Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8887 cluster # 8887       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8887#0 length = 979 sequences # 7  
consensusID : consensus_8887#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 979
fasta sequence 
                              [CGGTACCCCTTGGCAAGGGTGNNGAAATCAGGAAATATTAACAATAACGCAAATCAATTCAATGAATTAGATGAAGAGGATATTTTGAAAGAAGGTGAAGATGCTCAACTGTCAAATACACCATACCCTCCACAATTAATGCCTGTTTATACACCTGAGTCACTGGAAGATGGTTATGCTCGTTTAACGTTATTATCTAATTTATCTATTCGATCATTTGTGCGAATTACTGATCATGTTTTTACTGTACAGCAATATTGTAATAATACTGTAAATAATGCAAATATAACATCATCGGAATTATTACTTCGTGGTATTAAACGTCATCGTCAACAAATAGCAGCTAAACAAGCTGGTATGCATTTAGTGATTGGTTCAAACTCAACTGCAAGTGATTGTGATCCCCTAGTTCTTATGGATGAATTAAATGCGAATTTATTTAATCTTGTAATTTCATTGATGCCGGAATCTTCTATGTCACCGATGTTTGGTCTACCAGCTAACTGGCCTACTAAAGTTGATTTAAGAACAGCATTGAAATTCAAGGGAATTTCAGAGGAGGATGCTTGTGTGTTTGATGAGCATGCTTTACTCAGTGATGAACTAACAACACCACTTCTAACATCGGTTATTACTCAACGTTTGGCTCCCATTAGTTGTCCTGATCTTGTAGCACATCTGGAACTGATTCATCGTACTTGCCGTCGAAGATGGGCTGTAAAACGAATTGAAGATAGCTTATCTAATTCTCAGTTACAATTAAATACGGAGTATGTGGGTCGTTTGTGTGTTCTTGAAGAATTGGGTTTTATCGATTCAGCAACACATACTGGTTGTTTGAGTTTAAAAGGTCGAATTGCTTGTGAATTAACAAAAATGGAAGTGTTAATTACTCAACTACTACTTAATGGTTCATTTACTGATTTATCAGCTCCTGATTTGGCAGCTGTTTTATCGTGTTTTGTATTTGAAACACGTT]

[+] EMBL CD168142             [CGGTACCCCTTGGCAAGGGTGNNGAAATCAGGAAATATTAACAATAACGCAAATCAATTCAATGAATTAGATGAAGAGGATATTTTGAAAGAAGGTGAAGATGCTCAACTGTCAAATACACCATACCCTCCACAATTAATGCCTGTTTATACACCTGAGTCACTGGAAGATGGTTATGCTCGTTTAACGTTATTATCTAATTTATCTATTCGATCATTTGTGCGAATTACTGATCATGTTTTTACTGTACAGCAATATTGTAATAATACTGTAAATAATGCAAATATAACATCATCGGAATTATTACTTCGTGGTATTAAACGTCATCGTCAACAAATAGCAGCTAAACAAGCTGGTATGCATTTAGTGATTGGTTCAAACTCAACTGCAAGTGATTGTGATCCCCTAGTTCTTATGGATGAATTAAATGCGAATTTATTTAATCTTGTAATTTCATTGATGCCGGAATCTTCTATGTCACCGATGTTTGGTCTACCAGCTAACTGGCCTACTAAAGTTGATTTAAGAACAGCATTGAAATTCAAGGGAATTTCAGAGGAGGATGCTTGTGTGTTTGATGAGCATGCTTTACTCAGTGATGAACTAACAACACCACTTCTAACATCGGTTATTACTCAACGTTTGGCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD168161             [                                          