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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8404#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1176 fasta sequence
[ACTNNNTCATATCCTAATGACATTTCTCACCATCGCAGTCTCTTCCAGTCAGACTTTTAGGGGAAAAATTCATAATGGGTACTGGTTGTGGAAAGTGTTCTTTATTGTCAGTTTGTGGTTTACTGCTTACTTTTTCCCATACCTAGAAACCCTCACTAGAGTGTGGATGATTGTGGGAATCGTTGGTGGGATTTTATTTGTCTATGTACAACACATAACGCTTATCGACTTTGCTTATGAAATAAATGGAAACTGGCATAATAAATCGAAAACTTCAGTTTTTTATACACTAGCTATATATATTGTTACCTTGTCACTGTATGCTGTGGCTATTTGTGCTTATACTGCCTTTGTACTCTTTTATGGTTTACCTCGTCAATGTACATTAAATCTAACTGTCACGGGTATTAATGGAGGTCTTACATTATTATTTGCTATATGTTCTGCATTTTCCACCATATTAAGAAAAGGTCAAATGTGGTTACCAGGTGCAATCACTTCTGCATTTGTAGCTTTTCTAACATGGTCAGCTTTAGGTAGTCAACCGAGAATTTTATCATCGAATTTTCCGTGGCAAAAACAAACAGTAAAAAAGATGAACGATGTACAACAAGAGCGAAATCTTACTGTTCACCCGCTAGTTGTTGTTGCTGATCAGTTGAATCGTTTATTATCTCACCAATTCACTCAAACCACTAATCAAGTCAAAACATCACCAGCATTACCATCTGAATTAAAACCAAATATTACTGATTCAATCGTTTTAATTAATGAATGCCTACCTGGTGGTGTGAATAAAATCAGCGAACATTTAGGCAAAGATATTGTCACATTGTTAGGAATTACAGTTGTGATTAGTGGATTTTTATATTCAAGTTTTCGTGCATCTATGCAAGCAAGACGTTTGGGTATTCGAACACGAAGAGAACGTTTGAAAGCTCTCCTACCACCTATTCATGAAAATAGCCAATTTAATGAATCTACTCTACAAGCTTCCAATAATAACAAACCTACTCAGTCTTCCAATTCAGTTGTAACCGATAACTTGAATAAATCTCCAATACGTTTTATGAATTATAAGGATGTGAAGCGACAAGAGCATGCATTAAATCTTCTTGCTGACGCTGTGGCTGATTTACCTAATCCAAAGGTTNTTCGCAGACCTTCAGCACGTCA]
[-] EMBL CD200418 [ACTNNNTCATATCCTAATGACATTTCTCACCATCGCAGTCTCTTCCAGTCAGACTTTTAGGGGAAAAATTCATAATGGGTACTGGTTGTGGAAAGTGTTCTTTATTGTCAGTTTGTGGTTTACTGCTTACTTTTTCCCATACCTAGAAACCCTCACTAGAGTGTGGATGATTGTGGGAATCGTTGGTGGGATTTTATTTGTCTATGTACAACACATAACGCTTATCGACTTTGCTTATGAAATAAATGGAAACTGGCATAATAAATCGAAAACTTCAGTTTTTTATACACTAGCTATATATATTGTTACCTTG ]
[+] EMBL AI975025 [ GGGAATCGTTGGTGGGATTTTATTTGTCTATGTACAACACATAACGCTTATCGACTTTGCTTATGAAATAAATGGAAACTGGCATAATAAATCGAAAACTTCAGTTTTTTATACACTAGCTATATATATTGTTACCTTGTCACTGTATGCTGTGGCTATTTGTGCTTATACTGCCTTTGTACTCTTTTATGGTTTACCTCGTCAATGTACATTAAATCTAACTGTCACGGGTATTAATGGAGGTCTTACATTATTATTTGCTATATGTTCTGCATTTTCCACCATATTAAGAAAAGGTCAAATGTGGTTACCAGGTGCAATCACTTCTGCATTTGTAGCTTTTCTAACATGGTCAGCTTTAGGTAGTCAACCGAGAATTTTATCATCGAATTTTCCGTGGCAAAAACAAACAGTAAAAAAGATGAACGATGTACAACAAGAGCGAAATCTTACTGTTCACCCGCTAGTTGTTGTTGCTGATCAGTTGAATCGTTTATTATCTCACCAATTCACTCAAACCACTAATCAAGTCAAAACATCACCAGCATTACCATCTGAATTAAAACCAAATATTACTGATTCAATCGTTTTAATTAATGAATGCCTACCTGGTGGT ]
