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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8612#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 680 fasta sequence
[GCGGGAACATGTGATTTGATACCATGATGGATGTATTGGGTTTCAAAGTAGTGAAATCCACCTTATGATTAAACTTCTTCGTTTTGTTCTGTGGCTATCACCGTCGTCCACAGATCAAATATTTCCTAACTCAACAGGGTCCTCATATTACAT-GTCTT-CGAAG-CTGGTACC-TGGAAAGAACAAATCCGGATTGCAAGACTATTTTATTTTGCTATTTCTACTGATTTAAAACTTCGGTTTTTTAATGTTGAGGAATCGTGTGTGCTTAGCTGCTATCGGAGTTATTCCGTTAATTTTAATCACATTTTTCCTTGTCTTCGATGTGTGCGGTGAACACTGTCACAATGACGTCTTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGAAAAGGATATACGAGTGTTATGTGGTATTCTGTGCGGAAGGTTTACAAAATGGCTATTGGATGTCTTAAAAACGAACATAGGCAGTTACAGTTAGATTGGTTTCCTAATGTTCCTGAAATAATTGCTACTTACGTTTCATATGAAAAGCGAATTCGTCAAGTGTGTATATTTTCTTTATCAAATGGAATTCTATCTTCCGGGGTTTCAGTAGAAGAACTAAATGATCAATCAGTTGATATGATGCTGACTACGA]
[+] EMBL CD123977 [GCGGGAACATGTGATTTGATACCATGATGGATGTATTGGGTTTCAAGGTAGTGAAATCCACCTTATGATTAAACTTCTTCGTTTTGTTCTGTGGCTATCACCGTCGTCCACAGATCAAATATTTCCTAACTCAACAGGGTCCTCATATTACAT GTCTT CGAAG CTGGTACC TGGAAAGAACAAATCCGGATTGCAAGACTATTTTATTTTGCTATTTCTACTGATTTAAAACTTCGGTTTTTTAATGTTGAGGAATCGTGTGTGCTTAGCTGCTATCGGAGTTATTCCGTTAATTTTAATCACATTTTTCCTTGTCTTCGATGTGTGCGGTGAACACTGTCACAATGACGTCTTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGAAAAGGATATACGGGTGCTATGTGGTATTCTGTGCCGGAGGTTTACAA ]
[+] EMBL CD124002 [GCGGGAACATGTGACCTGATACCATGATGGATGCATTGGGATTCAAAGTAGTGAAACTCACCTCATGATTAAACTTCTTCACTTAGGTCTGAGGCTATCACCGTCGTTCACGGATCAAATATTTGCTAACTCAACAGGGTCCTCATATTACATAGTCTTCCCAAGCCTGGAACCTTGGAAAGAGCAAATCCGGATTGCAAGACTATTTTATTTTGCTATTTCTACTGATTTAAAACTTCGGTTTTTTAATGTTGAGGAATCGTGTGTGCTTATCTGCTATCGGAGTTATTCCGTTAATTTTAATCACATTTTTCCTTGTCTTCGATGTGTGCGGTGAACACTGTCACAATGACGTGTTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGTAAAGGATATACTAGTGTTATGTGGTATTCTGTGCGTACTGCTTACATAATGGCTATTGAATGTC ]
[+] EMBL CD123995 [GCGGGAACATGTGATTTGATACCATGATGGATGTATTGGGTTTCAAAGTAGTGAAATCCACCTCATGATTAAACTTCTTCGTTTTGTTCTGTGGCTATCACCGTCGTCCACAGATCAAATATTTCCTAACTCAACAGGGTCCTCATATTACAT GTCTT CGAAG CTGGTACC TGGAAAGAACAAATCCGGATTGCAAGACTATTTTATTTTGCTATTTCTACTGATTTAAAACTTCGGTTTTTTAATGTTGAGGAATCGTGTGTGCTTAGCTGCTATCGGAGTTATTCCGTTAATTTTAATCACATTTTTCCTTGTCTTCGATGTGTGCGGTGAACACTGTCACAATGACGTCTTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGAAAAGGATATACGAGTGTTATGTGGTATTCTGTGCGGAAGGTTTACAAAATGGCTATTGGATGTC ]
[+] EMBL CD153964 [ GGGTTTCAAAGTAGTGAAATCCACCTTATGATTAAACTTCTTCGTTTTGTTCTGTGGCTATCACCGTCGTCCACAGATCAAATATTTCCTAACTCAACAGGGTCCTCATATTACAT GTCTT CGAAG CTGGTACC TGGAAAGAACAAATCCGGATTGCAAGACTATTTTATTTTGCTATTTCTACTGATTTAAAACTTCGGTTTTTTAATGTTGAGGAATCGTGTGTGCTTAGCTGCTATCGGAGTTATTCCGTTAATTTTAATCACATTTTTCCTTGTCTTCGATGTGTGCGGTGAACACTGTCACAATGACGTCTTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGAAAAGGATATACGAGTGTTATGTGGTATTCTGTGCGGAAGGTTTACAAAATGGCTATTGGATGTCTTANAAACGAACATAGGCAGTTACAGTTAGATTGGTTTCCTAATGTTCCTGAAATAATTGCTACTTACGTTTCATATGAAAAGCGAATTCGTCAAGTGTGTATATTTTCTTTAT ]
[+] EMBL CD165559 [ TATTTCCTAACTCAACAGGGTCCTCATATTACAT GTCTT CGAAG CTGGTACC TGGAAAGAACAAATCCGGATTGCAAGACTATTTTATTTTGCTATTTCTACTGATTTAAAACTTCGGTTTTTTAATGTTGAGGAATCGTGTGTGCTTAGCTGCTATCGGAGTTATTCCGTTAATTTTAATCACATTTTTCCTTGTCTTCGATGTGTGCGGTGAACACTGTCACAATGACGTCTTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGAAAAGGATATACGAGTGTTATGTGGTATTCTGTGCGGAAGGTTTACAAAATGGCTATCGGATGTCTTAAAAACGAACATAGGCAGTTACAGTTAGATTGGTTTCCTAATGTTCCTGAACTAATTGCTACTTACGTTTCATATGACAAGCGAATTCGTCAAGTG ]
[+] EMBL CD094116 [ GTGCGGTGAACACTGTCACAATGACGTCTTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGAAAAGGATATACGAGTGTTATGTGGTATTCTGTGCGGAAGGTTTACAAAATGGCTATTGGATGTCTTAAAAACGAACATAGGCAGTTACAGTTAGATTGGTTTCCTAATGTTCCTGAAATAATTGCTACTTACGTTTCATATGAAAAGCGAATTCGTCAAGTGTGTATATTTTCTTTATCAAATGGAATTCTATCTTCCGGGGTTTCAGTAGAAGAACTAAATGATCAATCAGTTGATATGATGCTGACTACGA]
[-] EMBL CD195519 [ TTTTTGGAGGCTAAACTTGGTAAACCCTCTTATGCTAGATGGGTGAATACGTCAATTACTTTAATCTGCTCTGGAAAAGGATATACGAGTGTTATGTGGTATTCTGTGCGGAAGGTTTACAAAATGGCTATTGGATGTCTTAAAAACGAACATAGGCAGTTACAGTTAGATTGGTTTCCTAATGTTCCTGAAATAATTGCTACTTACGTTTCATATGAAAAGCGAATTCGTCAAGTGTGTATATTTTCTTTATCAAATGGAATTCTATCTTCCGGGGTTTCAGTAGAAGAACTAAATGATCAATCAGT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||