cluster # 9057

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Schistosoma mansoni
cluster # 9057 cluster # 9057 Sequences # 8 consensus # 2

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consensus_9057#0 length = 928 sequences # 5

consensus_9057#1 length = 745 sequences # 3

consensusID : consensus_9057#0
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Sequences nbr = 5
consensus length = 928
fasta sequence

                              [GCCAATATTCGGCACGAGGCGAAACATTCGTCCAGTACTACCTCAATACCTCTTGTTCATGTTCTTTTTCGAAGATCTGGATTTACTCGAATTGCAGGAGAATGAGTTTAACCTGGTAGCTTGCGTCAAAGTCACACGTCATGGTTAGTACCGAACCTGGTTACTCTTTTTTGGATCCAGGTACCGCTGTTGCTGTTCTGTCTGTGTGGAACAATCATAAAATCCCTGAAGAAATGTATTAGTGTTAAGTATTACAGGGGTACAAGACGGAAACACTGCCGCATGGGCCAATTCATCGGGGTCGATTGAGGAATCCTA-TTTAGTCATCCTCGACTAGGTTCAAAAGACTGTCTGGAGACCAGTGACCTGTCGTCGTTTGGACAGAGCTCAGTGGCGTTTCACTGGTTGTATATTCTGGTCGTTTGAATGACTTTATCAGTGAGTGCAGACCATACGACATAACTATCAGTCCGGAACATCGTTTCTGCAAGATCTATATTTGTATGCTCATGTGGGAATATGGAGAAAATTCCTCCATATCTGTTTTTCCTTATCTCTAGCTACTTGTATATGTTATTTTGATTATTGTCTGTATTTTGCATATTGATTCTCAATCTTGAGATTAATTGCAGTTATTATTACTATATTTTCTANAAATTTTTGATCCCACTATCCATCAGATGTCATTGGATCTTTAATACCACTTATTTTCCTTGTTTTATGCGCTCTCCGATTACTTGCCCGTTCAATTTTCTTTTGACCAATGCCTTGCTTGGAAGGTAATTGAACAGGCCTTTTTGTTTTGGACTTGCTTTTTATTGGAATGCTTTTTTTTGCCCCGTTTTTTCAGTGGACTTGGAAAACCAAGCCCCCCCCGGGCCAATTTTTTTCTATTTCCTAAATTTTAAATCCCCACNNAAATTTTTTT]

