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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8841#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 899 fasta sequence
[TAATTTGAAAGAAATTGTTTTAACCAATTCATGTTATAATCAATATTCGATTTTCGATGAACTGATAATAATTGAATAATATTTGGTTTTATGAAATTATTCATCCATTGGCTCGCCTGATATCATTAATTTGGAATTTTCTGTACAGCCAAGATCAAATGTAACATGAAAAGATTGGTGACTTTGTTGTTCGTTAGTAAGTATTGATTTATTCATTTTTAGTGTCATATCTATATCTTCAGTTTTCGCAGGCTGAAGATCGAAGCCTAATTTAAGAAACTTAAGACCTTGTTCGGTGATATGATCCGGATGACTAGAAAGCCAGCTAGTATAGTTGGATAAATTAGATGTTGATGTTTGTTTATCTAAGAATAA-TTGTCGACAATCTGTAAAAGATGTTCGGAGTAAAGCTAATTCATCATCTTCAAGTTTATTATAATCATTGTCCTGATCTTTATTATGTATGATGTGAACATCATGATTATCTCTTTGAAACGATGTATGGTCGTAAGACACTTCATCTTCGTAATCCTTGGACGACGGCATTCCTGACAAACGACGATAAAGTCTATAACTGATTGCTTCAGCTGAATCTAAGGAAGTTGATGTAAAAGTAGACGGTAACCAGGCAGGAATGCGAGTTAAATATTCAGTCTCTAACCAACTGGGTTTAGTATTTTCAGAATCGGAAATACATAAATTTTCATCAGATATACGATGGATAAAACGTGATGATGAGAGATCCAATCGACCTTTAGATATGTTTTCACTATACAGTGTAAGATCTTTGGTATCTGATAAGCTAAAACGCCGAGTAGATTTGAAACCCCCCATTTTACCTGAAATTGCTCTCATTGCTGAACTATTACCTTGAACCATACTCGCCACACGTCCGGTAT]
[+] EMBL CD195244 [TAATTTGAAAGAAATTGTTTTAACCAATTCATGTTATAATCAATATTCGATTTTCGATGAACTGATAATAATTGAATAATATTTGGTTTTATGAAATTATTCATCCATTGGCTCGCCTGATATCATTAATTTGGAATTTTCTGTACAGCCAAGATCAAATGTAACATGAAAAGATTGGTGACTTTGTTGTTCGTTAGTAAGTATTGATTTATTCATTTTTAGTGTCATATCTATATCTTCAGTTTTCGCAGGCTGAAGATCGAAGCCTAATTTAAGAAACTTAAGACCTTGTTCGGTGATATGATCCGGATGACTAGAAAGCCAGCTAGTATAGTTGGATAAATTAGATGTTGATGTTTGTTTATCTAAGAATAA TTGTCGACAATCTGTAAAAGATGTTCGGAGTAAAGCTAATTCATCATCTTCAAGTTTATTATAATCATTGTCCTGACCTTTATTATGTATGATGTGAAC ]
[+] EMBL CD159235 [ ATTTGGAATTTTCTGTACAGCCAAGATCAAATGTAACATGAAAAGATTGGTGACTTTGTTGTTCGTTAGTAAGTATTGATTTATTCATTTTTAGTGTCATATCTATATCTTCAGTTTTCGCAGGCTGAAGATCGAAGCCTAATTTAAGAAACTTAAGACCTTGTTCGGTGATATGATCCGGATGACTAGAAAGCCAGCTAGTATAGTTGGATAAATTAGATGTTGATGTTTGTTTATCTAAGAATAA TTGTCGACAATCTGTAAAAGATGTTCGGAGTAAAGCTAATTCATCATCTTCAAGTTTATTATAATCATTGCCCTGACCTTTATTATGTATGATGT ]
