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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8480#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1360 fasta sequence
[CGCTTTCTTTCTACGTGACTGACTAATGTGTCACTGACTGCTCGCTCCGCAATCATCTTGATAACAGCGCTTTGTTGCCTAACTTCTGATGGATGTGCCGGGTCCGAATGTATCACAGTTGATGCCACTGGTCATGCATCGAATCATATACATGTTGAAGCTTATCAAGTTAGTAATCAAGCTATGGCGTTAGTGAAAGATAATATTATTGTGCCAACGTATGATGCACCTGAATTAGGTTATGTAAAAGAAACTACCAAAGAACAATTCGTTCCGGAAGTGTTTTATGCGACCAAGGATAAATATGGTAATCGTGTCACACGTGTCGCTCGTCCTTTACCAGTTGAGTTCCTGTTGACAAATATGCCAACAG-CTTTTCCAATTGAACCATTTTATACGATGGCTAAATTTCCTGATGATTTTCCAGTTGATTTTCAATTTCCAATTGAGAATCGTGAGTGTTTAGGTCAAATTCAAGATATACCGAGTTTTGCTCGTATACTTCATAAATTTGGAGTTGATCAAATTCATACATGTTTGACTAATTTTCATATACTTGCATGGTTAGTTAATAATGATACACTTAGTTTACAACTTTTCAACTCTGAAGGTAAATTAAATGAAGATCCATATGGGATCATTGGTTTACTAGATGCAATTGCTTTACGTTGTTCTAATCATCAATCATCTAATAATAATAATAGTTCGATAAAACAATCTGAATTAGCTGTTAAGAAATGGGCTAAAGAATCACCAATTTGGGCTACTGTACAAGAGTTAGCTAATGCAGTTGTTTCCGATATGCCACCTAGTCCTCCATTGCCTACTCAATCAGATTCATATCGTTCTGCGCTCAGTAGTTCTAGTGTTTCTTTAGGAGTTGGTCCAACATCAGTGCTTAAGTCAACTTGGTCATCTCAAACAACAACACCGTCGGGGACAACAGAACTACGAAATTCAGAATCTAGTCACTGGGCCTGTTCTCACTGTACTTTTCATAATAGTCCTGGTACTGATGAATGCGAAATGTGTCGCCTACCTCGACGTGGATGAAGTGTGCTGAGGTGGTAAACCGATAACAGAAAAGATCAATGAACAGTTATCTTGGTAACAATGACGCTTATTCAAGACTAATTATCTCTGCATCTACAATTTCTTTAGAGCTCGTGTATCTTTTCTTTTTACCTAAGGATGGGATAAATAAACAAGAACTTTTTCCCGTCCTCTTTTGTATGTGAATAACGTTTGTCATTTATTGTAGATTGCCCATTTTTTCATCTGAACTTTTCTTGCCCTGTACTCCTATTAATCTGTTACTTTTGTCTNTAAAATAATAATTACTCAACGTTACCAAAAAAAG]
[+] EMBL CD114321 [CGCTTTCTTTCTACGTGACTGACTAATGTGTCACTGACTGCTCGCTCCGCAATCATCTTGATAACAGCGCTTTGTTGCCTAACTTCTGATGGATGTGCCGGGTCCGAATGTATCACAGTTGATGCCACTGGTCATGCATCGAATCATATACATGTTGAAGCTTATCAAGTTAGTAATCAAGCTATGGCGTTAGTGAAAGATAATATTATTGTGCCAACGTATGATGCACCTGAATTAGGTTATGTAAAAGAAACTACCAAAGAACAATTCGTTCCGGAAGTGTTTTATGCGACCAAGGATAAATATGGTAATCGTGTCACACGTGTCGCTCGTCCTTTACCAGTTGAGTTCCTGTTGACAAATATGCCAACAGCCTTTTCCAATTGAACCATTTTATACGATGGCTAAATTTCCTGATGATTTTCCAGTTGATTTTCAATTTCCAATTGAGAATCGTGAGTGTTTAGGTCAAATTCAA ]
[+] EMBL CD080339 [ aggGAACAATTCGTTCCGGAAGTGTTTTATGCGACCAAGGATAAATATGGTAATCGTGTCACACGTGTCGCTCGTCCTTTACCAGTTGAGTTCCTGTTGACAAATATGCCAACAG CTTTTCCAATTGAACCATTTTATACGATGGCTAAATTTCCTGATGATTTTCCAGTTGATTTTCAATTTCCAATTGAGAATCGTGAGTGTTTAGGTCAAATTCAAGATATACCGAGTTTTGCTCGTATACTTCATAAATTTGGAGTTGATCAAATTCATACATGTTTGACTAATTTTCATATACTTGCATGGTTAGTTAATAATGATACACTTAGTTTACAACTTTTCAACTCTGAAGGTAAATTAAATGAAGATCCATATGGGATCATTGGTTTACTAGATGCAATTGCTTTACGTTGTTCTAATCATCAATCATCTAATAATAATAATAGTTCGATAAAACAATCTGAATTAGCTGTTAAGAAATGGGCTAAAGAATCACCAATTTGGGCTACTGTACAAGAGTTAGCTAATGCAGTTGTTTCCGATATGCCACCTAGTCCTCCATTGCCTACTCAATCAGATTCATATCGTTCTGCGCTCAGTAGTTCTAGTGTTTCTTTAGGAGTTGGTCCAACATCAGTGCTTAAGTCAACTTGGTCAT ]