[+] EMBL CD083174             [GCCAATATTCGGCACGAGGCGAAACATTCGTCCAGTACTACCTCAATACCTTTTGTTCATGTTCTTTTTCGAAGATCTGGATTTACTCGAATTGCAGGAGAATGAGTTTAACCTGGTAGCTTGCGTCAAAGTCACACGTCATGGTTAGTACCGAACCTGGTTACTCTTTTTTGGATCCAGGTACCGTTGTTGCTGTTCTGTCTGTGTGGAACAATCATAAAATCCCTGAAGAAATGTATTAGTGTTAAGTATTACAGGGGTACAAGACGGAAACACTGCCGCATGGGCCAATTCATCGGGGTCGATTGAGGAATCCTA TTTAGTCATCCTCGACTAGGTTCAAAAGACTGTCTGGAGACCAGTGACCTGTCGTCGTTTGGACAGAGCTCAGTGGCGTTTCACTGGTTGTATATTCTGGTCGTTTGAATGACTTTATCAGTGAGTGCAGACCATACGACATAACTATCAGTCCGGAACATCGTTTCTGCAAGATCTATATTTGTATGCTCATGTGGGAATATGGAGAAAATTCCTCCATATCTGTTTTTCCTTATCTCTAGCTACTTGTATATGTTATTTTGATTATTGTCTGTATTTTGCATATTGATTCTCAATCTTGAGATTAATTGCAGTTATTATTACTATA                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD080034             [                   aGAAACATTCGTCCAGTACTACCTCAATACCTCTTGTTCATGTTCTTTTTCGAAGATCTGGATTTACTCGAATTGCAGGAGAATGAGTTTAACCTGGTAGCTTGCGTCAAAGTCACACGTCATGGTTAGTACCGAACCTGGTTACTCTTTTTTGGATCCAGGTACCGTTGTTGCTGTTCTGTCTGTGTGGAACAATCATAAAATCCCTGAAGAAATGTATTAGTGTTAAGTATTACAGGGGTACAAGACGGAAACACTGCCGCATGGGCCAATTCATCGGGGTCGATTGAGGAAT CTATTTTAGTCATCCTCGACTAGGTTCAAAAGACTGTCTGGAGACCAGTGACCTGTCGTCGTTTGGACAGAGCTCAGTGGCGTTTCACTGGTTGTATATTCTGGTCGTTTGAATGACTNTATCAGTGAGTGCAGACCATACGACATAACTATCAGTCCGGAACATCGTTTCTGCAAGATCTATATTTGTATGCTCATGTGGGAATATGGAGAAAATTCCTCCATATCTGTTNTTCCTTATCTCTAGCTACTTGNATATGTTATTTTGATTATTGGCTGAATTTTGCATATTGATTCTCAATCTTGAAATTAATTGCAGGTATTATTACTATATTTTCTANAAATTTTTGATCCCACTATCCATCAGATGTCATTGGATCTTTAATACCACTTATTTTCCTTGTTTTATGCGCTCTCCGATTACTTGCCCGTTCAATTTTCTTTTGACCAATGCCTTGCTTGGAAGGTAATTGAACAGGCCTTTTTGTTTTGGACTTGCTTTTTATTGGAATGCTTTTTTTTGCCCCGTTTTTTCAGTGGACTTGGAAAACCAAGCCCCCCCCGGGCCAATTTTTTTCTATTTCCTAAATTTTAAATCCCCACNNAAATTTTTTT]
[-] EMBL CD144652             [                                                CCTCTTGTTCATGTTCTTTTTCGAAGATCTGGATTTACTCTAATTGCAGGAGAATGAGTTTAACCTGGTAGCTTGCGTCAAAGTCACACGTCATGGTTAGTGCAGAACCTGGTTACT TTTTTTGGATCCAGGTACCGCTGTTGCTGTTCTGTCTGTGTGGAACAATCATAAAATCCCTGAAGAAATGTATTAGTGTTAAGTATTACAGGGGTACAAGACGGAAACACTGCCGCATGGGCCAATTCATCGGGGTCGATTGAGGAATCCTA TTTAGTCATCCTCGACTAGGTTCAAAAGACTGTCTGGAGACCAGTGACCTGTCGCCGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD184013             [                                                                                                                                            ATGGTTAGTACCGAACCTGGTTACTCTTTTTTGGATCCAGGTACCGCTGTTGCTGTTCTGTCTGTGTGGAACAATCATAAAATCCCTGAAGAAATGTATTAGTGTTAAGTATTACAGGGGTACAAGACGGAAACACTGCCGCATGGGCCAATTCATCGGGGTCGATTGAGGAATCCTA TTTAGTCATCCTCGACTAGGTTCAAAAGACTGTCTGGAGACCAGTGACCTGTCGTCGTTTGGACAGAGCTCAGTGGCGTTTCACTGGTTGTATATTCTGGTCGTTTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD184089             [                                                                                                                                            ATGGTTAGTACCGAACCTGGTTACTCTTTTTTGGATCCAGGTACCGCTGTTGCTGTTCTGTCTGTGTGGAACAATCATAAAATCCCTGAAGAAATGTATTAGTGTTAAGTATTACAGGGGTACAAGACGGAAACACTGCCGCATGGGCCAATTCATCGGGGTCGATTGAGGAATCCTA TTTAGTCATCCTCGACTAGGTTCAAAAGACTGTCTGGAGACCAGTGACCTGTCGTCGTTTGGACAGAGCTCAGTGGCGTTTCACTGGTTGTATATTCTGGTCGTTTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]




>consensus_9057#0
GCCAATATTCGGCACGAGGCGAAACATTCGTCCAGTACTACCTCAATACCTCTTGTTCAT
GTTCTTTTTCGAAGATCTGGATTTACTCGAATTGCAGGAGAATGAGTTTAACCTGGTAGC
TTGCGTCAAAGTCACACGTCATGGTTAGTACCGAACCTGGTTACTCTTTTTTGGATCCAG
GTACCGCTGTTGCTGTTCTGTCTGTGTGGAACAATCATAAAATCCCTGAAGAAATGTATT
AGTGTTAAGTATTACAGGGGTACAAGACGGAAACACTGCCGCATGGGCCAATTCATCGGG
GTCGATTGAGGAATCCTATTTAGTCATCCTCGACTAGGTTCAAAAGACTGTCTGGAGACC
AGTGACCTGTCGTCGTTTGGACAGAGCTCAGTGGCGTTTCACTGGTTGTATATTCTGGTC
GTTTGAATGACTTTATCAGTGAGTGCAGACCATACGACATAACTATCAGTCCGGAACATC
GTTTCTGCAAGATCTATATTTGTATGCTCATGTGGGAATATGGAGAAAATTCCTCCATAT
CTGTTTTTCCTTATCTCTAGCTACTTGTATATGTTATTTTGATTATTGTCTGTATTTTGC
ATATTGATTCTCAATCTTGAGATTAATTGCAGTTATTATTACTATATTTTCTANAAATTT
TTGATCCCACTATCCATCAGATGTCATTGGATCTTTAATACCACTTATTTTCCTTGTTTT
ATGCGCTCTCCGATTACTTGCCCGTTCAATTTTCTTTTGACCAATGCCTTGCTTGGAAGG
TAATTGAACAGGCCTTTTTGTTTTGGACTTGCTTTTTATTGGAATGCTTTTTTTTGCCCC
GTTTTTTCAGTGGACTTGGAAAACCAAGCCCCCCCCGGGCCAATTTTTTTCTATTTCCTA
AATTTTAAATCCCCACNNAAATTTTTTT

