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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8624#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 861 fasta sequence
[CCTATGCTCCATTGGGAGTAACGGGCGTAAGTAAGTAAGATTTTTATGTTTGGAAAACTATCTTTATGCCCTTCATAATTTTCTCTTGTTAAATATTCATACAATCAACATATAAACGATTCTTATTATTCTTTCACATGTATTACTTTTCATTAATTGATATGACAAAGGAACAGAAAATAAATCGAGCAGCATAATGAATACAGTTGCACCAAATGGGATTCATCATTCTGCGACGATAAGTTCCTGATGAATCTACTTAACAGGATTCTCGAGTTGTTTTGTTAGATACGGGTTCTTCCAATGATTCACAGAATTTTGATGAAATTTCTCACAAAAATAAGAAAAATATGTTAGATGATGGCCAAAAACCTAATGCAATTTTGTTAGATGTTGATTTCCCTAGTGATTCATCATCTACTAATGGGATTCTTAATAAATNTGCTGAGAATGTCTCAGAAGATTCAGACCCTGGTGACTTCAAATCAAATGTCGTTCATCCTCACCATCTAGTCACTTTTAACGGATTCTCTATTCAGTGAGAAAAATATGTTTAAAATAAAGCCATCTATCAGTTCACCTGCTCTTGTGGATCAAGGTACATTGGTCGTAGCCAGCACTCGCTTTCAACTCGGATACGTGAACATGTCGCAGTTTGGTTATACAAGGATGAAAGGAAAGCAGTTAAGAGTTCTATACTTGAACACCTAATCGATTGTAATCATTCTGCGGATCCACAGTTTGATTTTAAGGTTGTTTATATGATTCGTTCAAATCTACTTAGATTTCTTCGTATGCGACTCCTAAAATTAGCCGAAGCTCTTACCATCTATGAGCTCAAACCACAAATATCCGTACAAA]
[+] EMBL CD201989 [CCTATGCTCCATTGGGAGTAACGGGCGTAAGTAAGTAAGATTTTTATGTTTGGAAAACTATCTTTATGCCCTTCATAATTTTCTCTTGTTAAATATTCATACAATCAACATATAAACGATTCTTATTATTCTTTCACATGTATTACTTTTCATTAATTGATATGACAAAGGAACAGAAAATAAATCGAGCAGCATAATGAATACAGTTGCACCAAATGGGATTCATCATTCTGCGACGATAAGTTCCTGATGAATCTACTTAACAGGATTCTCGAGTTGTTTTGTTAGATACGGGTTCTTCCAATGATTCACAGAATTTTGATGAAATTTCTCACAAAAATAAGAAAAATATGTTAGATGATGGCCAAAAACCTAATGCAATTTTGTTAGATGTTGATTTCCCTAGTGATTCATCATCTACTAATGGGATTCTTAATAAATNTGCTGAGAATGTCTCAGAAGATTCAGACCCTGGTGACTTCAAATCAAATGTCGTTCATCCTCACCATCTAGTCACTTTTAACGGATCCTCTATTCAGTGAGAAAAATATGTTTAAAATAAAGCCATCTATC ]
[-] EMBL CD202040 [ nTATGCTCCATTGGGAGTAACGGGCGTAAGTAAGTAAGATTTTTATGTTTGGAAAACTATCTTTATGCCCTTCATAATTTTCTCTTGTTAAATATTCATACAATCAACATATAAACGATTCTTATTATTCTTTCACATGTATTACTTTTCATTAATTGATATGACAAAGGAACAGAAAATAAATCGAGCAGCATAATGTATACAGTTGCACCAAATGGAATTCATCATTCTGCGACGATAAGTTCCTGATGAATCTACTTAACAGGATTCTCGAGTTGTTTTGCTAGATACGGGTTCTTCCAATGATTCACAGAATTTTGATGAAATTTCTCACAAAAATAAGAAAAATATGTTAGATGATGGTCAAAAACCTAATGCAATTTTGTTAGATGTTGATTTCCCTAGTGATTCATCATCTACTAATGGGATTCTTAATAAATTTGCTGAGAATGTCTCAGAAGATTCAGACCCTGGTGACTTCAAATCAAATGTCGTTCATCCTCACCATCTAGTCACTTTTAACGGATTCTCTATTCAGTGAGAAAAATATGTTTAAAATAAAGCCATCTATCA ]
[-] EMBL CD066547 [ CAGAAGATTCAGACCCTGGTGACTTCAAATCAAATGTCGTTCATCCTCACCATCTAGTCACTTTTAACGGATTCTCTATTCAGTGAGAAAAATATGTTTAAAATAAAGCCATCTATCAGTTCACCTGCTCTTGTGGATCAAGGTACATTGGTCGTAGCCAGCACTCGCTTTCAACTCGGATACGTGAACATGTCGCAGTTTGGTTATACAAGGATGAAAGGAAAGCAGTTAAGAGTTCTATACTTGAACACCTAATCGATTGTAATCATTCTGCGGATCCACAGTTTGATTTTAAGGTTGTTTATATGATTCGTTCAAATCTACTTAGATTTCTTCGTATGCGACTCCTAAAATTAGCCGAAGCTCTTACCATCTATGAGCTCAAACCACAAATATCCGTACAAA]
[-] EMBL CD066861 [ AGTGAGAAAAATATGTTTAAAATAAAGCCATCTATCAGTTCACCTGCTCTTGTGGATCAAGGTACATTGGTCGTAGCCAGCACTCGCTTTCAACTCGGATACGTGAACATGTCGCAGTTTGGTTATACAAGGATGAAAGGAAAGCAGTTAAGAGTTCTATACTTGAACACCTAATCGATTGTAATCATTCTGCGGATCCACAGTTTGATTTTAAGGTTGTTTATATGATTCGTTCAAATCTACTTAGATTTCTTAGTATGCGACTCCTAAAATTAGCCGAAGCTCTTACCATCTATGAGCTCAAACCACAAATATCCGTACAAA]
[+] EMBL CD072607 [ ACATTGGTCGTAGCCAGCACTCGCTTTCAACTCGGATACGTGAACATGTCGCAGTTTGGTTATACAAGGATGAAAGGAAAGCAGTTAAGAGTTCTATACTTGAACACCTAATCGATTGTAATCAT ]
[+] EMBL CD072652 [ ACATTGGCCGTAGCCAGCACTCGCTTTCAACTCGGATACGTGAACATGTCGCAGTTTGGTTATACAAGGATGAAAGGAAAGCAGTTAAGAGTTCTATACTTGAACACCTAATCGATTGTAATCAT ]
[+] EMBL CD072605 [ ACATTGGTCGTAGCCAGCACTCGCTTTCAACTCGGATACGTGAACATGTCGCAGTTTGGTTATACAAGGATGAAAGGAAAGCAGTTAAGAGTTCTATACTTGAACACCTAATCGATTGTAATCAT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||