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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8766#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 977 fasta sequence
[CATTCTTTCAAAAACTATTGGAGGGTATTAATCCACCTGATGAAATGTTTAAAACTCTATACGATTTTGCAACTCAAGGTACACCTTCTCAACGTAAACTATTAGATGGAATTTTACGTATGTTAGCTGATGAAGTTTCACGTCATTTACAAGATTATCCTGAAACGATGCTACCTTTATTTGCTGACTTGTATGGTAGTGTTCTTGCCGCTAGTACACATCTCTTTTCTATGAGAGCTCTTTCAATGCTATGGCGTTCCGTGTTAGCTCGATTATTCACT-CTACCACCAGAGACACATATGGATTCAACGTTGTTTCGTGCTATGATTCATATTCTAATGAAGGCTAAAAACACGTTTGTGCACTTTTCTAATCTTCCAAATTGTTTAGCCAGTTGTCCAGTCTTCAAAGCGTTTCCACATGACCTTCAAGGATACATTTTAAACTCTGAATTAGCCGTCAAGAATTACGCATTATCCCAACAAACTACTGCATCCTTGTCGAAGAATTTGACAACTACCGGGAGTAATGGAGGTGGTTCTTCAAACCAATTGATTGCTTCACATTATCAGCTTGCTGATTCGTTGACACCATCGACTAGCTTAAATTTAACCATGCCTACTTCAAATATTGTCGGCAGCGGTGGTGTTGCTGCTGATACATCATCATGCATCAAGGCACCTGATGCACCAGAGGAAAGCATTTCCGATCGTGTCTACTTCTTATTTAATAATGTATCAAAAGTGAATGCTAAAGAAAAATCAAATGAATTAGCCACATTGTTATCAAAAGATCGACTTATACCATGGTTTGCCTTTTATCTTGTCAGTAAACGTATCCCGGTTGAACAAACATTTCACGATCTCTTCGCTTTGGTACTTGATCATATTCAAGAAAGAGTACCAAATGTTAGACCTAAAGTTATGTACGAACTTATCAGACATATCAAGTTTATTCTACGTAATATGCGTTTGGAC]
[+] EMBL CD085529 [CATTCTTTCAAAAACTATTGGAGGGTATTAATCCACCTGATGAAATGTTTAAAACTCTATACGATTTTGCAACTCAAGGTACACCTTCTCAACGTAAACTATTAGATGGAATTTTACGTATGTTAGCTGATGAAGTTTCACGTCATTTACAAGATTATCCTGAAACGATGCTACCTTTATTTGCTGACTTGTATGGTAGTGTTCTTGCCGCTAGTACACATCTCTTTTCTATGAGAGCTCTTTCAATGCTATGGCGTTCCGTGTTAGCTCGATTATTCACTCCTACCACCAGAGACACATATGGATTCAACGTTGTCTCGTGCTATGATTCATATTCTAATGAAGGCTAAAAACACGTTTGTGCACTTCTCTAATCTTCCAAATTGTTTAGCCAGTTGTCCAGTCTTCAACTTGTTTCCACATGACCTTCAAGGATACATTNTAAACTCTGAATTAGCCGTCAAGAATTACGCATTATCCCAACAAACTACTGCATCCTTGTCGAAGAATTTGACAACTACCGGGAGTAATGGAGGTGGNTCTTC AACCAA TGATTGCTT ACATTATCAGCTTGCTGATTCGNTGACACC TCGACTAGCTTAAATTTAcc ]
[+] EMBL CD085431 [CATTCTTTCAAAAACTATTGGAGGGTATTAATCCACCTGATGAAATGTTTAAAACTCTATACGATTTTGCAACTCAAGGTACACCTTCTCAACGTAAACTATTAGATGGAATTTTACGTATGTTAGCTGATGAAGTTTCACGTCATTTACAAGATTATCCTGAAACGATGCTACCTTTATTTGCTGACTTGTATGGTAGTGTTCTTGCCGCTAGTACACATCTCTTTTCTATGAGAGCTCTTTCAATGCTATGGCGTTCCGTGTTAGCTCGATTATTCACT CTACCACCAGAGACACATATGGATTCAACGTTGTTTCGTGCTATGATTCATATTCTAATGAAGGCTAAAAACACGTTTGTGCACTTTTCTAATCTTCCAAATTGTTTAGCCAGTTGTCCAGTCTTCAAAGCGTTTCCACATGACCTTCAAGGATACATTTTAAACTCTGAATTAGCCGTCAAGAATTACGCATTATCCCAACAAACTACTGCATCCTTGTCGTAGAATTTGACAACTACCGGGAGTAATGGAGGTGGTTCTTCAAACCAATTGATTGCTTCACATTATCAGCTTGCTGATTCGTTGACACCATCGACTAGCTTAAAT ]
