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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8585#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 903 fasta sequence
[TGTTTTACCTAACTGAATACGGATGTTCTGTAGATAATTAAAACCTTTCCTTTCCGGTATGATATCAGAACATTACATTGATTACTGTCTACTGAATTTATCATCCATTTGAAAACTACACAGAAACTAATAGAAACTTAAATGACATAAAAAACCTAACTCTCTAGTCTAAAATTTTCAGAATAATTGGCTGGTGAACCCATCTCCAAATGAAGGAGAGGATCATTTCGATTTCTATAGATAGAAATACTAATTGATGTCGCTTGATCGTAAGAATATCTATTTAAAAAAAATCAGTGGAACATAATAATTTTCTTGCAGTAAAATAGTTCTAATGCCAAATCTGCTGTGCATAAAACGTTTACAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGATAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGAAAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTAAATTGGGTAGCGCTAGTAATCTAACCTAAAAATTGATTTGGAGAGCTACTGA-AATGCAATTTGATCTTTTTCAGTACGGCTTTGGTTTGATGTCGTTTCAGTTTTAAGCATGTTATAATTACGCGACAAGCTTTTTAGACTGGTATGCTCATTCATATGTACTAACATTAGTATGCAGAGAAAATCAGGTAGCTTTCTTTAGAGGATTGCTAACGATATCCATTAGTGATCCCTTGAATAGTTGGATGAAGGGAGTTTTGTCTTCCTATACGGTCGATTCGTAATACAAGTTTGCGCATTTTACGGTCTGTGGGATAATGTGTTGGCCAGACAGCTTTGGATGATCTTAGAAATCGGAATTAACAGCTAAATATCTTGACACATTAGCAGAAATATCAAGCACTCGTGTTTAC]
[+] EMBL CD085099 [TGTTTTACCTAACTGAATACGGATGTTCTGTAGATAATTAAAACCTTTCCTTTCCGGTATGATATCAGAACATTACATTGATTACTGTCTACTGAATTTATCATCCATTTGAAAACTACACAGAAACTAATAGAAACTTAAATGACATAAAAAACCTAACTCTCTAGTCTAAAATTTTCAGAATAATTGGCTGGTGAACCCATCTCCAAATGAAGGAGAGGATCATTTCGATTTCTATAGATAGAAATACTAATTGATGTCGCTTGATCGTAAGAATATCTATTTAAAAAAAATCAGTGGAACATAATAATTTTCTTGCAGTAAAATAGTTCTAATGCCAAATCTGCTGTGCATAAAACGTTTACAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGATAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGAAAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTANATTGGGTAGCGCTAGTAATCTAACCTAAAAATTGATTTGGAGAGCTACTGA AATGCAATTTGATCTTTTTCAGTACGGCTTTGGTTTGATGTCGTTTCAGT ]
[+] EMBL CD085203 [TGTTTTACCTAACTGAATACGGATGTTCTGTAGATAATTAAAACCTTTCCTTTCCGGTATGATATCAGAACATTACATTGATTACTGTCTACTGAATTTATCATCCATTTGAAAACTACACAGAAACTAATAGAAACTTAAATGACATAAAAAACCTAACTCTCTAGTCTAAAATTTTCAGAATAATTGGCTGGTGAACCCATCTCCAAATGAAGGAGAGGATCATTTCGATTTCTATAGATAGAAATACTAATTGATGTCGCTTGATCGTAAGAATATCTATTTAAAAAAAATCAGTGGAACATAATAATTTTCTTGCAGTAAAATAGTTCTAATACCAAATCTGCTGTGCATAAAACGTTTACAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGGTAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGAAAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTAAATTGNGTAGCGCTAGTAATCTAACCTAAAAATTGATTTGGAGAGCTACTGANNATGC ATTTGATCTTTTTCAGTACGGCTTTGGTTT ]
[+] EMBL CD085054 [TGTTTTACCTAACTGAATACGGATGTTCTGTAGATAATTAAAACCTTTCCTTTCCGGTATGATATCAGAACATTACATTGATTACTGTCTACTGAATTTATCATCCATTTGAAAACTACACAGAAACTAATAGAAACTTAAATGACATAAAAAACCTAACTCTCTAGTCTAAAATTTTCAGAATAATTGGCTGGTGAACCCATCTCCAAATGAAGGAGAGGATCATTTCGATTTCTATAGATAGAAATACTAATTGATGTCGCTTGATCGTAAGAATATCTATTTAAAAAAAATCAGTGGAACATAATAATTTTCTTGCAGTAAAATAGTTCTAATGCCAAATCTGCTGTGCATAAAACGTTTACAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGATAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGAAAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTAAATTGGGTAGCG ]
