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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8926#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 974 fasta sequence
[CATCACGTGATGAGAACCCTTATTGTGCAGATTGCTATACACAATTA-TTGCGAAACACTGTGCAAAGTGTACAAAACGGATTAGTGGTTTTGGCGGTTGCAAATTTGTACCATTTGAAGACAAACATTGGCATTCTGATTGTTTCAACTGTAGTAAATGCCAAAATAGTCTGGTAGGCAAAGGATTCCTTGTTTCGGATGATGGGGTTGTTTGTCCTGAATGTGCAAGATAATGAAATGAACACATATATACACAAATAGACACAAAATCACAAAGACTATAATAAAAAGCCTAAATGATATCAGTAAGAATGAGAAAAAAACTTTCAACACTTTCAGTACAATCATAAAAATACACTAAAAGTTAACATACATGATTATGTTTTGTGGTTTTCCTCATTAATATACATTTATGTATTTACTTATTGTAAGCTGATTTGCTCTCTTTGGTATCTGCTTCCCTTTTATTTATTCACCAGTTTATTAACGATCCAAATTGTCCTTCATCTGAATGTTGCATAATTAAGTTTTTATTTTCAGTCATTTTATTGATGATATTTATAGTACTTATGTCGTTTATAAGTAGCTTCTACTG-TTTTTAAACTTTTATCTGCTTATTTTTAATAACCTACATTTCACTCCGAAATTAAATTGTCTCCAA-TCGATTCCGAAGTTACTTAAACATTAACCTATACATTTACACTTCATGGTATCTTTTCGCTTGATCACATGTATGAACTTTGCAGATAATTTCTTTATACAATTTGTATCAGATCATTATTGTGGATCGACATAAAGAAAAGTTGATCTGTTGACATGTAATACTTAACTTCTTAAATTCGACTTTCACTATTGTTTGTTATCAAGATCTTTCCTAATCATCAGGAGGGAGAAAGAGGAGAAGAGAGAGCAATATTGAAAGTGAATAAAAATAATAAATATCAATTATGCTATTTATTAAAACAATATCCTTNC]
[-] EMBL CD127110 [CATCACGTGATGAGAACCCTTATTGTGCAGATTGCTATACACAATTA TTGCGAAACACTGTGCAAAGTGTACAAAACGGATTAGTGGTTTTGGCGGTTGCAAATTTGTACCATTTGAAGACAAACATTGGCATTCTGATTGTTTCAACTGTAGTAAATGCCAAAATAGTCTGGTAGGCAAAGGATTCCTTGTTTCGGATGATGGGGTTGTTTGTCCTGAATGTGCAAGATAATGAAATGAACACATATATACACAAATAGACACAAAATCACAAAGACTATAATAAAAAGCCTAAATGATATCAGTAAGAATGAGAAAAAAACTTTCAACACTTTCAGTACAATCATAAAAATACACTAAAAGTTAACATACATGATTATGTTTTGTGGTTTTCCTCATTAATATACATTTATGTATTTACTTATTGTAAGCTGATTTGCTCTCTTTGGTATCTGCTTCCCTTTTATTTATTCACCAGTTTATTAACGATCCAAATTGTCCTTCATCTGAATGTTGCATAATTAAGTTTTTATTTTCAGTCATTTTATTGATGATATTTATAGTACTTATGTCGTTTATAAGTAGCTTCTACTGTTTTTTTAACTTTTATCTGCTTA ]
[-] EMBL CD166887 [ aCCTTATTGTGCAGATTGCTATACACAATTATTTGCGAAACACTGTGCAAAGTGTACAAAACTGATTAGTGGTTTTGGCGGTTGCAAATTTGTAACATTTGAAGACAAACATTGGCATTCTGATTGTTTCAACTGTAGTAAATGCCAAAATAGTCTGGTAGGCAAAGGATTCCTTGTTTCGGATGATGGGGTTGTTTGTCCTGAATGTGCAAGATAATGAAATGAACACATATATACACAAATAGACACAAAATCACAAAGACTATAATAAAAAGCNTAAATGATATAAGT AGAATGAG AAAAAACTTTCAACACTTTCAGTACAATCAT AAAATACACAAANAGTTAACATACATGATTATGTTTTGTGGTTTTCCTCATTAATATACATTTATGTATTTACTTATTGTAAGCTGATTTGCTCTCTTTGGTATCTGCTTCCCTTTTATTTATTCACCAGTTTATTAACGATCCAAATTGTCCTTCATCTGGATGTTGCATAATTAAGTTTTTATTTTCAGT ]
