cluster # 8639

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Schistosoma mansoni
cluster # 8639 cluster # 8639 Sequences # 7 consensus # 2

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consensus_8639#0 length = 870 sequences # 6

consensus_8639#1 length = 520 sequences # 1

consensusID : consensus_8639#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 870
fasta sequence

                              [CATTGAGCTGACACCCACAACATGCACCAGGAAAAATGAAATTGTTTTCTCCAAAAGTGGAAA-AACTGGTGAAGGGGACCTTAGAAACCAGAAGTAATATTC-CCTAGG-TAATGATCAAAAAAGACCTATTTCAGGT-GAACAACTCACTTAGTTGAAGTAATAGTCAATAAGATCAA-GGGAATACATTGATAA-GTATAAAGAGACCTTTATTTG-AATACTACTGTTATGTATAGCAATAAAAGCAGTAGTAATGGTAGTAGGGATGGAGGCATATTGTCAGTTTACAAGTATAGAGATTGTAT-TTGTCATCTCCTTTACCAATTATTTGACACTTTCTATTTTTATGCTGCCTATCCCCCCTCAGTTTTTAACATCATCAACGACATTATACAGCTTGATGGGTCAATTTACTATCATAAACATGATCATCTGATGTGTTAGTCGATGAAATATCTTTTAATACTGGAGTGGAATGGTGTTGTTTACCATTAATAATACTTTTTCTATCATTTTGAATATTATTGAAATTCGGATGTAAACTAGGTGCACTTAAGACAAATGGGATTTTTCTTTGAACTGATAATGATTTCTGATTATCACTATTACCATTAACATTATTGTTATCATCATCATCACTATTATTATGAACATGATTATCAGTCACCATGACTGACAGAATAAAATGTTGATTTGAAATGGTGTTAATTTCATTATTCGATGAATTGGAAATTNTACATTGACTNTNTAATTNTTCATTATGCTCTTCA-TTTTTATCGGTCGTGNTGTTGTGATTGTTGTTGATGATGGTGGNAGGNACATA-GTAGTAACTTGTACAGGAACAGGTACANAACTTGTCGACGGTACTCCTGT]

