cluster # 8667

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8667 cluster # 8667 Sequences # 7 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8667#0 length = 1248 sequences # 7
consensusID : consensus_8667#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1248
fasta sequence
                              [TTAAACCNCAAAGAAAAAAGACTAGTTATTCACAGTCAAGCGATGGAGACGCCCAGAAAACTCATGGTAGTAGTGGTGAGGATCTAACTACTCAAGAAGTTGATCCTAACACCCATAGCTGGCATCGTATGAACCGTAACGCCTGGAATGCACAATCGGGTAGTTCTTCACACCACCCTCATCAAAGATATCCAAGTGGACCAACTGGGGACGTCGATCCTTCAACTCTCGTTTCCCAAGCAAATGGTCCCTTGCGTCCCACTAATGAAACAAAAAGAGGAGGGCATGGTGACTGGTCCCGAGGATGTGCTGGTTGGCGTCAACGTTCTTACAGTGGCAGTGAGCAATCTGATATCTTCTATTATAATCACTCTAATCACCGAGGTCGTGGTAATGGGCACCCATCCAATGAAGTTGACGGAAATACGGGACGGGGACGTGGTCGAGGGCGTGGTTCCGGACGTCAAGGCTTAACACATCGAGAACCTGTTGGTGGTGGTCAGTCACAAACTTCAGGCGGTAATGCTTGTCGACCTGCCAGTTGCTTAGTTGATACTCCTGGAGGGCAATTAAATCAACAAACCAAAAATGGGAGGATTTACTCCAAATCATTTTGTAGTGATCCACCGCCTGGTTTCGATCTACCAATTCATGAGAAACCTTCTAATGAGTCATCATTTGA-CAAAACCTGTCAAAAAGAAGATGTTTTCATAGATAATATTGATTCAGTACCTATTCATCATTGCCAACCTGTGAATGATGATTCTTCAAAGAGTTCTACACAAATAAATTCTAAACAATCTATTATACATCCTTGTCATTGGTATTATATCGATTTGTTTACATGTACTCAAGGTCCATTTACAAATCAACAAATGAGTACATGGCTTGCTAGTGGTTATTTACCAT--TATCATTAAAAATACG--TCGTGA-TTGTGATGAATGTTTTCTTAGTTTAGCTGACCATATGAATTTAGCTGGACGCATTCCATTTTGGACTGGCTATAATCAACCACCTATTACAAATGTAAATCTATCAACACTTTCTGGATTAAACTATAATAGTAATAATAATAATGGTAATCAGGTATTAATTCATTCAACTATTATCAACAACCAAACACCCTCCTCCTCAACTCCACCAGGTATTACAAACCGTAAAACAGACTGTGAAATTTCACTTCCACAATCCACATTAACAACATTTGATGAAAATACAATTCAGCTTCAAAACAAAGGTGACGTTAATG]

[-] EMBL CD092886             [TTAAACCNCAAAGAAAAAAGACTAGTTATTCACAGTCAAGCGATGGAGACGCCCAGAAAACTCATGGTAGTAGTGGTGAGGATCTAACTACTCAAGAAGTTGATCCTAACACCCATAGCTGGCATCGTATGAACCGTAACGCCTGGAATGCACAATCGGGTAGTTCTTCACACCACCCTCATCAAAGATATCCAAGTGGACCAACTGGGGACGTCGATCCTTCAACTCTCGTTTCCCAAGCAAATGGTCCCTTGCGTCCCACTAATGAAACAAAAAGAGGAGGGCATGGTGACTGGTCCCGAGGATGTGCTGGTTGGCGTCAACGTTCTTACAGTGGCAGTGAGCAATCTGATATCTTCTATTATAATCACTCTAATCACCGAGGTCGTGGTAATGGGCACCCATCCAATGAAGTTGACGGAAATACGGGACGGGGACGTGGTCGAGGGCGTGGTTCCGGACGTCAAGGCTTAACACATCGAGAACCTGTTGGTGGTGGTCAGTCACAAACTTCAGGCGGTAATGCTTGTCGACCTGCCAGTTGCTTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AI976642             