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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8941#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 639 fasta sequence
[CATACCAGATCCAGTGACAACATATTTACTATTCTTAGTAATGACAACACAATCAACTTTCATACCTTCCATATTGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTATGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACACCAACCACAACATCCAGGTTTACATCTCCAACATGCCCATATTAAAGCAGAAATTAATAATAACAAAGCTAATAATAATCCAGCTAATAGACCATCAATCATAGCACCGCCTAAACCGAATAGTCCACCAGCTTGAGAAAGAATCAATCCAGTACCAGCATTAATTCCAGTTGCACCGGCACCATAAATATTACCATCGGATATATGAAG]
[+] EMBL CD170767 [CATACCAGATCCAGTGACAACATATTTACTATTCTTAGTAATGACAACACAATCAACTTTCATACCTTCCATATTGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTATGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGC ]
[+] EMBL CD124855 [ ACATATTTACTATTCTTAGTAATGACAACACAATCAACTTTCATACCTTCCATATTGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTATGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACAC ]
[+] EMBL CD124862 [ ACATATTTACTATTCTTAGTAATGACAACACAATCAACTTTCGTACCTTCCATATCGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTATGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACAC ]
[+] EMBL CD124974 [ ACATATTTACTATTCTTAGTAATGACAACACAATCAACTTTCATACCTTCCATATTGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTGTGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACAC ]
[+] EMBL CD124976 [ ACATATTTACTATTCTTAGCAATGACAACACAATCAACTTTCATACCTTCCATATTGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTATGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACAC ]
[+] EMBL CD124982 [ ACATATTTACTATTCTTAGTAATGACAACACAATCAACTTTCATACCTTCCATATTGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTATGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTCACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACAC ]
[+] EMBL CD124868 [ ACATATTTACTATTCTTAGTAATGACAACACAATCAACTTTCATACCTTCCATATTGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTATGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACAC ]
[-] EMBL CD197475 [ TGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTAAACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACACCAACCACAACATCCAGGTTTACATCTCCAACATGCCCATATTAAAGCAGAAATTAATAATAACAAAGCTAATAATAATCCAGCTAATAGACCATCAATCATAGCACCGCCTAAACCGAATAGTCCACCAGCTTGAGAAAGAATCAATCCAGTACCAGCATTAATTCCAGTTGCACCGGCACCATAAATATTACCATCGGATATATGAAG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||