus_8375#0      TATGAATCAATCTTGATGGAATATTCTGTGTGTGTGTGTATGCGAGTTTGTGTGTTTGCA 409
consensus_8375#1      CTTGAACTCAT-TTAATTTCTTTCTCGGTTTTTATTTACTTCTTAAAA-ATATGACTTTC 393
consensus_8375#2      TGTCTTCTAGT-TTAATTTTCCTC-CAATTTTTATTTCTCTCAGGTTACCTAACCATTAC 342
                        *       * ** **        *  * * * * *   *         *     *   

consensus_8375#0      TGTGCATACGTGTGTATGTGTATTTGTTTGAGTATTTTCTTTTCTTTTTTTTCTATATTT 469
consensus_8375#1      GTTGCAAACACACACACACACAT--GTCAGAATGCACATAATTCTT-------AACAGAT 444
consensus_8375#2      ACAGTA-ATGGAGAGAAGAATAGTAGCCTGAATGAATAAATACCCAG------AAATTTT 395
                         * * *       *     *   *   ** *          *          *    *

consensus_8375#0      TCAGACGTGTTATGTGATGAGTTTTTGTTTTGTTTATTTGTATTTTTTTTTGTTTTTTTT 529
consensus_8375#1      ACAAACA--------GATGAAATTGTACTTTCTGAATACACAGTCTCAAAAGTCATCAAC 496
consensus_8375#2      ATAGTTT------GTTATAATATC-TCCCTTGTGACCTTGAATCGTTGCTTTTTATATAA 448
                        *             ** *  *  *   ** *        *   *      *  *    

consensus_8375#0      GTTGGTTACTGTGCACTTAAAAATTGACGGTTTGAAAACAACAATAATAATAATAAATGC 589
consensus_8375#1      GATAATAATAAC------AACAGTT--CTTTTTGAAACACATACAACTGGTTTCGAATCT 548
consensus_8375#2      GATCATTACAAC----------TTATATATATATATATATATACGCGTGTGTGTACAGTG 498
                      * *  * *               *       *  * *   * *    *        *   

consensus_8375#0      ATTAATTATTGATTACTGATCTGATCATTAACAATGGGGCAAACCAACATGAGGAATCAG 649
consensus_8375#1      TTTCATTTTGAATTAGGGTACTAAAAACACAACTTTGAATTGTTCTACATCTTTTTTTAA 608
consensus_8375#2      CTATGTGAAAAGTTATGGTTCTACGAAAACAAATC--AGTCTTTCTATCTCTTTAATCCC 556
                       *   *      ***  *  **    *   *             * *  *      *   

consensus_8375#0      AAGATTAAATATTGCTAGCTTTGGC-GTGTATCTACGGTAA-TCTGTG-AATTTGTCTCC 706
consensus_8375#1      AAAACTATCTGTACATAATTATCCCAGTTCATTCAAAGTTACTTTGTCCAGTTTCTTTGA 668
consensus_8375#2      TG--TTTTCATAAAGTACTATTGTTAGGATAATGATAATTACTATACT--GCCTAATTGT 612
                           *         **    *    *   *   *   * * * *        *   *  

consensus_8375#0      GTGTCATATATATATATATATAGGTTGGATT---TCCAATTACTCATTATGATCATGTAC 763
consensus_8375#1      ATGAGATAAACAAAATTATATTTATCTATTTCTATCTATTTGTCCGCCAAAAATGTTATT 728
consensus_8375#2      CATTNTCAATTGTAACTNTACTATTATGTATCTGTTTACCATCCCATC------------ 660
                             *     *  * **    *     *   *  *      *               

consensus_8375#0      ATTTGAAAA-AATTACCTTTCGTATATCACTTTTATTATTTTTAAATATGCTTCTCTTT- 821
consensus_8375#1      GTCTGTTAACGAGTATCTTAGACTTATTTTTTTCTTTCAATCTGTGTGTAATCATCATCA 788
consensus_8375#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8375#0      TAAAAATAAATTAATAATATAAACA 846
consensus_8375#1      TAATAATAATGCTACCACCT----- 808
consensus_8375#2      -------------------------