[+] EMBL CD085140 [TGTTTTACCTAACTGAATACGGATGTTCTGTAGATAATTAAAACCTTTCCTTTCCGGTATGATATCAGAACATTACATTGATTACTGTCTACTGAATTTATCATCCATTTGAAAACTACACAGAAACTAATAGAAACTTAAATGACATAAAAAACCTAACTCTCTAGTCTAAAATTTTCAGAATAATTGGCTGGTGAACCCATCTCCAAATGAAGGAGAGGATCATTTCGATTTCTATAGATAGAAATACTAATTGATGTCGCTTGATCGTAAGAATATCTATTTAAAAAAAATCAGTGGAACATAATAATTTTCTTGCAGTAAAATAGTTCTAATGCCAAATCTGCTGTGCATAAAACGTTTACAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGATAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGAAAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTAAATTGG ]
[-] EMBL CD085204 [ TAGTTCGAATGCCAAATCTGCTGTGCATANAACGTTANCAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGATAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGAAAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTAAATTGGGTAGCGCTAGTAATCTAACCTAAAAATTGATTTGGAGAGCTACTGA AATGCAATTTGATCTTTTTCAGTACGGCTTTGGTTTGATGTCGTTTCAGTTTTAAGCATGTTATAATTACGCGACAAGCTTTTTAGACTGGTATGCTCATTCATATGTACTAACATTAGTATGCAGAGAAAATCAGGTAGCTTTCTTTAGAGGATTGCTAACGATATCCATTAGTGATCCCTTGAATAGTTGGATGAAGGGAGTTTTGTCTTCCTATACGGTCGATTCGTAATACAAGTTTGCGCATTTTACGGTCTGTGGGATAATGTGTTGGCCAGACAGCTTTGGATGATCTTAGAAATCGGAATTAACAGCTAAATATCTTGACACATTAGCAGAAATATCAAGCACTCGTGTTTAC]
[-] EMBL CD085206 [ TAGTTCTAATGCCAAATCTGCTGTGCATAAAACGTTTACAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGATAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGAAAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTAAATTGGGTAGCGCTAGTAATCTAACCTAAAAATTGATTTGGAGAGCTACTGA AATGCAATTTGATCTTTTTCAGTACGGCTTTGGTTTGATGTCGTTTCAGTTTTAAGCATGTTATAATTACGCGACAAGCTTTTTAGACTGGTATGCTCATTCATATGTACTAACATTAGTATGCAGAGAAAATCAGGTAGCTTTCTTTAGAGGATTGCTAACGATATCCATTAGTGATCCCTTGAATAGTTGGATGAAGGGAGTTTTGTCTTCCTATACGGTCGATTCGTAATACAAGTTTGCGCATTTTACGGTCTGTGGGATAATGTGTTGGCCAGACAGCTTTGGATGATCTTAGAAATCGGAATTAACAGCTAAATATCTTGACACATTAGCAGAAATATCAAGCACTCGTGTTTAC]
[-] EMBL CD085108 [ TTCTAATGCCAAATCTGCTGTGCATANAACGTNTACAGGTAGATTATAGTGGGATTAGGAAAATTCTTTATCATGATAAAAAAATAAGATGATACACCAATCTCTGCAAGTAGAGAGATAATATTTATATTTTACAGTGACGCTCCATCAATCCCTATTTAAATTGGGTAGCGCTAGTAATCTAACCTAAAAATTGATTTGGAGAGCTACTGA AATGCAATTTGATCTTTTTCAGTACGGCTTTGGTTTGATGTCGTTTCAGTTTTAAGCATGTTATAATTACGCGACAAGCTTTTTAGACTGGTATGCTCATTCATATGTACTAACATTAGTATGCAGAGAAAATCAGGTAGCTTTCTTTAGAGGATTGCTAACGATATCCATTAGTGATCCCTTGAATAGTTGGATGAAGGGAGTTTTGTCTTCCTATACGGTCGATTCGTAATACAAGTTTGCGCATTTTACGGTCTGTGGGATAATGTGTTGGCCAGACAGCTTTGGATGATCTTAGAAATCGGAATTAACAGCTAAATATCTTGACACATTAGCAGAAATATCAAGCACTCGTGTTTAC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||