|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8526#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 367 fasta sequence
[GTAGAAACAAAATGCGTTTATCAATACTGTGTTTGATCTTATGCCTCACAGTCTTCGTCCCATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACTGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGAAGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGTGATGATGATGATGATAATGATTCGGATGATGATGGCGATGACGATGATGATGATTCGGATGATGATGATTCGGATGATGATTCGGATGATGACGATGATGATGATGATGGTGATGAAGATGATGATGATT-GTGAAGATTATGATGA]
[+] EMBL CD155377 [GTAAAAACAAAATGCGTTTATCAATACTGTGTTTGATCTTATGCCTCACAGTCTTCGTCCCATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACTGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGAAGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGTGATGATGATGATGATAATGATTCGGATGATGATGGCGATGACGATGATGATGATTCGGATGATGATGATTCGGATGGTGATTCGGACTATGACGATG ]
[+] EMBL CD120340 [ AGAAACAAAATGCGTTTATCAATACTGTGTTTGATCTTATGCCTCACAGTCTTCGTCCCATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACTGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGAAGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGTGATGATGATGATGATAATGATTCGGATGATGATGGCGATGACGATGATGATGATTCGGATGATGATGATTCGGATGATGATTCGGATGATGACGATGATGATGATGATGGTGATGAAGATGATGATGATT GTGAAGATTATGATGA]
[+] EMBL CD120458 [ AGAAACAAAATGCGTTTATCAATACTGTGTTTGATCTTATGCCTCACAGTCTTCGTCCCATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACTGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGAAGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGTGATGATGATGATGATAATGATTCGGATGATGATGGCGATGACGATGATGATGATTCGGATGATGATGATTCAGATGATGATTCGGATGATGACGATGATGATGATGATGGTGATGAAGATGATGATGGTTCGTGAga ]
[+] EMBL CD120170 [ AGAAACAAAATGCGTTTATCAATACTGTGTTTGATCTTATGCCTCACAGTCTTCGTCCCATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACTGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGAAGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGTGATGATGATGATGATAATGATTCGGATGATGATGGCGATGACGATGATGATGATTCGGATGATGATGATTCGGATGATGATTNCGATGATGACGATGATGATGATGATGGTGATGAAGATGATGATGATT GTGAAGA ]
[+] EMBL CD120046 [ AGAAACAAAATCCGTTTATCAATACTGTGTTTGATCTTATGCCCCACAGTCTTCGTCCCATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACTGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGATGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGNGATGATGATGATGATAATGATTCGGATGATGATGGCGATGACGATGATGATGATTCGGATGATGATGATTCGGATGATGATTCGGATGATGACGATGATGATGATGATGGNGACGAAGATGATGATGATT GTGAAGA ]
[-] EMBL CD123365 [ CGTCCCATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACCGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGAAGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGTGATGATGATGATGATGATGATGATGATAATGATTCGGATGATGA ]
[+] EMBL CD161545 [ CATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACTGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGAAGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGTGATGATGATGATGATGATGAT GATGATAATG ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||