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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8665#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 713 fasta sequence
[ATTGTAATTGTCGTTACGATTTGGTCGTTATGTCCGGACAAATAAGTTGTTTCGAGATTTGAGGACCCGTGGCTAATTTCCAGTTCTTTAAACTTTCAATCTAATACCAACTATACATAAATCAAAATTATGGGTAACTCTTCCAGTGGTCACAAGCGCAGACCGTCACTGGACGACGATGTCCTCTCGGGCGTTCTTGCTGGTAAAAGATATGTATATCAAATGTCACATGACACTCCTGCCGAGGATTCCGTGATTAGCTTTGTTACTGGTAATTCTGCCGTTCATGCTATTGCGGACCAACTCCGTGATTCCCGACTTTATGACTCAGGTGGCAAGCCAAATTTATTCGTTGGAGGACCGGGTCCAGGTCTTGATATTTCAGAAGAAAATCAACCTGTTCAGAGTGTACCAACTGTTTTTAAGTGGGATGGAGGAGGAAAAGACGTTTACATAAGTGGTACATTCAATGGTTGGAGATCGAAAATCCCGATGGTTAAAAGCTCGAGTAAACATAACTTTTATACGATCATTGATCTTCCTCTTGGTGAACATCAGTACAAATTTATTGTTGATGAGCATTGGAAGCTAGACCAAAACCAGCCTGTTTCTACTAGTCCGACCGGTGTTCAAAATAACGTGATTCAAGTCAAAGAGTCGGACTTTGATGTGCTTACTGCTCTATCTCATGATATGGCGAATTCTCGTGGTAG]
[-] EMBL CD092890 [ATTGTAATTGTCGTTACGATTTGGTCGTTATGTCCGGACAAATAAGTTGTTTCGAGATTTGAGGACCCGTGGCTAATTTCCAGTTCTTTAAACTTTCAATCTAATACCAACTATACATAAATCAAAATTATGGGTAACTCTTCCAGTGGTCACAAGCGCAGACCGTCACTGGACGACGATGTCCTCTCGGGCGTTCTTGCTGGTAAAAGATATGTATATCAAATGTCACATGACACTCCTGCCGAGGATTCCGTGATTAGCTTTGTTACTGGTAATTCTGCCGTTCATGCTATTGCGGACCAACTCCGTGATTCCCGAC ]
[+] EMBL CD133028 [ GTTACGATTTGGTCGTTATGTCCGGACAAATAAGTTGTTTCGAGATTTGAGGACCCGTGGCTAATTTCCAGTTCTTTAAACTTTCAATCTAATACCAACTATACATAAATCAAAATTATGGGTAACTCTTCCAGTGGTCACAAGCGCAGACCGTCACTGGACGACGATGTCCTCTCGGGCGTTCTTGCTGGTAAAAGATATGTATATCAAATGTCACATGACACTCCTGCCGAGGATTCCGTGATTAGCTTTGTTACTGGTAATTCTGCCGTTCATGCTATTGCGGACCAACTCCGTGATTCCCGACTTTATGACTCAGGTGGCAAGCCAAATTTATTCGTTGGAGGACCGGGTCTAGGTCTTGATATTTCAGAAGAAAATCAACCTGTTCAGAGTGTACCAACTGTTTTTAAGTGGGATGGANGAGGAAAAGACGTTTACATAAGTGGTACATTCAATGGTTGGAGATCGAANATCCCGATGGTTAAAAGCTCGAGTAAACATAACTTTTATACGATCATTGATCTTCCTCTTGG ]
