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Schistosoma mansoni
cluster # 9087 cluster # 9087       Sequences # 8       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9087#0 length = 579 sequences # 8  
consensusID : consensus_9087#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 579
fasta sequence 
                              [TTTAATATTCGTGGTTGACAGTAATGACACTGATCGCATTGGGGAAGCAAAGGACGAGTTGTTCCGTATGTTACAAGAAGATGAGTTACGAGATA-CACTT--CTTTTGGTCTTTGCAAACAAACAAGATCTACCCAATGCTTTGAAACCTACGGAACTTACAGATAAATTAGGACTACATCAATTACGGAACCGCACATGGTATATTCAAGGGACATGTGCTACAAACAGTTCCGGTTTATTTGAGGGTTTAGATTGGCTCTGTCAAAATTTAGGTGGAAAGAATTAATAAGTTTTTTGCATTTTCATTCAAAGTGCTGTGAGACAACGGCGATTGGCCTTTTTTCTTCTTACTTCACATGTTTATTGGTTTCATAAAATCTGTTGTGTACATTTAATGTAACCATTTAACTAGATTTCCGCAATAATA-GACAAGTGGATTTCGGCCCATTCGTCGCTTGCATTTTTCCATTTTCTTTTCAAATTTGTTAATGTTTTAATGCAAAAATTCAATGTCTTATACGTGACTAACGTTACATTTCATATTGCGATATCT-AATTGTAAACTTGACTAATACAATAT]

[+] EMBL CD145791             [TTTAATATTCGTGGTTGACAGTAATGACACTGATCGCATTGGGGAAGCAAAGGACGAGTTGTTCCGTATGTTACAAGAAGATGAGTTACGAGATA CACTT  CTTTTGGTCTTTGCAAACAAACAAGATCTACCCAATGCTTTGAAACCTACGGAACTTACAGATAAATTAGGACTACATCAATTACGGAACCGCACATGGTATATTCAAGGGACATGTGCTACAAACAGTTCCGGTTTATTTGAGGGTTTAGATTGGCTCTGTCAAAATTTAGGTGGAAAGAATTAATAAGTTTTTTGCATTTTCATTCAAAGTGCTGTGAGACAACGGCGATTGGCCTTTTTTCTTCTTACTTCACATGTTTATTGGTTTCATAAAATCTGTTGTGTACATTTAATGTAACCATTTAACTAGATTTCCGCAATAATA GACAAGTGGATTTCGGCCCATTCGTCGCTTGCATTTTTCCATTTTCTTTTCANATTTGTTAATGTTTTAATGCANAAATTCAATGTCTTATACGTGACTAACGTTACATTTCATATTGCGATATCTAAATTG                     ]
[+] EMBL CD142686             [                                                                  TATGTTACAAGAAGATGAGTTACGAGATA CACTT  CTTTTGGTCTTTGCAAACAAACAAGATCTACCCAATGCTTTGAAACCTACGGAACTTACAGATAAATTAGGACTACATCAATTACGGAACCGCACATGGTATATTCAAGGGACATGTGCTACAAACAGTTCCGGTTTATTTGAGGGTTTAGATTGGCTCTGTCAAAATTTAGGTGGAAAGAATTAATAAGTTTTTTGCATTTTCATTCAAAGTGCTGTGAGACAACGGCGATTGGCCTTTTTTCTTCTTACTTCAC                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD142547             [                                                                  TATGTTACAAGAAGATGAGTTACGAGATA CACTT  CTTTTGGTCTTTGCAAACAAACAAGATCTACCCAATGCTTTGAAACCTACGGAACTTACAGATAAATTAGGACTACATCAATTACGGAACCGCACATGGTATATTCAAGGGACATGTGCTACAAACAGTTCCGGTTTATTTGAGGGTTTAGATTGGCTCTGTCAAAATTTAGGTGGAAAGAATTAATAAGTTTTTTGCATTTTCATTNCAAGTGCTGTGAGACAACGGC                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD145824             [                                                                                     TTACGAGATA CACTC  CTTTTGGTCTTTGCAAACAAACAAGATCTACCCAATGCTTTGAAACCTACGGAACTTACAGATAAATTAGGACTACATCAATTACGGAACCGCACATGGTATATTCAAGGGACATGTGCTACAAACAGTTCCGGTTTATTTGAGGGTTTAGATTGGCTCTGTCAAAATTTAGGTGGAAAGAATTAATAAGTTTTTTGCATTTTCATTCAAAGTGCTGTGAGACAACGGCGATTGGCCTTTTTTCTTCTTACTTCACATGTTTATTGGTTTCATAAAATCTGTTGTGTACATTTAATGTAACCATTTAACTAGATTTCCGCAATAATA GACAAGTGGATTTCGGCCCATTCGTCGCTTGCATTTTTCCATTTTCTTTTCAAATTTGTTAATGTTTTAATGCAAAAATTCAATGTCTTATACGTGACTAACGTTACATTTCATATTGCGATATCT AATTGTAAA                 ]
