Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9011 cluster # 9011       Sequences # 8       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9011#0 length = 591 sequences # 8  
consensusID : consensus_9011#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 591
fasta sequence 
                              [GTNTTCTATCAAAATCACA--GAGTATTATGAATAGTGATTGGAAAAGGCCAGATTTACCAAGCAAATGTACATTCTCTTTAGACCAATCCATAAATGAAAGTCCTCATCATCATATTCCAATTCCCAAGAGGAATAAAATTATAAAAAAGTCATTAGAATTAATTGGTAATACACCTTTAATTCAACTTGATCGAATTGCAAAGCATGAAGATATAGAATGTGAACTTTTAGGAAAATGTGAATTTCTTAATATTGGAGGTAGTGTTAAAGATAGAATTGGAAAACGTATGATTGAAGAGGCTGAATTGGAAGGTAAACTGAAGCCTGGTGATACAATTATTGAACCCACCTCTGGAAATACTGGTATTGGATTGGCGCTTACTGCTGCTCTTAAAGGTTACCGATGTATAATTGTAATGTCAGACAAAATGAGTAGTGAAAAGGAATCGTATTTACGATGCCTTGGAGCTGAAATTGTTCGTACCCCGGCTTCTGCGAATTTCGACAATCCTGATTCATTGTTTCTAGTATCAGAAAAATTAAAAAATGAAATTGGTCCATCTGCGCATATCATGAATCAATATACCAATC]

[+] EMBL CD153113             [GTTTTCTATCAAAATCACA  GAGTATTATGAATAGTGATTGGAAAAGGCCAGATTTACCAAGCAAATGTACATTCTCTTTAGACCAATCCATAAATGAAAGTCCTCATCATCATATTCCAATTCCCAAGAGGAATAAAATTATAAAAAAGTCATTAGAATTAATTGGTAATACACCTTTAATTCAACTTGATCGAATTGCAAAGCATGAAGATATAGAATGTGAACTTTTAGGAAAATGTGAATTTCTTAATATTGGAGGTAGTGTTAAAGATAGAATTGGAAAACGTATGATTGAAGAGGCTGAATTGGAAGGTAAACTGAAGCCTGGTGATACAATTATTGAACCCACCTCTGGAAATACTGGTATTGGATTGGCGCTTACTGCTGCTCTTAAAGGTTACCGATGTATAATTGTAATGTCAGACAAAATGAGTAGTGAAAAGGAATCGTATTTACGATGCCTTGGAGCTGAAATTGTTCGTACCCCGGCTTCTGCGAATTTCGACAATCCTGATTCATTGGTTCTAGTATCAGAAAAATTAAAAAATGAAATTGGTCCATCTGCGCATATCATGAATCAATATACCAAT ]
[-] EMBL CD153022             [ TNTTCTATCANAATCACA  GAGTANTATGAATAGTGA TGGAAAAGGCCAGATNTACCAAGCAAATGTACATTCTCTNTAGACCAATCCATAAATGAAAGTCCTCATCATCATATTCCAATTCNCAAGAGGAATAAAATTATAAAAAAGTCATTAGAATTAATTGGTAATACACCTTTAATTCAACTTGATCGAATTGCAAAGCATGAAGATATAGAATGTGAACTTTTAGGAAAATGTGAATTTCTTAATATTGGAGGTAGTGTTAAAGATAGAATTGGAAAACGTATGATTGAAGAGGCTGAATTGGAAGGTAAACTGAAGCCTGGTGATACAATTATTGAACCCACCTCTGGAAATACTGGTATTGGATTGGCGCTTACTGCTGCTCTTAAAGGTTACCGATGTATAATTGTAATGTCAGACAAAATGAGTAGTGAAAAGGAATCGTATTTACGATGCCTTGGAGCTGAAATTGTTCGTACCCCGGCTTCTGCGAATTTCGACAATCCTGATTCATTGTTTCTAGTATCGGAAAAATTAAAAAATGAAATTGGTCCATCTGCGCATATCATGAATCAATATACCAATC]
[-] EMBL CD164958             [  atttacTCAATAACATATCTACTATTATGAATAGTGATTGGAAAAGGCCAGATTNACCAAGCAAATGTACATTCTCTNTAGACCAATCCATAAATGAAAGTCCTCATCATCATACTCCAATTCCCAAGAGGAATAAAATTATAAAAAAGTCATTAGAATTAATTGGTAATACACCTTTAATTCAACTTGATCGAATTGCAAAGCATGAAGATATAGAATGTGAACTTTTAGGAAAATGTGAATTTCTTAATATTGGAGGTAGTGTTAAAGATAGAATTGGAAAACGTATGATTGAAGAGGCTGAATTGGAAGGTAAACTGAAGCCTGGTGATACAATTATTGAACCCACCTCT GAAATACTGG                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD060792             [                                    