[-] EMBL CD091647             [CATTGAGCTGACACCCACAACATGCACCAGGAAAAATGAAATTGTTTTCTCCAAAAGTGGAAA AACTGGTGAAGGGGACCTTAGAAACCAGAAGTAATATTC CCTAGGTTAATGATCAAAAAAGACCTATTTCAGGTGGACCAATTCACTTGGTTTAAGTAATAGTCATTAAGATCAAGGGGAATACATTGATAA GTATAAAGAGACCTTAATTTG AATACTACTGTTATGTATAGCAATAAAAGCAGTAGTAATGGTAGTAGGGATGGAGGCATATTGTCAGTTTACAAGTATAGAGATTGTAT TTGTCATCTCCTTTACCAATTATTTGACACTTTCTATTTTTATGCTGCCTATCCCCCCTCAGTTTTTAACATCATCAACGACATTATACAGCTTGATGGGTCAATTTACTATCATAAACATGATCATCTGATGTGTTAGTCGATGAAATATCTTTTAATACTGGAGTGGAATGGTGTTGTTTACCATTAATAATACTTTTTCTATCATTTTGAATATTATTGAAATTCAGATGTAAACTAGGTGCACTTAAGACAAATGGGATTTTTCTTTGAACTGATAATGATTTCTGATTATCACTATTACCATTAACATTATTGTTATCATCATCATCACTATTATTATGAACATGATTATCAGTCACCATGACTGACAGAATAAAAT                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD201828             [                                         TTATTTTGACGATAAATGGAAATAACTGTAGAAGGGAAACTAAAAAAACAGAAGTAATAATCGCCTAGG TAATGATCAAAAGAGAACTATTTCAGGT GAACAACTCACTTAGTTGAAGTAATAGTCAATAAGATCAA GGGAATACATTGATAA GTATAAAGAGACCTTTATTTG AATACTACTGTTATGTATAGCAATAAAAGCAGTAGTAATGGTAGTAGGGATGGAGGCATATTGTCAGTTTACAAGTATAGAGATTGTAT TTGTCATCTCCTTTACCAATTATTTGACACTTTCTATTTTTATGCTGCCTATCCCCCCTCAGTTTTTAACATCATCAACGACATTATACAGCTTGATGGGTCAATTTACTATCATAAATATGATCATCTGATGTGTTAGTCGATGAAATATCTTTTAATACTGGAGTGGAATGGTGTTGTTTACCATTAATAATACTTTTTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD066881             [                                                                                                                                             AACAACTCACTTAGTTGAAGTAATAGTCAATAAGATCAA GGGAATACATTGATAA GTATAAAGAGACCTTTATTTG AATACTACTGTTATGTATAGCAATAAAAGCAGTAGTAATGGTAGTAGGGATGGAGGCATATTGTCAGTTTACAAGTATAGAGATTGTAT TTGTCATCTCCTTTACCAATTATTTGACACTTTCTATTTTTATGCTGCCTATCCCCCCTCAGTTTTTAACATCATCAACGACATTATACAGCTTGATGGGTCAATTTACTATCATAAACATGATCATCTGATGTGTTAGTCGATGAAATATCTTTTAATACTGGAGTGGAATGGTGTTGTTTACCATTAATAATACTTTTTCTATCATTTTGAATATTATTGAAATTCGGATGTAAACTAGGTGCACTTAAGACAAATGGGATTTTTCTTTGAACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD091662             [                                                                                                                                                           TTGAAGTAATAGTCAATAAGATCAA GGGAATACATTGATAA GTATAAAGAGACCTTTATTTG AATACTACTGTTATGTATAGCAATAAAAGCAGTAGTAATGGTAGTAGGGATGGAGGCATATTGTCAGTTTACAAGTATAGAGATTGTAT TTGTCATCTCCTTTACCAATTATTTGACACTTTCTATTTTTATGCTGCCTATCCCCCCTCAGTTTTTAACATCATCAACGACATTATACAGCTTGATGGGTCAATTTACTATCATAAACATGATCATCTGATGTGTTAGTCGATGAAATATCTTTTAATACTGGAGTGGAATGGTGTTGTTTACCATTAATAATACTTTTTCTATCATTTTGAATATTATTGAAATTCAGATGTAAACTAGGTGCACTTAAGACAAATGGGATTTTTCTTTGAACTGATAATGATTTCTGATTATCACTATTACCATTAACATTATTGTTATCATCATCATCACTATTATTATGAACATGATTATCAGTCACCATGACTGACAGAATAAAATGTT                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD153231             [                                                                                                                                                                       TCAATAAGATCAA GGGAATACATTGACAA GTATAAAGAGACCTTTATTTG AATACTACTGTTATGTATAGCAATAAAAGCAGTAGTAATGGTAGTAGGGATGGAGGCATATTGTCAGTTTACAAGTATAGAGATTGTAT TTGTCATCTCCTTTACCAATTATTTGACACTTTCTATTTTTATGCTGCCTATCCCCCCTCAGTTTTTAACATCATCAACGACATTATACAGCTTGATGGGTCAATTTACTATCATAAACATGATCATCTGATGTGTTAGTCGATGAAATATCTTTTAATACTGGAGTGGAATGGTGTTGTTTACCATTAATAATACTTTTTCTATCATTTTGAATATTATTGAAATTCGGATGTAAACTAGGTGCACTTAAGACAAATGGGATTTTTCTTTGAACTGATAATGATTTCTGATTATCACTATTACCATTAACATTATTGTTATCATCATCATCATTATTATTATGAACATGATTATCAGTCACCATGACTGACAGAATANAATGTTGATTTGAAATGGTGTTAATTTCATTATTCGATGAATTGGAAATTNTACATTGACTNTNTAATTNTTCATTATGCTCTTCA TTTTTATCGGTCGTGNTGTTGTGATTGTTGTTGATGATGGTGGNAGGNACATA GTAGTAACTTGTACAGGAACAGGTACANAACTTGTCGACGGTACTCCTGT]
[-] EMBL CD153222             [                                                                                                                                                                        CATTAGGATC A GGGGAT CA TGATAAGGTATAAAGAGGCCTTTAATTGAAATACTACTGGTATGTATAGCAATAAAAGCAGTAGTAATGGTAGTAGGAATGGAGGCATATGNTCAGTTTACAAGTATAGAGA TGTATNTTGTCATCTCCTTTACCAATTATTTGACACTTTCTATTTNTATGCTGCCTATCCCGCCTCAGTTTTTAACATCATCAACGACATTATACAGCTTGATGGGTCAATTTACTATCATAAACATGATCATCTGATGTGTTAGTCGATGAAATATCTTTTAATACTGGAGTGGAATGGTGTTGTTTACCATTAATAATACTTTTTCTATCATTTTGAATATTATTGAAATTCGGATGTAAACTAGGTGCACTTAAGACAAATGGGATTTTTCTTTGAACTGATAATGATTTCTGATTATCACTATTACCATTAACATTATTGTTATCATCATCATCATTATTATTATGAACATGATTATCAGTCACCATGACTGACAGAATAAAATGTTGATTTGAAATGGTGTTAATTTCATTATTCGATGAATTGGAAATTTTACATTGACTTTTTAATTTTTCATTATGCTCTTCATTTTTTATCGGTCGTGTTGTTGTGATTGTTGTTGATGATGGTGG AGGGACATAGGTAGTAACTTGTACAGGAACAGGTACAAAACTTGTCGACGGTACTCCTG ]




