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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8779#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1613 fasta sequence
[TCCTTCCTTATCAAGCATCATTCGTGAGTAAAATCCAAACGCATATGGGAATGGTTGAGATTAACGATGGTCGCCATTTTAAAAATCCCTTCCAGGATTATACCGCCGGAGACCAGCTTAAAGTGGAGAATACGAGCATCCCGAACAAAATTGTCGAACTGTTAAATGTTCTGAATTCGAATTTCGAGAAGCTATCGTCGTCTGACGTTTCAATGTATACGGGGTTGTCAGGTGTTGGACTATTCTACAATTTCCTATCGCAATGCAAATGTGAATTATTAGACAGAAAGATACGTGAAAATGGTGTTGCATGTACCGAAAAGTTGCTAAATCGATGTCTACGTCATATTGAATTGAAGAAGTTGTCTAGAAACATCAGTGTTTACACCAGCCCGATCGGTCCACTGTGTTTAGGCGCTCTATCATCGGTCAAACATGGAAGCGAG-AATACAGAGGCGAAGAAATTCGTAGAAGAAATTTTGTCGGCGAGTAAATATGGCATAGATGTGGACAGTGGGATGCCTGATGAAGCGTTGTATGGGCGTACTGGCTATCTAAATTGTCTGGTAACACTTCGAGAGAATAATTTCGACATTCCTATTTCTGTTGTCTCGTCGATAACAGATGCTATATTGAAGTCTGGTCAGAAAACAGCTGGTGCTTACAAATCGAATGGTTTTTATGATAGATTAATGTATCAGTCATCGAAACGAGATTTGCGCATGCCACCGTTAATGTTCGAATGGTATAATGAATGCTATCTTGGGGCTGCGCATGG-TTTTGC-GGTAATTTGACTACTCTACTGAAGGTATATCGTTTGTTTCCTGGTAGCATATCGTCACATTCCTTAAATCAGTTAATTCTACCTACTGTTGATTGGATGAGTCAACTTCAGCTAAACAGCGGAAATTGGCCTTCTAGTTTAGGGGATAGCTTAAATCGTGATGTATTAGTTCATTGGTGTCATGGTGCAACGGGGTGTTATCCCACTTATGCTTTCAGCTCATAAGATTACAGGTGAAAATAAATATTTAAAAGTGTGCATTAGACGGAGGAGAAGCTGTATGGA-CTCGTGGTCTACTTCACAAA-GGCTGTGGTTTATGTCATGGTTCAGCTGGTAGTGGTTTCGCTCTATTAGAGATTTATCAAACAACTCAAGATCCCAAATATTTGTATAGAGCTATAAAGTTCGCTGAATGGTGCACCGACTATTCTAAAAATGCTACTCGCATTGCTGATCGTCCGTACTCACTTATGGAAGGTCTTGCTGGGACATTGTACTTCCTTGTTGGTATTTTGGATCCAGTTCATGCGAAGTTTCCTTTACTAAGTGGATTGTGAATAGAAAGGAACCATAATTGTATTTATTATTTATTCAACTAACTTTATCTAATTATTTTGTACTGACATATCCTATCTTGGATAAACTATCATACTGAAAAAAAACAAAAACGACTATATTGCATAATCATCACATTGAATTTTTAAGAGAAACCAGAAGTAATATTGAATATAAACTACAGTGAATAAAAGAATGTATTTTTTTTTATCCCATCATATCACCTTCACTTTCTTTTGTAATGGAATGCGTTAGGAACAAGTTTTTTATAGAG]
[+] EMBL CD064296 [TCCTTCCTTATCAAGCATCATTCGTGAGTAAAATCCAAACGCATATGGGAATGGTTGAGATTAACGATGGTCGCCATTTTAAAAATCCCTTCCAGGATTATACCGCCGGAGACCAGCTTAAAGTGGAGAATACGAGCATCCCGAACAAAATTGTCGAACTGTTAAATGTTCTGAATTCGAATTTCGAGAAGCTATCGTCGTCTGACGTTTCAATGTATACGGGGTTGTCAGGTGTTGGACTATTCTACAATTTCCTATCGCAATGCAAATGTGAATTATTAGACAGAAAGATACGTGAAAATGGTGTTGCATGTACCGAAAAGTTGCTAAATCGATGTCTACGTCATATTGAATTGAAGAAGTTGTCTAGAAACATCAGTGTTTACACCAGCCCGATCGGTCCA ]
[+] EMBL CD096212 [ AGAATACGAGCATCCCGAACAAAATTGTCGAACTGTTAAATGTTCTGAATTCGAATTTCGAGAAGCTATCGTCGTCTGACGTTTCAATGTATACGGGGTTGTCAGGTGTTGGACTATTCTACAATTTCCTATCGCAATGCAAATGTGAATTATTAGACAGAAAGATACGTGAAAATGGTGTTGCATGTACCGAAAAGTTGCTAAATCGATGTCTACGTCATATTGAATTGAAGAAGTTGTCTAGAAACATCAGTGTTTACACCAGCCCGATCGGTCCACTGTGTTTAGGCGCTCTATCATCGGTCAAACATGGAAGCGAG AATACAGAGGCGAAGAAATTCGTAGAAGAAATCTTGTCGGCGAGTAAATATGGCATAGATGTGGACAGTGGGATGCCTGATGAAGCGTTGTATGGGCGTACTGGCTATCTAAATTGTCTGGTAACACTTCGAGAGAATAATTTCGACATTCCTATTTCTGTTGTCTCGNCGATAACAGATGCTATATTGAAGTCTGNTCAG ]