AATAACGCAAATCAATTCAATGAATTAGATGAAGAGGATATTTTGAAAGAAGGTGAAGATGCTCAACTGTCAAATACACCATACCCTCCACAATTAATGCCTGTTTATACACCTGAGTCACTGGAAGATGGTTATGCTCGTTTAACGTTATTATCTAATTTATCTATTCGATCATTTGTGCGAATTACTGATCATGTTTTTACTGTACAGCAATATTGTAATAATACTGTAAATAATGCAAATATAACATCATCGGAATTATTACTTCGTGGTATTAAACGTCATCGTCAACAAATAGCAGCTAAACAAGCTGGTATGCATTTAGTGATTGGTTCAAACTCAACTGCAAGTGATTGTGATCCCCTAGTTCTTATGGATGAATTAAATGCGAATTTATTTAATCTTGTAATTTCATTGATGCCGGAATCTTCTATGTCACCGATGTTTGGTCTACCAGCTAACTGGCCTACTAAAGTTGATTTAAGAACAGCATTGAAATTCAAGGGAATTTCAGAGGAGGATGCTTGTGTGTTTGATGAGCATGCTTTACTCAGTGATGAACTAACAACACCACTTCTAACATCGGTTATTACTCAACGTTTGGCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD167926             [                                           ATAACGCAAATCAATTCAATGAATTAGATGAAGAGGATATTTTGAAAGAAGGTGAAGATGGTCAACTGTCAAATACACCATACCCTCCACAATTAATGCCTGTTTATACACCTGAGTCACTGGAAGATGGTTATGCTCGTTTAACGTTATTATCTAATTTATCTATTCGATCATTTGTGCGAATTACTGATCATGTTTTTACTGTACAACAATATTGTAATAATACTGTAAATAATGCGAATATAACATCATCGGAATTATTACTTCGTGGTATTAAACGTCATCGTCAACAAATAGCAGCTAAACAGGCTGGTATGCATTTAGTGATTGGTTCAAACTCAACTGCAAGTGATTGTGATCCCCTAGTTCTTATGGATGAATTAAATGCGAATTTATTTAATCTTGTAATTTCATTGATGCCGGAATCTTCTATGTCACCGATGTTTGGTCTACCAGCTAACTGGCCTACTAAAGTTGATTTAAGAACAGCATTGAAATTCAAGGGAATTTCAGAGGAGGATGCTTGTGTGTTTGATGAGCATGCTTTACTCAGTGATGAACTAACAACACCACTTCTAACATCGGTTATTACTCAACGTTTGGCTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD169450             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GGTCTACCAGCTAACTGGCCTACTAAAGTTGATTTAAGAACAGCATTGAAATTCAAGGGAATTTCAGAGGAGGATGCTTGCGTGTTTGATGAGCATGCTTTACTCAGTGATGAACTAACAACACCACTTCTAACATCGGTTATTACTCAACGTTTGGCTCCCATTAGTTGTCCTGATCTTGTAGCACATCTGGAACTGGTTCATCGTACTTGCCGTCGAAGATGGGCTGTAAAACGAATTGAAGATAGCTTATCTAATTCTCAGTTACAATTAAATACGGAGTATGTGGGTCGTTTGTGTGTTCTTGAAGAATTGGGTTTTATCGATTCAGCAACACATACTGGTTGTTTGAGTTTAAAAGGTCGAATTGCTTGTGAATTAACAAAAGTGGAAGTGTTAATTACTCAACTACTACTTAATGGTTCATTAACTGATTTATCAGCTCCTGATTTGGCAGCTGTTTTATCGTGTTTTGTATTTGAAACACGTT]
[+] EMBL CD089749             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACAGCATTGAAATTCAAGGGAATTTCAGAGGAGGATGCTTGTGTGTTTGATGAGCATGCTTTACTCAGTGATGAACTAACAACACCACTTCTAACATCGGTTATTACTCAACGTTTGGCTCCCATTAGTTGTCCTGATCTTGTAGCACATCTGGAACTGATTCATCGTACTTGCCGTCGAAGATGGGCTGTAAAACGAATTGAAGATAGCTTATCTAATTCTCAGTTACAATTAAATACGGAGTATGTGGGTCGTTTGTGTGTTCTTGAAGAATTGGGTTTTATCGATTCAGCAACACATACTGGTTGTTTGAGTTTAAAAGGTCGAATTGCTTGTGAATTAACAAAAATGGAAGTGTTAATTACTCAACTACTACTTAATGGTTCATTTACT                                                          ]