[+] EMBL CD169163 [ GTTTATCTAAGAATAATTTGTCGACAATCTGTAAAAGATGTTCGGAGTAAAGCTAATTCATCATCTTCAAGTTTATTATAATCATTGTCCTGATCTTTATTATGTATGATGTGAACATCATGATTATCTCTTTGAAACGATGTATGGTCGTAAGACACTTCATCTTCGTAATCCTTGGACGACGGCATTCCTGACAAACGACGATAAGGTCTATAACTGATTGCTTCAGCTGAATCTAAGGAAGTTGATGTAAAAGTAGACGGTAACCAGGCAGGAATGCGAGTTAAATATTCAGTCTCTAACCAACTGGGTTTAGTATTTTCAGAATCGGAAATACATAAATTTTCATCAGATATACGATGGATAAAACGTGATGATGAGAGATCCAATCGACCTTTAGATATGTTTTCACTATACAGTGTAAGATCTTTGGTATCTGATAAGCTAAAACGCCGAGTAGATTTGAAACCCCCCATTTT ]
[+] EMBL CD168927 [ CTAAGAATAA TTGTCGACAATCTGTAAAAGATGTTCGGAGTAAAGCTAATTCATCATCTTCAAGTTTATTATAATCATTGTCCTGATCTTTATTATGTATGATGTGAACATCATGATTATCTCTTTGAAACGATGTATGGTCGTAAGACACTTCATCTTCGTAATCCTTGGACGACGGCATTCCTGACAAACGACGATAAAGTCTATAACTGATTGCTTCAGCTGAATCTAAGGAAGTTGATGTAAAAGTAGACGGTAACCAGCCAGGAATGCGAGTTAAATATTCAGTCTCTAACCAACTGGGTTTAGTATTTTCAGAATCGGAAATACATAAATTTTCATCAGATATACGATGGATAAAACGTGATGATGAGAGATCCAATCGACCTTTAGATATGTTTTCACTATACAGTGTAAGATCTTTGGTATCTGATAAGCTAAAACGCCGAGTAGATTTGAAACCCCCCATTTT ]
[+] EMBL CD169054 [ CTAAGAATAA TTGTCGACAATCTGTAAAAGATGTTCGGAGTAAAGCTAATTCATCATCTTCAAGTTTATTATAATCATTGTCCTGATCTTTATTATGTATGATGTGAACATCATGATTATCTCTTTGAAACGATGTATGGTCGTAAGACACTTCATCTTCGTAATCCTTGGACGACGGCTTTCCTGACAAACGACGATAAAGTCTATAACTGATTGCTTCAGCTGAATCTAAGGAAGTTGATGTAAAAGTAGACGGTAACCAGGCAGGAATGCGAGTTAAATATTCAGTCTCTAACCAACTGGGTTTAGTA ]
[+] EMBL CD168399 [ AACATCATGATTATCTCTTTGAAACGATGTATGGTCGTAAGACACTTCATCTTCGTAATCCTTGGACGACGGCATTCCTGACAAACGACGATAAAGTCTATAACTGATTGCTTCAGCTGAATCTAAGGAAGTTGATGTAAAAGTAGACGGTAACCAGGCAGGAATGCGAGTTAAATATTCAGTCTCTAACCAACTGGGTTTAGTATTTTCAGAATCGGAAATACACAAATTTTCATCAGATATACGATGGATAAAACGTGATGATGAGAGATCCAATCGACCTTTACATATGTTTTCACTATACAGTGTAAGATCTTTGGTATCTGAT AGCTAAAACGCCGAGTAGATTTGAAACCCCCCATTTTACCTGAAATTGCTCTCATTGCTGAACTATTACCTTGAACCATACTCGCCACACGTCCGGTAT]
[+] EMBL CD168398 [ AACATCATGATTATCTCTTTGAAACGATGTATGGTCGTAAGACACTTCATCTTCGTAATCCTTGGACGACGGCATTCCTGACAAACGACGATAAAGTCTATAACTGATTGCTTCAGCTGAATCTAAGGAAGTTGATGTAAAAGTAGACCGTAACCAGGCAGGAATGCGAGTTAAATATTCAGTCTCTAACCAACTGGGTTTAGTATTTTCAGAATC ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||