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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8655#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1287 fasta sequence
[AATCATGTAATATTTCGCATGTTAATAACCATCTAGATCAACCATTAGATATAACACATTCAAATTTTTAAGATTTGTAGCATTTGTACTCCTTATCGTACAGATGACCAAGAACACCAACGATATCGTCGCATTTTGTCAGGCAATGCATTGTAACGTCCAGGAATGGGTTTTGGTCTTGGTATATTTCTTGAATGTAAAGCTTCATACATTTCTTGTTCCTTACGTATGGTGAAATCTGATCGACCAGGATAAGAACATTTTAATCTAAAATAGTCTGGTGAACTTTTACTTGATACAAGATCAACAGGTGGACCGATCGGTCGTATTTTCCGACCAAATCTTCCTGTTTTACGCTGCCACAATCCACTGCGTTGTTTAATTCCTCTCCATTTCTTTTCACCGAATTTACGAAATTTAAATTGATCATGATTTTGATTAGAAACTTGTCCAACTACAGACATACATGTTGGTAAAAGTCGATAAATTTTACGTTTTCCATTTGTTCTAACAAATACAACATATTCATCTCCTAGTTCATTAGTNTGAAGATGTTAAATTTAAATCATCATTTAATTTTGTACCAACATATTTTCCTCGTCGAAATATTGTTGCACTAGATCCTGCTGTAC-GACAAAATAAAG-CACCTTGACCAGGTTTTATTTCAAATTGACTAATGATTGTACCA-ACTGGTAATGCACCAACTGGATGAGCATCACCTTCTTTTGGATCAACTGGTATAGTAGGGATATCAACGTGTGAACGTATAACATCTCCAGGTTTCATATTAACAGTTGCAATAATCCATCTTTTCACTTCACCTGAAGCTACTAAAGCAATAAACGGATGTCTCCACCATGTTTTTTTGACCTGTAATACTAATTCTTCATGGATAGTTTTAGTTAAAACTTG-T-CTGGAACGATTATTATCCACCATAAAC-CATGGACGATTTAATCCAGTTGTAACATGTTTTAGTTGAATTTTACCGTCAGGTCCTCGTCCTCCTGTTCGTACCAATGGCATTGCGTCAACTGTATATTGATGAGGATCCATCACTTTACTAATTGCCCAATAGCGACTAACTGGCCGCGGATATGTTATACCAGGACGGCGATTTAAACTGCAGCTTGTTGACAATCCATATTTATAAATTTGTAGAGGATTTAAGCTAGTAAGGTATGATGGTGAGAATTTGGATGACTGAAGCAATTTGTTTCCCAAACTGAAATTTGTATATAACCGTAGAGAATTAGTCAAATGACTACAAAGATTCATTTAATGCCATCA]
[+] EMBL CD074060 [AATCATGTAATATTTCGCATGTTAATAACCATCTAGATCAACCATTAGATATAACACATTCAAATTTTTAAGATTTGTAGCATTTGTACTCCTTATCGTACAGATGACCAAGAACACCAACGATATCGTCGCATTTTGTCAGGCAATGCATTGTAACGTCCAGGAATGGGTTTTGGTCTTGGTATATTTCTTGAATGTAAAGCTTCATACATTTCTTGTTCCTTACGTATGGTGAAATCTGATCGACCAGGATAAGAACATTTTAATCTAAAATAGTCTGGTGAACTTTTACTTGATACAAGATCAACAGGTGGACCGATCGGTCGTATTTTCCGACCAAATCTTCCTGTTTTACGCTGCCACAATCCACTGCGTTGTTTAATTCCTCTCCATTTCTTTTCACCGAATTTACGAAATTTAAATTGATCATGATTTTGATTAGAAACTTGTCCAACTACAGACATACATGTTGGTAAAAGTCGATAAATTTTACGTTTTCCATTTGTTCTAACAAATACAACATATTCATCTCCTAGTTCATTAGTNTGAAGATGTTAAATTTAAATCATCATTTAATTTTGTACCAACATATTTTCCTCGTCGAAATATTGTTGCACTAGATCCTGCTGTAC GACAAAATAAAG CACCTTGACCAGGTTTTATTTCAAATTGACTAATGATTGTACCA ]