consensusID : consensus_9057#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 745
fasta sequence

                              [TCGGCACGAGGCCGAACCTGGTTACTCTTTTTTGGATCCGGTACCGTTGTTGCTGTTCTGTCTGGAGACCAGTGACCTGTCGTCGTTTGGACAGAGCTCAGTGGCGTTTCACTGGTTGTATATTCTGGTCGTTTGAATGACTTTATCAGTGAGTGCAGACCATACGACATAACTATCAGTCTGGAACATCGTTTCTGCAAGATCTATATTTGTATGCTCATGTGGGAATATGGAGAAAATTCCTCCATATCTGTTTTTCCTTATCTCTAGCTACTTGTATATGTTATTTTGATTATTGTCTGTATTTTGCATATTGATTCTCAATCTTGAGATTAATTGCAGTTATTATTACTATATTTTCTAGAAATTTTGAATCCCAACTATCCATCAGATGTCATTGAGTCTTTTAATAACCACTATATTTTGCTTTGTTTTCATGGCGCTCTCCGTATTCAACTGCCGTGTTTCGATTATTACTTTTTGAACTAATTGCCTCTGCATTGTGAGGTTGATCTTGAAGCAAGTGCTCTGTTTGTTTTCGGGACGTTTGCTATTATTCATTGGCAATTGCACTTTTTTGTATGGTCGTCGTTTTCATGTCGATTGCTGACATTTGGAGTAACCTGAATTGACCTACCCTACTCGGGTACCATAATTTTTATCTATCCTTACATTTTCCCTCATAGCATCTCTCCTGAGTATCCTCTGCAACGTTCTGAACGTTTGTTACGTTATTGTATGGAAG]

