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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8549#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1158 fasta sequence
[AGGTTATCTCAATCTTGCTGCCAATGTAATTGATAATTTTACTCATGGTGTGGCTATTGCTGGAAGTTATCTTGTATCTCTTCGTTTAGGGATTTTGACGACTACCTGCATATTAGTACATGAAGTTCCTCATGAAATGGCTGATTTTGTAATTTTACTCCGAAGTGGGTTCAGTCGGTGGGAAGCTGCCAAAGCTCAA----CTACAGCATCTGGATCCACTTTGGGCGCCATCCTAACACTT-TGTGCTAATGCTTCAGTAACCGGTTGTACAACGAAATGGATACTTCCTTTTACTGCCGGTGGTTTTCTATACATTGCATTGGTTTCTCTTCTACCTGATATTTTAAAAGAATTATCATTTAAGGAATCAATTATTCATCTAAGTCTTATGTTTTTCGGTTTAACTTCAATGGCAGTTGTCTCATATGCAATGGATTGAATTGATAAATACTTGCGATAATAACCAAAATAACAACCATATTACATAATATGTAAAATTGTAAAGAAAAGACGCTCATCGATAGTTGAAAAAAAGAACACTCAAAAGATTATCGAATTTTTATATCCGGTTATTATATATCCCCTTTCTGATTTCCCACTTTATTTGCCTTCTCTTATTTATCCAACTAATATATATATGTGTAAACATAATATTTCTTATTATTATGATAAGGATGATGATGAGAAATCTAGAGAGGATCTCTATAAAACAAGTATTCACTATCATTTACCCTCTTTTTTCTTGGTTGTTTCACATTTTTTCTCTACTGAGAATTTCCTTCTTTCTTTTTCTATGTATGTAATGCAATCTATGGATTGTTTCATTCAATGATAATGATATACCGTAAATTACATCCATTACTGAATATTGTACAAGTTGTGTTGTATAGTGTAATAAGCTAAACTTGTGTTATTATTATTATTGTTATTATTATTATTATGTTCAGTAGTTTGTGGAGATATGTGAAATCTCAGAATAGTTCTCATCATGTTTTAAAATGAGATGGAGAACAATTCAGTACCAAGGAGTACTAAACAACCGTTTCATTCTACTTTAAAATACATTAACAGTGAATATAAATAAATCCTCACCGGATTTAACCTAGGACCATCACATCTTGAGATGAGTATAATATTATTTGGTGACTGCTTCGGTATC]
[+] EMBL CD169162 [AGGTTATCTCAATCTTGCTGCCAATGTAATTGATAATTTTACTCATGGTGTGGCTATTGCTGGAAGTTATCTTGTATCTCTTCGTTTAGGGATTTTGACGACTACCTGCATATTAGTACATGAAGTTCCTCATGAAATGGCTGATTTTGTAATTTTACTCCGAAGTGGGTTCAGTCGGTGGGAAGCTGCCAAAGCTCAA CTACAGCATCTGGATCCACTTTGGGCGCCATCCTAACACTT TGTGCTAATGCTTCAGTAACCGGTTGTACAACGAAATGGATACTTCCTTTTACTGCCGGTGGTTTTCTATACATTGCATTGGTTTCTCTTCTACCTGATATTTTAAAAGAATTATCATTTAAGGAATCAATTATTCATCTAAGTCTTATGTTTTTCGGTTTAACTTCAATGGCAGTTGTCTCATATGCAATGGATTGAATCGATAAATACTTGCGATAATAACCAAAATAACAACCATATTACATAATATGTAAAATTGTAAAGAAAAGACGCTCATCGATAGTTGAAAAAAAGAACACTCAAAAGATTATCGAATTTTTATATCCGGTTATTATATATCCCCTTTCTGATTTCCCACTTTATTTGCCTTCTCTTATTTATCCAACTAATATA ]
[+] EMBL CD169809 [ TTATCTCAATCTTGCTGCCAATGTAATTGATAATTTTACTCATGGTGTGGCTATTGCTGGAAGTTATCTTGTATCTCTTCGTTTAGGGATTTTGACGACTACCTGCATATTAGTACATGAAGTTCCTCATGAAATGGCTGATTTTGTAATTTTACTCCGAAGTGGGTTCAGTCGGTGGGAAGCTGCCAAAGCTCAA CTACAGCATCTGGATCCACTTTGGGCGCCATCCTAACACTT TGTGCTAATGCTTCAGTAACCGGTTGTACAACGAAATGGATACTTCCTTTTACTGCCGGTGGTTTTCTATACATTGCATTGGTTTCTCTTCTACCTGATATTTTAAAAGAATTATCATTTAAGGAATCAATTATTCATCTAAGTCTTATGTTTTTCGGTTTAACTTCAATGGCAGTTGTCTCATATGCAATGGATTGAATTGATAAATACTTGCGATAATAACCAAAATAACAACCATATTACATAATATGTAAAATTGTAAAGAAAAGACGCTCATCGATAGTTGAAAAAAAGAACACTCAAAAGATTATCGAATTTTTATATCCGGTTATTATATATCCCCTTTC ]