[+] EMBL CD179099 [ ATTTGTAGCTTTTCTAACATGGTCAGCTTTAGGTAGTCAACCGAGAATTTTATCATCGAATTTTCCGTGGCAAAAACAAACAGTAAAAAAGATGAACGATGTACAACAAGAGCGAAATCTTACTGTTCACCCGCTAGTTGTTGTTGCTGATCAGTTGAATCGTTTATTATCTCACCAATTCACTCAAACCACTAATCAAGTCAAAACATCACCAGCATTACCATCTGAATTAAAACCAAATATTACTGATTCAATCGTTTTAATTAATGAATGCCTACCTGGTGGTGTGAATAAAATCAGCGAACATTTAGGCAAAGATATTGTCACATTGTTAGGAATTACAGTTGTGATTAGTGGATTTTTATATTCAAGTTTTCGTGCATCTATGCAAGCAAGACGTTTGGGTATTCGAACACGAAGAGAACGTT ]
[-] EMBL CD178439 [ TTTGTAGCTTTTCTAACATGGTCAGCTTTAGGTAGTCAACCGAGAATTTTATCATCGAATTTTCCGTGGCAAAAACAAACAGTAAAAAAGATGAACGATGTACAACAAGAGCGAAATCTTACTGTTCACCCGCTAGTTGTTGTTGCTGATCAGTTGAATCGTTTATTATCTCACCAATTCACTCAAACCACTAATCAAGTCAAAACATCACCAGCATTACCATCTGAATTAAAACCAAATATTACTGATTCAATCGTTTTAATTAATGAATGCCTACCTGGTGGTGTGAATAAAATCAGCGAACATTTAGGCAAAGATATTGTCACATTGTTAGGAATTACAGTTGTGATTAGTGGATTTTTATATTCAAGTTTTCGTGCATCTATGCAAGCAAGACGTTTGGGTATTCGAACACGAAGAGAACGTTT ]
[+] EMBL AI976334 [ TGAATCGTTTATTATCTCACCAATTCACTCAAACCACTAATCAAGTCAAAACATCACCAGCATTACCATCTGAATTAAAACCAAATATTACTGATTCAATCGTTTTAATTAATGAATGCCTACCTGGTGGTGTGAAT AAATCAGCGAACATTTAGGCAAAGATATTGTTACATTGTTAGGAATTACAGTTGTGATTAGTGGATTTTTATATTCAAGTTTTCGTGCATCTATGCAAGCAAGACGTTTGGGTATTCGAACACGAAGAGAACGTTTGAAAGCTCTCCTACCACCTATTCATGAAAATAGCCAATTTAATGAATCTACTCTACAAGCTTCCAATAATAACAAACCTACTCAGTCTTCCAATTCAGTTGTAACCGATAACTTGAATAAATCTCCAATACGTTTTATGAATTATAAGGATGTGAAGCGACAAGAGCATGCATTAAATCTTCTTGCTGACGCTGTGGCTGATTTACCTAATCCAAAGGTTNTTCGCAGACCTTCAGCACGTCA]
[+] EMBL AW016997 [ TGAATCGTTTATTATCTCACCAATTCACTCAAACCACTAATCAAGTCAAAACATCACCAGCATTACCATCTGAATTAAAACCAAATATTACTGATTCAATCGTTTTAATTAATGAATGCCTACCTGGTGGTGTGAATAAAATCAGCGAACATTTAGGCAAAGATATTGTTACATTGTTAGGAATTACAGTTGTGATTAGTGGATTTTTATATTCAAGTTTTCGTGCATCTATGCAAGCAAGACGTTTGGGTATTCGAACACGAAGAGAACGTTTGAAAGCTCTCCTACCACCTATTCATGAAAATAGCCAATTTAATGAATCTACTCTACAAGCTTCCAATAATAACAAACCTACTCAGTCTTCCAATTC ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||