cluster # 9148

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Schistosoma mansoni
cluster # 9148 cluster # 9148 Sequences # 8 consensus # 2

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consensus_9148#0 length = 880 sequences # 5

consensus_9148#1 length = 605 sequences # 3

consensusID : consensus_9148#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 880
fasta sequence

                              [TAATTCGGCACGCCGGAATATATAGCTCTATGTACACATCTATTTTAGGAATCAAGAATCTATCGTCACATTT-TCGGCAAAATATGGATTAATCATTAACATTAGTGTTTTTATTGTTATATTTGCTGTTGGAATCAAAATGTTATTATTTGAAGGAGAACCAGCTTTATTCTTTTTATTCATTATATCAACATTGAGCTTATTAATTGGTGGTTGCTTATGGGGATCGGGTGAAGATGAAGGTGCAGTAACTAAAATGACTATTGGGATCGTAATATTTACT-GTA-GGATGTGCTACTACTGTAGCATTTTTTGTCACATACACTTTAAAACAAATTAGAAAAAAACGGAAACGCAAAAAGGAAATTGAACGTATTTTACAATTAAAAGAAGAAGTCAATGCATATGAAATATATAAACCACAAATGAGTAAAATGACCGATGAAGGTTATGATAATGAAGGTTTAGATCATAATGAACGGACAACAACTCTTTAACTTTGAATAATTTTCAATAACAGCATAATTACATGAACGTTTTTACAGAATATATCTATTGCAAACTTTTAAAATTTATTAATAGCGCTATTGTCTGTTGACTATTTGTTTAAATTATGTCTTTTCCCATCTTTTGCTAACTATTGACTACTTTCAATGAAAATCAAATGAGAATGTTAA-TAATAATTCCAAACCTTGTGATAATTTCTTAAAAATTGGGATTTTCTATNNTCTACAACATTTCCCTACATTACTTCTGGACGTNATACGATCTATATGCATCTTATCTGAGATTTGATATCTNCACTGATGAACATNCTATCTTATAGTCACTTATNCATGCTGGATCTTTACTATACGGNTAANTTATGNTATTATGAAATA]

[+] EMBL CD081568             [TAATTCGGCACGCCGGAATATATAGCTCTATGTACACATCTATTTTAGGAATCAAGAATCTATCGTCACATTTCTCGGCAAAATATGGATTAATCATTAACATTAGTGTTTTTATTGTTATATTTGCTGTTGGAATCAAAATGTTATTATTTGAAGGAGAACCAGCTTTATTCTTTTTATTCATTATATCAACATTGAGCTTATTAATTGGTGGTTGCTTATGGGGATCGGGTGAAGATGAAGGTGCAGTAACTAAAATGACTATTGGGATCGTAATATTTACT GTA GGATGTGCTACTACTGTAGCATTTTTTGTCACATACACTTTAAAACAAATTAGAAAAAAACGGAAACGCAAAAAGGAAATTGAACGTATTTTACAATTAAAAGAAGAAGTCAATGCATATGAAATATATAAACCACAAATGAGTAAAATGACCGATGAAGGTTATGATAATGAAGGTTTAGATCATAATGAACGGACAACAACTCTTTAACTTTGAATAATTTTCAATAACAGCATAATTACATGAACGTTTTTACAGAATATATCTATTGCAAACTTTTAAAATTTATTAATAGCGCTATTGTCTGTTGACTATTTGTTTAAATTATGTCTTTTCCCATCTTTTGCTAACTATTGACTACTTTCAATGAAAATCAAATGAGAATGTTAA TAATAATTCCAAACCTTGTGATAATTTCTTAAAAATTGGGATTTT                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD082438             [                      TAGCTCTATGTACACATCTATTTTAGGAATCAAGAATCTATCGTCACATTT TCGGCAAAATATGGATTAATCATTAACATTAGTGTTTTTATTGTTATATTTGCTGTTGGAATCAAAATGTTATTATTTGAAGGAGAACCAGCTTTATTCTTTTTATTCATTATATCAACATTGAGCTTATTAATTGGTGGTTGCTTATGGGGATCGGGTGAAGATGAAGGTGCAGTAACTAAAATGACTATTGGGATCGTAATATTTACT GTA GGATGTGCTACTACTGTAGCATTTTTTGTCACATACACTTTAAAACAAATTAGAAAAAAACGGAAACGCAAAAAGGAAATTGAACGTATTTTACAATTAAAAGAAGAAGTCAATGCATATGAAATATATAAACCACAAATGAGTAAAATGACCGATGAAGGTTATGATAATGAAGGTTTAGATCATAATGAACGGACAACAACTCTTTAACTTTGAATAATTTTCAATAACAGCATAATTACATGAACGTTTTTACAGAATATATCTATTGCAAACTTTTAAAATTTATTAATAGCGCTATTGTCTGTTGACTATTTGTTTAAATTATGTCTTTTCCCATCTTTTGCTAACTATTGACTACTTTCAATGANNATCANATGAGAATGTTAANNTAT ATT CGAACCTTGTGATAATTTCTTAAANNTTGGGATTCACTATNNTCTACAACATTTCCCTACATTACTTCTGGACGTNATACGATCTATATGCATCTTATCTGAGATTTGATATCTNCACTGATGAACATNCTATCTTATAGTCACTTATNCATGCTGGATCTTTACTATACGGNTAANTTATGNTATTATGAAATA]
[+] EMBL AA559796             [                             ATGTACACATCTATTTTAGGAATCAAGAATCTATCGTCACATTT TCGGCAAAATATGGATTAATCNNTAACATTAGTGTTTTTATTGTNATATTTGCTGTTGGAATCANAATGTTATTATTTGAAGGAGAACCNGCTTTATTCTTTTNATTCATTATATCAACATTGAGCTTATTNATTGGTGGTTGCTTATGGGGATCGGGTGAAGATGANGGTGCAGTACCTAAAATGACNATTGGGATCGTAATATTTACTGGTAGGGATGTGCTNCTACTGTANCATTTTTTGTCNCNTCCNCTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BG932209             [                            gcgGTACACATCTATTTTAGGAATCAAGAATCTATCGTCACATTT TCGGCAAAATATGGATTAATCATTAACATTAGTGTTTTTATTGTTATATTTGCTGTTGGAATCAAAATGTTATTATTTGAAGGAGAACCAGCTTTATTCTTTTTATTCATTATATCAACATTGAGCTTATTAATTGGTGGTTGCTTATGGGGATCGGGTGAAGATGAAGGTGCAGTAACTAAAATGACTATTGGGATCGTAATATTTACT GTA GGATGTGCTACTACTGCAGCATTTTTTGTCACATACACTTTAAAACAAATTAGAAAAAAACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD078207             [                                            ggAGGAATCAAGAATCTATCGT ACATTT TCGGCAAAATATGGATTAATCATTAACATTAGTGTTTTTATTGTTATATTTGCTGTTGGAATCAAAATGTTATTATTTGAAGGAGAACCAGCTTTATTCTTTTTATTCATTATATCAACATTGAGCTTATTAATTGGTGGTTGCTTATGGGGATCGGGTGAAGATGAAGGTGCAGTAACTAAAATGACTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]