>consensus_8639#0
CATTGAGCTGACACCCACAACATGCACCAGGAAAAATGAAATTGTTTTCTCCAAAAGTGG
AAAAACTGGTGAAGGGGACCTTAGAAACCAGAAGTAATATTCCCTAGGTAATGATCAAAA
AAGACCTATTTCAGGTGAACAACTCACTTAGTTGAAGTAATAGTCAATAAGATCAAGGGA
ATACATTGATAAGTATAAAGAGACCTTTATTTGAATACTACTGTTATGTATAGCAATAAA
AGCAGTAGTAATGGTAGTAGGGATGGAGGCATATTGTCAGTTTACAAGTATAGAGATTGT
ATTTGTCATCTCCTTTACCAATTATTTGACACTTTCTATTTTTATGCTGCCTATCCCCCC
TCAGTTTTTAACATCATCAACGACATTATACAGCTTGATGGGTCAATTTACTATCATAAA
CATGATCATCTGATGTGTTAGTCGATGAAATATCTTTTAATACTGGAGTGGAATGGTGTT
GTTTACCATTAATAATACTTTTTCTATCATTTTGAATATTATTGAAATTCGGATGTAAAC
TAGGTGCACTTAAGACAAATGGGATTTTTCTTTGAACTGATAATGATTTCTGATTATCAC
TATTACCATTAACATTATTGTTATCATCATCATCACTATTATTATGAACATGATTATCAG
TCACCATGACTGACAGAATAAAATGTTGATTTGAAATGGTGTTAATTTCATTATTCGATG
AATTGGAAATTNTACATTGACTNTNTAATTNTTCATTATGCTCTTCATTTTTATCGGTCG
TGNTGTTGTGATTGTTGTTGATGATGGTGGNAGGNACATAGTAGTAACTTGTACAGGAAC
AGGTACANAACTTGTCGACGGTACTCCTGT

consensusID : consensus_8639#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 520
fasta sequence

