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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8472#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1215 fasta sequence
[GGCGCTGGCTCGTCTTAACCATCATTTAAAACAAGCACAAACTGATGTCACTGTCGTAGCCTTCCTCATTTTTCCAGCTCATACGAATAGTTTTAACGTGGATTCGTTTCGTGCCCAAGCTATTGTAAAGCAACTGCGTGAAACAGTAAATTCGATCCAATGTGAAATGGGACATAGGTTATTTGAGGTGTGTCTTCGAGGACGTATTCCTCAAGGATCTGATCTACTTACTCAGGGTGATGTATTTCGCCTTAAACGTTGTATATATGCAACACAACGAAATAATTTGCCCCCTATTTGTACACACAATGTCGTTCAAGATAATATTGATCTAGTTCTGTGTAACTTACGCCGGTGTCAGTTATTTAATGACCGTCATGATCGTGTTAAGGTTATTTTTCATCCTGAATTCTTAAGTTCTACCAATCCACTATTACCGATGGATTATGAAGAATTTGTGCGAGGCTGTCATTTAGGTGTTTTTCCATCTTATTATGAACCATGGGGTTATACACCAGCTGAATGCACTGTAATGGGTATTCCATCGGTAACGACAAATCTTTCTGGATTTGGCTGCTTCATAGAAGAGCATGTAGAAGATCCCAAATCGTATGGAATATACATTGTTGATCGTCGTTTCCAAAGCTGTGAAGACAGTGTTCAACAGTTAACCAAGTATTTGGTTGAGTTCTCTCAATATTCTCGTCGTCAACGTATTGTTTTACGAAATCGTACCGAGCGATTAAGTGAACTGTTGGATTGG-AAAATCTTTCCTGTTACTATCAACGTGCCAGATTAATGGCATTAAAGAAATTCTCTCCAGAACTATTCACATCTAACAACAATGATGATGCATTATCGACCCATAGTTTTCATATTAGTCGACCATATTCAGCACCTGTATCTCCATCACTATCTGGACAATCAACACCGTTGCGTAGTGCCGGTGCAAATAGTTCAAATCGTAGCAGTCCTACATCACATTTAGATGATGATGAAATTGATGATAACACAGAACGATTAGAACTAGGTCTTGGTGCAATAGAAATCACTGATGCTGTACCTGGTTGAGGTACAAAAGTGAAAAAAAATATCTCATCAATATTGAACTATAAACTTAGAATGTGCCTAGTTTATTGTCTACTTTTATTTCTTCTCTTTTCATTATTTGTCATTTATTTCATTTCTTTTTTGGTCATTTCTAATTCATTTAGA]
[+] EMBL AW017457 [GGCGCTGGCTCGTCTTAACCATCATTTAAAACAAGCACAAACTGATGTCACTGTCGTAGCCTTCCTCATTTTTCCAGCTCATACGAATAGTTTTAACGTGGATTCGTTTCGTGCCCAAGCTATTGTAAAGCAACTGCGTGAAACAGTAAATTCGATCCAATGTGAAATGGGACATAGGTTATTTGAGGTGTGTCTTCGAGGACGTATTCCTCAAGGATCTGATCTACTTACTCAGGGTGATGTATTTCGCCTTAAACGTTGTATATATGCAACACAACGAAATAATTTGCCCCCTATTTGTACACACAATGTCGTTCAAGATAATATTGATCTAGTTTTGTGTAACTTACGCCGGTGTCAGTTATTTAATGACCGTCATGATCGTGTTAAGGTTATTTTTCATCCTGAATTCTTAAGTTCTACCAATCCACTATTACCGATGGATTATGAAGAATTTGTGCGAGGCTGTCATTTAGGTGTTTTTCCATCTTATTATGAACCATGGGGTTATACACCAGCTGAATGCACTGTAATGGGTATTCCATCGGTAACGACAAATCTTTCTGGATTTGGCTGCTTCATAGAAGAGCATGTAGAAGATCCCAAATCGTATGGAATATACATTG ]
[-] EMBL BG930989 [ TCGTCTTAACCATCATTTAAAACAAGCACAAACTGATGTCACTGTCGTAGCCTTCCTCATTTTTCCAACTCATACGAATAGTTTTAACGTGGATTCGTTTCGTGCCCAAGCTATTGTAAAGCAACTGCGTGAAACAGTAAATTCGATCCTATGTGAAATGGGACATAGGTTATTTGAGGTGTGTCTTCGAGGACGTATTCCTCAAGGATCTGATCTACTTACTCAGGGTGATGTATTTCGCCTTAAACGTTGTATATATGCAACACAACGAAATAATTTGCCCCCTATTTGTACACACAATGTCGTTCAAGATAATATTGATCTAGTTCTGTGTAACTTACGCCGGTGTCAGTTATTTAATGACCGTCATGATCGTGTTAAGGTTATT ]