[+] EMBL CD082776             [TCGGCACGAGGCCGAACCTGGTTACTCTTTTTTGGATCCGGTACCGTTGTTGCTGTTCTGTCTGGAGACCAGTGACCTGTCGTCGTTTGGACAGAGCTCAGTGGCGTTTCACTGGTTGTATATTCTGGTCGTTTGAATGACTTTATCAGTGAGTGCAGACCATACGACATAACTATCAGTCTGGAACATCGTTTCTGCAAGATCTATATTTGTATGCTCATGTGGGAATATGGAGAAAATTCCTCCATATCTGTTTTTCCTTATCTCTAGCTACTTGTATATGTTATTTTGATTATTGTCTGTATTTTGCATATTGATTCTCAATCTTGAGATTAATTGCAGTTATTATTACTATATTTTCTAGAAATTTTGAATCCCAACTATCCATCAGATGTCATTGAGTCTTTTAATAACCACTATATTTTGCTTTGTTTTCATGGCGCTCTCCGTATTCAACTGCCGTGTTTCGATTATTACTTTTTGAACTAATTGCCTCTGCATTGTGAGGTTGATCTTGAAGCAAGTGCTCTGTTTGTTTTCGGGACGTTTGCTATTATTCATTGGCAATTGCACTTTTTTGTATGGTCGTCGTTTTCATGTCGATTGCTGACATTTGGAGTAACCTGAATTGACCTACCCTACTCGGGTACCATAATTNTTATCTATCCTTACATTNTCCNTCATAGCATCTCTCCTGAGTATCCTCTGCAACGTNCTGAACGTTTTGTACGTTATTGTATGGga ]
[-] EMBL CD076368             [                                                                                                                                                    GTGAGTGCAGACCATACGACATAACTATCAGTCTGGAACATCGTTTCTGCAAGATCTATATTTGTATGCTCATGTGGGAATATGGAGAAAATTCCTCCATATCTGTTTTTCCTTATCTCTAGCTACTTGTATATGTTATTTTGATTATTGTCTGTATTTTGCATATTGATTCTCAATCTTGAGATTAATTGCAGTTATTATTACTATATTTTCTAGAAATTTTGAATCCCAACTATCCATCAGATGTCATTGAGTCTTTTAATAACCACTATATTTTGCTTTGTTTTCATGGCGCTCTCCGTATTCAACTGCCGTGTTTCGATTATTACTTTTTGAACTAATTGCCTCTGCATTGTGAGGTTGATCTTGAAGCAAGTGCTCTGTTTGTTTTCGGGACGTTTGCTATTATTCATTGGCAATTGCACTTTTTTGTATGGTCGTCGTTTTCATGTCGATTGCTGACATTTGGAGTAACCTGAATTGACCTACCCTACTCGGGTACCATAATTTTTATCTATCCTTACATTTTCCCTCATAGCATCTCTCCTGAGTATCCTCTGCAACGTTCTGAACGTTTGTTACGTTATTGTATGGAAG]
[-] EMBL CD076747             [                                                                                                                                                                         TAACTATCAGTCCGGAACATCGTTTCTGCAAGATCTATATTTGTATGCTCATGTGGGAATATGGAGAAAATTCCTCCATATCTGTTTTTCCTTATCTCTAGCTACTTGTATATGTTATTTTGATTATTGTCTGTATTTTGCATATTGATTCTCAATCTTGAGATTAATTGCAGTTATTATTACTATATTTTCTAGAAATTTTGAATCCCAACTATCCATCAGATGTCATTGAGTCTTTTAATAACCACTATATTTTGCTTTGTTTTCATGGCGCTCTCCGTATTCAACTGCCGTGTTTCGATTATTACTTTTTGAACTAATTGCCTCTGCATTGTGAGGTTGATCTTGAAGCAAGTGCTCTGTTTGTTTTCGGGACGTTTGCTATTATTCATTGGCAATTGCACTTTTTTGTATGGTCGTCGTTTTCATGTCGATTGCTGACATTTGGAGTAACCTGAATTGACCTACCCTACTCGGGTACCATAATTTTTATCTATCCTTACATTTTCCCTCATAGCATCTCTCCTGAGTATCCTCTGCAACGTTCTGAACGTTTGTTACGTTATTGTATGGAAG]




>consensus_9057#1
TCGGCACGAGGCCGAACCTGGTTACTCTTTTTTGGATCCGGTACCGTTGTTGCTGTTCTG
TCTGGAGACCAGTGACCTGTCGTCGTTTGGACAGAGCTCAGTGGCGTTTCACTGGTTGTA
TATTCTGGTCGTTTGAATGACTTTATCAGTGAGTGCAGACCATACGACATAACTATCAGT
CTGGAACATCGTTTCTGCAAGATCTATATTTGTATGCTCATGTGGGAATATGGAGAAAAT
TCCTCCATATCTGTTTTTCCTTATCTCTAGCTACTTGTATATGTTATTTTGATTATTGTC
TGTATTTTGCATATTGATTCTCAATCTTGAGATTAATTGCAGTTATTATTACTATATTTT
CTAGAAATTTTGAATCCCAACTATCCATCAGATGTCATTGAGTCTTTTAATAACCACTAT
ATTTTGCTTTGTTTTCATGGCGCTCTCCGTATTCAACTGCCGTGTTTCGATTATTACTTT
TTGAACTAATTGCCTCTGCATTGTGAGGTTGATCTTGAAGCAAGTGCTCTGTTTGTTTTC
GGGACGTTTGCTATTATTCATTGGCAATTGCACTTTTTTGTATGGTCGTCGTTTTCATGT
CGATTGCTGACATTTGGAGTAACCTGAATTGACCTACCCTACTCGGGTACCATAATTTTT
ATCTATCCTTACATTTTCCCTCATAGCATCTCTCCTGAGTATCCTCTGCAACGTTCTGAA
CGTTTGTTACGTTATTGTATGGAAG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9057#0      GCCAATATTCGGCACGAGGCGAAACATTCGTCCAGTACTACCTCAATACCTCTTGTTCAT 60
consensus_9057#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9057#0      GTTCTTTTTCGAAGATCTGGATTTACTCGAATTGCAGGAGAATGAGTTTAACCTGGTAGC 120
consensus_9057#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9057#0      TTGCGTCAAAGTCACACGTCATGGTTAGTACCGAACCTGGTTACTCTTTTTTGGATCCAG 180
consensus_9057#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9057#0      GTACCGCTGTTGCTGTTCTGTCTGTGTGGAACAATCATAAAATCCCTGAAGAAATGTATT 240
consensus_9057#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9057#0      AGTGTTAAGTATTACAGGGGTACAAGACGGAAACACTGCCGCATGGGCCAATTCAT-CGG 299
consensus_9057#1      ---------------------------------------------------TCGGCACGA 9
                                                                         *     ** 