>consensus_9148#0
TAATTCGGCACGCCGGAATATATAGCTCTATGTACACATCTATTTTAGGAATCAAGAATC
TATCGTCACATTTTCGGCAAAATATGGATTAATCATTAACATTAGTGTTTTTATTGTTAT
ATTTGCTGTTGGAATCAAAATGTTATTATTTGAAGGAGAACCAGCTTTATTCTTTTTATT
CATTATATCAACATTGAGCTTATTAATTGGTGGTTGCTTATGGGGATCGGGTGAAGATGA
AGGTGCAGTAACTAAAATGACTATTGGGATCGTAATATTTACTGTAGGATGTGCTACTAC
TGTAGCATTTTTTGTCACATACACTTTAAAACAAATTAGAAAAAAACGGAAACGCAAAAA
GGAAATTGAACGTATTTTACAATTAAAAGAAGAAGTCAATGCATATGAAATATATAAACC
ACAAATGAGTAAAATGACCGATGAAGGTTATGATAATGAAGGTTTAGATCATAATGAACG
GACAACAACTCTTTAACTTTGAATAATTTTCAATAACAGCATAATTACATGAACGTTTTT
ACAGAATATATCTATTGCAAACTTTTAAAATTTATTAATAGCGCTATTGTCTGTTGACTA
TTTGTTTAAATTATGTCTTTTCCCATCTTTTGCTAACTATTGACTACTTTCAATGAAAAT
CAAATGAGAATGTTAATAATAATTCCAAACCTTGTGATAATTTCTTAAAAATTGGGATTT
TCTATNNTCTACAACATTTCCCTACATTACTTCTGGACGTNATACGATCTATATGCATCT
TATCTGAGATTTGATATCTNCACTGATGAACATNCTATCTTATAGTCACTTATNCATGCT
GGATCTTTACTATACGGNTAANTTATGNTATTATGAAATA

consensusID : consensus_9148#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 605
fasta sequence