[+] EMBL CD079174 [ CGTGTCACACGTGTCGCTCGTCCTTTACCAGTTGAGTTCCTGTTGACAAATATGCCAACAG CTTTTCCAATTGAACCATTTTATACGATGGCTAAATTTCCTGATGATTTTCCAGTTGATTTTCAATTTCCAATTGAGAATCGTGAGTGTTTAGGTCAAATTCAAGATATACCGAGTTTTGCTCGTATACTTCATAAATTTGGAGTTGATCAAATTCATACATGTTTGACTAATTTTCATATACTTGCATGGTTAGTTAATAATGATACACTTAGTTTACAACTTTTCAACTCTGAAGGTAAATTAAATGAAGATCCATATGGGATCATTGGTTTACTAGATGCAATTGCTTTACGTTGTTCTAATCATCAATCATCTAATAATAATAATAGTTCGATAAAACAATCTGAATTAGCTGTTAAGAAATGGGCTAAAGAATCACCAATTTGGGCTACTGTACAAGAGTTAGCTAATGCAGTTGTTTCCGATATGCCACCTAGTCCTCCATTGCCTACTCAATCAGATTCATATCGTTCTGCGCTCAGT ]
[-] EMBL CD127141 [ ATGGCTAAATTTCCTGATGATTTTCCAGTTGATTTTCAATTTCCAATTGAGAATCGTGAGTGTTTAGGTCAAATTCAAGATATACCGAGTTTTGCTCGTATACTTCATAAATTTGGAGTTGATCAAATTCATACATGTTTGACTAATTTTCATATACTTGCATGGTTAGTTAATAATGATACACTTAGTTTACAACTTTTCAACTCTGAAGGTAAATTAAATGAAGATCCATATGGGATCATTGGTTTACTAGATGCAATTGCTTTACGTTGTTCTAATCATCAATCATCTAATAATAATAATAGTTCGATAAAACAATCTGAATTAGCTGTTAAGAAATGGGCTAAAGAATCACCAATTTGGGCTACTGTACAAGAGTTAGCTAATGCAGTTGTTTC ]
[-] EMBL CD074259 [ CTGTTAAGAAATGGGCTAAAGAATCACCAATTTGGGCTACTGTACAAGAGTTAGCTAATGCAGTTGTTTCCGATATGCCACCTAGTCCTCCATTGCCTACTCAATCAGATTCATATCGTTCTGCGCTCAGTAGTTCTAGTGTTTCTTTAGGAGTTGGTCCAACATCAGTGCTTAAGTCAACTTGGTCATCTCAAACAACAACACCGTCGGGGACAACAGAACTACGAAATTCAGAATCTAGTCACTGGGCCTGTTCTCACTGTACTTTTCATAATAGTCCTGGTACTGATGAATGCGAAATGTGTCGCCTACCTCGACGTGGATGAAGTGTGCTGAGGTGGTAAACCGATAACAGAAAAGATCAATGAACAGTTATCTTGGTAACAATGACGCTTATTCAAGACTAATTATCTCTGCATCTACAATTTCTTTAGAGCTCGTGTATCTTTTCTTTTTACCTAAGGATGGGATAAATAAACAAGAACTTTTTCCCGTCCTCTTTTGTATGTGAATAACGTTTGTCATTTATTGTAGATTGCCCATTTTTTCATCTGAACTTTTCTTGCCCTGTACTCCTATTAGTCTGTTACTTTTGTCTNTAAAATAATAATTACTCAACGTTACCAAAAAAAG]
[+] EMBL CD084357 [ cgaggGTTTCCGATATGCCACCTAGTCCTCCATTGCCTACTCAATCAGATTCATATCGTTCTGCGCTCAGTAGTTCTAGTGTTTCTTTAGGAGTTGGTCCAACATCAGTGCTTAAGTCAACTTGGTCATCTCAAACAACAACACCGTCGGGGACAACAGAACTACGAAATTCAGAATCTAGTCACTGGGCCTGTTCTCACTGTACTTTTCATAATAGTCCTGGTACTGATGAATGCGAAATGTGTCGCCTACCTCGACGTGGATGAAGTGTGCTGAGGTGGTAAACCGATAACAGAAAAGATCAATGAACAGTTATCTTGGTAACAATGACGCTTATTCAAGACTAATTATCTCTGCATCTACAATTTCTTTAGAGCTCGTGTATCTTTTCTTTTTACCTAAGGATGGGATAAATAAACAAGAACTTTTTCCCGTCCTCTTTTGTATGTGAATAACGTTTGTCATTTATTGTAGATTGCCCATTTTTTCATCTGAACTTTTCTTGCCCTGTACTCCTATTAATCTGTTACTTTTGTCTCT TAATAATA ]
[+] EMBL CD084302 [ GTTTCCGATATGCCACCTAGTCCTCCATTGCCTACTCAATCAGATTCATATCGTTCTGCGCTCAGTAGTTCTAGTGTTTCTTTAGGAGTTGGTCCAACATCAGTGCTTAAGTCAACTTGGTCATCTCAAACAACAACACCGTCGGGGACAACAGAACTACGAAATTCAGAATCTAGTCACTGGGCCTGTTCTCACTGTACTTTTCATAATAGTCCTGGTACTGATGAATGCGAAATGTGTCGCCTACCTCGACGTGGATGAAGTGTGCTGAGGTGGTAAACCGATAACAGAAAAGATCAATGAACAGTTATCTTGGTAACAATGACGCTTATTCAAGACTAATTATCTCTGCATCTACAATTTCTTTAGAGCTCGTGTATCTTTTCTTTTTACCTAAGGATGGGATAAATAAACAAGAACTTTTTCCCGTCCTCTTTTGTATGTGAATAACGTTTGTCATTTATTGTAGATTGCCCATTTTTTCATCTGAACTTTTCTTGCCCTGTACTCCTATTAATCTGTT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||