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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8826#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 794 fasta sequence
[AATAATACGCCATGGAACAGAACTCCCGGTAAACCTGGTATTGGCACTGGTGGTACTGTTAGTTCTTATCCAACATTTTCAACGCCCTCAAATATTCCATGGTCTACAACTAGGAATGATGCCGTAGATTTAATACAAGGACGTGGTCAAATTGAAGGTGGTGGTGGTCAGATGTGGCCTCTTCCTTCAATTTTCGACACAAACCGAACTTCTGATCGTAATGCTGTTGTTGTCGGTGGTGAGGGAGGTGGAGAATTTTTACCTCAGGAATCAACAACTGATAGCCAGTGGGCAACCACACCTTTTTCAGGTCAAACAACTTCAAATGTCAGCTCTCTATTAGGTTCACCTAATACATTTCCTATCAGTAATAATCATATACAAGCTCTTAATCCATGGTCTTTCGATAATCCAAATAATAATTGTTCTATTACTGCGACCCGAGCAATTACTGGTCAACAATTAAATAATGTTGTAACCTTAGCAAACACACCGTCGGATACATTGAATCCAGATCGTTCTCGTCGTTATATGCAGCATTGGACAACATTGAATAATGAACAAGATTTGTTAAATGACGATCGATCTGGATTGGCTTTTCCTTTATCAAGTATTAACATTAATAATAATAGTAATAATTCCGTCAGTGGATTCGGCAATCCTTCTGATTTTATTGAAAATCAATCACTCTCTTCTAACATAAACAATAATACACGAGGTAGTAACAAGTTATCAGAATTTGATATTGGACAAACTAGTTTAAAAAAATCTAGTTCTGATATTGACTCTTCAAC]
[+] EMBL CD147181 [AATAATACGCCATGGAACAGAACTCCCGGTAAACCTGGTATTGGCACTGGTGGTACTGTTAGTTCTTATCCAACATTTTCAACGCCCTCAAATATTCCATGGTCTACAACTAGGAATGATGCCGTAGATTTAATACAAGGACGTGGTCAAATTGAAGGTGGTGGTGGTCAGATGTGGCCTCTTCCTTCAATTTTCGACACAAACCGAACTTCTGATCGTAATGCTGTTGTTGTCGGTGGTGAGGGAGGTGGAGAATTTTTACCTCAGGAATCAACAACTGATAGCCAGTGGGCAACCACACCTTTTTCAGGTCAAACAACTTCAAATGTCAGCTCTCTATTAGGTTCACCTAATACATTTCCTATCAGTAATAATCATATACAAGCTCTTAATCCATGGTCTTTCGATAATCCAAATAATAATTGTTCTATTACTGCGACCC ]
[+] EMBL CD093790 [ CGAACTTCTGATCGTAATGCTGTTGTTGTCGGTGGTGAGGGAGGTGGAGAATTTTTACCTCAGGAATCAACAACTGATAGCCAGTGGGCAACCACACCTTTTTCAGGTCAAACAACTTCAAATGTCAGCTCTCTATTAGGTTCACCTAATACATTTCCTATCAGTAATAATCATATACAAGCTCTTAATCCATGGTCTTTCGATAATCCAAATAATAGTTGTTCTATTACTGCGCCTCGAGCAATTACTGGTCAGCAATTAAATAATGTTGTAACCTTAGCAAACACACCGTCGGATACATTGAATCCAGATCGTTCTC ]
[+] EMBL CD071287 [ TGGTCAACAATTAAATAATGTTGTAACCTTAGCAAACACACCGTCGGATACATTGAATCCAGATCGTTCTCGTCGTTATATGCAGCATTGGACAACATTGAATAATGAACAAGATTTGTTAAATGACGATCTATCTGGATTGGCTTTTCCTTTATCAAGTATTAACATTAATAATAATAGTAATAATTCCGTCAGTGGATTCGGCAATCCTTCTGATTTTATTGAAAATCAATCACTCTCTTCTAACATAAACAATAATACACGAGGTAGTAACAAGTTATCAGAATTTGATATTGGACCAACTAGTTT AAAAAATCTAGTTCTGATATTGACTCTTCAAC]
[-] EMBL CD071249 [ GGTCAACAATTAAATAATGTTGTAACCTTAGCAAACACACCGTCGGATACATTGAATCCAGATCGTTCTCGTCGTTATATGCAGCATTGGACAACATTGAATAATGAACAAGATTTGTTAAATGACGATCGATCTGGATTGGCTTTTCCTTTATCAAGTATTAACATTAATAATAATAGTAATAATTCCGTCAGTGGATTCGGCAATCCTTCTGATTTTATTGAAAATCAATCACTCTCTTCTAACATAAACAATAATACACGAGGTAGTAACAAGTTATCAGAATTTGATATTGGACAAACTAGTTTAAAAAAATCTAGTTCTGATATTGACTCTTCAAC]
[-] EMBL CD071245 [ GGTCAACAATTAAATAATGTTGTAACCTTAGCANACACACCGTCGGATACATTGAATCCAGATCGTTCTCGTCGTTATATGCAGCATTGGACAACATTGAATAATGAACAAGATTTGTTAAATGACGATCGATCTGGATTGGCTTTTCCTTTATCAAGTATTAACATTAATAATAATAGTAATAATTCCGTCAGTGGATTCGGCAATCCTTCTGATTTTATTGAAAATCAATCACTCTCTTCTAACATAAACAATAATACACGAGGTAGTAACAAGTTATCAGAATTTGATATTGGACAAACTAGTTTAAAAAAATCTAGTTCTGATATTGACTCTTCAAC]
[-] EMBL CD071241 [ ACATTGAATAATGAACAAGATTTGTTAAATGACGATCGATCTGGATTGGCTTTTCCTTTATCAAGTATTAACATAAATAATAATAGTAATAATTCCGTCAGTGGATTCGGCAATCCTTCTGATTTTATTGAAAATCAATCACTCTCTTCTAACATAAACAATAATACACGAGGTAGTAACAAGTTATCAGAATTTGATATTGGACAAACTAGTTTAAAAAAATCTAGTTCTGATATTGACTCTTCAAC]
[-] EMBL CD071258 [ CATTGAATAATGAACAAGATTTGTTAAATGACGATCGATCTGGATTGGCTTTTCCTTTATCAAGTATTAACATTAATAATAATAGTAATAATTCCGTCAGTGGATTCGGCAATCCTTCTGATTTTATTGAAAATCAATCACTCTCTTCTAACATAAACAATAATACACGAGGTAGTAACAAGTTATCAGAATTTGATATTGGACAAACTAGTTTAAAAAAATCTAGTTCTGATATTGACTCTTCAAC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||