[+] EMBL CD168867 [ TTATCTCAATCTTGCTGCCAATGTAATTGATAATTTTACTCATGGTGTGGCTATTGCTGGAAGTTATCTTGTATCTCTTCGTTTAGGGATTTTGACGACTACCTGCATATTAGTACATGAAGTTCCTCATGAAATGGCTGATTTTGTAATTTTACTCCGAAGTGGGTTCAGTCGGTGGGAAGCTGCCAAAGCTCAA CTACA ]
[-] EMBL CD169576 [ CTGATTTTGTAATTTTACTCCGAAGTGGGTTCAGTCGGTGGGAAGCTGCCAAAGCTCAA CTACAGCATCTGGATCCACTTTGGGCGCCATCCTAACACTT TGTGCTAATGCTTCAGTAACCGGTTGTACAACGAAATGGATACTTCCTTTTACTGCCGGTGGTTTTCTATACATTGCATTGGTTTCTCTTCTACCTGATATTTTAAAAGAATTATCATTTAAGGAATCAATTATTCATCTAAGTCTTATGTTTTTCGGTTTAACTTCAATGGCAGTTGTCTCATATGCAATGGATTGAATTGATAAATACTTGCAATAATAACCAAAATAACAACCATATTACATAATATGTAAAATTGTAAAGAAAAGACGCTCATCGATAGTTGAAAAAAAGAACACTCAAAAGATTATCGAATTTTTATATCCGGTTATTATATATCCCCTTTCTGATTTCCCACTTTATTTGCCTTCTCTTATTTATCCAACTAATATATATATGTGTAAACATAATATTTCTTATTATTATGATAAGGATGATGATGAGAAATCTAGAGAGGATCTCTATAAAACAAGTACTCACTATCATTTACCCTCTTTTTTCTTGGTTGTTTCACATTTTTTCTCTACTGAGAAT ]
[-] EMBL CD169222 [ CGAAGTGGGTTCAGTCGGTGGGAAGCTGCCAAAGCTCAATTAGCTACAGCATCTGGATCCACTTTGGGCGCCATCCTAACACTT TGTGCTAATGCTTCAGTAACCGGTTGTACAACGAAATGGATACTTCCTTTTACTGCCGGTGGTTTTCTATACATTGCATTGGTTTCTCTTCTACCTGATATTTTAAAAGAATTATCATTTAAGGAATCAATTATTCATCTAAGTCTTATGTTTTTTGGTTTAACTTCAATGGCAGTTGTCTCATATGCAATGGATTGAATTGATAAATATTTGCGATAATAACCAAAATAACAACCATATTACATAATATGTAAAATTGTAAAGAAAAGACGCTCATCGATAGTTGAAAAAAAGAACACTCAAAAGACTATCGAATTTTTATATCCGGTTATTATATATCCCCTTTCTGATTTCCCACTTTATTTGCCTTCTCTTGTTTATCCAACTAATATATATATGTGTAAACATAATATTTCTTATTATTATGATAAGGATGATGATGAGAAATCTAGAGAGGATCTCTATAAAACAAGTATTCACTATCATTTACCCTCTTTTTTCTTGGTTGTTTCACATTTTTTCTCTACTGAGAAT ]
[-] EMBL CD181931 [ TTTGGGCGCCATCCT ACACTTNNGTGCTAATGCTCNAGTAACCGGTTGTACAACGAAATGGATACTTCCTTNTACTGCCGGTGGTTTTCTATACANTGCATTGGTGTCTCTTCTACCTGATA TTTAAAAGAATTATCATTTAAGGAATCAATTATTCATCTAAGTCTTATGTTTTTTGGTTTAACTTCAATGGCAGTTGTCTCATATGCAATGGATTGAATTGATAAATATTTGCGATAATAACCAAAATAACAACCATATTACATAATATGTAAAATTGTAAAGAAAAGACGCTCATCGATAGTTGAAAAAAAGAACACTCAAAAGATTATCG ]
[+] EMBL CD129414 [ AATAACAACCATATTACATAATATGTAAAATTGTAAAGAAAAGACGCTCATCGATAGTTGAAAAAAAGAACACTCAAAAGATTATCGAATTTTTATATCCGGTTATTATATATCCCCCTTCTGATTTCCCACTTTATTTGCCTTCTCTTATTTATCCAACTAATATATATATGTGTAAACATAATATTTCTTATTATTATGATAAGGATGATGATGAGAAATCTAGAGAGGATCTCTATAAAACAAGTATTCACTATCATTTACCCTCTTTTTTCTTGGTTGTTTCACATTTTTTCTCTACTGAGAATTTCCTTCTTTCTTTTTCTATGTATGTAATGCAATCTATGGATTGTTTCATTCAATGATAATGATATACCGTAAATTACATCCATTACTGAATATTGTACAAGTTGTGTTGTATAGTGTAATAAGCTAAACTTGTGTTATTATTATTATTGTTATTATTATTATTATGTTCAGTAGTTTGTGGAGATATGTGAAATCTCAGAATAGTTCTCATCATGTTTTAAAATGAGATGGAGAACAATTCAGTACCAAGGAGTACTAAACAACCGTTTCATTCTACTTTAAAATACATTAACAGTGAATATAAATAAATCCTCACCGGATTTAACCTAGGACCATCACATCTTGAGATGAGTATAATATTATTTGGTGACTGCTTCGGTATC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||