[+] EMBL CD186920 [ GGCATTCTGATTGTTTCAACTGTAGTAAATGCCAAAATAGTCTGGTAGGCAAAGGATTCCTTGTTTCGGATGATGGGGTTGTTTGTCCTGAATGTGCAAGATAATGAAATGAACACATATATACACAAATAGACACAAAATCACAAAGACTATAATAAAAAGCCTAAATGATATCAGTAAGAATGAGAAAAAAACTTTCAACACTTTCAGTACAATCATAAAAATACACTAAAAGTTAACATACATGATTATGTTTTGTGGTTTTCCTCATTAATATACATTTATGTATTTACTTATTGTAAGCTGATTTGCTCTCTTTGGTATCTGCTTCCCTTTT ]
[+] EMBL CD091425 [ TAAAAATACACAAAAAGTTAACATACATGATTATGTTTTGTGGTTTTCCTCATTAATATACATTTATGTATTTACTTATTGTAAGCTGATTTGCTCTCTTTGGTATCTGCTTCCCTTTTATTTATTCACCAGTTTATTAACGATCCAAATTGTCCTTCATCTGAATGTTGCATAATTAAGTTTTTATTTTCAGTCATTTTATTGATGATATTTATAGTACTTATGTCGTTTATAAGTAGCTTCTACTG TTTTTAAACTTTTATCTGCTTATTTTTAATAACCTACATTTCACTCCGAAATTAAATTGTCTCCAA TCGATTCCGAAGTTACTTAAACATTAACCTATACATTTACACTTCATGGTATCTTTTCGCTTGATCACATGTATGAACTTTGCAGATAATTTCTTTATACAATTTGTATCAGATCATTATTGTGGATCGACATAAAGAAAAGTTGATCTGTTGACATGTAATACTTAACTTCTTAAATTCGACTTTCACTATTGTTTGTTATCAAGATCTTTCCTAATCATCAGGAGGGAGAAAGAGGAGAAGAGAGAGCAATATTGAAAGTGAATAAAAATAATAAATATCAATTATGCTATTTATTAAAACAATATCCTTNC]
[-] EMBL SMRAP019 [ gbyAGTTGACATACATGATTATGTTTTGTGGTTTTCCTCATTAATAMASATTTATGTATTTACTTATTGTAAGCTGATTTGCTCTCTTTGGTA ]
[+] EMBL SM3741 [ AACATACATGATTATGTTTTGTGGTTTTCCTCATTAATATACATTTATGTATTTACTTATTGTAAGCTGATTTGCTCTCTTTGGTATCTGCTTCCCTTTTATTTATTCACCAGTTTATTAACGATCCAAATTGTCCTT ]
[-] EMBL CD201309 [ ATTAAGTTTTTATTTTCAGTCATTTTATTGATGATATTTATAGTACTTATGTCGTTTATAAGTAGCTTCTACTG TTTTTAAACTTTTATCTGCTTATTTTTAATAACCTACATTTCACTCCGAAATTAAATTGTCTCCGA TCGATTCCGAAGTTACTTAAACATTAACCTATACATTTACACTTCATGGTATCTTTTCGCTTGATCACATGTATGAACTTTGCAGATAATTTCTTTATACAATTTGTATCAGATCATTATTGTGGATCGACATAAAGAAAAGTTGATCTGTTGACATGTAATACTTAACTTCTTAAATTCGACTTTCACTATTGTTTGTTATCAAGATCTT ]
[+] EMBL AI618820 [ TTTATCTGCTTATTTTTAATAACGTACATTTCACTCCGAAATTAAATTGTCTCCAAGTCGATTCCGAAGTTACTTAAACATTAACCTATACATTTACACTTCATGGTATCTTTTCGCTTGATCACATGTATGAACTTTGCAGATAATTTCTTTATACAATTTGTATCAGATCATTATTGTGGATCGACATAAAGAAAAGTTGATCTGTTGACATGTAATACTTAACTTCT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||