gcaggGGAAAAGGCCAGATTTACCAAGCAAATGTACATTTTCTTTAGACCAATCCATAAATGAAAGTCCTGGTGATCATATTCCAATTCCCAAGAGGAATAAAATTATAAAAAAGTCATTAGAATTAATTGGTAATACACCTTTAATTCAACTTGATCGAATTGCAAAGCATGAAGATATAGAATGTGAACTTTTAGGAAAATGTGAATTTCTTAATATTGGAGGTAGTGTTAAAGATAGAATTGGAAAACGTATGATTGAAGAGGCTGAATTGGAAGGTAAACTGAAGCCTGGTGATACAATTATTGAACCCACCTCTGGAAATACTGGTATTGGATTGGCGCTTACTGCTGCTCTTAAAGGTTACCGATGTATAATTGTAATGTCAAACAAAATGAGTAGTGAAAAGGA                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD061032             [                                                  CAGATTTACCAAGCAAATGTACATTCTCTTTAGACCAATCCATAAATGAAAGTCCTCATCATCATATTCCAATTCCCAAGAGGAATAAAATTATAAAAAAGTCATTAGAATTAATTGGTAATACACCTTTAATTCAACTTGATCGAATTGCAAAGCATGAAGATATAGAATGTGAACTTTTAGGAAAATGTGAATTTCTTAATATTGGAGGTAGTGTTAAAGATAGAATTGGAAAACGTATGATTGAAGAGGCTGAATTGGAAGGTAAACTGAAGCCTGGTGATACAATTATTGAACCCACCTCTGGAAATACTGGTATTGGATTGGCGCTTACTGCTGCTCTTAAAGGTTACCGATGTATAATTGTAATGTCAGACAAAATGAGTAGTGAAAAGGAATCGTATTTACGATGCCTTGGAGCTGAAATTGTTCGTACCCCGGCTTCTGCGAA                                                                                            ]
[+] EMBL CD061031             [                                                  CAGATTTACCAAGCAAATGTACATTCTCTTTAGACCAATCCATAAATGAAAGTCCTCATCATCATATTCCAATTCCCAAGAGGAATAAAATTATAAAAAAGTCATTAGAATTAATTGGTAATACACCTTTAATTCAACTTGATCGAATTGCAAAGCATGAAGATATAGAATGTGAACTTTTAGGAAAATGTGAATTTCTTAATATTGGAGGTAGTGTTAAAGATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD153319             [                                                                             CTTTAGAGCAATCCATAAATGAAAGTCCTCATCATCATATTCCAATTCCCAAGAGGAATAAAATTATAAAAAAGTCATCAGAATTAATTGGTAATACACCTTTAATTCAACTTGATCGAATTGCAAAGCATGAAGATATAGAATGTGAACTTTTAGGAAAATGTGAATTTCTTAATATTGGAGGTAGTGTTAAAGATAGAATTGGAAAACGTATGATTGAAGAGGCTGGATTGGAAGGTAAACTGAAGCCTGGTGATACAATTATTGAACCCACCTCTGGAAATACTGGTATTGGATTGGCGCTTACTGCTGCTCTTAAAGGTTACCGATGTATAATTGTAATGTCAGACAAAATGAGTAGTGAAAAGGAATCGTATTTACGATGCCTTGGAGCTGAAATTGTTCGTACACCGGCTTCTGCGAATTTCGACAATCCTGATTCATTGTTTCTAGTATCAGAAAAATTAAAAAATGAAATTGGTCCATCTGCGCATATCATGAATCAATATACCAATC]
[-] EMBL CD061003             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCCTCCTCTGGAAATACTGGTATTGGATTGGCGCATACTGCTGCTCTTAAAGGTTACCGATGTATCATTGTAATGTCAGACAAAATGAGTAGTGAAAAGGAATCGTATTTACAATGCATTGGAGCTGTAATTGTTCGTACCCCGGCTTCTGCGAATTTCGACAATCC                                                                                ]




>consensus_9011#0
GTNTTCTATCAAAATCACAGAGTATTATGAATAGTGATTGGAAAAGGCCAGATTTACCAA
GCAAATGTACATTCTCTTTAGACCAATCCATAAATGAAAGTCCTCATCATCATATTCCAA
TTCCCAAGAGGAATAAAATTATAAAAAAGTCATTAGAATTAATTGGTAATACACCTTTAA
TTCAACTTGATCGAATTGCAAAGCATGAAGATATAGAATGTGAACTTTTAGGAAAATGTG
AATTTCTTAATATTGGAGGTAGTGTTAAAGATAGAATTGGAAAACGTATGATTGAAGAGG
CTGAATTGGAAGGTAAACTGAAGCCTGGTGATACAATTATTGAACCCACCTCTGGAAATA
CTGGTATTGGATTGGCGCTTACTGCTGCTCTTAAAGGTTACCGATGTATAATTGTAATGT
CAGACAAAATGAGTAGTGAAAAGGAATCGTATTTACGATGCCTTGGAGCTGAAATTGTTC
GTACCCCGGCTTCTGCGAATTTCGACAATCCTGATTCATTGTTTCTAGTATCAGAAAAAT
TAAAAAATGAAATTGGTCCATCTGCGCATATCATGAATCAATATACCAATC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)