                              [TAAAACAAATTAGAAAAAAACGGAAACGCAAAAAGGAAATTGAACGTATTTTACAATTAAAAGAAGAAGTCAATGCATATGAAATATATAACCCACAAATGAGTAAAATGACCGATGAAGGTTATGATAATGAAGGTTTAGATCATAATGAACGGACAACAACTCTTTAACTTTGAATAATTTTCAATAACAGCATAATTACATGAACGTTTTTACAGAATATATCTATTGCAAACTTTTAAAATTTATTAATAGCGCTATTGTCTGTTGACTATTTGTTTAAATTATGTCTTTTCCCATCTTTTGCTAACTATTGACTACTTTCAATGAAAATCAAATGAGAATGTTAATAATAATTCGACCCTTGTGATAATTTCTTAAAATTGGGATTTCAACTATTTTCTACAAACATTTCCCTACAATTTACTTCTGGAACGTTTATACCGATCTTAATATGCATCTTTAATCTGAGTATTTGTATTAATCTCCACTGAGTGGAACGATTCCTATCTTTTATAAAGTACACTTTAATTCCATGGCTGTGATTCTTTACTTATTTACTGTTTTAAATTTTTATGTATATTTTATGAAATATAAAGTTTTTT]

[-] EMBL CD076037             [TAAAACAAATTAGAAAAAAACGGAAACGCAAAAAGGAAATTGAACGTATTTTACAATTAAAAGAAGAAGTCAATGCATATGAAATATATAACCCACAAATGAGTAAAATGACCGATGAAGGTTATGATAATGAAGGTTTAGATCATAATGAACGGACAACAACTCTTTAACTTTGAATAATTTTCAATAACAGCATAATTACATGAACGTTTTTACAGAATATATCTATTGCAAACTTTTAAAATTTATTAATAGCGCTATTGTCTGTTGACTATTTGTTTAAATTATGTCTTTTCCCATCTTTTGCTAACTATTGACTACTTTCAATGAAAATCAAATGAGAATGTTAATAATAATTCGACCCTTGTGATAATTTCTTAAAATTGGGATTTCAACTATTTTCTACAAACATTTCCCTACAATTTACTTCTGGAACGTTTATACCGATCTTAATATGCATCTTTAATCTGAGTATTTGTATTAATCTCCACTGAGTGGAACGATTCCTATCTTTTATAAAGTACACTTTAATTCCATGGCTGTGATTCTTTACTTATTTACTGTTTTAAATTTTTATGTATATTTTATGAAATATAAAGTTT   ]
[-] EMBL CD075394             [                                                                                                                      AGGTTATAATAATGAAGGTTTAGATCATAATGAACGGACAACAACTCTTTAACTTTGAATAATTTTCAATAACAGCATAATTACATGAACGTTTTTACAGAATATATCTATTGCAAACTTTTAAAATTTATTAATAGCGCTATTGTCTGTTGACTATTTGTTTAAATTATGTCTTTTCCCATCTTTTGCTAACTATTGACTACTTTCAATGAAAATCAAATGAGAATGTTAATAATAATTCGAACCTTGTGATAATTTCTTAAAATTGGGATTTCAACTATTTTCTACAAACATTTCCCTACAATTTACTTCTGGAACGTTTATACCGATCTTAATATGCATCTTTAATCTGAGTATTTGTATTAATCTCCACTGAGTGGAACGATTCCTATCTTTat                                                                                         ]
[-] EMBL CD076969             [                                                                                                                                                                                                                    TTACAGAATATATTTATTGCAAACTTTTAAAATTTATTAAAAGCGCTATTGTTTGTTGACTATTTGTTTAAATTATGTCTTTTCCCATTTTTTGGTAACTATTGGCTCCTTTCAATGAAAATCAAATGAGAATGTTAATAATAATTCGACCCTTGGGATAATTTTTTAAAATTGGGATTTCAACTATTTTTTACAAACATTTCCCTACAATTTACTTTTGGAACGTTTAAACCGATTTTAAAATGCATCTTTAATTTGAGGATTTGTATTAATCTCCCCTGAGTGGAACGATTCCTATTTTTTATAAAGTACCCTTTAATTCCAGGGCTGGGATTCTTTACTTATTTACTGTTTTAAATTTTTAGGGATATTTTATGAGAAATAAAGTTTTTT]