[+] EMBL CD096286 [ AGAATACGAGCATCCCGAACAAAATTGTCGAACTGTTAAATGTTCTGAATTCGAATTTCGAGAAGCTATCGTCGTCTGACGTTTCAATGTATACGGGGTTGTCAGGTGTTGGACTATTCTACAATTTCCTATCGCAATGCAAATGTGAATTATTAGACAGAAAGATACGTGAAAATGGTGTTGCATGTACCGAAAAGTTGCTAAATCGATGTCTACGTCATATTGAATTGAAGAAGTTGTCTAGAAACATCAGTGTTTACACCAGCCCGATCGGTCCACTGTGTTTAGGCGCTCTATCATCGGTCAAACATGGAAGCGAG AATACAGAGGCGAATAAATTCGTAGAAGAAATTTTGTCGGCGAGCAAATATGGCATAGATGTGGACAGTGGGATGCCTGATGAAGCGTTGTATGGGCGTACTGGCTATCTAAATTGTCTGGTAACACTTCGAGAGAATAATTGCGACATTCCTATTTC ]
[+] EMBL AI977752 [ ATGGAAGCGAG AATACAGAGGCGAAGAAATTTGTTGAAGAAATTTTGTCGGCGAGTAAATATGGCTTAGATGTGGACAGTGGGATGCCTGATGAAGCGTTGTATGGGCGTACTGGCTATCTAAATTGTCTGGTAACACTTCGAGAAAATAATTTCGACATCCCTGTCTCTGTTGTCTCGTCGATAACAGATGCTATATTGAAGTCCGGTCAGAAAACAGCTGGTGCTTACAAATCGAATGGTTTTTATGATAGATTAATGTATCAGTCATCGAAACGAGATTTGCGCATGCCACCGTTAATGTTCGAATGGTATAATGAATGCTATCTTGGGGCTGCGCATGGTTTTTGC GGTAATTTGAC ]
[+] EMBL BF936620 [ GAGAAATACAGAGGCGAAGAAATTCGTAGAAGAAATTTTGTCGGCGAGTAAATATGGCATAGATGTGGACAGTGGGATGCCTGATGAAGCGTTGTATGGGCGTACTGGCTATCTAAATTGTCTGGTAACACTTCGAGAGAATAATTTCGACATTCCTATTTCTGTTGTCTCGTCGATAACAGATGCTATATTGAAGTCTGGTCAGAAAACAGCTGGTGCTTACAAATCGAATGGTTTTTATGATAGATTAATGTATCAGTCATCGAAACGAGATTTGCGCATGCCACCGTTAATGTTTGAATGGCATGATATATGTTATCTTGGGGCTGCGCATGG TTTTGCTGGTATTTTGACTACTCTACTGAAGGTATATCGTTTGTTTCCTGGTAGCATATCGTCACATTCCTTAAATCAGTTAATTCTACCTACTGTTGATTGGATGAGTCAACTTCAGCTAAACAGCGGAAATTGGCCTTCTAGTTTAGGGGATAGCTTAAATCGTGATGTATTAGTTCATTGGTGTCATGGTGCAACGGGGTGTTATCCCACTTATGCTTTCAGCTCATAAGATTACAGGTGAAAATAAATATTTAAAAGTGTGCATTAGACGGAGGAGAAGCTGTATGGACCTCGTGGTCTACTTCACAAAGGGCTGTGGTT ]
[-] EMBL CD074947 [ GAAAATAAATATTT AAAGTGTGCATTAGACGGAGGAGAAGCTGTATGGA CTCGTGGTCTACTTCACAAA GGCTGTGGTTTATGTCATGGTTCAGCTGGTAGTGGTTTCGCTCTATTAGAGATTTATCAAACAACTCAAGATCCCAAATATTTGTATAGAGCTATAAAGTTCGCTGAATGGTGCACCGACTATTCTAAAAATGCTACTCGCATTGCTGATCGTCCGTACTCACTTATGGAAGGTCTTGCTGGGACATTGTACTTCCTTGTTGGTATTTTGGATCCAGTTCATGCGAAGTTTCCTTTACTAAGTGGATTGTGAATAGAAAGGAACCATAATTGTATTTATTATTTATTCAACTAACTTTATCTAATTATTTTGTACTGACATATCCTATCTTGGATAAACTATCATACTGAAAAAAAACAAAAACGACTATATTGCATAATCATCACATTGAATTTTTAAGAGAAACCAGAAGTAATATTGAATATAAACTACAGTGAATAAAAGAATGTATTTTTTTTTATCCCATCATATCACCTTCACTTTCTTTTGTAATGGAATGCGTTAGGAACAAGTTTTTTATAGAG]
[+] EMBL CD081125 [ GTGCATTAGACGGAGGAGAAGCTGTATGGA CTCGTGGTCTACTT ACAAA GGCTGTGGTTTATGTCATGGTTCAGCTGGTAGTGGTTTCGCTCTATTAGAGATTTATCAAACAACTCAAGATCCCAAATATTTGTATAGAGCTATAAAGTTCGCTGAATGGTGCACCGACTATTCTAAAAATGCTACTCGCATTGCTGATCGTCCGTACTCACTTATGGAAGGTCTTGCTGGGACATTGTACTTCCTTGTTGGTATTTTGGATCCAGTTCATGCGAAGTTTCCTCTACTAAGTGGATTGTGAATAGAAAGGAACCATAATTGTATTTATTATTTATTCAACTAACTTTATCTAATTATTTTGTACTGACATATCCTATCTTGGATAAACTATCATACTGAAAAAAAACAAAAACGACTATATTGCATAATCATCACATTGAATTTTTAAGAGAAACCAGAAGTAATATTGAATATAAACTACAGTGAATAAAAGAATGTATTTTTTTTTATCCCATCATATCACCTTCACTTTCTTTTGTAATGGAATGCGTTAGGAACAAGTTTTCTATAGAG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||