[+] EMBL CD080434             [                                                                                         GAGATACCACTTNNCTTTTGGTCTTTGCAAACAAACAAGATCTACCCAATGCTTTGAAACCTACGGAACTTACAGATAAATTAGGACTACATCAATTACGGAACCGCACATGGTATATTCAAGGGACATGTGCTACAAACAGTTCCGGTTTATTTGAGGGTTTAGATTGGCTCTGTCAAAATTTAGGTGGAAAGAATTAATAAGTTTTTTGCATTTTCATTCAAAGTGCTGTGAGACAACGGCGATTGGCCTTTTTTCTTCTTACTTCACATGTTTATTGGTTTCATAAAATCTGTTGTGTACATTTAATGTAACCATTTAACTAGATTTCCGCAATAATA GACAAGTGGATTTCGGCCCATTCGTCGCTTGCATTTTTCCATTTTCTTTTCAAATTTGTTAATGTTTTAATGCAAAAATTCAATGTCTTATACGTGACTAACGTTACATTTCATATTGCGATATCT AATTGTAAACTTGACTAATACAATA ]
[-] EMBL CD074347             [                                                                                          AGATA CACTT  CTTTTGGTCTTTGCAAACAAACAAGATCTACCCAATGCTTTGAAACCTACGGAACTTACAGATAAATTAGGACTACATCAATTACGGAACCGCACATGGTATATTCAAGGGACATGTGCTACAAACAGTTCCGGTTTATTTGAGGGTTTAGATTGGCTCTGTCAAAATTTAGGTGGAAAGAATTAATAAGTTTTTTGCATTTTCATTCAAAGTGCTGTGAGACAACGGCGATTGGCCTTTTTTCTTCTTACTTCACATGTTTATTGGTTTCATAAAATCTGTTGTGTACATTTAATGTAACCATTTAACTAGATTTCCGCAATAATA GACAAGTGGATTTCGGCCCATTCGTCGCTTGCATTTTTCCATTTTCTTTTCAAATTTGTTAATGTTTTAATGCAAAAATTCAATGTCTTATACGTGACTAACGTTACATTTCATATTGCGATATCT AATTGTAAACTTGACTAATACAATAT]
[-] EMBL CD074526             [                                                                                          AGATA CACTT  CTTTTGGTCTTTGCAAACAAACAAGATCTACCCAATGCTTTGAAACCTACGGAACTTACAGATAAATTAGGACTACATCAATTACGGAACCGCACATGGTATATTCAAGGGACATGTGCTACAAACAGTTCCGGTTTATTTGAGGGTTTAGATTGGCTCTGTCAAAATTTAGGTGGAAAGAATTAATAAGTTTTTTGCATTTTCATTCAAAGTGCTGTGAGACAACGGCGATTGGCCTTTTTTCTTCTTACTTCACATGTTTATTGGTTTCATAAAATCTGTTGTGTACATTTAATGTAACCATTTAACTAGATTTCCGCAATAATA GACAAGTGGATTTCGGCCCATTCGTCGCTTGCATTTTTCCATTTTCTTTTCAAATTTGTTAATGTTTTAATGCAAAAATTCAATGTCTTATACGTGACTAACGTTACATTTCATATTGCGATATCT AATTGTAAACTTGACTAATACAATAT]
[-] EMBL AI976051             [                                                                                                                                                                                          ACGGAACCGCACATGGTATATTCAAGGGACATGTGCTACAAACAGTTCCGGTTTATTTGAGGGTTTAGATTGGCTCTGTCAAAATTTAGGTGGAAAGAATTAATAAGTTTTTTGCATTTTCATTCAAAGTGCTGTGAGACAGCGGCGATTGGCCTTTTTTTTTCTTACTTCACATGTTTATTGGTTTCATAAAATCTGTTGTGTACATTTAATGTAGCCATTTAACTAGATTTCCGCAATAATATGACAAGTGGATTTCGGCCCATTGGTCGCTTGCATTTTTCCATTTTCTTTTCAAATTTGTTAATGTTTTAATGCAAAAATTCAATGTCTTATACGTGACCAGCGTTACATTTCATATTGCGATATTT AATTGTAAACTTGACTAATACAATAT]




>consensus_9087#0
TTTAATATTCGTGGTTGACAGTAATGACACTGATCGCATTGGGGAAGCAAAGGACGAGTT
GTTCCGTATGTTACAAGAAGATGAGTTACGAGATACACTTCTTTTGGTCTTTGCAAACAA
ACAAGATCTACCCAATGCTTTGAAACCTACGGAACTTACAGATAAATTAGGACTACATCA
ATTACGGAACCGCACATGGTATATTCAAGGGACATGTGCTACAAACAGTTCCGGTTTATT
TGAGGGTTTAGATTGGCTCTGTCAAAATTTAGGTGGAAAGAATTAATAAGTTTTTTGCAT
TTTCATTCAAAGTGCTGTGAGACAACGGCGATTGGCCTTTTTTCTTCTTACTTCACATGT
TTATTGGTTTCATAAAATCTGTTGTGTACATTTAATGTAACCATTTAACTAGATTTCCGC
AATAATAGACAAGTGGATTTCGGCCCATTCGTCGCTTGCATTTTTCCATTTTCTTTTCAA
ATTTGTTAATGTTTTAATGCAAAAATTCAATGTCTTATACGTGACTAACGTTACATTTCA
TATTGCGATATCTAATTGTAAACTTGACTAATACAATAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)