cluster # 8834

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Schistosoma mansoni
cluster # 8834 cluster # 8834 Sequences # 7 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_8834#0 length = 424 sequences # 7

consensusID : consensus_8834#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 424
fasta sequence

                              [TATTCTACCTACCAAGTGATGTGGAAAGTATATGTAAACG-ACTCGGTGTAAAAACCAGTGGCCCTACAATATACCGGTG-TAGCGTGATATTCACGAAAACGTTTTTACATAATCATGGATACTGTATGCCACAACTCAACAA-CATAATTTACGGATAAACAATTTGTGATAATTGGATGTTAGTTTATATTTTATGCGGAAATAACATGTGACTTCTATTGGTACTATAACCCGGGTATGCAGTATGCATCTCACACAGCTGCTTGTAAACAGGAGAATATCTGATGAA-TTTTTTGGAATTCAAGGAATTATTCGAATTCGAAATCCTACTTTGTTTTTTTTGTAACTGACTGCTTTCCATTGAACATTTGATATGTCCTACTCCTTATTTATAAACCTGTTATGTTTGAAAATAACGATAGCG]

[+] EMBL CD178535             [TATTCTACCTACCAAGTGATGTGGAAAGTATATGTAAACG ACTCGGTGTAAAAACCAGTGGCCCTACAATATACCGGTG TAGCGTGATATTCACGAAAACGTTTTTACATAATCATGGATACTGTATGCCACAACTCAACAA CATAATTTACGGATAAACAATTTGTGATAATTGGATGTTAGTTTATATTTTATGCGGAAATAACATGTGACTTCTATTGGTACTATAACCCGGGTATGCAGTATGCATCTCACACAGCTGCTTGTAAACAGGAGAATATCTGATGAATTTTTTTGGAATTCAAGGAATTATTCGAATTCGAAATCCTACTTTGTTTTTTTTG                                                                                 ]
[+] EMBL CD139085             [           gCAAGTGATGTGGAAAGTATATGTAAACG ACTCGGTGTAAAAACCAGTGGCCCTACAATATACCGGTG TAGCGTGATATTCACGAAAACGTTTTTA ATAATCATGGATACTGTATGCCACAACTCAACAA CATAATTTACGGATAAACAATTTGTGATAATTGGATGTTAGTTTATATTTTATGCGGAAATAACATGTGACTTCTATTGGTACTATAACCCGGGTATGCAGTATGCATCTCACACAGCTGCTTGTAAACAGGAGAATATCTGATGAA TTTTTTGGAATTCAAGGAATTATTCGAATTCGAAATCCTACTTTGTTTTTTTTGTAACTGACTGCTTTCCATTGAACATTTGATATGTCCTACTCCTTATTTAT AACCTGTTATGTTTGAAAATAACGATAGCG]
[+] EMBL CD139104             [                           GTATATGTAAACG ACTCGGTGTAAAAACCAGTGGCCCTACAATATACCGGTG TAGCGTGATATTCACGAAAACGTTTTTACATAATCATGGATACTATATGCCACAACTCAACAAGCATAATTTACGGATAAACAATTTCTGATAATTGGATGTTAGTTTATATTTTATGCGGAAATAACATGTGACTTCTATTGGTACTATAACCCGGGTATGCAGTATGCATCTCACACAGCTGCTTGTAAACAGGAGAATATCTGATGAA TTTTTTGGAATTCAAGGAATTATTCGAATTCGAAATCCTACTTTGTTTTTTTTGTAACTGACTGCTTTCCATTGAACATTTGATATGTCCTACTCCTTATTTATAAACCTGTTATGTTTGAAAATAACGATAGCG]
[+] EMBL CD139180             [                           GTATATGTAAACG ACTCGGTGTAAAAACCAGTGGCCCTACAATATACCGGTG TAGCGTGATATTCACGAAAACGTTTTTACATAATCATGGATACTGTATGCCACAACTCAACAA CATAATTTACGGATAAACAATTTGTGATAATTGGATGTTAGTTTATATTTTATGCGGAAATAACATGTGACTTCTATTGGTACTATAACCCGGGTATGCAGTATGCATCTCACACAGCTGCTTGTAAACAGGAGAATATCTGATGAA TTTTTTGGAATTCAAGGAATTATTCGAATTCGAAATCCTACTTTGTTTTTTTTGTAACTGACTGCTTTCCATTGAACATTTGATATGTCCTACTCCTTATTTATAAACCTGNTATGTTTGAAAATAACGATAGC ]
[+] EMBL CD139218             [                           GTATATGTAAACG ACTCGGTGTAAAAACCAGTGGCCCTACAATATACCGGTG TAGCGTGATATTCACGAAAACGTTTTTACATAATCATGGATACTGTATGCCACAACTCAACAA CATAATTTACGGATAAACAATTTGTGATAATTGGATGTTAGTTTATATTTTATGCGGAAATAACATGTGACTTCTATTGGTACTATAACCCGGGTATGCAGTATGCATCTCACACAGCTGCTTGTAAACAGGAGAATATCTGATGAA TTTTTTGGAATT AAGGAATTATTCGAATTCGAAATCCTACTTTGTTTTTTTTGTAACTGACTGCTTTTCATTTGACATGTGATATGTCCTACTCCTCATTTATAAAGCTGNTATGTATGAAAAT ACGATAGC ]
[+] EMBL CD139123             [                           GTATATGTTCCCC ACTCGGTGTAAAAACCAGTGGCCCTACAATATACCGGTG TGGCGTGATATTCACGAAAACGTTTTTACATAATCATGGATACTGTATGCCACAACTCAACAA CATAATTTACGGATGAACGATTTGTGATAATTGGATGTTAGTTTATATTTTATGCGGAAATAACATGTGACTTCTATTGGTACTATAACCCGGGTATGCAGTATGCATCTCACACAGCTGCTTGTAAACAGGAGAATATCTGATGAATTTTTTTGGAATTCAAGGAATTATTCGAATTCAAAATCCTACTTTGTTTTTTTTGTAACTGACTGCTTTCCATTGAACATTTGATATGTCCTACTCCTTATTTATAAACCTGTTATGTTTGAAAATAACGATAGCG]
[+] EMBL CD139107             [                           GTATAT TTTACGCACTCGGTGAAAAAACCAGTGGCCCTACGATATACCGGNGNNNGCGTGATATTCACGAAAACGTTTTTACATAATCATGGATACTATATGCCACAACTCAACAA CATAATTTACGGATAAACAATTTCTGATAATTGGATGTTAGTTTATATTTTATGCGGAAATAACATGTGACTTCTATTGGTACTATAACCCGGGTATGCAGTATGCATCTCACACA                                                                                                                                                                       ]




>consensus_8834#0
TATTCTACCTACCAAGTGATGTGGAAAGTATATGTAAACGACTCGGTGTAAAAACCAGTG
GCCCTACAATATACCGGTGTAGCGTGATATTCACGAAAACGTTTTTACATAATCATGGAT
ACTGTATGCCACAACTCAACAACATAATTTACGGATAAACAATTTGTGATAATTGGATGT
TAGTTTATATTTTATGCGGAAATAACATGTGACTTCTATTGGTACTATAACCCGGGTATG
CAGTATGCATCTCACACAGCTGCTTGTAAACAGGAGAATATCTGATGAATTTTTTGGAAT
TCAAGGAATTATTCGAATTCGAAATCCTACTTTGTTTTTTTTGTAACTGACTGCTTTCCA
TTGAACATTTGATATGTCCTACTCCTTATTTATAAACCTGTTATGTTTGAAAATAACGAT
AGCG

clustalw multiple alignements is not computed in this case