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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8931#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 496 fasta sequence
[TTCTTTTTGCCAATCAGAAGCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACAATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCAGGCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAGAAGTCTGCTAGAATGGAAACTTTTCGCTT-GATCCAGATTGAGGCTAGGGCAAATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGATGTTACGGAAGCTTAGGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATATGTGCATGAAAATTGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCGAAGAGTTGAGAGAATCATTAAAATAGATGAAACAGTTGTCAGGAAACCA]
[+] EMBL CD162295 [TTCTTTTTGCCAATCAGAAGCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACAATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCAGGCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAGAAGTCTGCTATAATGGAAACTTTTCGCTT GATCCAGATTGAGGCTAGGGCAAATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGATGTTACGGAAGCTTAGGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATATGTGCATGAAAATTGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCGAAGAGTTGAGAGAATCATTAAAATAGATGAAACAGTTGTCAGGAAAC ]
[+] EMBL CD162307 [TTCTCTTTGCCAATCAGAAGCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACTATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCAGGCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAGAAGTCTGCTAGAATGGAAACTTTTCGCTT GATCCAGATTGAGGCTAGGGCAAATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGGTGTTACGGAAGCTTATGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATATGTGCATGAAGATTGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCGAAGAGTTGAGAGAATCATTAAAATAGATGAAACAGTTGTCAGGAAA ]
[+] EMBL CD162174 [ AGCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACAGTTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCAGGCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAAAAGTCTGCTAGAATGGAAACTTTTCGCTTGGATCCAGATTGAGGCTAGGGCAAATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGATGTTACGGAAGCTTAGGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATATGTGCATGAAAAATGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCAAAAAG TGNGAGATTCATT ANATAGATG AACAAGTGTCAGGAAAg ]
[+] EMBL CD162234 [ GCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGATTTTAGAGAGGACGTGACAATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTGTTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCATTCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAGAAGTCTGCTAGAATGGAAACTTTTCGCTT GATCCAGATTGAGGCTAGGGCAGATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGATGTTACGGAAGCTTAGGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATGTGTGCATGAAAATTGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCGAAGAGTTGAGAGAATCATTAAAATAGATGAAACAGTTGTCAGGAAA ]
[+] EMBL CD162235 [ GCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCCATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACAATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCATTTTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAGAAGTCTGCTAGAATGGAAACTTTTCGCTT GATCCAGATTGAGGCTAGGGCAAATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGATGTTACGGAAGCTTAGGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATATGTGCATGAAAATTGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCGAAGAGTTGAGAGAATCATTAAAATAGATGAAACAGTTGTCAGGAAA ]
[+] EMBL CD162299 [ GCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACAATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCAGGCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAGAAGTCTGCTAGAATGGAAACTTTTCGCTT GATCCAGATTGAGGCTAGGGCAAATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGATGTTACGGAAGCTTAGGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATATGTGCATGAAAATTGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCGAAGAGTTGAGAGAATCATTAAAATAGATGAAACAGTTGTCAGGAAA ]
[+] EMBL CD162273 [ GCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACAATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCAGGCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAGAAGTCTGCTAGAATGGAAACTTTTCGCTT GATCCAGATTGAGGCTAGGGCAAATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGATGTTACGGAAGCTTAGGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATATGTGCATGAAAATTGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCGAAGAG TGAGAGAATCATTAAAATAGATGAAACCGGTGTCAGGAAACCA]
[+] EMBL CD162277 [ GCGTTTAAAGAATTTTAAGGTTACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACTATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCAGGCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAG ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||