|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8450#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1110 fasta sequence
[GATGAGTCATATTTAGAAGAGGCCTGAATAAGGGACATAGATGTTGGAATACTCTTTTCAGTTGAATTGCTANATACGCTATTAGGATTATTTGATCCCACANAACTACGCACAGGAATTACACCTATTTCAGTGAGTTGAGCTTCAACCAACTGACGCAAACGAACTTCTTCACCTAAATTTTGCTCAATTGTGTTTAAATTAATTCGTTCAGTACGGCATTTATTAGTAAGCTTTGAAATACGTGATGAAATACCCTCGTTCTCTTGACGCTGGTTGGACAGACTGAGTCGATTGAGGTGATCGTCATGTTGAAGACTGTTTAACTGGTTACGCAATTGTGTTTCCAGTCCACGCATGGACTGTAATTCGGAACGGAGACGTCTAACGTTACTCTCTAATCTTGTTACTGGATCTTCCTTAGCACCTCGTTCACGTACTGGTTTCCCACTATTAGATTGCTTAGGAACACAACCATTAACTGTAGGTTTAGAATTTGGGTAAAGGTTCACTGGATTCTCTGTGGTATATCGACGACCGATTTGTGATCCAGACGGACTTGAGTCAAGGCACTGTATAGTTCGACGTCGACCAGCATCAGTAACATATGTATTTGATATTACTCCATTTACTATCGTAGTCGAGGAATGGTTAAAACGTGCAGTTCGACTGTCAAAATCCAAGTATTGTTTATCAATAGATCTAAAATAGCTGAAAGTCCATCGAGCTAAACGATCAAAACACGACTGACCAAAGCGAAAAAGTATGAATACCGACCGACTAGAAAAATCTGATGAGAAGTCATTGGACAATGCAACTTCGTGAACTTCTAGGGAATCCTTATGAAAATAATCAAGACTATGTTGAACGTAAGCGTTGTCATTTACCGATGAAGGTGGGAGAGCTTCATAAAGTATTCGAAAATGCATGTAATTTTGTCTTCTGACATTCATCCTTTTAAAATCTCGATAGTTTATATCAGGTACCGTTTTACAGAANATCCCACACAAACTACCGAATAACCAATGCTGTGTGCTGCAAATGGACGGAAAACACAAATGCTGTGAGTGGATTTCGTTGCTTTTGAGTAGAGACTAAATTCGAATATAT]
[-] EMBL AI974963 [GATGAGTCATATTTAGAAGAGGCCTGAATAAGGGACATAGATGTTGGAATACTCTTTTCAGTTGAATTGCTANATACGCTATTAGGATTATTTGATCCCACANAACTACGCACAGGAATTACACCTATTTCAGTGAGTTGAGCTTCAACCAACTGACGCAAACGAACTTCTTCACCTAAATTTTGCTCAATTGTGTTTAAATTAATTCGTTCAGTACGGCATTTATTAGTAAGCTTTGAAATACGTGATGAAATACCCTCGTTCTCTTGACGCTGGTTGGACAGACTGAGTCGATTGAGGTGATCGTCATGTTGAAGACTGTTTAACTGGTTACGCAATTGTGTTTCCAGTCCACGCATGGACTGTAATTCGGAACGGAGACGTCTAACGTTACTCTCTAATCTTGTTACTGGATCTTCCTTAGCACCTCGTTCACGTACTGGTTTCCCACTATTAGATTGCTTAGGAACACAACCATTAACTGTAGGTTTAGAATTTGGGTAAAGGTTCACTGGATTCTCTGTGGTATATCGACGACCGATTTGTGATCCAGACGGACTTGAGTCAAGGCACTGTATAGTTCGACGT ]
[-] EMBL BF936224 [ GCTATTAGGATTATTTGATCCCACAAAACTACGCACAGGAATTACACCTATTTCAGTGAGTTGAGCTTCAACCAACTGACGCAAACGAACTTCTTCACCTAAATTTTGCTCAATTGTGTTTAAATTAATTCGTTCAGTACGGCATTTATTAGTAAGCTTTGAAATACGTGATGAAATACCCTCGTTCTCTTGACGCTGGTTGGACAGACTGAGTCGATTGAGGTGATCGTCATGTTGAAGACTGTTTAACTGGTTACGCAATTGTGTTTCCAGTCCACGCATGGACTGTAATTCGGAACGGAGACGTCTAACGTTACTCTCTAATCTTGTTACTGGATCTTCCTTAGCACCTCGTTCACGTACTGGTTTCCCACTATTAGATTGCTTAGGAACACAACCATTAACTGTAGGTTTAGAATTTGGGTAAAGGTTCACTGGATTCTCTGTGGTATATCGACGACCGATTTGTGATCCAGACGGACTTGAGTCAAGGCACTGTATAGTTCGACGT ]