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AGAACCTGTTGGTGGTGGTCAGTCACAAACTTCAGGCGGTAATGCTTGTCGACCTGCCAGTTGCTTAGTTGATACTCCTGGAGGGCAATTAAATCAACAAACCAAAAATGGGAGGATTTACTCCAAATCATTTTGTAGTGATCCACCGCCTGGTTTCGATCTACCAATTCATGAGAAACCTTCTAATGAGTCATCATTTGACCAAAACCTGTCAAAAAGAAGATGTTTTCATAGATAATATTGATTCAGTACCTATTCATCATTGCCAACCTGTGAATGATGATTCTTCAAAGAGTTCTACACAAATAAATTCTAAACAATCTATTATACATCCTTGTCATTGGTATTATATCGATTTGTTTACATGTACTCAAGGTCCATTTACAAATCAACAAATGAGTACATGGCTTGCTAGTGGTTATTTACCAT  TATCATTAAAAATACG  TCGTGA TTGTGATGAATGTTTTCTTAGTTTAGCTGACCATATGAATTTAGCTGGACGCATTCCATTTTGGACTGGCTATAATCAACCACCTATTACAAATGTAAATCTATCAACACTTTCTGGATTAAACTATAATAGTAATAATTATAATGGTAATCAGGTATTAATTCATTTCACTATTATCAACAACCAAACA                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD148472             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CAACAAACCAAAAATGGGAGGATTTACTCCAAATCATTTTGTAGTGATCCACCGCCTGGTTTCGATCTACCAATTCATGAGAAACCTTCTAATGAGTCATCATTTGA CAAAACCTGTCAAAAAGAAGATGTTTTCATAGATAATATTGATTCAGTACCTATTCATCATTGCCAACCTGTGAATGATGATTCTTCAAAGAGTTCTACACAAATAAATTCTAAACAATCTATTATACATCCTTGNCATTGGTATTATACCGATTTGTTTACATGTACTCAAGGTCCATTTACAAATCAACAAATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD096785             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGAAACCTTCTAATGAGTCATCATTTGA CAAAACCTGTCAAAAAGAAGATGTTTTCATAGATAATATTGATTCAGTACCTATTCATCATTGCCAACCTGTGAATGATGATTCTTCAAAGAGTTCTACACAAATAAATTCTAAACAATCTATTATACATCCTTGTCATTGGTATTATATCGATTTGTTTACATGTACTCAAGGTCCATTTACAAATCAACAAATGAGTACATGGCTTGCTAGTGGTTATTTACCAT  TATCATTAAAAATACG  TCGTGA TTGTGATGAATGTTTTCTTAGTTTAGCTGACCATATGAATTTAGCTGGACGCATTCCATTTTGGACTGGCTATAATCAACCACCTATTACAAATGTAAATCTATCAACACTTTCTGGATTAAACTATAATAGTAATAATAATAATGGTAATCAGGTATTAATTCATTCAACTATTATCAACAACCAAACACCCTCCTCCTCAACTCCACCAGGTATTACAAACCGTAAAACAGACTGTGAAATTTCACTTCCACAATCCACATTAACAACATTTGATGAAAATACAATTCAGCTTCAAAACAAAGGTGACGTTAATG]
[-] EMBL CD132826             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTCATCATTTGA CAAAACCTGTCAAAAAGAAGATGTTNTCATAGATAATATTGATTCAGTACCTATTCATCATTGCCAACCTGTGAATGATGATTCTTCAAAGAGTTCTACACAAATAAATTCTAAACAATCTATTATACATCCTTGTCATTGGTATTATATCGATTTGTTTACATGTACTCAAGGTCCATTTACAAATCAACAAATGAGTACATGGCTCGCTAGTGGTTATTTACCAT  TATCATTAAAAATACG  TCGTGA TTGTGATGAATGTTTTCTTAGTTTAGCTGACCATATGAATTTAGCTGGACGCATTCCATTTTGGACTGGCTATAATCAACCACCTATTACAAATGCAAATCTATCAACACTTTCTGGATTAAACTATAATAGTAATAATAATAATGGTAATCAGGTATTAATTCATTCAACTATTATCAACAACCAAACACCCTCCTCC                