                              [TTGTTGATGATGGTGGAGGGACATAGGTAGTAACTTGTACAGGAACAGGTACAAAACTTGTCGACGGTACTCCTGTAGCTAAAGCAGCAGCCTCAGCTAATGCAACTGCACTGGCTGATGAAGAAGCAGAAATTAAAAGTAAAGGGAAGGATGATGTGCCACTACTACTATTTACAAAGTTTGATGTGGTGATGGCGGGGGTAGTATAAGTTTGGGAAAAATTAGATGAATGTGGTATGATTTTAGAATTATTATTGTTATTATAATTGGGTGAAGATTGTTGAACATTTGACAATGATGATGATTATCAGTCACCATGACTGACAGAATAAAATGTTGATTTGAAATGGTGTTAATTTCATTATTCGATGAATTGGAAATTTTACATTGACTTTTTAATTTTTCATTATGCTCTTCATTTTTTATCGGTCGTGTTGTTGTGATTGTTGTTGATGATGGTGGAGGGACATAGGTAGTAACTTGTACAGGAACAGGTACAAAACTTGTCGACGGTACTCCT]

[+] EMBL CD153273             [TTGTTGATGATGGTGGAGGGACATAGGTAGTAACTTGTACAGGAACAGGTACAAAACTTGTCGACGGTACTCCTGTAGCTAAAGCAGCAGCCTCAGCTAATGCAACTGCACTGGCTGATGAAGAAGCAGAAATTAAAAGTAAAGGGAAGGATGATGTGCCACTACTACTATTTACAAAGTTTGATGTGGTGATGGCGGGGGTAGTATAAGTTTGGGAAAAATTAGATGAATGTGGTATGATTTTAGAATTATTATTGTTATTATAATTGGGTGAAGATTGTTGAACATTTGACAATGATGATGATTATCAGTCACCATGACTGACAGAATAAAATGTTGATTTGAAATGGTGTTAATTTCATTATTCGATGAATTGGAAATTTTACATTGACTTTTTAATTTTTCATTATGCTCTTCATTTTTTATCGGTCGTGTTGTTGTGATTGTTGTTGATGATGGTGGAGGGACATAGGTAGTAACTTGTACAGGAACAGGTACAAAACTTGTCGACGGTACTCCT]




>consensus_8639#1
TTGTTGATGATGGTGGAGGGACATAGGTAGTAACTTGTACAGGAACAGGTACAAAACTTG
TCGACGGTACTCCTGTAGCTAAAGCAGCAGCCTCAGCTAATGCAACTGCACTGGCTGATG
AAGAAGCAGAAATTAAAAGTAAAGGGAAGGATGATGTGCCACTACTACTATTTACAAAGT
TTGATGTGGTGATGGCGGGGGTAGTATAAGTTTGGGAAAAATTAGATGAATGTGGTATGA
TTTTAGAATTATTATTGTTATTATAATTGGGTGAAGATTGTTGAACATTTGACAATGATG
ATGATTATCAGTCACCATGACTGACAGAATAAAATGTTGATTTGAAATGGTGTTAATTTC
ATTATTCGATGAATTGGAAATTTTACATTGACTTTTTAATTTTTCATTATGCTCTTCATT
TTTTATCGGTCGTGTTGTTGTGATTGTTGTTGATGATGGTGGAGGGACATAGGTAGTAAC
TTGTACAGGAACAGGTACAAAACTTGTCGACGGTACTCCT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_8639#0      CATTGAGCTGACACCCACAACATGCACCAGGAAAAATGAAATTGTTTTCTCCAAAAGTGG 60
consensus_8639#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8639#0      AAAAACTGGTGAAGGGGACCTTAGAAACCAGAAGTAATATTCCCTAGGTAATGATCAAAA 120
consensus_8639#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8639#0      AAGACCTATTTCAGGTGAACAACTCACTTAGTTGAAGTAATAGTCAATAAGATCAAGGGA 180
consensus_8639#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8639#0      ATACATTGATAAGTATAAAGAGACCTTTATTTGAATACTACTGTTATGTATAGCAATAAA 240
consensus_8639#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8639#0      AGCAGTAGTAATGGTAGTAGGGATGGAGGCATATTGTCAGTTTACAAGTATAGAGATTGT 300
consensus_8639#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8639#0      ATTTGTCATCTCCTTTACCAATTATTTGACACTTTCTATTTTTATGCTGCCTATCCCCCC 360
consensus_8639#1      --------------TTGTTGATGATGGTGGAGGGAC-ATAGGTA-GTAACTTGTACAGGA 44
                                    **    ** **     *    * **   ** *   * * * *    