[-] EMBL CD085403 [ ATTCTTTCGAAAACTATTGGAGGGTATTAATCCACCTGATGAAATGTTTAAAGCTCTATGCGATTTTGCAACTCAAGGTACACTTTCTCAACGTAAACTATTAGATGGAATTTTACGTATGTTAGCTGATGAAGTTTCACGTCATTTACAAGATTATCCTGAAGCGATGCTA CGTTATTTGCTGACTTGTATGGTAGTGTTCTTGCCGCTAGTACACATCTCTTTTCTATGAGAGCTCTTTCAATGCTATGGCGTTCCGTGTTAGCTCGATTATTCACT CTACCACCAGAGACACATATGGATTCAACGTTGTTTCGTGCTATGATTCATATTCTAATGAAGGCTAAAAACACGTTTGTGCACTTTTCTAATCTTCCAAATTGTTTAGCCAGTTGTCCAGTCTTCAAAGCGTTTCCACATGACCTTCAAGGATACATTTTAAACTCTGAATTAGCCGTCAAGAATTACGCATTATCCCAACAAACTACTGCATCCTTGTCGAAGAATTTGACAACTACCGGGAGTAATGGAGGTGGTTCTTCAAACCAATTGATTGCTTCACATTATCAGCTTGCTGATTCGTTGACACCATCGACTAGCTTAAATT ]
[+] EMBL CD132524 [ gAACTCAAGG ACACCTTCTCAACGTAAACTATTAGATGGAATTTTACGTATGTTAGCTGATGAAGTTTCACGTCATTTACAAGATTATCCTGAAACGATGCTACCTTTATTTGCTGACTTGTATGGTAGTGTTCTTGCCGCTAGTACACATCTCTTTTCTATGAGAGCTCTTTCAATGCTATG ]
[-] EMBL CD117490 [ ACGTATGTTAGCTGATGAAGTTTCACGTCATTTACAAGATTATCCTGAAACGATGCTACCTTTATTTGCTGACTTGTATGGTAGTGTTCTTGCCGCTAGTACACATCTCTTTTCTATGAGAGCTCTTTCAATGCTATGGCGTTCCGTGTTAGCTCGATTATTCACT CTACCACCAGAGACACATATGGATTCAACGTTGTTTCGTGCTATGATTCATATTCTAATGAAGGCTAAAAACACGTTTGTGCACTTTTCTAATCTTCCAAATTGTTTAGCCAGTTGTCCAGTCTTCAAAGCGTTTCCACATGACCTTCAAGGATACATTTTAAACTCTGAATTAGCCGTCAAGAATTACGCATTATCCCAACAAACTACTGCATCCTTGTCGAAGAATTTGACAACTACCGGGAGTAATGGAGGTGGTTCTTCAAACCAATTGATTGCTTCACATTATCAGCTTGCTGATTCGTTGACACCATCGACTAGCTTAAATTTAACCATGCCTACTTCAAATATTGTCGGCAGCGGTGGTGTTGCTGCTGATACATCATCATG ]
[-] EMBL CD117791 [ ATGAGAGCTCTTTCAATGCTATGGCGTTCCGTGTTAGCTCGATTATTCACT CTACCACCAGAGACACATATGGATTCAACGTTGTTTCGTGCTATGATTCATATTCTAATGAAGGCTAAAAACACGTTTGTGCACTTTTCTAATCTTCCAAATTGTTTAGCCAGTTGTCCAGTCTTCAAAGCGTTTCCACATGACCTTCAAGGATACATTTTAAACTCTGAATTAGCCGTCAAGAATTACGCATTATCCCAACAAACTACTGCATCCTTGTCGAAGAATTTGACAACTACCGGGAGTAATGGAGGTGGTTCTTCAAACCAATTGATTGCTTCACATTATCAGCTTGCTGATTCGTTGACACCATCGACTAGCTTAAATTTAACCATGCCTACTTCAAATATTGTCGGCAGCGGTGGTGTTGCTGCTGATACATCATCATG ]
[+] EMBL CD063367 [ CGCTTTATCCCAACAAACTACTGCATCCTTGTCGAAGAATTTGACAACTACCGGGAGTAATGGAGGTGGTTCTTCAAACCAATTGATTGCTTCACATTATCAGCTTGCTGATTCGTTGACACCATCGACTAGCTTAAATTTAACCATGCCTACTTCAAATATTGTCGGCAGCGGTGGTGTTGCTGCTGATACATCATCATGCATCAAGGCACCTGATGCACCAGAGGAAAGCATTTCCGATCGTGTCTACTTCTTATTTAATAATGTATCAAAAGTGAATGCTAAAGAAAAATCAAATGAATTAGCCACATTGTTATCAAAAGATCGACTTATACCATGGTTTGCCTTTTATCTTGTCAGTAAACGTATCCCGGTTGAACAAACATTTCACGATCTCTTCGCTTTGGTACTTGATCATATTCAAGAAAGAGTACCAAATGTTAGACCTAAAGTTATGTACGAACTTATCAGACATATCAAGTTTATTCTACGTAATATGCGTTTGGAC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||