[+] EMBL CD060890 [ TAGATCCTGCTGTACGGACAAAATAAAGACACCTTGACCAGGTTTTATTTCAAATTGACTAATGATTGTACCG ACTGGTAATGCACCAACTGGATGAGCATCACCTTCTTTTGGATCAACTGGTATAGTAGGGATATCAACGTGTGAACGTATAACATCTCCAGGTTTCATATTAACAGTTGCAATAATCCATCTTTTCACTTCACCTGAAGCTACTAAAGCAATAAACGGATGTCTCCACCATGTTTTTTTGACCTGTAATACTAATTCTTCATGGATAGTTTCAGATAAAACTTG T CTGGAACGATTATTATCC ]
[+] EMBL CD096705 [ CAAAATAAAG CACCTTGACCAGGTTTTATTTCAAATTGACTAATGATTGTACCA ACTGGTAATGCACCAACTGGATGAGCATCACCTTCTTTTGGATCAACTGGTATAGTAGGGATATCAACGTGTGAACGTATAACATCTCCAGGTTTCATATTAACAGTTGCAATAATCCATCTTTTCACTTCACCTGAAGCTACTAAAGCAATAAACGGATGTCTCCACCATGTTTTTTTGACCTGTAATACTAATTCTTCATGGATAGTTTTAGTTAAAGCTTG T CTGGAACGATTATTATCCACCATAAAC CATGGACGATTTAATCCAGTTGTAACATGTTTTAGTTGAATTTTACCGTCAGGTCCTCGTCCTCCTGTTCGTACCAATGGCATTGCGTCAACTG ]
[+] EMBL CD096787 [ CAAAATAAAG CACCTTGACCAGGTTTTATTTCAAATTGACTAATGATTGTACCA ACTGGTAATGCACCAACTGGATGAGCATCACCTTCTTTTGGATCAACTGGTATAGTAGGGATATCAACGTGTGAACGTATAACATCTCCAGGTTTCATATTAACAGTTGCAATAATCCATCTTTTCACTTCACCTGAAGCTACTAAAGCAATAAACGGATGTCTCCACCATGTTTTTTTGACCTGTAATACTAATTCTTCATGGATAGTTTTAGTTAAAACTTG T CTGGAACGATTATTATCCACCATAAAC CATGGACGATTTAATCCAGTTGTAACATGTTTTAGTTGAATTTTACCGTCAGGTCCTCGTCCTCCTGTTCGTACCAATGGCATTGCGTCAACTG ]
[+] EMBL CD096814 [ CAAAATAAAG CACCTTGACCAGGTTTTATTTCAAATTGACTAATGATTGTACCA ACTGGTAATGCACCAACTGGATGAGCATCACCTTCTTTTGGATCAACTGGTATAGTAGGGATATCAACGTGTGAACGTATAACATCTCCAGGTTTCATATTAACAGTTGCAATAATCCATCTTTTCACTTCACCTGAAGCTACTAAAGCAATAAACGGATGTCTCCACCATGTTTTTTTGACCTGTAATACTAATTCTTCATGGATAGTTTTAGTTAAAACTTG T CTGGAACGATTATTATCCACCATANAC CATGGGCGATTTAATCCAGTTGTAACATGTTTTAGTTGAATTTTA ]
[-] EMBL CD183225 [ AAATAAAG CACCTTGACCAGGTTTTATTTCAAATTGAGTAATGATTGTGCCAGACTGGTAATGCACCAGCTGGATGAGCATCACCTTCTTTTGGATCAGGTGGTATAGTAGGGATATCAACGTGTGAGCGTATAACATCTCCAGGTTTCATATTAACAGTTGCAATAATCCATCTTTTCACTTCACCTGAAGCTACTAAAGCAATAAACGGATGTCTCCACCATGTTCTTTTGACCTGTAATACTAATTGTTCATGGATAGTGTTAGTTAAAACTTG TCCTGGAGCGATTATTATCCA ]
[-] EMBL CD079802 [ ATTCTTCATGGATAGTTTTAGTTAAAACTTGTT CTGGAACGATTATTATCCATCATAAACTCATGGACGATTTAATCCAGTTGTAACATGTTTTAGTTGAATTTTACCGTCAGGTCCTCGTCCTCCTGTTCGTACCAATGGCATTGCGTCAACTGTATATTGATGAGGATCCATCACTTTACTAATTGCCCAATAGCGACTAACTGGCCGCGGATATGTTATACCAGGACGGCGATTTAAACTGCAGCTTGTTGACAATCCATATTTATAAATTTGTAGAGGATTTAAGCTAGTAAGGTATGATGGTGAGAATTTGGATGACTGAAGCAATTTGTTTCCCAAACTGAAATTTGTATATAACCGTAGAGAATTAGTCAAATGACTACAAAGATTCATTTAATGCCATCA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||