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Schistosoma mansoni
cluster # 8563 cluster # 8563       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8563#0 length = 686 sequences # 7  
consensusID : consensus_8563#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 686
fasta sequence 
                              [GTTGACGTAATGTTCTGATAGTTGTAAAGGCCATGGTTGTGGTCCATGTGTAACTAGCATATTTCGAGTTGAACCTATTGCAACAGGAGTTACTTCAGAAACAGGATCAATAAAATTGATTTTACGATATGCGGCAACATGAACACGTGAAACAATTAAAACGGATTCATCAAATTTGTTAACTGGTGAGGGATTGTAGATTGCTTTAATTTCAGTGAAACCAACATTAACTCCGATCACATAAAAATGTAAGCATTCGTTAGAATCGAATAATCCATATTCAGTAGATGAATTAAGTCGTGGTGCATGAAAACCTGGGATAATCTTCACAACATTAGAGTCGACTGCACGAATTTCAATGTTTAAATTTCTGCAATCCGTCATACTTTGACCGTCAGAATCAAGAACAGCTAATCCTATTGCCAAACGTTCCAAGTCGAATTCTACGGCAGAGGGATCT--CGTACACTCCATTCTTCATTTGTTGGCTGATTCGAATAACTTCTCGTTAATTCTTCGTCAATAAACTTAGCATTACGACGAGGTGGAATTAGAACTTCATTGCGTTCGTATACAAATTTCATTTCAGAAGGTGGACGCACATAAACTACAGTATATCCACAAATTTGAGGATTCGAAGAGCTTGATGCAACTATGATAGATTCACCGNGATTTAGAGCTGATATAA]

[+] EMBL CD160968             [GTTGACGTAATGTTCTGATAGTTGTAAAGGCCATGGTTGTGGTCCATGTGTAACTAGCATATTTCGAGTTGAACCTATTGCAACAGGAGTTACTTCAGAAACAGGATCAATAAAATTGATTTTACGATATGCGGCAACATGAACACGTGAAACAATTAAAACGGATTCATCAAATTTGTTAACTGGTGAGGGATTGTAGATTGCTTTAATTTCAGTGAAACCAACATTAACTCCGATCACATAAAAATGTAAGCATTCGTTAGAATCGAATAATCCTTATTCAGTAGATGAATTAAGTCGTGGTGCATGAAAACCTGGGATAATCTTCACAACATTAGAGTCGACTGCACGAATTTCAATGTTTAAATTTCTGCAATCCGTCATACTTTGACCGTCAGAATCAAGAACAGCTAATCCTATTGCCAAACGTTCCAAGTCGAATTCTACGGCAGAGGGATCT  CGTACACTCCATTCTTCATTTGTTGGCTGATTCGAATAACTTCTCGTTAATTCTTCGTCAATAAACTTAGCATTACGACGAGGTGGAATTAGAACTTCATTGCGTTCGTATACAAATTTCATTTCAGAAGGTGGACGCACATANACTACAGTA                                                                         ]
[+] EMBL CD161264             [GTTGACGTAATGTTCTGATAGTTGTAAAGGCCATGGTTGTGGTCCATGTGTAACTAGCATATTTCGAGTTGAACCTATTGCAACAGGAGTTACTTCAGAAACAGGATCAATAAAATTGATTTTACGATATGCGGCAACATGAACACGTGAAACAATTAAAACGGATTCATCAAATTTGTTAACTGGTGAGGGATTGTAGATTGCTTTAATTTCAGTGAAACCAACATTAACTCCGATCACATAAAAATGTAAGCATTCGTTAGAATCGAATAATCCATATTCAGTAGATGAATTAAGTCGTGGTGCATGAAAACCTGGGATAATCTTCACAACATTAGAGTCGACTGCACGAATTTCAATGTTTAAATTTCTGCAATCCGCCATACTTTGACCGTCAGAATCAAGAACAGCTAATCCTATTGCCAAACGTTCCAAGTCGAATTCTACGGCAGAGGGATCT  CGTACAC                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD161302             [GTTGACGTAATGTTCTGATAGTTGTAAAGGCCATGGTTGTGGTCCATGTGTAACTAGCATATTTCGAGTTGAACCTATTGCAACAGGAGTTACTTCAGAAACAGGATCAATAAAATTGATTTTACGATATGCGGCAACATGAACACGTGAAACAATTAAAACGGATTCATCAAATTTGTTAACTGGTGAGGGATTGTAGATTGCTTTAATTTCAGTGAAACCAACATTAACTCCGATCACATAAAAATGTAAGCATTCGTTAGAATCGAATAATCCATATTCAGTAGATGAATTAAGTCGTGGTGCATGAAAACCTGGGATAATCTTCACAACATTAGAGTCGACTGCACGAATTTCAATGTTTAAATTTCTGCAATCCGTCATACTTTGACCGTCAGAATCAAGAACAGCTAATCCTATTGCCAAACGTTCCAAGTCGAATTCTACGGCAGAGGGATCT  CGTACAC                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD160951             [ TTGACGTAATGTTCTGATAGTTGTAAAGGCCATGGTTGTGGTCCATGTGTAACTAGCATATTTCGAGTTGAACCTATTGCAACAGGAGTTACTTCAGAAACAGGATCAATAAAATTGATTTTACGATATGCGGCAACATGAACACGTGAAACAATTAAAACGGATTCATCAAATTTGTTAACTGGTGAGGGATTGTAGATTGCTTTAATTTCAGTGAAACCAACATTAACTCCGATCACATAAAAATGTAAGCATTCGTTAGAATCGAATAATCCATATTCAGTAGATGAATTAAGTCGTGGTGCATGAAAACCTGGGATAATCTTCACAACATTAGAGTCGACTGCACGAATTTCAATGTTTAAATTTCTGCAATCCGTCATACTTTGACCGTCAGAATCAAGAACAGCTAATCCTATTGCCAAACGTTCCAAGTCGAATTCTACGGCAGAGGGATCT  CGTACACT                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD118679             [                                                                                                                                                            TAAAACGGATTCATCAAATTTGTTAACTGGTGAGGGATTGTAGATTGCTTTAATTTCAGTGAAACCAACATTAACTCCGATCACATAAAAATGTAAGCATTCGTTAGAATCGAATAATCCATATTCAGTAGATGAATTAAGTCGTGGTGCATGAAAACCTGGGATAATCTTCACAACATTAGAGTCGACTGCACGAATTTCAATGTTTAAATTTCTGCAATCCGTCATACTTTGACCGTCAGAATCGAGAACAGCTAATCCTATTGCCAAACGTTCCAAGTCGAATTCTACGGCA AGGATTGTNNNNGACACTCCATTCTTCATTTGTTGGCTGATTCGAATAACTTCTCGTTAATTCTTCGTCAATAAACTTAGCATTACGACGAGGTGGAATTAGAACTTCATTGCGTTCGTATACAAATTTCATTTCAGAAGGTGGACGCACATAAACTACAGTATATCCACAAATTTGAGGATTCGAAGAGCTTGATGCAACTATGATAGATTCACCGNGATTTAGAGCTGATATAA]
[+] EMBL CD118649             [                                                                                                                                                            TAAAACGGATTCATCAAATTTGTTAACTGGTGAGGGATTGTAGATTGCTTTAATTTCAGTGAAACCAACATTAACTCCGATCACATAAAAATGTAAGCATTCGTTAGAATCGAATAATCCATATTCAGTAGATGAATTAAGCCGTGGCGCATGAAAACCTGGGATAATCTTCACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD183558             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CACAACATTAGAGTCGACTGCACGAATTTCAATGTTTAAATTTCTGCAATCCGTCATACTTTGACCGTCAGAATCAAGAACAGCTAATCCTATTGCCAAACGTTCCAAGTCGAATTCTACGGCAGAGGGATCT  CGTACACTCCATTCTTCATTTGTTGGCTGATTCGAATAACTTCTCGTTAATTCTTCGTCAATAAACTTAGCATTACGACGAGGTGGAATTAGAACTTCATTGCGTTCGTATACAAATTTCATTTCAGAAGGTGGACGCACATAAACTACAGTATATCCACAAATTTGAGGATTCGAAGAGCTTGATGCAACTATGATAGATTCACCG                   ]




>consensus_8563#0
GTTGACGTAATGTTCTGATAGTTGTAAAGGCCATGGTTGTGGTCCATGTGTAACTAGCAT
ATTTCGAGTTGAACCTATTGCAACAGGAGTTACTTCAGAAACAGGATCAATAAAATTGAT
TTTACGATATGCGGCAACATGAACACGTGAAACAATTAAAACGGATTCATCAAATTTGTT
AACTGGTGAGGGATTGTAGATTGCTTTAATTTCAGTGAAACCAACATTAACTCCGATCAC
ATAAAAATGTAAGCATTCGTTAGAATCGAATAATCCATATTCAGTAGATGAATTAAGTCG
TGGTGCATGAAAACCTGGGATAATCTTCACAACATTAGAGTCGACTGCACGAATTTCAAT
GTTTAAATTTCTGCAATCCGTCATACTTTGACCGTCAGAATCAAGAACAGCTAATCCTAT
TGCCAAACGTTCCAAGTCGAATTCTACGGCAGAGGGATCTCGTACACTCCATTCTTCATT
TGTTGGCTGATTCGAATAACTTCTCGTTAATTCTTCGTCAATAAACTTAGCATTACGACG
AGGTGGAATTAGAACTTCATTGCGTTCGTATACAAATTTCATTTCAGAAGGTGGACGCAC
ATAAACTACAGTATATCCACAAATTTGAGGATTCGAAGAGCTTGATGCAACTATGATAGA
TTCACCGNGATTTAGAGCTGATATAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)