[-] EMBL AI975028 [ GAATTACACCTATTTCAGTGAGTTGAGCTTCAACCAACTGACGCAAACGAACTTCTTCACCTAAATTTTGCTCAATTGTGTTTAAATTAATTCGTTCAGTACGGCATTTATTAGTAAGCTTTGAAATACGTGATGAAATACCCTCGTTCTCTTGACGCTGGTTGGACAGACTGAGTCGATTGAGGTGATCGTCATGTTGAAGACTGTTTAACTGGTTACGCAATTGTGTTTCCAGTCCACGCATGGACTGTAATTCGGAACGGAGACGTCTAACGTTACTCTCTAATCTTGTTACTGGATCTTCCTTAGCACCTCGTTCACGTACTGGTTTCCCACTATTAGATTGCTTAGGAACACAACCATTAACTGTAGGTTTAGAATTTGGGTAAAGGTTCACTGGATTCTCTGTGGTATATCGACGACCGATTTGTGATCCAGACGGACTTGAGTCAAGGCACTGTATAGTTCGACGT ]
[-] EMBL CD119476 [ CTAATCATGTTACTGGATCTTCCTTAGCACCTCGTTCACGTACTGGTTTCCCACTATTAGATTGCTTAGGTACACAACCATTAACTGTAGGTTTAGAATTTGGGTAAAGGTTCACTGGATTCTCCGTGGTATATCGACGACCGATTTGTGATCCAGACGGACTTGAGTCAAGGCACTGTATAGTTCGACGTCGACCAGCATCAGTAACATATGTATTTGATATTACTCCATTTACTATCGTAGTCGAGGAATGGTTAAAACGTGCAGTTCGACTGTCAAAATCCAAGTATTGTTTATCAATAGATCTAAAATAGCTGAATGT ]
[-] EMBL CD119292 [ CTAATCATGTTACTGGATCTTCCTTAGCACCTCGTTCACGTACTGGTTTCCCACTATTAGATTGCTTAGGAACACAACCATTAACTGTAGGTTTAGAATTTGGGTAAAGGTTCACTGGATTCTCCGTGGTATATCGACGACCGATTTGTGATCCAGACGGACTTGAGTCAAGGCACTGTATAGTTCGACGTCGACCAGCATCAGTAACATATGTATTTGATATTACTCCATTTACTATCGTAGTCGAGGAATGGTTAAAACGTGCAGTTCGACTGTCAAAATCCAAGTATTGTTTATCAACAGATCTAAAATAGCTGAAAGT ]
[+] EMBL CD116504 [ CTTAGGAACACAACCATTAACTGTAGGTTTAGAATTTGGGTAAAGGTTCACTGGATTCTCCGTGGTATATCGACGACCGATTTGTGATCCAGACGGACTTGAGTCAAGGCACTGTATAGTTCGACGTCGACCAGCATCAGTAACATATGTATTTGATATTACTCCATTTACTATCGTAGTCGAGGAATGGTTAAAACGTGCAGTTCGACTGTCAAAATCCAAGTATTGTTTATCAATAGATCTAAAATAGCTGAAAGTCCATCGAGCTAAACGATCAAAACACGACTGACCAAAGCGAAAAAGTATGAATACCGACCGACTAGAAAAATCTGATGAGAAGTCATTGGACAATGCAACTTCGTGAACTTCTAGGGAATCCTTATGAAAATAATCAAGACTATGTTGAACGTAAGCGTTGTCATTTACCGATGAAGGTGGGAGAGCTTCATAAAGTATTCGAAAATGCATGTAATTTTGTCTTCTGACATTCATCCTTTTAAAATCTCGATAGTTTATATCAGGTACCGTTTTACAGAANATCCCACACAAACTACCGAATAACCAATGCTGTGTGCTGCAAATGGACGGAAAACACAAATGCTGTGAGTGGATTTCGTTGCTTTTGAGTAGAGACTAAATTCGAATATAT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||