[-] EMBL CD089844             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CAGCATTGAAATTCAAGGGAATTTCAGAGGAGGATGCTTGTGTGTTTGATGAGCATGCTTTACTCAGTGATGAACTAACAACACCACTTCTAACATCGGTTATTACTCAACGTTTGGCTCCCATTAGTTGTCCTGATCTTGTAGCACATCTGGAACTGATTCATCGTACTTGCCGTCGAAGATGGGCTGTAAAACGAATTGAAGATAGCTTATCTAATTCTCAGTTACAATTAAATACGGAGTATGTGGGTCGTTTGTGTGTTCTTGAAGAATTGGGTTTTATCGATTCAGCAACACATACTGGTTGTTTGAGTTTAAAAGGTCGAATTGCTTGTGAATTAACAAAAATGGAAGTGTTAATTACTCAACTACTACTTAATGGTTCATTTACTG                                                         ]
[-] EMBL CD089724             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CAGCATTGAAATTCAAGGGAATTTCAGAGGAGGATGCTTGTGTGTTTGATGAGCATGCTTTACTCAGTGATGAACTAACAACACCACTTCTAACATCGGTTATTACTCAACGTTTGGCTCCCATTAGTTGTCCTGATCTTGTAGCACATCTGGAACTGATTCATCGTACTTGCCGTCGAAGATGGGCTGTAAAACGAATTGAAGATAGCTTATCTAATTCTCAGTTACAATTAAATACGGAGTATGTGGGTCGTTTGTGTGTTCTTGAAGAATTGGGTTTTATCGATTCAGCAACACATACTGGTTGTTTGAGTTTAAAAGGTCGAATTGCTTGTGAATTAACAAAAATGGAAGTGTTAATTACTCAACTACTACTTAATGGTTCATTTACTG                                                         ]




>consensus_8887#0
CGGTACCCCTTGGCAAGGGTGNNGAAATCAGGAAATATTAACAATAACGCAAATCAATTC
AATGAATTAGATGAAGAGGATATTTTGAAAGAAGGTGAAGATGCTCAACTGTCAAATACA
CCATACCCTCCACAATTAATGCCTGTTTATACACCTGAGTCACTGGAAGATGGTTATGCT
CGTTTAACGTTATTATCTAATTTATCTATTCGATCATTTGTGCGAATTACTGATCATGTT
TTTACTGTACAGCAATATTGTAATAATACTGTAAATAATGCAAATATAACATCATCGGAA
TTATTACTTCGTGGTATTAAACGTCATCGTCAACAAATAGCAGCTAAACAAGCTGGTATG
CATTTAGTGATTGGTTCAAACTCAACTGCAAGTGATTGTGATCCCCTAGTTCTTATGGAT
GAATTAAATGCGAATTTATTTAATCTTGTAATTTCATTGATGCCGGAATCTTCTATGTCA
CCGATGTTTGGTCTACCAGCTAACTGGCCTACTAAAGTTGATTTAAGAACAGCATTGAAA
TTCAAGGGAATTTCAGAGGAGGATGCTTGTGTGTTTGATGAGCATGCTTTACTCAGTGAT
GAACTAACAACACCACTTCTAACATCGGTTATTACTCAACGTTTGGCTCCCATTAGTTGT
CCTGATCTTGTAGCACATCTGGAACTGATTCATCGTACTTGCCGTCGAAGATGGGCTGTA
AAACGAATTGAAGATAGCTTATCTAATTCTCAGTTACAATTAAATACGGAGTATGTGGGT
CGTTTGTGTGTTCTTGAAGAATTGGGTTTTATCGATTCAGCAACACATACTGGTTGTTTG
AGTTTAAAAGGTCGAATTGCTTGTGAATTAACAAAAATGGAAGTGTTAATTACTCAACTA
CTACTTAATGGTTCATTTACTGATTTATCAGCTCCTGATTTGGCAGCTGTTTTATCGTGT
TTTGTATTTGAAACACGTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)