>consensus_9148#1
TAAAACAAATTAGAAAAAAACGGAAACGCAAAAAGGAAATTGAACGTATTTTACAATTAA
AAGAAGAAGTCAATGCATATGAAATATATAACCCACAAATGAGTAAAATGACCGATGAAG
GTTATGATAATGAAGGTTTAGATCATAATGAACGGACAACAACTCTTTAACTTTGAATAA
TTTTCAATAACAGCATAATTACATGAACGTTTTTACAGAATATATCTATTGCAAACTTTT
AAAATTTATTAATAGCGCTATTGTCTGTTGACTATTTGTTTAAATTATGTCTTTTCCCAT
CTTTTGCTAACTATTGACTACTTTCAATGAAAATCAAATGAGAATGTTAATAATAATTCG
ACCCTTGTGATAATTTCTTAAAATTGGGATTTCAACTATTTTCTACAAACATTTCCCTAC
AATTTACTTCTGGAACGTTTATACCGATCTTAATATGCATCTTTAATCTGAGTATTTGTA
TTAATCTCCACTGAGTGGAACGATTCCTATCTTTTATAAAGTACACTTTAATTCCATGGC
TGTGATTCTTTACTTATTTACTGTTTTAAATTTTTATGTATATTTTATGAAATATAAAGT
TTTTT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9148#0      TAATTCGGCACGCCGGAATATATAGCTCTATGTACACATCTATTTTAGGAATCAAGAATC 60
consensus_9148#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9148#0      TATCGTCACATTTTCGGCAAAATATGGATTAATCATTAACATTAGTGTTTTTATTGTTAT 120
consensus_9148#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9148#0      ATTTGCTGTTGGAATCAAAATGTTATTATTTGAAGGAGAACCAGCTTTATTCTTTTTATT 180
consensus_9148#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9148#0      CATTATATCAACATTGAGCTTATTAATTGGTGGTTGCTTATGGGGATCGGGTGAAGATGA 240
consensus_9148#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9148#0      AGGTGCAGTAACTAAAATGACTATTGGGATCGTAATATTTACTGTAGGATGTGCTACTAC 300
consensus_9148#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9148#0      TGTAGCATTTTTTGTCACATACACTTTAAAACAAATTAGAAAAAAACGGAAACGCAAAAA 360
consensus_9148#1      --------------------------TAAAACAAATTAGAAAAAAACGGAAACGCAAAAA 34
                                                **********************************

consensus_9148#0      GGAAATTGAACGTATTTTACAATTAAAAGAAGAAGTCAATGCATATGAAATATATAAACC 420
consensus_9148#1      GGAAATTGAACGTATTTTACAATTAAAAGAAGAAGTCAATGCATATGAAATATATAACCC 94
                      ********************************************************* **

consensus_9148#0      ACAAATGAGTAAAATGACCGATGAAGGTTATGATAATGAAGGTTTAGATCATAATGAACG 480
consensus_9148#1      ACAAATGAGTAAAATGACCGATGAAGGTTATGATAATGAAGGTTTAGATCATAATGAACG 154
                      ************************************************************

consensus_9148#0      GACAACAACTCTTTAACTTTGAATAATTTTCAATAACAGCATAATTACATGAACGTTTTT 540
consensus_9148#1      GACAACAACTCTTTAACTTTGAATAATTTTCAATAACAGCATAATTACATGAACGTTTTT 214
                      ************************************************************

consensus_9148#0      ACAGAATATATCTATTGCAAACTTTTAAAATTTATTAATAGCGCTATTGTCTGTTGACTA 600
consensus_9148#1      ACAGAATATATCTATTGCAAACTTTTAAAATTTATTAATAGCGCTATTGTCTGTTGACTA 274
                      ************************************************************

consensus_9148#0      TTTGTTTAAATTATGTCTTTTCCCATCTTTTGCTAACTATTGACTACTTTCAATGAAAAT 660
consensus_9148#1      TTTGTTTAAATTATGTCTTTTCCCATCTTTTGCTAACTATTGACTACTTTCAATGAAAAT 334
                      ************************************************************

consensus_9148#0      CAAATGAGAATGTTAATAATAATTCCAAACCTTGTGATAATTTCTTAAAAATTGGGATTT 720
consensus_9148#1      CAAATGAGAATGTTAATAATAATTC-GACCCTTGTGATAATTTCTTAAAA-TTGGGATTT 392
                      *************************  * ********************* *********

consensus_9148#0      T--CTATNNTCTACAA-CATTTCCCTACA--TTACTTCTGGA-CGTN-ATAC-GATCT-- 770
consensus_9148#1      CAACTATTTTCTACAAACATTTCCCTACAATTTACTTCTGGAACGTTTATACCGATCTTA 452
                         ****  ******* ************  *********** ***  **** *****  

consensus_9148#0      ATATGCATCTT--ATCTGAG-ATTTG-AT--ATCTNCACTGAT--GAACA--TNCTATCT 820
consensus_9148#1      ATATGCATCTTTAATCTGAGTATTTGTATTAATCTCCACTGAGTGGAACGATTCCTATCT 512
                      ***********  ******* ***** **  **** ******   ****   * ******

consensus_9148#0      TATA----GT-CACTTA---TNCATGC---TGGATCTTTACTATACGGNTAANTTATGNT 869
consensus_9148#1      TTTATAAAGTACACTTTAATTCCATGGCTGTGATTCTTTACTTATTTACTGTTTTAAATT 572
                      * **    ** *****    * ****    **  ********       *   ***   *

consensus_9148#0      ATTATGAAATA----------------------- 880
consensus_9148#1      TTTATGTA-TATTTTATGAAATATAAAGTTTTTT 605
                       ***** * **