[+] EMBL AI976332 [ TACGATTTGGTCGTTATGTCCGGACAAATAAGTTGTTTCGAGATTTGAGGACCCGTGGCTAATTTCCAGTTCTTTAAACTTTCAATCTAATACCAACTATACATAAATCAAAATTATGGGTAACTCTTCCAGTGGTCACAAGCGCAGACCGTCACTGGACGACGATGTCCTCTCGGGCGTTCTTGCTGGTAAAAGATATGTATATCAAATGTCACATGACACTCCTGCCGAGGATTCCGTGATTAGCTTTGTTACTGGTAATTCTGCCGTTCATGCTATTGCGGACCAACTCCGTGATTCCCGACTTTATGACTCACGTGGCAAGCCAAATTTATTCGTTGGAGGACCGGGTCCAGGTCTTGATATTTCAGAAGAAAATCAACCTGTTCAGAGTGTACCAACTGTTTTTAAGTGGGATGGAGGAGGAAAAGACGTTTACATAAGTGGTACATTCAATGGTTGGAGATCGAA ]
[+] EMBL AI976330 [ TACGATTTGGTCGTTATGTCCGGACAAATAAGTTGTTTCGAGATTTGAGGACCCGTGGCTAATTTCCAGTTCTTTAAACTTTCAATCTAATACCAACTATACATAAATCAAAATTATGGGTAACTCTTCCAGTGGTCACAAGCGCAGACCGTCACTGGACGACGATGTCCTCTCGGGCGTTCTTGCTGGTAAAAGATATGTATATCAAATGTCACATGACACTCCTGCCGAGGATTCCGTGATTAGCTTTGTTACTGGTAATTCTGCCGTTCATGCTATTGCGGACCAACTCCGTGATTCCCGACTTTATGACTCAGGTGGCAAGCCAAATTTATTCGTTGGAGGACCGGGTCCAGGTCTTGATATTTCATAAGAAAATCAACCTGTTCAGAGT ]
[-] EMBL CD181103 [ GTTTCGAGATTCGAGGACCCGTGGCTAATTTCCAGTTCTTTAAACTTTCAATCTAATACCAACTATACATAAATCAAAATTATGGGTAACTCTTCCAGTGGTCACAAGCGCAGACCGTCACTGGACGACGATGTCCTCTCGGGCGTTCTTGCTGGTAAAAGATATGTATATCAAATGTCACATGACACTCCTGCCGAGGATTCCGTGATTAGCTTTGTTACTGGTAATTCTGCCGTTCATGCTATTGCGGACCAACTCCGTGATTCCCGACTTTATGACTCAGGTGGCAAGCCAAATTTATTCGTTGGAGGACCGGGTCCAGGTCTTGATATTTCAGAAGAAAATCAACCTGTTCAGAGTGTACCAACTGTTTTTAAGTGGGATGGAGGAGGAAAAGACGTTTACATAAGTGGTACATTCAATGGTTGGAGATCGAAAATCCCGATGGTTAAAAGCTCGAGTAAACATAACTTTTATACGATCATTG ]
[-] EMBL CD110789 [ AAATTATGGGTAACTCTTCCAGTGGTCACAAGCGCAGACCGTCACTGGACGACGATGTCCTCTCGGGCGTTCTTGCTGGTAAAAGATATGTATATCAAATGTCACATGACACTCCTGCCGAGGATTCCGTGATTAGCTTTGTTACTGGTAATTCTGCCGTTCATGCTATTGCGGACCAACTCCGTGATTCCCGACTTTATGACTCAGGTGGCAAGCCAAATTTATTCGTTGGAGGACCGGGTCTAGGTCTTGATATTTCAGAAGAAAATCAACCTGTTCAGAGTGTACCAACTGTTTTT ]
[+] EMBL CD095983 [ GTTTACATAAGTGGTACATTCAATGGTTGGAGATCGAAAATCCCGATGGTTAAAAGCTCGAGTAAACATAACTTTTATACGATCATTGATCTTCCTCTTGGTGAACATCAGTACAAATTTATTGTTGATGAGCATTGGAAGCTAGACCAAAACCAGCCTGTTTCTACTAGTCCGACCGGTGTTCAAAATAACGTGATTCAAGTCAAAGAGTCGGACTTTGATGTGCTTACTGCTCTATCTCATGATATGGCGAATTCTCGTGGTAG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||