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD178338             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATTGGTATTATATCGATTTGTTTACATGTACTCAAGGTCCATTTACAAATCAACAAATGAGTACATGGCTTGCTAGTGGTTATTTACCAT  TATCATTAAAAATACG  TCGTGA TTGTGATGAATGTTTTCTTAGTTTAGCTGACCATATGAATTTAGCTGGACGCATTCCATTTTGGACTGGCTATAATCAACCACCTATTACAAATGTAAATCTATCAACACTTTCTGGATTAAACTATAATAGTAATAATAATAATGGTAATCAGGTATTAATTCATTCAACTATTATCAACA                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD096906             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttnngnCTAGTGGTTATTTACCATNNTATCATTAAAAATACGTTTCGTGANTTGTGATGAATGTTTTCTTAGTTTAGCTGACCATATGAATTTAGCTGGACGCATTCCATTTTGGACTGGCTATAATCAACCACCTATTACAAATGTAAATCTATCAACACTTTCTGGATTAAACTATAATAGTAATAATAATAATGGTAATCAGGTATTAATTCATTCAACTATTATCAACAACCAAACACCCTCCTCCTCAACTCCACCAGGTATTACAAACCGTAAAACAGACTGTGAAATTTCACTTCCACAATCCACATTAACAACATTTGATGAAAATACAATTCAGCTTCAAAACAAAGGTGACGTTAATG]




>consensus_8667#0
TTAAACCNCAAAGAAAAAAGACTAGTTATTCACAGTCAAGCGATGGAGACGCCCAGAAAA
CTCATGGTAGTAGTGGTGAGGATCTAACTACTCAAGAAGTTGATCCTAACACCCATAGCT
GGCATCGTATGAACCGTAACGCCTGGAATGCACAATCGGGTAGTTCTTCACACCACCCTC
ATCAAAGATATCCAAGTGGACCAACTGGGGACGTCGATCCTTCAACTCTCGTTTCCCAAG
CAAATGGTCCCTTGCGTCCCACTAATGAAACAAAAAGAGGAGGGCATGGTGACTGGTCCC
GAGGATGTGCTGGTTGGCGTCAACGTTCTTACAGTGGCAGTGAGCAATCTGATATCTTCT
ATTATAATCACTCTAATCACCGAGGTCGTGGTAATGGGCACCCATCCAATGAAGTTGACG
GAAATACGGGACGGGGACGTGGTCGAGGGCGTGGTTCCGGACGTCAAGGCTTAACACATC
GAGAACCTGTTGGTGGTGGTCAGTCACAAACTTCAGGCGGTAATGCTTGTCGACCTGCCA
GTTGCTTAGTTGATACTCCTGGAGGGCAATTAAATCAACAAACCAAAAATGGGAGGATTT
ACTCCAAATCATTTTGTAGTGATCCACCGCCTGGTTTCGATCTACCAATTCATGAGAAAC
CTTCTAATGAGTCATCATTTGACAAAACCTGTCAAAAAGAAGATGTTTTCATAGATAATA
TTGATTCAGTACCTATTCATCATTGCCAACCTGTGAATGATGATTCTTCAAAGAGTTCTA
CACAAATAAATTCTAAACAATCTATTATACATCCTTGTCATTGGTATTATATCGATTTGT
TTACATGTACTCAAGGTCCATTTACAAATCAACAAATGAGTACATGGCTTGCTAGTGGTT
ATTTACCATTATCATTAAAAATACGTCGTGATTGTGATGAATGTTTTCTTAGTTTAGCTG
ACCATATGAATTTAGCTGGACGCATTCCATTTTGGACTGGCTATAATCAACCACCTATTA
CAAATGTAAATCTATCAACACTTTCTGGATTAAACTATAATAGTAATAATAATAATGGTA
ATCAGGTATTAATTCATTCAACTATTATCAACAACCAAACACCCTCCTCCTCAACTCCAC
CAGGTATTACAAACCGTAAAACAGACTGTGAAATTTCACTTCCACAATCCACATTAACAA
CATTTGATGAAAATACAATTCAGCTTCAAAACAAAGGTGACGTTAATG
clustalw multiple alignements is not computed in this case