consensus_8639#0      TCAGTTTTTAACATCATCAACGACATTATACAGCTTGATGGGTCAATTTACTATCATAAA 420
consensus_8639#1      ACAGGTACAAAACTTGTCGACGGTACT------CCTGT--AGCTAAAGCAGCAGCCTCAG 96
                       *** *   **  *  ** ***  * *      * **    *  **   *  * * * * 

consensus_8639#0      CATGATCATCTGATGTGTTAGTCGATGAAATATCTTTTAATACTGGAGTGGAATGGTGTT 480
consensus_8639#1      CTAATGCAACTGCACTGGCTGATGAAGAAGCAGAAATTAAAAGTAAAG-GGAAGGATGAT 155
                      *     ** ***   **   *  ** ***  *    **** * *  ** **** * ** *

consensus_8639#0      GTTTACCATTAATAATACTTTTTCTATCATTTTGAATATTATTGAAATTCGGATGTAAAC 540
consensus_8639#1      GT-----GCCACTACTACTATTTACAAAGTTTGATGTGGTGATGG----CGGGGGTAGTA 206
                      **        * ** **** ***  *   ***    *  *  **     ***  ***   

consensus_8639#0      TAGGTGCACTTAAGACAAATGGGATTTTTCTTTGAACTGATAATGATTTCTGATTATCAC 600
consensus_8639#1      TAAGT----TTGGGAAAAATTAGAT--------GAATGTGGTATGATTTTAGA--ATTAT 252
                      ** **    **  ** ****  ***        ***      *******  **  ** * 

consensus_8639#0      TATTACCATTAACATTATTGTTATCATCATCATCACTATTATTATGAACATGATTATCAG 660
consensus_8639#1      TATTGTTATTATAATTGG-GTGAAGATTGTTGAACATTTGACAATGATGATGATTATCAG 311
                      ****   ****  ***   ** *  **  *      * * *  ****  ***********

consensus_8639#0      TCACCATGACTGACAGAATAAAATGTTGATTTGAAATGGTGTTAATTTCATTATTCGATG 720
consensus_8639#1      TCACCATGACTGACAGAATAAAATGTTGATTTGAAATGGTGTTAATTTCATTATTCGATG 371
                      ************************************************************

consensus_8639#0      AATTGGAAATTNTACATTGACTNTNTAATTNTTCATTATGCTCTTCATTTTT-ATCGGTC 779
consensus_8639#1      AATTGGAAATTTTACATTGACTTTTTAATTTTTCATTATGCTCTTCATTTTTTATCGGTC 431
                      *********** ********** * ***** ********************* *******

consensus_8639#0      GTGNTGTTGTGATTGTTGTTGATGATGGTGGNAGGNACATAG-TAGTAACTTGTACAGGA 838
consensus_8639#1      GTGTTGTTGTGATTGTTGTTGATGATGGTGGA-GGGACATAGGTAGTAACTTGTACAGGA 490
                      *** ***************************  ** ****** *****************

consensus_8639#0      ACAGGTACANAACTTGTCGACGGTACTCCTGT 870
consensus_8639#1      ACAGGTACAAAACTTGTCGACGGTACTCCT-- 520
                      ********* ********************