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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9135#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 718 fasta sequence
[CTCGAGGCCCAAAATTCGGCACGAGGGCGAAATTTGAAGTTTACGTTACCGTGCTTGGGATGACGTCTGGAACTGTTAGTATCAAAGAGTTGACCATCCCACAGCTTCAAGATCTTGCACGGCAATTCGAGCAAAAAGTTCAATTTATATCTGCTTCTATACAGCAACTCAAGTCTCTACAGGCTCAGTTCGTTGCCTCCAAAAATTGTCTGGGCGAGCTTAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGTGTTCCTGGGAAACTTTCTGATGCTTCGCATGTGCTTGTGGATATTGGAACTGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGTAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGG-AAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGACGTTCTGGATGCTAAAATTCAAGAGTTTATTAAAGTTCGAACAGCAGCGTGTCCTTGAATTGTTGACGTATGCTTTTTAGGCTCCTTTTCATTAGGATCCATCCATCTTATGGTTTTTGTGCTTACAGC-GAACGTTCATGCTTGATTGTGTATTCCATTATTGACAACTCAGAGTGTGTTTTGTTGTCCGGGACATAGTGTCTCCTAACAATGTCAATATCTGGAAAACTAAAAGCCTTGTAAATACATATTTTTGTT]
[+] EMBL CD079438 [CTCGAGGCCCAAAATTCGGCACGAGGGCGAAATTTGAAGTTTACGTTACCGTGCTTGGGATGACGTCTGGAACTGTTAGTATCAAAGAGTTGACCATCCCACAGCTTCAAGATCTTGCACGGCAATTCGAGCAAAAAGTTCAATTTATATCTGCTTCTATACAGCAACTCAAGTCTCTACAGGCTCAGTTCGTTGCCTCCAAAAATTGTCTGGGCGAGCTTAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGTGTTCCTGGGAAACTTTCTGATGCTTCGCATGTGCTTGTGGATATTGGAACTGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGTAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGG AAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGACGTTCTGGATGCTAAAATTCAAGAGTTTATTAAAGTTCGAACAGCAGCGTGTCCTTGAATTGTTGACGTATGCTTTTTAGGCTCCTTTTCATTAGGATCCATCCATCTTATGGTTTTTGTGCTTACAGC GAACGTTCATGCTTGATTGTGTATTCCATTATTGACAACTCAGAGTGTGTTTTGTTGTCCGGGACATAGTGTCTCCTAACAATGTCAATATCTGGGAAACTAANAGCCTTGTAAATACATATTc ]
[+] EMBL CD079449 [ AGGCCAANAATTCTGCACGAGGGCCAAATTTGAAGTTTACGTTACCGTGCTTGGGATGACGTCTGGAACTGTTAGTATCAAAGAGTTGACCATCCCACAGCTTCAAGATCTTGCACGGCAATTCGAGCAAAAAGTTCAATTTATATCTGCTTCTATACAGCAACTCAAGTCTCTACAGGCTCAGTTCGTTGCCTCCAAAAATTGTCTGGGCGAGCTTAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGAGTTCCTGGGAAACTTTCTGATGCTTCGCATGTGCTTGTGGATATTGGAACTGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGTAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGG AAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGACGTTCTGGATGCTAAAATTCAAGAGTTTATTAAAGTTCGAACAGCAGCGTGTCCTTGAATTGTTGACGTATGCTTTTTAGGCTCCTTTTCATTAGGATCCATCCATCTTATGGTTCTTGTGCTTACAGC GAACGTTCATGCTTGATTGAGTATTCCATTATTGACAACTCANAGTGTGTTTTGTTGTCCGGTACATAGTGTCTCCTAACAATGTCTATATCTGCAATACTAACAGCCTTGTAAATACATATNTCTGT ]
[-] EMBL CD167232 [ CGAGCAAAAAGTTCAATTTATATCTGCTTCTATACAGCAACTCAAGTCTCTACAGGCTCAGTTCGTTGCCTCCAAAAATTGTCTGGGCGAGCTTAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGTGTTCATGGGAAACTTTCTGATGCTTCGCATGTGCTTGTGGATATTGGAACTGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGTAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGGAAAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGACGTTCTGGATGCTAAAATca ]
[-] EMBL CD073709 [ GTTCAATTTATATCTGCTTTTATACAGCAACTCAAGTCTTTACAGGGTCAGTTCGTTGCCTCCAAAAATTGTCTGGGCGAGCTTAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGTGTTCCTGGGAAACTTTTTGATGCTTCGCATGTGCTTGTGGATATTGGAACTGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGTAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGG AAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGACGTTTTGGATGCTAAAATTCAAGAGTTTATTAAAGTTTGAACAGCAGCGTGTCCTTGAATTGTTGACGTATGCTTTTTAGGCTCCTTTTCATTAGGATCCATCCATTTTATGGTTTTTGTGCTTACAGC GAACGTTCATGCTTGATTGTGTATTCCATTATTGACAACTCAGAGTGTGTTTTGTTGTCCGGGACATAGTGTTTCCTAACAATGTCAATATTTGGAGAACTAAAAGCC TGTAAAAACATATTTT ]
[+] EMBL CD168895 [ agTTTATATCTGCTTCTATACAGCAACTCAAGTCTCTACAGGCTCAGTTCGTTGCCTCCAAAAATTGTCTGGGCGAGCTTAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGTGTTCCTGGGAAACTTTCTGATGCTTCGCATGTGCCTGTGGATGTTGGAACTGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCG ]
[-] EMBL CD073720 [ CCTCCAAAAAATGTCTGGGCGAGCTTAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGTGTTCCTGGGAAACTTTTTGATGCTTCGCATGTGCTTGTGGATATTGGAAATGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGGAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGG AAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGCCGTTTTGCATGTTAAAATTCAAGAGTTTATTAAAGTTCGAACACCAGCGTGTCCTTGAATTGTTCACGTATGCTTTTTAGGATCCTTTTCATTAGGATCCATCCCTCTTATGGTTTTTGTGCGTACAACTGAACGTTCACGGTTGATTGTGTATTCCACTATTGTCAACTCAAAGTGTGTTTTGTTGTCCAGGACATAGTGTCTCCTGACAATGTCAAAATTTGGCGATCTAAAAGCC TGTAAAAACCTATTTTGGTT]
[+] EMBL CD189737 [ TAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGTGTTCCTGGGAAACTTTCTGATGCTTCGCATGTGCTTGTGGATATTGGAACTGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGTAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGG AAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGACGTTCTGGATGCTAAAATTCAAGAGTTTATTAAAGTTCGAACAGCAGCGTGTCCTTGAATTGTTGACGTATGCTTTTTAGGCTCCTTTTCATTAGGATCCATCCATCATATGGTTTTTGTGCTTACAGC GAACATTCATGCTTGATTGTGTATTCCATTATTGACAACTCAGAGTGT ]
[+] EMBL CD082051 [ TGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGTAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGG AAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGACGTTCTGGATGCTAAAATTCAAGAGTTTATTAAAGTTCGAACAGCAGCGTGTCCTTGAATTGTTGACGTATGCTTTTTAGGCTCCTTTTCATTAGGATCCATCCATCTTATGGTTTTTGTGCTTACAGC GAACGTTCATGCTTGATTGTGTATTCCATTATTGACAACTCAGAGTGTGTTTTGTTGTCCGGGACATAGTGTCTCCTAACAATGTCAATATCTGGAAAACTAAAAGCC ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||