[-] EMBL BG931496 [ TCGTCTTAACCATCATTTAAAACAAGCACAAACTGATGTCACTGTCGTAGCCTTCCTCATTTTTCCAGCTCATACGAATAGTTTTAACGTGGATTCGTTTCGTGCCCAAGCTATTGTAAAGCAACTGCGTGAAACAGTAAATTCGATCCAATGTGAAATGGGACATAGGTTATTTGAGGTGTGTCTTCGAGGACGTATTCCTCAAGGATCTGATCTACTTACTCAGGGTGATGTATTTCGCCTTAAACGTTGTATATATGCAACACAACGAAATAATTTGCCCCCTATTTGTACACACAATGTCGTTCAAGATAATATTGATCTAGTTCTGTGTAACTTACGCCGGTGTCAGTTATTTAATGACCGTCATGATCGTGTTAAGGTTATT ]
[+] EMBL CD096402 [ GACGTATTCCTCAAGGATCTGATCTACTTACTCAGGGTGATGTATTTCGCCTTAAACGTTGTATATATGCAACACAACGAAATAATTTGCCCCCTATTTGTACACACAATGTCGTTCAAGATAATATTGATCTAGTTCTGTGTAACTTACGCCGGTGTCAGTTATTTAATGACCGTCATGATCGTGTTAAGGTTATTTTTCATCCTGAATTCTTAAGTTCTACCAATCCACTATTACCGATGGATTATGAAGAATTTGTGCGAGGCTGTCATTTAGGTGTTTTTCCATCTTATTATGAACCATGGGGTTATACACCAGCTGAATGCACTGTAATGGGTATTCCATCGGTAACGACAAATCTTTCTGGATTTGGCTGCTTCATAGAAGAGCATGTAGAAGATCCCAAATCGTATGGAATATACATTGTTGATCGTCGTTTCCAAAGCTGTGAAGACAGTGTTCAACAGTTAACCAAGTATTTGGTTGAGTTCTCTCAATATTCTCGTCGTCAACGTATTGTTTTACGAAATCGTACCGAGCGATTAAGTGAACTGTTGGATTGG AAAATCTTTCCTGTTACTATCAACGTGCCAGATT ]
[+] EMBL CD189147 [ CGTTGTATATATGCAACACAACGAAATAATTTGCCCCCTATTTGTACACACAATGTCGTTCAAGATAATATTGATCTAGTTCTGTGTAACTTACGCCGGTGTCAGTTATTTAATGGCCGTCATGATCGTGTTAAGGTTATTTTTCATCCTGAATTCTTAAGTTCTACCAATCCACTATTACCGATGGATTATGAAGAATTTGTGCGAGGCTGTCATTTAGGTGTTTTTCCATCTTATTATGAACCATGGGGTTATACACCAGCTGAATGCACTGTAATGGGTATTCCATCGGTAACGACAAATCTTTCTGGATTTGGCTGCTTCATAGAAGAGCATGTAGAAGATCCCAAATCGTATGGAATATACATTGTTGATCGTCGTTTCCAAAGCTGTGAAGACAGTGTTCAACAGTTAACCAAGTATTTGGTTGAGTTCTCTCAATATTCTCGTCGT ]
[-] EMBL CD132419 [ ccgtgtcTAGGGAATATACATTGTTGATCGTCGTTTCCAAAGCTGTGAAGACAGTGTTCAACAGTTAACCGAGTATTTGGTTGAGTTCTCTCAATATTCTCGTCGTCAACGTATTGTTTTACGAAATCGTACCGAGCGATTAAGTGAACTGTTGGATTGGAAAAATCTTTCCTGTTACTATCAACGTGCCAGATTAATGGCATTAAAG ]
[+] EMBL CD134636 [ TGTGAAGACAGTGTTCAACAGTTAACCAAGTATTTGGTTGAGTTCTCTCAATATTCTCGTCGTCAACGTATTGTTTTACGAAATCGTACCGAGCGATTAAGTGAACTGTTGGATTGGAAAAATCTTTCCTGTTACTATCAACGTGCCAGATTAATGGCATTAAAGAAATTCTCTCCAGAACTATTCACATCTAACAACAATGATGATGCATTATCGACCCATAGTTTTCATATTAGTCGACCATATTCAGCACCTGTATCTCCATCACTATCTGGACAATCAACACCGTTGCGTAGTGCCGGTGCAAATAGTTCAAATCGTAGCAGTCCTACATCACATTTAGATGATGATGAAATTGATGATAACACAGAACGATTAGAACTAGGTCTTGGTGCAATAGAAATCACTGATGCTGTACCTGGTTGAGGTACAAAAGTGAAAAAAAATATCTCATCAATATTGAACTATAAACTTAGAATGTGCCTAGTTTATTGTCTACTTTTATTTCTTCTCTTTTCATTATTTGTCATTTATTTCATTTCTTTTTTGGTCATTTCTAATTCATTTAGA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||