consensus_9057#0      GGTCGATTGAGGAATCCTATTTAGTCATCCTCGACTAGGTTCAAAAGACTGTCTGGAGAC 359
consensus_9057#1      GGCCGAACCTGGTTACTCTTTTTTGGATCCGGTACCGTTGTTGCTGTTCTGTCTGGAGAC 69
                      ** ***    **   *   ***    ****   **     *       ************

consensus_9057#0      CAGTGACCTGTCGTCGTTTGGACAGAGCTCAGTGGCGTTTCACTGGTTGTATATTCTGGT 419
consensus_9057#1      CAGTGACCTGTCGTCGTTTGGACAGAGCTCAGTGGCGTTTCACTGGTTGTATATTCTGGT 129
                      ************************************************************

consensus_9057#0      CGTTTGAATGACTTTATCAGTGAGTGCAGACCATACGACATAACTATCAGTCCGGAACAT 479
consensus_9057#1      CGTTTGAATGACTTTATCAGTGAGTGCAGACCATACGACATAACTATCAGTCTGGAACAT 189
                      **************************************************** *******

consensus_9057#0      CGTTTCTGCAAGATCTATATTTGTATGCTCATGTGGGAATATGGAGAAAATTCCTCCATA 539
consensus_9057#1      CGTTTCTGCAAGATCTATATTTGTATGCTCATGTGGGAATATGGAGAAAATTCCTCCATA 249
                      ************************************************************

consensus_9057#0      TCTGTTTTTCCTTATCTCTAGCTACTTGTATATGTTATTTTGATTATTGTCTGTATTTTG 599
consensus_9057#1      TCTGTTTTTCCTTATCTCTAGCTACTTGTATATGTTATTTTGATTATTGTCTGTATTTTG 309
                      ************************************************************

consensus_9057#0      CATATTGATTCTCAATCTTGAGATTAATTGCAGTTATTATTACTATATTTTCTANAAATT 659
consensus_9057#1      CATATTGATTCTCAATCTTGAGATTAATTGCAGTTATTATTACTATATTTTCTAGAAATT 369
                      ****************************************************** *****

consensus_9057#0      TTTGATCCCA-CTATCCATCAGATGTCATTGGATCTTT-AATA-CCACT-TATTTT-CCT 714
consensus_9057#1      TTGAATCCCAACTATCCATCAGATGTCATTGAGTCTTTTAATAACCACTATATTTTGCTT 429
                      **  ****** ********************  ***** **** ***** ****** * *

consensus_9057#0      TGTTTT-ATG-CGCTCTCCGA--TTACTTGCC------CGTTCAATTTTCTTTTGACCAA 764
consensus_9057#1      TGTTTTCATGGCGCTCTCCGTATTCAACTGCCGTGTTTCGATTATTACTTTTTGAACTAA 489
                      ****** *** *********   * *  ****      ** * * *  * ***  ** **

consensus_9057#0      T-GCCT-TGC-TTGGAAGGTAA---TTGAA-CAGGC---CTTTTTGTTTT--GGAC---- 808
consensus_9057#1      TTGCCTCTGCATTGTGAGGTTGATCTTGAAGCAAGTGCTCTGTTTGTTTTCGGGACGTTT 549
                      * **** *** ***  ****     ***** ** *    ** ********  ****    

consensus_9057#0      -TTGCTTTTTATTGGAA--TGCTTTTTTTTGCCCCGTT----TTTTCA-GTGGACTTGGA 860
consensus_9057#1      GCTATTATTCATTGGCAATTGCACTTTTTTGTATGGTCGTCGTTTTCATGTCGATTGCTG 609
                        *  * ** ***** *  ***  *******    **     ****** ** ** *    

consensus_9057#0      AAACCAAGCCCCCCCCG----GGCCAATTTTTTTCTATTTCCTAAATTTTAAATCCCCAC 916
consensus_9057#1      ACATTTGGAGTAACCTGAATTGACCTACCCTACTCGGGTACCATAATTTTTA-TCTATCC 668
                      * *    *     ** *    * ** *   *  **   * **  ****** * **    *

consensus_9057#0      NNAAATTTTTTT------------------------------------------------ 928
consensus_9057#1      TTACATTTTCCCTCATAGCATCTCTCCTGAGTATCCTCTGCAACGTTCTGAACGTTTGTT 728
                        * *****                                                   

consensus_9057#0      -----------------
consensus_9057#1      ACGTTATTGTATGGAAG 745